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文档简介

1、动物肝脏中DNA勺提取及检测一、前言脱氧核糖核酸脱氧核糖核酸DNA,为英文Deoxyribonucleic?aci啲缩写,又称去氧核糖核酸,是 脱氧核糖核酸染色体的主要化学成分,同时也是组成基因的材料。有时也被称为“遗传微 粒,原因是在繁殖过程中,父代会把它们自己 DNA的一局部复制传递到子代中,从而 完成性状的传播。DNA是高分子聚合物,DNA溶液为高分子溶液,具有很高的粘度,可被甲基绿染成 绿色。DNA对紫外线260nm有吸收作用,利用这一特性,可以对 DNA进行含量测定。 当核酸变性时,吸光度升高,称为增色效应;当变性核酸重新复性时,吸光度又会恢复到 原来的水平。较高温度、有机溶剂、酸碱

2、试剂、尿素、酰胺等都可以引起DNA分子变性,即DNA双链碱基间的氢键断裂,双螺旋结构解开一也称为DNA的解螺旋。在细胞内,DNA能与蛋白质结合形成染色体,整组染色体那么统称为染色体组。对于人 类而言,正常的体细中含有46条染色体。染色体在细胞分裂之前会先在分裂间期完成复制, 细胞分裂间期又可划分为:G1期-DNA合成前期、S期-DNA合成期、G2-DNA合成后期。 对于真核生物,如动物、植物及真菌而言,染色体主要存在于细胞核内;而对于原核生物, 如细菌而言,那么主要存在于细胞质中的拟核内。染色体上的染色质蛋白,如组织蛋白,能 够将DNA进行组织并压缩,以帮助DNA与其他蛋白质进行交互作用,进而

3、调节基因的转 录。脱氧核糖核酸的结构DNA的结构:DNA的结构一般可划分为一级结构、二级结构、三级结构和四级结构 四个水平。DNA是一种长链聚合物,组成单位为四种脱氧核苷酸,即腺嘌呤脱氧核苷酸dAMP脱 氧腺苷、胸腺嘧啶脱氧核苷酸dTMP脱氧胸苷、胞嘧啶脱氧核苷酸dCMP脱氧胞 苷、鸟嘌呤脱氧核苷酸dGMP脱氧鸟苷。而脱氧核糖五碳糖与磷酸分子借由酯 键相连,组成其长链骨架,排列在外侧,四种碱基排列在内侧。每个糖分子都与四种碱基 里的其中一种相连,这些碱基沿着 DNA长链所排列而成的序列,可组成遗传密码,指导 蛋白质的合成。读取密码的过程称为转录,是以 DNA双链中的一条单链为模板转录出一 段称

4、为mRNA 信使RNA的核酸分子。DNA是由许多脱氧核苷酸按一定碱基顺序彼此用 3',5'-磷酸二酯键相连构成的长 链。大多数DNA含有两条这样的长链,也有的 DNA为单链,如大肠杆菌噬菌体 © X174、 G4、M13等。DNA有环形DNA和链状DNA之分。在某些类型的DNA中,5-甲基胞嘧啶 可在一定限度内取代胞嘧啶,其中小麦胚 DNA的5-甲基胞嘧啶特别丰富。在某些噬菌体 中,5-羟甲基胞嘧啶取代了胞嘧啶。40年代后期,查加夫E.Chargaf发现不同物种DNA 的碱基组成不同,但其中的腺嘌呤数等于其胸腺嘧啶数A=T ,鸟嘌呤数等于胞嘧啶数G=C,因而嘌呤数之和

5、等于嘧啶数之和,一般用几个层次描绘DNA的结构。浓盐法从动物组织中提取 DNA核酸和蛋白质在生物体中常以核蛋白DNP/RNP 的形式存在,其中DNP能溶于水 及高浓度盐溶液,但在0.14 M的盐溶液中溶解度很低,而RNP那么可溶于低盐溶液,因此可利用不同浓度的NaCI溶液将其从样品中分别抽提出来。 将抽提得到的DNP用SDS处理可 将其别离 DNA 和蛋白质,用氯仿 -异戊醇将蛋白质沉淀除去可得 DNA 上清,参加冷乙醇 即可将其呈纤维状析出。肝脏细胞肝脏是由肝细胞组成,肝细胞极小,肉眼看不到,必须通过显微镜才能看到。人肝约 有 25 亿个肝细胞, 5000个肝细胞组成一个肝小叶,因此人肝的肝

6、小叶总数约有50 万个。肝细胞为多角形,直径约为 20-30/加(微米),有 6-8 个面,不同的生理条件下大小有差异, 如饥饿时肝细胞体积变大。每个肝细胞外表可分为窦状隙面、肝细胞面和胆小管面三种。 肝细胞里面含有许许多多复杂的细微结构 :如肝细胞核、肝细胞质、线粒体、内质网、溶酶 体、高尔基氏体、微粒体及饮液泡等组成。二、实验目的1. 掌握浓盐法从动物组织中提取 DNA 的原理与技术三、实验原理核酸和蛋白质在生物体中常以核蛋白( DNP/RNP )的形式存在,其中 DNP 能溶于水 及高浓度盐溶液,但在0.14 M的盐溶液中溶解度很低,而RNP那么可溶于低盐溶液,因此可 利用不同浓度的Na

7、CI溶液将其从样品中分别抽提出来。将抽提得到的DNP用SDS处理可将其别离DNA和蛋白质,用氯仿-异戊醇将蛋白质 沉淀除去可得 DNA 上清,参加冷乙醇即可将其呈纤维状析出四、实验器材和材料试剂实验器材: 匀浆器 量筒 离心机 离心管 试管 吸管 恒温水浴锅实验材料: 猪肝实验试剂: O.1mol/L NaCI-0.05mol/L 柠檬酸钠溶液pH6.8 95%乙醇A.R. NaCI 固体A.R. 5%SDS溶液5g SDS定容至100m V氯仿:V 异戊醇20: 1的混合液五、实验操作1. 称量 称取一定质量的猪肝,参加 2倍肝重的0.1mol/L NaCI-0.05mol/L柠檬酸钠缓冲液

8、并 用匀浆器磨碎已完成。2. 提取 DNA 量取肝糜 4 ml 于 10毫升离心管,在 4000r/min 下离心 10min ,沉淀中再参加 8 ml 缓冲液于 4000r/min 离心 5 min; 弃上清,取沉淀; 将沉淀用10 ml柠檬酸钠缓冲液完全洗入干净的小烧杯、参加5 ml氯仿-异戊醇混合液、1 ml SDS,振荡30min 保鲜膜封口; 缓慢参加固体NaCl 约0.9g,使其最终浓度为1mol/L ; 将溶液分装到2个10毫升离心管中,在4000r/min离心5 min,取上清水相; 在上述水相溶液中分别加等体积冷 95%乙醇,边加边用玻棒慢慢朝一个方向搅动, 将缠绕在玻棒上的

9、凝胶状物用滤纸吸去多余的乙醇,即得 DNA 粗品; 用 8ml 蒸馏水溶解 DNA 粗品于 10ml 离心管中3标准曲线的绘制按下表参加各种 试剂,混匀,于60C恒温水浴锅45min,冷却后,在595nm波长下于分光光度计比色测定,以吸光度对 DNA浓度作图,制作标准曲线012345标准DNA溶液/ml0.00.40.81.21.62.0蒸馏水/ml2.01.61.20.80.40二苯胺试剂/ml4.04.04.04.04.04.0A595nm4.样品的测定将DNA粗品定容至25ml容量瓶,再取DNA样液1.0ml,参加蒸馏水1.0ml,混匀。然 后准确参加二苯胺试剂4.0ml,混匀,于60C

10、恒温水浴锅45min,冷却后,595nm波长下于 分光光度计比色测定,根据所测的吸光度对照标准曲线求得 DNA的质量ug。5计算100g猪肝中DNA含量w=m1/m2 X 100%w: DNA的质量分数%ml:样液中测得的DNA的质量ugm2:样液中所含样品的质量ug六、实验数据处理1标准曲线012345标准DNA溶液/ml0.00.40.81.21.62.0蒸馏水/ml2.01.61.20.80.40二苯胺试剂/ml4.04.04.04.04.04.0A595nm00.0390.090.1460.1970.249DNA含量/ug0801602403204002.实验结果处理猪肝质量为2.04

11、gDNA提取液体积为12.53ml序号123A595nm0.1020.1020.101平均A595nm0.102样液中DNA含量/ug171.4样液中样品质量/g0.1628根据公式w=m1/m2 x 100%得:w=0.1053%那么100g猪肝中DNA含量为:wx 100=0.1053g七、思考题1实验中的乙醇、SDS氯仿-异戊醇、NaCI、柠檬酸钠分别有什么作用?答:柠檬酸的钠盐在实验中既充当 DNA酶的抑制剂,也是pH缓冲溶液; SDS是外表活性剂,可以让蛋白质与 DNA分开; 氯仿是有机溶剂,可以使蛋白质聚集沉淀,便于别离出去; 异戊醇是消泡剂,可以减少泡沫的发生; 氯仿-异戊醇的作

12、用是使蛋白质变性、膜溶解; NaCI固体溶解使得试液成为高浓度的盐溶液,在这样的环境中DNA核蛋白能溶解,RNA核蛋白那么溶解度很低,可以利用这一性质别离两种核酸。八、实验考前须知1.DNA 主要集中在细胞核中,因此,通常选用细胞核含量比例大的生活组织作为提取 制备 DNA 的材料,小牛胸腺组织中细胞核比例较大,因而 DNA 含量丰富,同时其脱氧核 苷酸酶活性较低,制备过程中 DNA 被降解的可能性相对较低,所以是制备 DNA 的良好材 料,但其来源较困难,脾脏或肝脏易获得,也是实验室制备 DNA 常用的材料,本实验用 新鲜肝脏作为实验材料。2. 为了防止大分子核酸在提取过程中被降解, 须采取

13、以下措施: 整个过程必须在低温下 进行,可参加某些物质抑制核酸酶的活性,如柠檬酸钠、EDTA、SDS等,EDTA是抑制核酸酶的活性最好的抑制剂。3. 从核蛋白中脱去蛋白质的方法很多,经常采用的有:氯仿-异丙醇法、苯酚法、去垢剂法等,他们均能使蛋白质变性和核蛋白解聚,并释放出核酸。4. 使用离心机时,对称放置的离心管必须用天平调平衡。5. 防止剧烈振荡,如研磨过程、搅拌过程等。九、实验结果误差分析及讨论经过对本次实验结果进行分析,得出100g猪肝中DNA含量大约为0.1053g的结论,在上网 查阅相关资料后发现:猪肝中 DNA 含量与本次试验实际操作测量得出的结果大致相互吻 合。由此可知,本次试

14、验结果是相比照拟成功的,较为粗略地测量出猪肝中 DNA 的含量, 并且较为熟练地掌握了浓盐法从动物组织中提取 DNA 的原理与技术,根本到达了本次实 验的目的。但是本次实验结果只是粗略测量,并未到达精确测量猪肝中 DNA 的含量,且实验数 据较理论值偏低,这是由于某些误差导致,在实验过程中些许因素可能会导致实验结果数 据有偏差,经分析得出以下几点: 在称取猪肝后参加柠檬酸钠缓冲液进行研磨的过程中,由于猪肝组织外表较滑不易 磨碎,且研磨至最后依旧有小局部猪肝组织块残留,因此可能导致猪肝中 DNA 提取不充 分,致使实验数据较理论值偏低; 研磨过程中,可能由于操作不当,导致局部液体溅出,因此可能使得提取液中局部DNA 损失,导致实验数据偏低; 在粗提取 DNA 操作中,频繁地将 DNA 提取液转移至各个仪器内,可能有极小局部DNA 提取液未倒净,残留在仪器壁上损耗掉,导致实验误差; 在使用移液枪的过程中, 可能因为操作不当或移液枪经常错误使用, 出现仪器误差, 导致吸取的 DNA 样液不精确,出现实验误差; 在水相中参加乙醇析出 DNA 时,不是所有 DNA

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