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文档简介

1、.第第 一一 节节 .l 三种三种RNAmRNA(messenger RNA, 信使信使RNA)rRNA(ribosomal RNA, 核蛋白体核蛋白体RNA)tRNA(transfer RNA, 转移转移RNA). 遗传学将编码一个多肽的遗传单位称为遗传学将编码一个多肽的遗传单位称为顺反顺反子子(cistron)。 原核细胞中数个结构基因常串联为一个转录原核细胞中数个结构基因常串联为一个转录单位,转录生成的单位,转录生成的mRNA可编码几种功能相可编码几种功能相关的蛋白质,为关的蛋白质,为多顺反子多顺反子(polycistron) 。 真核真核mRNA只编码一种蛋白质,为只编码一种蛋白质,为

2、单顺反子单顺反子(single cistron) 。原核生物的多顺反子原核生物的多顺反子真核生物的单顺反子真核生物的单顺反子非编码序列非编码序列核蛋白体结合位点核蛋白体结合位点起始密码子起始密码子终止密码子终止密码子编码序列编码序列PPP5 3 蛋白质蛋白质PPPmG -5 3 蛋白质蛋白质.l mRNA上存在遗传密码上存在遗传密码mRNA分子上从分子上从5 至至3 方向,由方向,由AUG开开始,每始,每3个核苷酸为一组,决定肽链上某一个核苷酸为一组,决定肽链上某一个氨基酸或蛋白质合成的起始、终止信号,个氨基酸或蛋白质合成的起始、终止信号,称为称为三联体密码三联体密码(triplet code

3、n)。起始密码起始密码(initiation coden): AUG 终止密码终止密码(termination coden): UAA,UAG,UGA 第三字母UCAGUCAGUCAGCUAG.l遗传密码的特点遗传密码的特点编码蛋白质氨基酸序列的各个三联体密编码蛋白质氨基酸序列的各个三联体密码连续阅读,密码间既无间断也无交叉。码连续阅读,密码间既无间断也无交叉。 .基因损伤引起基因损伤引起mRNA阅读框架内的碱基发生阅读框架内的碱基发生插入或缺失,可能导致框移突变插入或缺失,可能导致框移突变(frameshift mutation)。 遗传密码中,除色氨酸和甲硫氨酸仅遗传密码中,除色氨酸和甲硫

4、氨酸仅有一个密码子外,其余氨基酸有有一个密码子外,其余氨基酸有2、3、4个或多至个或多至6个三联体为其编码。个三联体为其编码。.转运氨基酸的转运氨基酸的tRNA的反密码需要通过的反密码需要通过碱基互补与碱基互补与mRNA上的遗传密码反向配对结上的遗传密码反向配对结合,但反密码与密码间不严格遵守常见的碱合,但反密码与密码间不严格遵守常见的碱基配对规律,称为摆动配对。基配对规律,称为摆动配对。 U摆动配对摆动配对. 不同细胞核蛋白体的组成不同细胞核蛋白体的组成 原核生物翻译过程中核蛋白体结构模式原核生物翻译过程中核蛋白体结构模式:A位:氨基酰位位:氨基酰位(aminoacyl site)P位:肽酰

5、位位:肽酰位(peptidyl site)E位:排出位位:排出位(exit site).反密码环反密码环氨基酸臂氨基酸臂.氨基酸氨基酸 + tRNA氨基酰氨基酰- tRNAATP AMPPPi氨基酰氨基酰-tRNA合成酶合成酶(一)(一)氨基酰氨基酰-tRNA合成酶合成酶(aminoacyl-tRNA synthetase)l 氨基酸的活化氨基酸的活化第一步反应第一步反应氨基酸氨基酸 ATP-E 氨基酰氨基酰-AMP-E AMP PPi第二步反应第二步反应氨基酰氨基酰-AMP-E tRNA 氨基酰氨基酰-tRNA AMP E.tRNA氨基酰氨基酰-tRNA合成酶合成酶ATP.(二)(二)起始肽

6、链合成的氨基酰起始肽链合成的氨基酰-tRNA.第第 二二 节节 .整个翻译过程可分为整个翻译过程可分为 :翻译过程从阅读框架的翻译过程从阅读框架的5 -AUG开始,按开始,按mRNA模板三联体密码的顺序延长肽链,直模板三联体密码的顺序延长肽链,直至终止密码出现。至终止密码出现。 .原核、真核生物各种起始因子的生物功能原核、真核生物各种起始因子的生物功能 促进核蛋白体分离成大小亚基促进核蛋白体分离成大小亚基eIF-6促进各种起始因子从小亚基解离,进而结合大亚基促进各种起始因子从小亚基解离,进而结合大亚基eIF-5eIF-4F复合物成分,结合复合物成分,结合eIF-4E和和PABeIF-4GeIF

7、-4F复合物成分,结合复合物成分,结合mRNA5帽子帽子eIF-4E结合结合mRNA,促进,促进mRNA扫描定位起始扫描定位起始AUGeIF-4BeIF-4F复合物成分,有解螺旋酶活性,促进复合物成分,有解螺旋酶活性,促进mRNA结结合小亚基合小亚基IF-4A最先结合小亚基促进大小亚基分离最先结合小亚基促进大小亚基分离eIF-2B,eIF-3促进起始促进起始tRNA与小亚基结合与小亚基结合eIF-2真核真核生物生物促进大小亚基分离,提高促进大小亚基分离,提高P位对结合起始位对结合起始tRNA敏感性敏感性EIF-3促进起始促进起始tRNA与小亚基结合与小亚基结合EIF-2占据占据A位防止结合其他

8、位防止结合其他tRNAIF-1原核原核生物生物生物功能生物功能起始因子起始因子促进核蛋白体分离成大小亚基促进核蛋白体分离成大小亚基eIF-6促进各种起始因子从小亚基解离,进而结合大亚基促进各种起始因子从小亚基解离,进而结合大亚基eIF-5eIF-4F复合物成分,结合复合物成分,结合eIF-4E和和PABeIF-4GeIF-4F复合物成分,结合复合物成分,结合mRNA5帽子帽子eIF-4E结合结合mRNA,促进,促进mRNA扫描定位起始扫描定位起始AUGeIF-4BeIF-4F复合物成分,有解螺旋酶活性,促进复合物成分,有解螺旋酶活性,促进mRNA结结合小亚基合小亚基IF-4A最先结合小亚基促进

9、大小亚基分离最先结合小亚基促进大小亚基分离eIF-2B,eIF-3促进起始促进起始tRNA与小亚基结合与小亚基结合eIF-2真核真核生物生物促进大小亚基分离,提高促进大小亚基分离,提高P位对结合起始位对结合起始tRNA敏感性敏感性EIF-3促进起始促进起始tRNA与小亚基结合与小亚基结合EIF-2占据占据A位防止结合其他位防止结合其他tRNAIF-1原核原核生物生物生物功能生物功能起始因子起始因子.IF-3IF-11. 核蛋白体大小亚基分离核蛋白体大小亚基分离A U G53IF-3IF-12. mRNA在小亚基定位结合在小亚基定位结合.IF-3IF-1IF-2GTP3. 起始氨基酰起始氨基酰t

10、RNA( fMet-tRNAimet )结合到结合到小亚基小亚基A U G53IF-3IF-1IF-2GTPGDPPi4. 核蛋白体大亚基结合,起始复合物形成核蛋白体大亚基结合,起始复合物形成A U G53IF-3IF-1A U G53IF-2GTPIF-2-GTPGDPPi.mRNA eIF-6 GDP+PielF-5ATPADP+PielF4E, elF4G, elF4A, elF4B,PABMetMet-tRNAiMet-elF-2 -GTP真核生物翻译起始真核生物翻译起始复合物形成过程复合物形成过程.肽链合成的延长因子肽链合成的延长因子 (一)进位(一)进位指根据指根据mRNA下下一组

11、遗传密码指导,一组遗传密码指导,使相应氨基酰使相应氨基酰-tRNA进入核蛋白体进入核蛋白体A位。位。.延长因子延长因子EF-T催化催化进位(原核生物)进位(原核生物).Tu TsGTPGDPA U G53TuTsGTP.是由转肽酶是由转肽酶(transpeptidase)催化的肽键催化的肽键形成过程。形成过程。.fMetA U G53fMetTuGTP.进进位位转转位位成肽成肽.真核生物肽链合成的延长过程与原核基本相真核生物肽链合成的延长过程与原核基本相似,但有不同的反应体系和延长因子。似,但有不同的反应体系和延长因子。另外,真核细胞核蛋白体没有另外,真核细胞核蛋白体没有E位,转位时位,转位时

12、卸载的卸载的tRNA直接从直接从P位脱落。位脱落。(四)真核生物延长过程(四)真核生物延长过程.当当mRNA上终止密码出现后,多肽链合成上终止密码出现后,多肽链合成停止,肽链从肽酰停止,肽链从肽酰-tRNA中释出,中释出,mRNA、核、核蛋白体等分离,这些过程称为肽链合成终止。蛋白体等分离,这些过程称为肽链合成终止。.终止相关的蛋白因子称为释放因子终止相关的蛋白因子称为释放因子 (release factor, RF) 一是识别终止密码,如一是识别终止密码,如RF-1特异识别特异识别UAA、UAG;而;而RF-2可识别可识别UAA、UGA。二是诱导转肽酶改变为酯酶活性,相当于催化二是诱导转肽酶

13、改变为酯酶活性,相当于催化肽酰基转移到水分子肽酰基转移到水分子-OH上,使肽链从核蛋上,使肽链从核蛋白体上释放。白体上释放。 释放因子的功能释放因子的功能原核生物释放因子:原核生物释放因子:RF-1,RF-2,RF-3 真核生物释放因子:真核生物释放因子:eRF .原原核核肽肽链链合合成成终终止止过过程程 U A G53COO-.使蛋白质合成高速、使蛋白质合成高速、高效进行。高效进行。电镜下的多聚核蛋白体现象电镜下的多聚核蛋白体现象.第第 三三 节节.1. 热休克蛋白热休克蛋白(heat shock protein, HSP) HSP70、HSP40和和GreE族族 2. 伴侣素伴侣素(cha

14、peronins) GroEL和和GroES家族家族分子伴侣分子伴侣分子伴侣是细胞一类保守蛋白质,可识别分子伴侣是细胞一类保守蛋白质,可识别肽链的非天然构象,促进各功能域和整体蛋白肽链的非天然构象,促进各功能域和整体蛋白质的正确折叠。质的正确折叠。 热休克蛋白促进蛋白质折叠的基本作用热休克蛋白促进蛋白质折叠的基本作用结合保护待折叠多肽片段,再释放该片段进结合保护待折叠多肽片段,再释放该片段进行折叠。形成行折叠。形成HSP70和多肽片段依次结合、解离和多肽片段依次结合、解离的循环。的循环。 HSP40结合待结合待折叠多肽片段折叠多肽片段 HSP70-ATP复合物复合物 HSP40- HSP70-

15、ADP-多肽复合物多肽复合物 ATP水解水解GrpE ATPADP复合物解离,释出多肽链片段进行正确折叠复合物解离,释出多肽链片段进行正确折叠 .伴侣素伴侣素GroEL/GroES系统促进蛋白质折叠过程系统促进蛋白质折叠过程 伴侣素的主要作用伴侣素的主要作用为非自发性折叠蛋白质提供能折叠形成天然为非自发性折叠蛋白质提供能折叠形成天然空间构象的微环境。空间构象的微环境。 .蛋白二硫键异构酶蛋白二硫键异构酶 多肽链内或肽链之间二硫键的正确形成对稳多肽链内或肽链之间二硫键的正确形成对稳定分泌蛋白、膜蛋白等的天然构象十分重要,这定分泌蛋白、膜蛋白等的天然构象十分重要,这一过程主要在细胞内质网进行。一过

16、程主要在细胞内质网进行。 二硫键异构酶在内质网腔活性很高,可在较二硫键异构酶在内质网腔活性很高,可在较大区段肽链中催化错配二硫键断裂并形成正确二大区段肽链中催化错配二硫键断裂并形成正确二硫键连接,最终使蛋白质形成热力学最稳定的天硫键连接,最终使蛋白质形成热力学最稳定的天然构象。然构象。.肽肽-脯氨酰顺反异构酶脯氨酰顺反异构酶 多肽链中肽酰多肽链中肽酰- -脯氨酸间形成的肽键有顺反两脯氨酸间形成的肽键有顺反两种异构体,空间构象明显差别。种异构体,空间构象明显差别。 肽酰肽酰- -脯氨酰顺反异构酶可促进上述顺反两种脯氨酰顺反异构酶可促进上述顺反两种异构体之间的转换。异构体之间的转换。 肽酰肽酰-

17、-脯氨酰顺反异构酶是蛋白质三维构象形脯氨酰顺反异构酶是蛋白质三维构象形成的限速酶,在肽链合成需形成顺式构型时,可成的限速酶,在肽链合成需形成顺式构型时,可使多肽在各脯氨酸弯折处形成准确折叠。使多肽在各脯氨酸弯折处形成准确折叠。 .NC信号肽信号肽PMOCKRKR103肽肽 ( ?)ACTH -LT -MSH -MSHEndophin. 蛋白质的靶向输送蛋白质的靶向输送(protein targeting). 信号序列信号序列(signal sequence).靶向输送蛋白的信号序列或成分靶向输送蛋白的信号序列或成分 .真核细胞分泌蛋白等前体合成后靶向真核细胞分泌蛋白等前体合成后靶向输送过程首先

18、要进入内质网。输送过程首先要进入内质网。 信号肽信号肽(signal peptide) 各种新生分泌蛋白的各种新生分泌蛋白的N端有保守的氨端有保守的氨基酸序列称信号肽。基酸序列称信号肽。 .信号肽引导真核分泌蛋白进入内质网信号肽引导真核分泌蛋白进入内质网 .第第 四四 节节.l抗生素抗生素(antibiotics)是微生物产生的能够杀灭或抑制细菌的是微生物产生的能够杀灭或抑制细菌的一类药物。一类药物。l抗代谢药物抗代谢药物指能干扰生物代谢过程,从而抑制细胞过指能干扰生物代谢过程,从而抑制细胞过度生长的药物,如:度生长的药物,如:6-MP。l 某些毒素也作用于基因信息传递过程。某些毒素也作用于基因信息传递过程。.抗生素抑制蛋白质生物合成的原理抗生素抑制蛋白质生物合成的原理 .四四环环素素族族氯霉素氯霉素链霉素和卡那霉素链

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