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1、TNF-基因多态性与分泌性中耳炎的关联 作者:谭慧欢,黄海玲,解继胜,赵琼芝 【摘要】 目的 探讨TNF-基因启动子-238G/A多
2、态性与分泌性中耳炎(SOM)的相关关系。方法 应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性法(PCR-RFLP)检测125例SOM患者和130例健康对照者TNF-基因启动子-238G/A多态性。结果 TNF-238基因型GG、GA频率在对照组和SOM组分别为93.85%,6.15%和85.60%,14.40%;等位基因G、A频率在对照组和SOM组分别为96.92%,3.08%和92.80%,7.20%。两组差异均有显著性(P<0.05),携带GA基因型个体患SOM的风险约是GG基因型的2.565倍(OR=2.565,95%CI=1.0726.138)。结论 TNF-238基因多态性与SOM的发
3、病有相关性,A等位基因可能是SOM的遗传易感基因。 【关键词】 肿瘤坏死因子-;基因多态性;中耳炎,伴渗出液 Abstract: Objective To examine the association between polymorphism of tumor necrosis factor-alpha (TNF-alpha)-238 G/A promoter with secretory otitis media (SOM). Methods The polymorphism of TNF-al
4、pha was detected by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) methods in 125 patients with SOM and 130 healthy controls. Results TNF-alpha genotype frequencies of GG, GA were 93.85%, 6.15% and 85.60%, 14.40% in SOM group and control group, respectively
5、. Allele frequencies of G, A were 96.92%, 3.08% and 92.80%, 7.20% in SOM group and control group, respectively. There was statistically significant difference in frequencies of allele and genotype in TNF-alpha polymorphism between SOM group and control group (P<0.05). The relative risk suffered f
6、rom SOM in patients with GA genotype was as 2.565 times as those with GG genotype (OR=2.565, 95%CI=1.0726.138). Conclusion TNF-alpha-238 polymorphism is positively associated with the genesis of SOM, and A allele maybe a risk factor for SOM. Key words: tumor necr
7、osis factor-alpha; gene polymorphism; otitis media with effusion分泌性中耳炎(secretory otitis media,SOM)是以中耳积液及听力下降为主要特征的中耳非化脓性炎性疾病,小儿的发病率比成人高,是引起小儿听力下降的重要原因之一。目前SOM发病确切机理尚未完全明了,近年国内外的研究1表明免疫反应与SOM的发病关系密切,其中肿瘤坏死因子-(tumor necrosis factor alpha,TNF-)在SOM免疫反应中的作用日益被耳科学者重视,已成为研究SOM发病机理的活跃领域。有研究证实2,TNF-基因多态性与多
8、种疾病相关,但TNF-基因多态性与SOM是否关联,目前尚不清楚,为此,我们采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法,探讨TNF-基因多态性与SOM的关系,为揭示SOM的发病机理提供一定的实验依据和新的视角。1 对象与方法1.1 研究对象 SOM组:经纯音测听、声导抗测试、鼓膜穿刺等检查确诊为SOM患儿(排除鼻咽部疾病者)125例,男68例,女57例,年龄316岁,平均9.8岁;病程116周。对照组:正常健康体检,无中耳炎病史、耳部正常儿童130例,男68例,女62例,平均10.4岁。1.2 方法参照文献3设计合成一对引物(北京
9、赛百盛有限公司合成),扩增TNF-基因启动子区的一段DNA序列。上游引物:5'-AGAAGACCCCCCTCGGAACC-3',下游引物:5'-ATCTGGAGGAAGCGGTAGTG-3'。PCR反应体系包括5.0l基因组DNA,2.5l 10×PCR Buffer,2.0l 2.5mmol/L dNTPs, 1.5l 25mmol/L MgCl2,引物各20 pmol/l,Taq DNA聚合酶1.25u,所有试剂均为大连宝生物公司产品。PCR反应循环参数:95预变性反应3min;94变性50s,59退火1min,72延伸1min,33个循环;72延
10、伸5min,4保存,以上反应均在GeneAmp PCR System 2700型(美国PE公司)基因扩增仪上完成。取PCR扩增产物10l,用10u限制性内切酶(英国Biolabs公司提供)Msp I于37酶切1h。反应终止后,产物经8%聚丙烯酰胺凝胶电泳,EB染色,染色后以DNA片段长度标准物为参考,在紫外灯下判断结果,并拍照。1.3 统计学处理 用基因直接计数法计算TNF-的基因型及等位基因频率,疾病组和对照组间基因型及等位基因频率用2检验,均在SPSS11.0软件包上完成。2 结果2.1 TNF-基因型分析 TNF-基因238G/A多
11、态性,PCR扩增产物片段大小为152 bp,根据限制性内切酶Msp I酶切片段的情况,基因型有两种,GG型(133 bp、19 bp 2条带)、GA型(152 bp、133 bp、19 bp 3条带),在两组人群中均未检出AA基因型,见图1。2.2 SOM组与对照组TNF-基因多态性的比较 TNF- -238G/A位点基因型在两组中的分布差异有显著性(2=4.732,P<0.05);等位基因频率在两组中差异有显著性(2=4.478,P<0.05);SOM组TNF- GA基因型明显升高,关联分析结果显示,SOM组与TNF-基因多态性存在关联(2=4.732,P&
12、lt;0.05,OR=2.565,95%,CI=1.0726.138),见表1。表1 两组TNF- -238基因型及等位基因频率分布的比较 (略) 3 讨论 TNF是一种促炎细胞因子,主要由单
13、核或巨噬细胞分泌,包括TNF-和TNF-两种。它可诱导自身及IL-1、IL-6等其它细胞因子产生,增加白细胞相关抗原(HLA)-、类抗原表达,促进T、B淋巴细胞增殖及免疫球蛋白的合成,具有广泛的诱导炎症和调节免疫的功能。近年研究证实4,适量的TNF可调整机体的免疫及代谢作用,在维持机体内部环境的稳定状态及抵制各种致病因子具有重要意义,但是过量的TNF则会导致各种病理改变。 随着分子生物学和分子遗传学研究的不断深入,人们已经认识到基因的多态性可以造成某些疾病不同的易感性。人TNF基因位于第6号染色体短臂MHC 类基因区一段长7 kb的DNA序列内,其中TNF-
14、基因长4 kb,含4个外显子和3个内含子。有研究证实5TNF-基因启动子区域238位点存在G/A多态性,这种基因多态性的存在可能影响TNF基因转录和表达,进而影响TNF的生物学功能,可导致TNF的血清水平发生改变。 SOM发病确切的发病机理尚未明确,目前认为咽鼓管功能障碍、感染和免疫反应是三大致病原因,此外家族中有中耳炎患者为患病的危险遗传因素。大量研究表明,TNF-基因-238位点多态性与青春期单发关节炎6、慢性乙肝7和口腔鳞状细胞癌8等多种疾病存在密切相关性,但TNF-基因多态性与SOM是否存在关联性的研究很少。因此,我们检测了125例SOM患者TNF-
15、基因238位点多态性的分布,从遗传和免疫反应角度探讨SOM的发病机理。 实验结果发现,TNF- -238G/A位点基因型在两组中的分布差异有显著性(P<0.05);等位基因频率在两组中的差异也存在显著性(P<0.05);其中携带GA基因型个体患SOM的风险约是GG基因型的2.565倍(OR=2.565,95%,CI=1.0726.138),提示A等位基因可能是SOM的遗传易感基因。综上所述,SOM是一种可严重影响小儿听力的常见病,除上述因素外,遗传因素在其中也起着重要的作用,通过我们的研究可以发现,TNF-基因238G/A位点多态性与SOM存在关
16、联,A等位基因可能是SOM的遗传易感基因。TNF-基因多态性与SOM的研究才刚起步,还有待进行大样本、多地域、多民族广泛深入的协同研究,将有可能为SOM的风险预测、及早预防和个性化治疗提供一条新的线索和途径。【参考文献】 1郭志强.肿瘤坏死因子及其受体与分泌性中耳炎的关系J.听力学及言语疾病杂志,2003,11(3):221-223.2曹傅,高敏,周刚,等.肿瘤坏死因子基因多态性与溃疡性结肠炎相关性研究J.中华消化杂志,2006,26(7):460-463.3Allen RA, Lee EM, Roberts DH, et al. Polymorphism in the TNF-a
17、lpha and TNF-receptor genes in patients with coronary artery disease J. Eur J Clin Invest,2001,31(10):843-851.4郝俊贵,秦波.肿瘤坏死因子及其基因多态性在乙型肝炎中的作用研究进展J.国外医学:流行病学传染病学分册,2005,32(3):174-176.5王禹,张颖超,杜艳.原发性肝癌患者sIL-2R、IL-6 和TNF-测定及其临床意义J.中国普通外科杂志,2004,13(8):622-623.6Zeggini E, Thomson W, Kwiatkowski D, et al. L
18、inkage and association studies of single-nucleotide polymorphism-tagged tumor necrosis factor haplotypes in juvenile oligoarthritis J. Arthritis Rheum,2002,46(12):3304-3311.7Cheong JY, Cho SW, Hwang IL, et al. Association between chronic hepatitis B virus infection and interleukin-10, tumor necrosis factor-alpha gene promoter polymorphisms J.
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