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文档简介

1、鼠T细胞抗原识别受体v5.2核酸序列分析软件功能BLAST是基础局域联培搜索工具（basic local alignment search tool）的缩写，是目前最常用的数据库比对程序。在运行时，根据分析的数据类型和要求搜素数据库类型。以及是否把核酸序列翻译成蛋白质，选用不同的BLAST程序程序名称查询序列搜素的数据库BLASTN核酸核酸BLASTP蛋白质蛋白质BLASTX核酸的6个读框蛋白质TBLASTN蛋白质核酸的6个读框TBLASTX核酸的6个读框核酸的6个读框比对返回的结果，与查询序列的相似程度用期待值E值表示。只有搜素时找到的期待值比E值小的序列才作为结果返回。操作过程Tcrb-v

2、5.2的获得：进入NCBI首页（）选择Protein,输入T-cell receptor beta, variable 5.2search点击进入即出现所需序列Tcrb-5.2核酸序列ORIGIN 1 msntvladsa wgitllswvt vfllgtssad sgvvqsprhi ikekggrsvl tcipisghsn 61 vvwyqqtlgk elkfliqhye kverdkgflp srfsvqqfdd yhsemnmsal eledsamyfc 121 assl/Tcrb-v5.2核酸序列的比对分析：1 进入NCBI/BLAST页面（/）点击进入2 选择protien blast进入3 输入核酸序列，选择nr，物种输入mouse点击搜索4 搜索结果结果分析 对比得到的分值，分值 比值越小， 越大，表示匹配程度越高 匹配程度越高 BLAST与FASTA比较 BLAST和FASTA都有多种工作方式，主要区别在于搜索数据库种类不同。 一般认为，BLAST运行的速度较快，对蛋白序列的比较更有效；而FASTA运行速度比较慢但对核酸更敏感。 BLAST需要根据分析数据类型和要求搜索数据库类型等选择不同的BLAST程序，FASTA服务器可自动根据提交的序列的字母类型判断是蛋白

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