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文档简介
1、The 16S rRNA or 18S rRNA Technique In Prokaryotes: 5S rRNA is too small, contains limited info 23S rRNA is too large, too difficult to manage 16S rRNA has the right size for studies In Eukaryotes: 18S rRNA is used for phylogenetic measurements第1页/共14页Phylogenetic Trees from DNA Sequences第2页/共14页 第二节
2、第二节 微生物的分类单位和命名微生物的分类单位和命名 一、种以上的系统分类单位一、种以上的系统分类单位 界 Kingdom (拉,Regnum) 门 Phylum (拉,Phylum) 亚门 纲 Class (拉,Classis) 亚纲 目 Order (拉,Ordo) 亚目 科 Family (拉,Familia)亚科 属 Genus (拉, Genus )亚属 种 Species (拉, Species)亚种第3页/共14页第4页/共14页第5页/共14页第6页/共14页第7页/共14页第8页/共14页第9页/共14页第三节第三节 细菌分类的依据和方法细菌分类的依据和方法 一、形态学特征细
3、胞形态 群体形态:平板菌落特征和液体培养特征 二、生理生化特征: 1、利用营养物质的能力 2、细菌对生活环境的要求及抗逆性 3、生化反应和酶 4、营养类型 5、代谢产物 6、对抗生素的敏感性三、血清学试验与噬菌体分型第10页/共14页四、氨基酸顺序和蛋白质分析五、核酸的碱基组成和分子杂交 1、DNA(G+C)mol/L 2、核酸杂交 (DNA-DNA,DNA-rRNA,核酸探针) 3、16SrRNA核苷酸分类目录六、遗传重组第11页/共14页第四节第四节 细菌的分类系统和分类位置细菌的分类系统和分类位置 细菌的分类系统细菌的分类系统 微生物分类的国际性权威著作,从1923年来出版9个版本,新版
4、为 Bergeys Manual of Determinative Bacteriology,9th 1994。第12页/共14页Questions Why is Ribosomal RNAs used as Evolutionary Chronometers Why is 16S rRNA employed to study phylogenetics rather than the smaller 5S rRNR and the large 23S rRNA in Prokaryotics? How to sequence 16S rRNA from inside the cells? How to identify a prokaryotic or eukaryotic organism based on 16S or 18S rRNA? How to build Phylogenetic Trees from DNA Sequences? Why it is said the archaea closer to eukarya than bacteria is? Wh
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