DNA启动子、终止子-文档资料

1、1如何分析基因序列中的启动子、外显子和内含子生命科学学院2启动子：RNA聚合酶特异性和结合的DNA序列。 启动子是基因的一个组成部分，控制基因表达的起始时间和表达的程度。外显子：断裂基因中的编码序列。外显子是真核生物基因的一部分，它在剪接后仍会被保存下来，并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。内含子：断裂基因的非编码区，可被转录，但在mRNA加工过程中被剪切掉，故成熟mRNA上无内含子编码序列。3怎样利用互联网中的网站或软件分析该序列中的外显子、内含子和启动子呢？现有人基因组中的一段序列GGTATGGGGCCAAGAGATATATCTT.4一、根据一段碱基序列一、根据一段碱基序列找到其对应

2、的基因名或找到其对应的基因名或其序列号其序列号5任选浏览器搜索“NCBI”找到后点击进入，出现如上界面点击“BLAST”（Basic Local Alignment Search Tool, BLAST）6当出现如上界面时，点击“nucleotide blast”7 打开页面后，在检索框中输入需要查找的序列，如图所示8根据索要查询的基因来源，选定需要查询的基因（人类基因）点击“BLAST”打开9u出现页面后向下滑动直至出现图1u寻找Ident(一致性）最高的一项u点击进入10点击进入后见 所查序列名称 以及序列号 据此进行操作11二、已知基因的基因名或序列号找到其启动子、外显子和内含子121

3、1、输入网址进入、输入网址进入UCSCUCSC网站网站132 2、点击、点击Genome BrowserGenome Browser143 3、点击进入后可看到以下页面、点击进入后可看到以下页面（1 1）选择是何种生物的基因（如人类，老鼠等）选择是何种生物的基因（如人类，老鼠等）（2）输入你所需要查询的基因名）输入你所需要查询的基因名称称输入完毕，点击输入完毕，点击SUBMITSUBMIT154 4、可看到以下页面、可看到以下页面（1 1）将）将Ensembl GenesEnsembl Genes设置为设置为densedense（显示）（显示）（2 2）点击）点击refreshrefresh1

4、65 5、可看到以下页面、可看到以下页面找到找到Ensembl Genes Ensembl Genes 点击所对应的序列图形点击所对应的序列图形176 6、可看到以下页面、可看到以下页面继续点击所对应的序列图继续点击所对应的序列图形形187 7、可看到以下页面、可看到以下页面选择选择Genomic Genomic Sequence Sequence198 8、可看到以下页面、可看到以下页面（2 2）选择表现形式（如）选择表现形式（如外显子大写，其余都小写）外显子大写，其余都小写）（1 1）根据需要选择所要展现）根据需要选择所要展现的内容（如外显子、内含子）的内容（如外显子、内含子）（3 3）点

5、击）点击submitsubmit209 9、可看到以下页面、可看到以下页面此为此为HBBHBB基因的全部序列基因的全部序列第一第一段段大写大写部分为第一部分为第一个个外显子外显子。第一个外显第一个外显子子前面的所前面的所有小写部分有小写部分为该序列的为该序列的启动子启动子。大写部分之大写部分之间间夹杂的小夹杂的小写部分写部分为该为该序列的序列的内含内含子子。21三、检验所得序列是目的序列221 1、验证、验证利用利用wordword输入我们所得到序列的第一个外显子输入我们所得到序列的第一个外显子的部分序列进行验证，看是否与原题序列匹配的部分序列进行验证，看是否与原题序列匹配23验证完成后，确认匹