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文档简介
1、 第二章 基因的概念和结构一、孟德尔的“遗传因子”-生物性状的遗传符号。二、基因-位于染色体上的遗传功能单位。 1909年,约翰逊首创了“基因”一词,用来代替孟德尔的遗传因子。 1926年,摩尔根提出基因的“三位一体”的概念,即基因是决定性状的最小单位、突变的最小单位、重组的最小单位。1、等位基因 一对同源染色体同一基因座上的一对基因称为一对等位基因。 等位基因之间存在着显隐性关系。(1)完全显性(2)不完全显性(3)共显性 2、复等位基因 一个群体中,一对同源染色体的同一基因座上有2个以上的等位基因。例如:(1)果蝇的眼色基因 用w代表果蝇的眼色基因,则:(2)ABO血型系统 人类的ABO血
2、型是由三个复等位基因IA 、IB 、i控制。IA 、IB对i 为显性, IA 、 IB之间为共显性。因此,A型血的个体,基因型可能为IA IA 、 IA i ;B型血的个体,基因型可能为IB IB 、 IB i;AB型血的个体,基因型只能为IA IB ;O型血的个体,基因型只能为i i.为显性。(3) 人白细胞抗原(HLA) 主要组织相容性抗原系统。 主要组织相容性复合体基因(MHC) 人类的MHC又称HLA,位于第6号染色体短臂上,长约4000Kb。按结构功能和组织分布情况的不同可分为三类: a. HLA-类基因 在远离着丝粒2000-4000Kb范围内,有A、B、C、E、F、G、H、J等基
3、因座,每个基因座又有几十个以上的等位基因。(P41 表3-3)b.HLA-类基因 在近着丝粒的1000Kb范围内,主要有DQ 、DR、DP等基因座,每个基因座又有几个、上百个基因。(P41 表3-3)c.HLA-类基因 在近着丝粒处1000Kb-2000Kb范围内,位于HLA-和HLA- 基因之间。该区已发现60多个基因座。 HLA是目前已发现的最复杂的复等位基因系统。对于每一个基因座上的复等位基因,它们之间均为共显性。 对于每一个人的某一条6号染色体,HLA各基因座紧密连锁,就构成了单倍型或单元型。 HLA是以单倍型方式遗传给下一代的。 同卵双生子之间, HLA单倍型完全相同;兄弟姐妹之间,
4、两个单倍型可能相同,也可能不同,通常情况下是一个相同,一个不同。三、 顺反子 一个基因一条多肽 1957年,Benzer以大肠杆菌T4噬菌体为材料, 研究了基因内部的精细结构,提出了顺反子、突变子、重组子的概念。1、 T4噬菌体简介 T4噬菌体为T-偶列噬菌体之一,基因组为165Kb的双链DNA分子,包括160个基因,宿主为E.coli。 (1)形态特征 (2)环状遗传学图 2. 顺反子(cistron)、突变子(muton)、重组子(recon) 通过实验和推导,Benzer提出了顺反子、突变子、重组子的概念。 顺反子是一个遗传功能单位,一个顺反子决定一条多肽链,顺反子即是基因的同义语。一个
5、顺反子内可以包含一系列突变单位-突变子。各突变子之间可以发生重组,顺反子内也有一系列的重组单位-重组子。2、重组(recombination )实验和 互补(complemetation)实验(1)重组实验 测定两个突变位点之间的距离关系的实验。 重组频率(%)= 2 野生型噬菌斑数 100% 噬菌斑总数(2)互补实验 确定两个突变之间的功能关系,判断两个突变是位于同一基因内的突变还是两个基因内的突变。 在反式测验中,如两个突变之间能互补,则表明两个突变是位于两个基因(顺反子)内的突变。如两个突变之间不能互补,则表明两个突变是位于同一个基因内的突变。四、操纵子(operon)-遗传信息传递和表
6、达调控 的统一体。1961,法国科学家F.Jacob和J.Monod提出了大肠杆菌乳糖操纵子模型。 操纵子模型的提出表明: 基因不仅是传递遗传信息的载体,同时又具有调节其它基因表达活性的功能。基因不仅在结构上可分,功能上也可分。 操纵子(operon):指几个功能上相近或相关的结构基因排列在一起,由一个共同的启动子、操纵子或其它调控序列来调控这些基因的转录。包括这些结构基因和控制区的整个核苷酸序列就称为操纵子。1、乳糖操纵子(lac-operon)乳糖操纵子的研究进展:(1)调控区的DNA序列a.启动子(promoter) 位于调节基因 LacI 末端与结构基因LacZYA mRNA转录起始位
7、点之间,长度约为82bp的一段DNA序列。 a) RNA聚合酶识别和结合部位: -10区: 序列特征 5-TATGTT-3 -35区: 序列特征 5-TTTACA -3 b)CAP结合位点: -70 至 -50 区 CAP(catabolite activator protein,分解代谢物激活蛋白)。正调控蛋白、cAMP-CAP复合物 CAP-cAMP复合物激活Lac启动子的机制大肠杆菌的葡萄糖效应:b. 操纵子(operator) -5-+28区。与启动子重叠。2、基因家族(gene family)、基因簇(gene cluster)、假基因(pseuds gene) 真核生物基因组中来源
8、相同、结构相似、功能相关的一组基因称为基因家族。例如:(1)5sRNA基因家族 由结构相同的数个基因以串联方式重复排列,基因与基因间由中度重复序列间隔开来。(2)血红蛋白基因家族 血红蛋白基因家族由等基因组成。 类链基因簇:由、成串排列在一起构成,位于11号染色体上。其表达时间顺序为 。 类链基因簇:由成串排列在一起构成,位于16号染色体上。其表达时间顺序为 。 假基因:来源于相应的有功能的基因,由于某种突变而失去原有的功能的基因。用 表示。五、外显子和内含子-基因的结构是断裂的 (断裂基因 interrupted gene) 原核生物的结构基因绝大多数是连续的,而真核生物的编码序列是不连续的
9、。1、实验证明非编码序列的存在 1977,Flavell和Jeffreys兔珠蛋白基因的mRNA cDNA 同位数标记cDNA 与珠蛋白基因杂交。结果: 珠蛋白基因片段 cDNA 片段 Chambon鸡卵清蛋白mRNA cDNA 卵清蛋白基因杂交 电镜观察 异源双链体(cDNA)2、断裂基因中外显子保守,内含子可变。DHRF基因在哺乳类不同物种中外显子和内含子情况3、RNA剪接(1)直接切割连接 pre-tRNA 内含子(2)通过转酯作用实现剪接 (3)可变剪接(alternative splicing) 一个基因产生不止一种类型的mRNA,称为可变剪接。例如:与果蝇性别有关的基因dsx, 其
10、mRNA在雌蝇和雄蝇中剪接方式不同。(4)内含子的类型 P53六、重叠基因(overlapping gene) 1977,Sanger , 噬菌体x174各基因的功能:各基因的功能:A,DNA单链合成和双单链合成和双链的复制;链的复制;B、C、D,单链的合成和(或)包装;单链的合成和(或)包装;F、G、H,噬菌体噬菌体衣壳的结构蛋白;衣壳的结构蛋白;J,参与病毒颗粒构成的一种小的碱性蛋白;参与病毒颗粒构成的一种小的碱性蛋白;K,产产物未知;物未知;E,细胞裂解细胞裂解 重叠方式:(1)基因套基因 如x174基因组中,B基因含在A基因中, E基因含在D基因中。但起始密码子不同,密码 的阅读框不同
11、。(2)部分重叠 上游基因的终止密码子和下游基因的起始 密码子重叠。 如: 基因D终止 x174 DNA序列T-A-A-T-G 基因J 起始 基因A终止 x174 DNA序列 A-T-G-A 基因C起始(3)三个基因重叠 1978,Shaw ,噬菌体 G4 . G4 DNA序列 -TTCTGATGAAA-基因B基因A基因K七、转座元件-基因并不全是固定在染色体的一个位置上(1)DNA DNA的转座元件1、玉米的Ac-Ds系统 1950,B.McClintock Ac:为可自主移动的调节因子,全长4.5Kb,含有 5个外显子,编码转座酶,两端具有11bp的反向重复序列(IR)。 Ds:来源于Ac
12、,由Ac转座酶基因缺失形成。Ds不能自主转座。只有在Ac存在时,Ds才能转座。 Ds全长0.4-4Kb,两端同样具有11bp的反向重复序列(IR)。Ac-Ds系统产生的遗传学效应2、插入序列(Insertion sequence,IS)(1)插入序列的结构(2)IS插入靶位点的示意图(3)一些IS的类型与结构(4)IS的遗传学特征(P59)3、转座子(Transposon,Tn)(1)Tn的结构(2)转座模型a、剪-粘型转座(cut-and-paste transposition) 又叫简单插入转座,是一种非复制转座。Tn5、Tn10均以此方式转座。b. 保守型转座(conservation
13、transposition)非复制转座的一种。c.复制型转座(replicative transposition) 在复制转座的过程中,转座子被复制,一个拷贝留在供体原位,另一个拷贝插入受体新位点。(3)转座的遗传效应 a,插入突变 b,基因重排4、果蝇的P因子(P element) (1)果蝇中P品系与M品系杂交中,杂种劣育现象。(2)P因子的结构 与细菌的转座子(Tn)非常相似。a.P因子全2907bp 两端具有33bp的反向重复序列。(IR)b. P因子有4个编区(外显子0.1.2.3), 3个内含子(1.2.3)(3)P因子与杂种劣育无转座,可育转座,不育无转座,可育(二) RNA介导
14、的转座元件-反转录转座(retroposon 存在于真核生物中,种类复杂。根据其结构和组成,可分为两类: 病毒超家族(viral super family) 能编码转座酶或整合酶,能自主地进行转座。如:酵母Ty转座成分、果蝇copia因子、哺乳动物,LINE1以及所有的还原病毒。 非病毒超家族(nonviral super family) 自身没有转座酶或整合酶的编码能力,依靠细胞内的酶系统作用下进行转座。如:SINE等。1、Ty(transposon in yeast)转座元件(1)Ty的分子结构LTR LTR(2)Ty因子的转录和翻译(3)Ty因子的转座的机制 实验证明Ty为RNA介导的反转录转座(4) Ty转座的遗传效应 a 插入失活 b 增强效应 c DNA重排(2)果蝇的copia因子(P75)反转录转座子转座子转座子3、LINEs L1 长散在重复序列(Long inters
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