thermoxca创建及检索库用户手册

1、© 2011 Thermo Fisher Scientific Inc. 保留所利。Xcalibur、Surveyor 和 Accela 是 Thermo Fisher Scientific Inc. 在美国的商标。Microsoft、Windows、Excel 和 Windows Vista 是 Microsoft Corporation 在美国及其它和地区的商标。商标。Adobe、Acrobat 和 Reader 是 Adobe Systems Inc. 在美国及其它和地区的下列是在美国和其它（地区）的商标：Oracle 是 Oracle 公司及其子公司的商标。LCQ 和 LCq

2、uan 是 Thermo Fisher Scientific Inc. 的商标。所有其它商标均为 Thermo Fisher Scientific Inc. 及其子公司的。Thermo Fisher Scientific Inc. 为的客户提供本文档，供其在操作时参考。本文档受何部分。保护，Thermo Fisher Scientific Inc.，严禁本文档或本文档的任本文档的内容可能随时更改，恕不另行通知。本文档中的所有技术信息参考。本文档中的系统配置和规格将取代者先前获得的所有信息。Thermo Fisher Scientific Inc. 不保证本文档的完整性和准确性，而且对于可能因使

3、用本文档（即使是在正确遵循本文档中的说明信息的情况下）而导致的任何错误、疏忽、损害或损失， Thermo Fisher Scientific Inc. 概不负责。本文档不是 Thermo Fisher Scientific Inc. 和者之间的销售合同的一部分。任何情形下，都不得使用本文档来取代或修改任何 “ 销售条款与条件 ”，若两份文档信息发生“ 销售条款与条件 ” 中的信息为准。，则以历史：2011 年 1 月修订版 A （以反映 Windows 7 的兼容性）； 2011 年 5 月修订版 B软件版本：Thermo Xcalibur 2.2研究使用。不可用于。目录目录前言 . . .

4、. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .相关文档 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .特殊注意事项 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .我们 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .v.v vi vi. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .vii第1

5、 章Library Browser 概述. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Library Browser 处理概述. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ..5.8.81011关于 Library Browser . Library Browser 窗口. Library Search 窗口. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

6、 . . . . . . . . . . . . . .Other Search 窗口 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Name Search 窗口. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Compare 窗口. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Librarian 窗口. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .第2 章添加一个谱图至库中 . . . . . . .

7、. . . . . . . . . . . . . . . .在 Qual Browser 窗口中打开原始数据文件 （.raw） . . . . . . . . . .在 Qual Browser 窗口中查看谱图 . . . . . . . . . . . . . . . . . .背景谱图 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .使用背景扣除工具 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .扣除背景光谱 . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

8、 . . . . . .从 Xcalibur 数据系统中导出谱图 . . . . . . . . . . . . . . . . . .从 Qual Browser 窗口中手动导出谱图 . . . . . . . . . . . . . . .从处理方法中自动导出谱图 . . . . . . . . . . . . . . . . . . .151516181920222223第3 章管理库 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .创建用户库 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

9、 . . . . . . .添加谱图至用户库 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .编辑用户库 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .编辑谱图信息 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .添加化学结构至库条目 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .添加其他化合物至用户库 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .管理 NIST 库 .

10、. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .252629303032374243434445添加库删除库库. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .将库转化为其它格式. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .T

11、hermo Scientificiii创建和检索库用户手册ii 目录第4 章检索库 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .自定义检索 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .添加要检索的用户库 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .限定库检索 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .通过 ID 号检索用户库条目 . . . . . . . . .

12、 . . . . . . . . . . .设置 Library Search Option 参数 . . . . . . . . . . . . . . . . .提交谱图至库检索 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .限定库检索 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .474849505152545556565758596061626469717376应用量限定 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .应用其它数据库

13、限定 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .应用名称片段限定 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .应用元素限定 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .应用质谱峰限定 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .选择需检索的库 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .设置自动库检索 . . . . . . . . . . . .

14、. . . . . . . . . . . . .在 Qual 视图中指定检索参数 . . . . . . . . . . . . . . . . . . .为库检索指定报告选项 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .在 Sequence Setup 中指定原始数据文件 . . . . . . . . . . . . . .处理原始文件并打印报告 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .从 Qual Browser 执行库检索 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .利用

15、 Library Browser 检索库 . . . . . . . . . . . . . . . . . . .附录 A库样品报告 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .利用 Sequence Setup 获取库检索报告 . . . . . . . . . . . . . . . .利用 Qual Browser 获取库检索报告 . . . . . . . . . . . . . . . . .利用 Library Browser 获取库检索报告 . . . . . . . . . . . . . . .83839495附

16、录 BAMDIS 化合物鉴定. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .AMDIS 概况. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .应用 AMDIS 实现化合物自动鉴定 . . . . . . . . . . . . . . . . . .Results 窗口. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .97979798Confirm 窗口. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

17、 . . . .100附录 C库参考指南 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .0008.113.114Library Manager框. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Convert Libraries 页面. . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Manage Libraries 页面 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Librar

18、y Search Options框 . . . . . . . . . . . . . . . . .Search 页面 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Libraries 页面. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Automation 页面 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Limits 页面 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Library Searc

19、h Constraints 页面 （Library 视图） . . . . . . .Spectrum Information框 . . . . . . . . . . . . . . . . . .Library Search Results 窗口 . . . . . . . . . . . . . . . . . .索引 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .117ivThermo Scientific创建和检索库用户手册前言前言本 Thermo Xcalibur 质谱数据系统包含创建、检索和编辑库所需的所有软件。

20、本指南描述：如何为 MS、MS/MS 或 MSn 谱图创建并编辑自定义库如何管理多个库如何检索多个库若要对此文档作出评论，以下：在此先对您的帮助表示感谢。相关文档Thermo Fisher Scientific 为 Xcalibur 数据系统提供以下文档：Xcalibur Getting Started (Quantitative Analysis) （Xcalibur 入门手册 （定量分析）Acquisition and ProcessingUser Guide （和处理用户手册）QuantitativeAnalysis UserGuide （定量分析用户手册）QuanlitativeCre

21、ating andAnalysis UserGuide （定性分析用户手册）Searching Libraries User Guide （创建和检索库用户手册）XReport UserGuide （XReport 用户手册）软件提供 “Help” （帮助）功能Thermo Scientificv创建和检索库用户手册前言特殊注意事项确保您遵循本指南中发布的事先。在方框内出现的其他特别注意事项。其他特别注意事项包括下列内容：我们可以通过多种方式Thermo Fisher Scientific，获取所需信息。技术支持中心传真电子邮件知识库us.techsupport.analyze若要更新和配套软

22、件，请： 。客户服务中心，获取订购信息传真电子邮件us.customer-support.analyze获取本地销售或服务信息请从互联网手册，同意相关条款和条件，然后单击窗口左侧空白处的Customer Manuals （用户手册）。viThermo Scientific创建和检索库用户手册提示 强调能够帮助简化工作的信息。注释 强调普遍关注的信息。重要信息 强调防止软件损害、数据丢失或无效测试结果必需的信息；或可能包含获得系统最佳性能的重要信息。注意事项 强调对、或环境可能会造成危害。每个 “ 注意 ” 事项都会标有适当的 “CAUTION” 符号。前言对文档或 “ 帮助 ” 提出更改建议填

23、写读者问卷。向技术编辑电子邮件，邮箱地址为techpubs-lcms。Thermo Scientific创建和检索库用户手册vii1Library Browser 概述本章节简要概述 Library Browser （库浏览器）， 器）中导出的数据及如何创建并维护用户库。如何利用 Qual Browser （定性浏览利用 Xcalibur Library Browser 可以完成以下任务：创建谱图库，包括 MS/MS 碎裂谱图库。利用 Library Browser 对 MS/MS 碎裂谱图自动进行后的库检索。由数据系统中的 Qual Broswer 直接运行检索，或利用定性处理方法通过 Se

24、quence Setup （序列设置）窗口中的批处理数据文件直接自动运行。“Library Browser 处理概述 ” 页码为 2 总结创建、编辑及检索用户库和打印结果报告的步骤。本章节同时提供在执行库检索为 Xcalibur 数据系统选择峰检测算法方面的信息。 术质谱检索库系统 ) 同义，代表 NIST MS 检索桌面。Thermo Scientific创建和检索库用户手册1注释 在本指南中 , 术语 Library Browser 和术语 NIST MS Search（美国标准和技目录 Library Browser 处理概述 关于 Library Browser Library Bro

25、wser 窗口1 Library Browser 概述Library Browser 处理概述LibraryBrowser 处理概述图1 总结利用 Xcalibur 数据系统创建、检索库及打印报告的步骤。当使用 Library Browser 创建用户自定义 MS/MS 或 MSn 谱图库时，一次可创建一个条目。若要将谱图添加到一个库条目中，首先在 Qual Browser 中显示定性 .raw 文件数据。随后，在 Qual Browser 中，可以通过平均几次扫描结果和扣除背景扫描的方法来优化谱图。谱图优化完成后，即可将其导出至 Library Browser。有“ 添加谱图至用户库 ” 页

26、码为 29。过程的详细信息，请参阅当谱图被导入 Library Browser 后，即可编辑谱图信息。例如：可改变条目的名称、指定量及 CAS （美国化学）登记号。也可以在库条目中添加化学结构或者选择需包含在内的比。有关详细信息，请参阅 “ 管理库” 页码为 25。最后，Xcalibur 数据系统提供三种库检索和打印自定义报告的方法。自动利用 Sequence Setup 中的原始 (.raw) 和结果 (.rst) 文件 （有关详细信息，请参阅 “ 设置自动库检索 ” 页码为 61 ）手动利用 Qual Browser 中的单个谱图 （有关详细信息，请参阅 “ 从 Qual Browser

27、执行库检索 ” 页码为 73）手动利用导入到 Library Browser 中的单个谱图 （有关详细信息，请参阅 “ 利用Library Browser 检索库 ” 页码为 76）可以利用 Processing Setup （处理设置）窗口中的 Qual （定性）页面选项指定一个自动打印报告的处理方法。然后参考这一处理方法对 Sequence Setup 中文件进行排序。当排序完成后，数据系统便打印报告。有关 Processing 和 Sequence Setup 的信息，请参阅 the Acquisition and Processing User Guide （和处理用户手册）也可通过创

28、建处理设置自动将谱图添加到库中。若手动检索匹配单个谱图的检索结果，请在 Qual Browser 或 LibraryFile （文件）> Print （打印）命令来打印结果报告。Browser 中点击2Thermo Scientific创建和检索库用户手册重要信息 对 MS/MS 和 MSn 谱图，切勿删除由数据系统检测到的任何质量数，特定的质荷比是鉴定化合物的基础，而非它的强度。1Library Browser 概述关于Library Browser图 1. Library Browser 处理概述创建库谱创建一个库或添加至一个已的库搜索库并打印报告自动使用 .raw 和 .rst 文

29、件手动使用单个谱图关于 Library BrowserXcalibur 数据系统利用美国系统包含多达三个不同的库：标准和技术（NIST）质谱检索库系统。本2000 版 NIST/EPA/NIH 质谱库包含超过 147000 个化合物 （可选）NIST/EPA/NIH Selected Replicates 质谱库包含 27750 个谱图 （可选）默认用户库，NISTDEMONIST 库提供广泛的化学名称集合美国化学（CAS）登记号式及质量化学结构Thermo Scientific3创建和检索库用户手册打印报告指定库选项；检索在 Qual Browser 中打开原始文件并显示谱图将谱图导出至Li

30、brary Browser打印报告指定库选项；检索批处理：选择打印报告在 Sequence Setup 中指定顺序在 Processing Setup 中指定检索参数添加其它谱图至库中添加结构 （可选）为新建库命名或选择一个已的库在 Library Browser 中指出条目名、CAS 号和 MW。将谱图导出到Library Browser 中显示谱图在 Qual Browser 中打开 .raw 文件1 Library Browser 概述Library Browser 窗口可通过谱图来创建用户库从 Qual Browser 导出通过处理方法自动导出来源于其它文件，包括文本文件本程序以多种不

31、同的方式进行检索：检索出与所提交谱图匹配度最高的标准谱图。找出具有指定特征的谱图或化合物 （例如特征峰等）。显示所选的质谱。LibraryBrowser 窗口Library Browser 包含 5 个主要窗口，分别在窗口底部设有：Library Search 窗口Other Search 窗口Name Search 窗口Compare 窗口Librarian 窗口每个窗口的描述如下。请在屏幕底部选择合适的显示指定的窗口。4Thermo Scientific创建和检索库用户手册1Library Browser 概述Library Browser 窗口Library Search 窗口Libra

32、ry Browser 中的 Library Search 窗口 （请参阅图 2）具有 8 个窗格 :Spec list （谱图列表）Histogram （柱状图）用于保存导入的感的谱图和数据库谱图的 “ 便笺本 ”图表显示随匹配因子变化的匹配数。点击柱体，更改显示在其它窗口中的信息。数据库中与未知物相似的化合物列表Search results (Hit list)（检索结果 （目标列表）Plot of Search Spectrum（检索谱图）Text of Search Spectrum（检索谱图文本）Difference (Compare Result) （差异 （比较结果）Plot of

33、 Hit （目标谱图）Hit Text Information （目标文本信息）待分析谱图关于待分析谱图的文本显示第一个谱图 （上方）和第二个谱图 （下方）对应峰差异的图表检索结果的谱图检索结果的文本信息Thermo Scientific5创建和检索库用户手册1 Library Browser 概述Library Browser 窗口图 2. LibrarySearch 窗口检索谱图检索谱图文本谱图列表柱状图检索结果列表目标谱图目标文本使用 SpecList 窗格当进行以下任一操作时，Library 窗口的 Spec List 窗格中。Browser （库浏览器）可将谱图保LibrarySea

34、rch从 Qual Browser （定性浏览器）中导出谱图利用 File > Open 命令从其他文件导入谱图从库中获取一个谱图浏览器可通过首字母辨别任一谱图列表的来源：(T)(E)(M)(R)(U)谱图直接来自在 Qual Browser 中导出的文本文件谱图由 Editor （编辑器）或 User Library Manager （用户库管理器）创建谱图来自于 NIST/EPA/NIH 谱图来自于 NIST/EPA/NIH谱库来自于用户库Main LibraryReplicates Library6Thermo Scientific创建和检索库用户手册1Library Browse

35、r 概述Library Browser 窗口 将 Spec List 中的谱图提交至 Library Browser 进行检索1. 设置 Library Search 选项请参阅 “ 自定义检索 ” 页码为 48。2. 双击谱图名称。浏览器在检索结果 （Hit List）窗格中显示所有的检索结果 （如下所示）。在 Compare 窗格中比较 Spec List 中的谱图若要将 Spec List 窗格中的条目转移至 Compare （比较）窗口，双击该条目。请参阅“在Compare 窗口中显示谱图 ” 页码为 10。使用 Hit List 窗格在 Library Search 窗口的 Hit

36、List 窗格中，按与未知谱图的匹配度由高到低的顺序显示库谱。每个检索结果按照序号、正反向匹配因子和库标识符进行排列：(M) 指 MAIN NIST 库(R) 指 Replicates 库(U) 指用户库单击检索结果中的任一名称，在 Plot 窗格中显示它的谱图和结构，并在 Text 窗格中显示描述该条目的文本信息。该谱图同时出现在 Compare 窗口中。Plot 和 Text 窗格Plot （谱图）窗格可显示如下信息：或选定比范围的展开谱图 化合物结构 （）Text （文本）窗格可显示如下信息：化合物信息：名称、式、量、CAS 号、NIST 库号、ID 号和检索库质谱图上最大的 10 个峰

37、谱库中使用的其它名称Thermo Scientific7创建和检索库用户手册1 Library Browser 概述Library Browser 窗口OtherSearch 窗口Library Browser （库浏览器）中的 Other Search （其它检索）窗口 （请参阅图 3) 可执行基于以下字段的检索 :Formula （式）ID number （ID 号）Molecular weight （量）Any peaks （任）CAS Registry number （CAS 登记号）Sequential method （序列方法）NIST library number （NIST 库

38、号）通过在窗口左上角的检索类型列表中选择合适的选项或在 Search （检索）菜单中使用合适令来进行检索。有关修改检索的详细信息，请参阅 “ 检索库 ”图 3. Other Search 窗口页码为47。Name Search 窗口 在 NIST 库中检索化合物名称或文本片段1. 在位于 Name Search （名称检索）窗口左上角的表格中输入检索名称，例如( 请参阅图 4)。PACETOXcalibur 数据系统可在 Name Search 窗口的窗格中显示谱图、结构和文本信息。2. 右击一个条目。从快捷菜单中选择 Library Search （库检索）。浏览器可将化合物的具体信息载入

39、Compare 窗口和 Library Search 窗口的 Plot、Text、Compare 和 Hit List 窗格中。默认名称检索模式接受字母 （a-z）或数字 （0-9）。标点符号和空格可忽略 （例如：1- butene 和 1butene 一致）。希腊字母必须要拼写完整 （例如：alpha）。8Thermo Scientific创建和检索库用户手册1Library Browser 概述Library Browser 窗口图 4.Namesearch 窗口如果选择 ato z only, no prefix，浏览器仅接受字母检索，并忽略常用前缀 （如：cis，trans，dl，di

40、，和 tri）、数字和希腊字母。在此模式下，输入 butene 可检索出 1-butene 和 cis2-butene。Thermo Scientific9创建和检索库用户手册1 Library Browser 概述Library Browser 窗口Compare 窗口Compare 窗口仅用以进行谱图的比较 无检索能力。它支持任何组别的谱图的比较，与Library Search 窗口不同，它可以显示多个谱图。Compare 窗口中包含三个窗格。上窗格显示谱图，中窗格为标准差显示窗格，下窗格显示来自 Hit List 的谱图。图 5.Compare 窗口Compare 窗口使用如下标准差显示

41、选项：Difference（差异）显示第一个 （上方）谱图和第二个 （下方）谱图以及两个质谱图中峰的差异。Head to Tail（头对尾）仅显示比较的两个谱图。在普通坐标轴上，第一个谱图朝向往上，第二个谱图朝向往下。Side by Side（肩并肩）仅显示相邻的两个谱图。Subtraction（扣除）创建一个在第一个谱图基础上扣除第二个谱图所得的差谱。在 Compare 窗口中显示谱图 在上窗格中添加谱图1. 双击 Library Search 窗口 Spec List 窗格中的条目，或选中 Spec List 或 Hit List 中的一个条目。2. 右击该条目，然后从快捷菜单中选择 Co

42、py （）。3. 在上窗格中粘贴谱图：返回 Compare 窗口，从快捷菜单中选择 Paste （粘贴）。格式化 Compare 窗口 格式化 Compare 窗口在窗格中右击，然后在快捷菜单中选择 Properties （性质）。Compare ToolProperties （比较工具性质）框打开。10Thermo Scientific创建和检索库用户手册1Library Browser 概述Library Browser 窗口图 6.CompareToolProperties可以在 Compare Tool Properties框中更改选项参数。Plot page （谱图页面）：指定谱图查

43、看参数Comp.Result （比较结果）：指定比较查看参数Comp.List （比较列表）：指定比较列表参数最佳库检索目标：自动将 Hit List 顶端的目标谱图数量比较列表中。覆盖列表中的内容：自动将列表中的内容覆盖为新信息。若不选择该选项，数据将会被添加至比较列表中。No structures （无化学结构）：Compare 窗口中不包含结构。Spectra per page （每页谱图数）：指定在 Compare 窗口底部显示的比较列表中结构的数量。Librarian 窗口Librarian （库管理员）窗口是 Library Browser （库浏览器）的用户库管理员。利用它可创建

44、用户库并在其中添加谱图文件和化合物信息。也可利用 Librarian 窗口来创建、保存和编辑文本文件、保存质谱及编辑化合物 ID 信息。Thermo Scientific创建和检索库用户手册111 Library Browser 概述Library Browser 窗口图 7.Librarian 窗口Librarian 被分为三个窗格：Spec List （谱图列表）显示分析中的所有文件名，包括结构和化学式 （当上述信息时）。Plot （图表）窗格显示 Spec List 中一个文件的谱图Text （文本）窗格显示 Spec List 中所选文件的详细文本信息删除谱图单击并在列表中删除谱图及其

45、它相关库信息。添加谱图单击并将列表中突出显示的谱图添加至指定的用户库中。移除谱图单击并将列表中突出显示的谱图删除，将其转移至指定的用户库中。删除用户库单击并删除整个用户库。12Thermo Scientific创建和检索库用户手册1Library Browser 概述Library Browser 窗口单击 Add to Library （添加至库）按钮打开显示可用用户库的框。选择命令所需的库。当添加或转移一个谱图时，要求，请输入新建库名称。图 8.选择库并粘贴至框框包含管理单个库条目的按钮：单击 New （新建）来创建一个新的库条目。单击 Edit （编辑）来更改谱图信息框中的现有库条目。T

46、hermo Scientific创建和检索库用户手册132添加一个谱图至库中利用 Qual Browser （定性浏览器）窗口，创建 MS 或 MS/MS （或 MSn）质谱数据的库条目。本部分操作使用类固醇数据。Xcalibur 数据系统将原始数据文件保C:Xcaliburexamplesdata 目录下。若要手动创建一个库条目，请完成以下操作：Browser 窗口中打开原始数据文件 （.raw）利用 Qual Browser 窗口查看原始数据。打开数据文件，展开 Qual Browser 菜单栏。在 Qual 若要显示类固醇数据文件中的原始数据1. 在计算机桌面上双击或者选择 Start

47、（开始）> Programs （程序）>ThermoXcalibur > Xcalibur，显示 Xcalibur 主页。2. 在 Xcalibur 主页上单击，显示 Qual Browser 窗口。3. 选择 File （文件）> Open （打开）或单击工具栏上。显示 Open Raw File（打开原始文件）框。4. 浏览原始文件位置并选中文件。5. 单击 Open。数据文件的色谱图和一级质谱图打开 （请参阅图 9）。Thermo Scientific15创建和检索库用户手册目录 在 Qual Browser 窗口中打开原始数据文件 （.raw） 在 Qual B

48、rowser 窗口中查看谱图 背景谱图 从 Xcalibur 数据系统中导出谱图2 添加一个谱图至库中在Qual Browser 窗口中查看谱图在 QualBrowser 窗口中查看谱图利用 Qual Browser 窗口中的活动窗格，查看质谱图。 若要在含四窗格的窗口中显示原始数据的质谱图1. 确认数据系统显示和 图9 相似的色谱图。若未能查看色谱图，请按如下操作：a.b.c.d.选中一个窗格。应用程序默认同时显示色谱图和质谱图。选择 View Spectrum （查看谱图）。选择 Grid （栅格）> Delete （删除）> All Cells （所有窗格），删除色谱图。选择

49、 View （查看），清除 Specturm （谱图）之外的所有条目，将色谱图展开至Qual Browser 全窗口。e.若要扩大窗口显示区域，请单击窗口右上角。图 9.在 QualBrowser 窗口中，显示原始文件色谱图。2. 打开窗格，在栅格内四个窗格中显示原始数据( 如图 10 所示 ):a.选择 Grid （栅格）>个窗格。选择 Grid （栅格）>四个窗格。InsertCells （窗格）>Left （左），在窗口中显示两b.InsertCells （窗格）>below （下），在窗口中显示16Thermo Scientific创建和检索库用户手册2添加一个

50、谱图至库中在Qual Browser 窗口中查看谱图图 10 显示以下页面 （左下角顺时针方向）：Scan Filter （扫描过滤器）视图、（已过滤）Chromatogram （色谱图）视图，（平均）Spectrum （质谱图）视图及 （未过滤）色谱图视图。Qual Browser 窗口图 10.色谱图视图 （已过滤）质谱图视图 （平均）扫描过滤器视图色谱图视图 （未过滤）3. 若要显示扫描过滤器数据，单击左下方窗格并选择 View > Scan Filters。该窗格列出了在指定时间范围内总离子流 （TIC）色谱图包含的过滤器。4. 若要在左上方窗格中显示质量范围色谱图：a.b.单击

51、右上方激活一个窗格。单击并按住列表中的条目。Xcalibur 应用程序将条目置于方框中间，并显示一个页面光标。c.将页面光标拖曳至左上方窗格中，并并显示质量范围色谱图。鼠标按钮。该应用程序自动使用过滤器，Thermo Scientific创建和检索库用户手册172 添加一个谱图至库中背景谱图5. 若要在右上方窗格显示平均质谱图：a.b.c.d.单击右上方激活一个窗格。选择 View > Spectrum，显示质谱图。单击并按住左上方窗格内色谱峰左边区域的位置。按住鼠标左键拖曳光标水平穿过谱峰，然后鼠标按钮。Xcalibur 数据系统即会在右上方窗格中显示质谱图。该谱图为选定保留时间范围内

52、的平均扫描质谱图。 例如：见图 10 中右上方窗格。背景谱图本主题详述如已显示的谱图中扣除背景，获得最关键的谱图。使用背景扣除工具扣除背景光谱18Thermo Scientific创建和检索库用户手册2添加一个谱图至库中背景谱图使用背景扣除工具 若要更改库检索列表1. 在 Qual Browser （定性浏览器）窗口中选择 Tools （工具）> BackgroundSubstract（背景扣除），打开 Substract Background （扣除背景）框。图 11.SubtractBackground框2. 在 File （文件）框内键入输入文件的路径，或单击 Browse （浏览

53、），利用 Open （打开）框找到文件，选择导入文件。3. 若要选择检测器，利用 Single Detector （单检测器）列表识别来自于所需检测器源的数据。若要使用原始文件中的所有检测器测器）复选框。数据，选择All Detectors （所有检4. 若要选择扫描过滤器，单击 Filter （过滤器）箭头，显示保器选项。随后，选择过滤器。.raw 文件中的过滤5. 若要选择背景文件，在 File 内输入背景文件的路径，或单击Browse （浏览），利用Open （打开）框找到文件。6. 选择扣除背景文件的操作范围 : 若要从导入文件中扣除整个背景文件，选择 Subtract Whole File （扣除全文件）选项。 若要在导入文件每次扫描的背景文件