肝脏蛋白质组计划实施和毒理学发展机遇PPT

1、关于肝脏蛋白质组计划的实施与毒理学发展的机遇PPT第一张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月曼哈顿原子弹研制计划人类基因组计划阿波罗登月计划人类历史上的三大科技工程1941.12.61945.7.16罗斯福批准, 耗资20亿美元原子半径10-10m原子体积10-30m3人体半径100m人体体积100m3太阳系半径1012m太阳系体积1034m31990.10.1-2003.4.23克林顿、布莱尔批准，耗资30亿美元1961.5.251969.7.20肯尼迪批准, 耗资240亿美元第二张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月人类基因组计划开创了 “基因组时代”第三张，PPT共一百一

2、十六页，创作于2022年6月基因组学向蛋白质组学“求助” ! Nature 409:747, 15 Feb. 2001 And now for proteome“现在轮到蛋白质组”Science 291:1221, 16 Feb. 2001Proteomics in Genomeland“基因组大地中的蛋白质组学”第四张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月PROTEIN第五张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月转录组一种细胞、组织或生物体所对应的全套mRNA RNA基因组生物体所拥有的全套染色体上的全部基因DNA蛋白质组一种细胞、组织或生物体所对应的全套蛋白质PROTEIN功能

3、执行体遗传信息载体第六张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月 基因和蛋白质并不存在严格的线性关系 ORF并不预示一定存在相对应的功能性基因 mRNA水平并非与蛋白质的表达水平对应 翻译后修饰及同工蛋白质 (Isoforms) 等现象在基 因水平无从表现 蛋白质与蛋白质的相互作用难以在基因水平得以 认识基因组与转录组不能取代蛋白质组第七张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月翻译后修饰相互作用构象变化翻译后拼接移位胞质胞核蛋白质调节的多样性生命的“万花筒”第八张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月蛋白质功能的群体性第九张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月绳墙扇茅蛇

4、树蛋白质作用的整体性第十张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月探索生命奥秘的直接对象蛋白质组 生命体的统一性源于基因组 生命体的多样性、复杂性、 功能性、表型源于蛋白质组1463-4 x 1043 x 109103 (1012) 第十一张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月 Proteomics seeks to provide functional information for all proteins. proteomics is more of a concept than a defined technology, and it refers to any prote

5、in-based approach that has the capacity to provide new information about proteins on a genomewide scale.“Proteomics includes not only the identification and quantification of proteins but also the determination of their: localization modifications interactions activities function第十二张，PPT共一百一十六页，创作于2

6、022年6月报 告 提 要蛋白质组学产生的时代背景“国际人类肝脏蛋白质组计划”的目标与意义蛋白质组学与毒理学/环境医学第十三张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月DNA序列图基因图人类基因组中1/3以上 基因未曾确认基因确认的基本层次-蛋白质水平天书解读天书Science 291:1221, 2001第十四张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月全面揭示重大疾病发生发展机制的基础蛋白质组单基因病遗传病多基因病肿瘤等 重大疾病发生发展机制单一基因单一蛋白基因群蛋白质群转录组蛋白质组?第十五张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月发现大量新型药靶与新药的源泉蛋白质组最重要的疾病

7、 100 - 150每种疾病相关的基因 10 每个基因相关的蛋白质 3 10药靶蛋白总数 3000 - 15,000现有药物约2000种85是针对目前已知的500种药靶6-30倍药靶有待发现第十六张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月启动人类蛋白质组计划势在必行！探索人体生命奥秘的直接对象全面揭示重大疾病发生发展机制的基础发现大量新型药靶与新药的源泉 人类基因组序列及基因注释人类蛋白质组 VIP: Very Important Proteome第十七张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月人类蛋白质组计划的主要科学目标验证人类基因组计划推测的基因，注释基因组阐明蛋白质组的调控模式

8、并与转录组进行对比建立蛋白质群/组装体，蛋白质复合物或蛋白质机器, 即连锁图建立人体生理学、病理学的蛋白质组基础第十八张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月1463-4 x 1043 x 109103 (1012) 基因组计划蛋白质组计划第十九张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月第二十张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Body fluid most accessible for biomarker discovery in animal and humans. LiverKidneyOrganBody FluidBrainImmune Organs/Vessels

9、IntestineOther TissuesCSFFecesEndocrine/Paracrine SecretionsBileUrineAir/BALFLymphLungsEyesSkinOral CavitySweatSalivaTearsVenous BloodArterial BloodSerum10 %90 %Serum ProteinsNon-Informative Abundant Proteins i.e. albumin, IgG, etc. Informative Low Abundance ProteinsEnrichment Strategies for Informa

10、tive Serum Proteins: SELDI Serum Immunosubtraction 第二十一张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月人类肝脏蛋白质组计划里程碑蛋白表达谱蛋白连锁图亚细胞定位图修饰谱人类基因组计划里程碑遗传图物理图序列图第二十二张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Initiatives of Human Proteome Project (HPP)HPPPHuman Plasma ProteomeProject, USAHLPPHuman Liver Proteome Project,ChinaPSIProteomics Standards In

11、itiative UK HBPP Human Brain Proteome Project, GermanyHAIHumanAntibodyInitiativeSweden第二十三张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Why is liver?wwwww.HLPP.HUPO为何研究肝脏?第二十四张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月肝脏功能的多样性与重要性能量能量转换、储存物质代谢（活性分子的合成、 毒性分子的分解）信息信息分子的合成与分泌第二十五张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月肝脏为其它组织提供能量可氧化底物组织的活力依赖于高能键的连续生成。肝脏产生大部分脂肪酸

12、，后者是禁食状态下能量的基本来源。肝脏是给食状态下由过剩糖合成脂肪酸的主要部位。第二十六张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月药 物毒 物营养物生物异源物生物转化第二十七张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月化学多样性向体内的生物转化体系提出严峻挑战1.2107种以上的化学物 (CA Services list)以每周约8000种的速率增加常用化学物在63,000种以上大约 11,500种，作为食物或药物制剂添加物摄入其余的50,000种，为潜在的环境污染物第二十八张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月人类发育过程中造血组织的兴替造血系统的发育必需肝脏的“培育”第二十九

13、张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月合成大多数循环血浆蛋白合成和分泌血浆蛋白是肝脏实质细胞肝细胞的独有功能（肝细胞占肝脏总细胞数的60% 及肝脏质量的约80%）最有特征的血浆蛋白是白蛋白，在大多数哺乳动物中占总血浆蛋白的55-60%凝血酶、抗凝因子、溶栓酶等第三十张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月肝脏再生机体再生能力 最强的器官终生保持旺盛 的再生能力第三十一张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月肝脏中包含的“组”(-ome)Metabolic genomics Metabolome (代谢组)Energy genomics Energome (能量组)Pharm

14、acogenomics Pharmacome (药理组)Toxicogenomics Toxicome (毒理组)Regenerating genomics Regenerome (再生组)第三十二张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月全球及中国肝炎的流行病学统计 全球: 3.5亿携带者中国: 1.8亿携带者死亡: 23万人/年疾病负担: 500亿元人民币治疗手段: 抗病毒,保肝降 酶,抗纤维化,免疫治疗等缺点: 病毒易反弹,病 情易反复第三十三张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月肝炎向肝癌的恶性转化难以遏制全世界现有3.5亿慢性乙肝病毒（HBV）携带者，占世界人口的5%，亚

15、洲和非洲HBV携带率为8-15% HBV携带者中50-70%病毒复制活跃，为慢性乙肝 慢性乙肝病人肝硬化发生率为2-20%，代偿性肝硬化发展成失代偿性肝硬化为20-23%，发展成肝癌的占6-15%中国的慢性乙肝病人中，约25-40%最终将死于肝硬化或合并肝癌 HBV携带者最终死于相关肝病的危险性，男性为50%，女性为15% 第三十四张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月全球: 100万人/年中国: 50万人/年死亡: 约45万人/年疾病负担: 400亿元人民币治疗手段: 手术切除(只有15%-20%)治疗效果: 术后易转移,易复发,五年存活率40-50%全球及中国肝癌的流行病学统计第三

16、十五张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月原发性肝癌的治疗水平亟待突破世界上每年有100万新发原发性肝癌病人，其中40-50%在我国 我国原发性肝癌发病率和死亡率均位居第二位 近20年来我国肝癌的发病率上升近40%原发性肝癌一般起病较隐匿，早期缺乏典型临床表现，初诊大多已属中晚期 初诊肝癌病人中，只有15-20%的病人具备手术条件这些病人术后5年生存率仅为40-50% 肝癌是致死率最高的恶性肿瘤之一第三十六张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月重大肝病的发生发展无法归咎于少数几个基因或蛋白质所呈现的功能状态和信号通路从蛋白质组层面上“全景式”揭示肝脏疾病的生理病理机制是解决重大

17、肝病的根本出路肝炎病毒肝脏/肝细胞肝炎肝硬化/纤维化原发肝癌肝癌转移多因素、 多步骤的发病机制第三十七张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月肝脏是人类蛋白质组计划的首批目标！第三十八张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Prometheus stole fire from the gods and gave it to mortals. Prometheus BoundHeracles Liberate Prometheus HLPPModern Prometheus MythPrometheus Liver Eagle Liver diseases Heracles HLPP

18、第三十九张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月人类肝脏蛋白质组计划Human Liver Proteome Project (HLPP)国际HLPP共同体第四十张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Generate an integrative approach leading to a comprehensive functional map of the liver Expand liver proteome to its “PHYSIOME” and “PATHOME” to dramatically accelerate the development of diagn

19、ostics, prevention and therapeutics towards its diseases Develop standard operating procedures (SOPs) for other HUPO InitiativesVISION第四十一张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月HUPO Workshop, Bethesda, April 28-29, 2002 Broad interests and supports for initiating HLPP HUPO Liver Proteome Workshop, Beijing, October

20、22-24, 2002 Getting consensus view for scientific objectives of HLPP HUPO 1st World Congress, Versailles, November 21-24, 2002 Co-chairs of HLPP: Drs. Fuchu He, John Bergeron and Christian Brchot HLPP Planning Committee: 17 members; May 2003Proposals about Working Plan of HLPP Dr. John Bergeron: Jan

21、 31, 2003 (Management); Dr. Fuchu He: Feb 17, 2003 (Scientific Strategy) Dr. Fuchu He: Mar 22, 2003 (Action Plan); Dr. Christian Brechot: Mar 31, 2003 (Sampling) HLPP Office, March 18, 2003 HUPO LPP Workshop, Bethesda, July 17-18, 2003 NIH participatingHUPO 2nd World Congress, Montreal, Oct. 8-12, 2

22、003 Dr. Fuchu He was appointed as the executive Chair of HLPP (2003-2005)HUPO HLPP Satellite Meeting, Montreal, Oct.12, 2003 Set up Executive Committee & 9 Sub-committees, Action Plan at Pilot PhaseFrench liver samples were collected and distributed among 8 labs, May, 2004HUPO HLPP Satellite Meeting

23、, Beijing, Oct. 24, 2004Chinese part of HLPP was officially launched, Nov., 2004Chinese liver samples were collected and distributed among 7 labs, Feb., 2005MISION第四十二张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月表达谱修饰谱定位图连锁图样品库抗体库数据库HLPP的科学目标-肝脏蛋白质组的“太阳系”3-D图ORF组第四十三张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月肝脏蛋白质组与肝脏生理、病理的衔接肝脏蛋白质组代谢组毒理组药理组

24、再生组肝炎组 肝癌组能量组第四十四张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月作为分泌器官，肝脏合成大多数的循环血浆蛋白 肝脏转录组“肝脏蛋白质组计划”和“血浆蛋白质组计划”的整合肝脏蛋白质组血浆蛋白质组?第四十五张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月基因组肝脏蛋白质组肝脏转录组基因组、转录组和蛋白质组的集成证实推测基因对比调控模式 第四十六张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月重要功能蛋白质肝病药物靶标肝病诊断标志物人类肝脏蛋白质组第四十七张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月肝炎病毒肝脏/肝细胞感染肝炎肝硬化/纤维化原发肝癌肝癌转移重大肝病预警、诊断、预防、治疗的

25、关键环节“东亚病夫”“肝病大国”1亿多肝炎病毒携带者1000亿多/年医疗费用第四十八张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月SOPsSpecimen BankingPlatformsWorking teamGlobal CollaborationExpression ProfileORFeome AntibodiesBioinformatics Modification Profile Subcellular Localization Protein-Protein Interaction Antibodies Bioinformatics Integrate proteome with

26、 transcriptome Compare proteomes within health and diseased liverTime LinesPilot Phase(2003-2005)Phase II(2006-2010)第四十九张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Outline BackgroundProgress of the HLPP - Progress report on expression profilingInitiation of the CNHLPPNext work第五十张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Progress - Express

27、ion profilingEvaluation of technologiesBioinformatics set-upSampling and preparationPreview with human fetal liverPrimary analysis of French liver tissues 第五十一张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月ProgressEvaluation of technologiesBioinformatics set-upSampling and PreparationPreview with human fetal liverPrimary a

28、nalysis of French liver tissues 第五十二张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Major conclusions from the valuation of technologies 16 standard proteins/7 labsHigh molecular weight and low abundance proteins are less detectable by 2DE.Proteins with only three order of magnitude could be identified in 2DE, but proteins

29、with four order of magnitude could be identified in shotgun technology.More peptides (redundant) were identified for high MW proteins in shotgun technology.Some similar proteins were identified (not protein group), suggesting the criteria for distinguishing similar proteins should be more strict.第五十

30、三张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月ProgressEvaluation of technologiesBioinformatics set-upSampling and PreparationPreview with human fetal liverPrimary analysis of French liver tissues 第五十四张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月HLPP Experimental DatabaseMWS Data ClientGUI，Web Services, APIFiles Interchange, DMBS DumpData sync

31、hronizeData submissionExperiment reports, data, files HLPP Data MirrorMWS Data ClientMWS Data ClientMWS Data ClientMWS Data ClientMWS Server AdministratorHLPP Data MirrorSubmission Packages RepositoryHLPP Project Management DatabaseHLPP Project Management SystemHLPP Participating LaboratoriesHLPP Da

32、ta CenterThe HLPP Data Management System Architecture Based on MyWorkSpace System (MWS)第五十五张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Current Standard draft of HLPPSample InformationProtein extractionConcentration MeasurementSeparationGel-based2DEGel1D-IEFGel1D-SDSLC-basedRPLCSCXLCSAXLCSECTrapDesaltingDigestionIon sour

33、ceMALDIAutoflexUltraflexABI 4700ESIQstarQTofMicroLCQLTQMass spectrometryTOFTOFTOFUltraflexABI 4700QTOFQstarQTofMicroITMSLCQLTQPeak list generationABI 4700QStarAutoflexTurboSequestMasslynxFlexAnalysisPeak list preprocessingGPS peak list preprocessProtein/peptide identificationMascotSequestProtein lis

34、t generationAutoflexGPSBiotoolsQstarBuildSummaryDTASelectBioworksAutoQuest第五十六张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Protein identification is based on the analysis of peptides generated by proteolyic digestion. When the detected peptides match many proteins and cannot identify a unique protein, the result will be

35、presented in the form of a group of possible proteins. Definition of Protein GROUP 第五十七张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Criteria for protein identificationIon trapXCorr (highest) 1.9(1), 2.2(2), 3.75(3) ; DeltaCn0.1; RSp4.ABI-TOF/TOFProtein score59 (Rank 1 for the spot)Q-TOF or Q-STARProtein score thresholdPe

36、ptide score “the score for identity” or 29 MALDI-TOFProtein score threshold The proteins in first report (multi-protein for the mixture)第五十八张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月ProgressEvaluation of technologiesBioinformatics set-upSampling and preparationPreview with human fetal liverPrimary analysis of French l

37、iver tissues 第五十九张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Evaluation of the SOPs for the subcellular fractionationObject: Find the optimum method of pretreatmentSample: Liver tissues of C57 miceSubcellular: Mitochondria, Golgi, PM, Nucleus, ER, CytoplasmSample pretreatment Fresh tissues Frozen homogenised tissues Fro

38、zen tissues第六十张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Purity (Western blotting): Fresh tissues frozen homogenized tissues frozen tissuesThe yield of proteins:Fresh tissues frozen homogenized tissues frozen tissuesIntegrity (TEM):Fresh tissues frozen homogenized tissuesSummary第六十一张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月ProgressEvalua

39、tion of technologiesBioinformatics set-upSampling and PreparationPreview with human fetal liverPrimary analysis of French liver tissues 第六十二张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月It is a giant ambitious objective and gives a great challenge to embryonic proteomics It is necessary to carry out a preview before the f

40、ormal launching of this projectScience 302:1316, Nov. 21, 2003Nature 425: 441, Oct. 2, 2003第六十三张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Average Throughput of the Platform 2DE System 12 Gel / 3 Days Auto-Spot Digest System 1152 spots / Day MS and MS/MS System 500-1000 Spots / Day 第六十四张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月The flowcha

41、rt of CCPIT for the protein expression profile of human fetal liver 第六十五张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月 The area scales before and after isoform processing in group and protein levels respectively. In protein level, the red circularity areas represent the number of confirmed proteins and the yellow annulus

42、areas represent the number of possible proteins. Non-iso groups 19%Extensively confirmed81%Groups 41%Confirmed59%Non-isoforms43%Isoforms57%contribute 545 additionalproteins and eliminate763 groupscontribute 545 additionalproteins and eliminate1335 possible proteinsIn Protein LevelIn Group Levelconfi

43、rmed:1950possible: 2593extensivelyconfirmed:2495non-isoformpossible: 1258第六十六张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月ACBChromosomal distribution of HFL proteome-encoding genes 第六十七张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Functional Modules in plasma membrane第六十八张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月ProgressEvaluation of technologiesBioinformatics s

44、et-upSampling and PreparationPreview with human fetal liverPrimary analysis of French liver tissues 第六十九张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月 Reference Labs for HLPP Expression Profiling Project Fuchu He & Xiaohong Qian (Beijing Institute of Radiation Medicine)Rong Zeng (Shanghai Institute for Biological Sciences

45、)Pengyuan Yang (Fudan University)Siqi Liu (Beijing Genomics Institute, Chinese Academy of Sciences)第七十张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Laura Beretta (FHCRC, USA)Richard J. Simpson (Royal Melbourne Hospital, Australia)Angelika Gorg (Technische Universitat Munchen, Germany)Mark Baker/Junhong Sun (APAF, Australi

46、a)第七十一张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Outline BackgroundProgress of the HLPPInitiation of the CNHLPPNext work第七十二张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月CNHLPP OverviewThe first phase : 2004-2005Funding from central government: 10 million US dollarsChinese MOST: jointly funded by National Program on Key Basic Research Projec

47、ts (973), National High-tech R&D Program (863), and National Key Technologies R&D Programmein in the first phase. Local and Institutional funding: 3.5 million US dollars 8 subprojects70 institutes, universities, and companies involvedLong-term support as a national project (20062020)第七十三张，PPT共一百一十六页

48、，创作于2022年6月Celebration of CNHLPP Official Launching (Beijing Institute of Radiation Medicine)第七十四张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月 Key labsBeijing Institute of Radiation Medicine第七十五张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Consulting committee(5)ORFeome & PPI Subproject, Zeguang HanChairFuchu HeHeadquartersBPRCModification Pro

49、file subproject, Yun CaiExpression ProfileSubproject, Xiaohong QianStructural Biology Subproject, Weimin GongBioinformatics subproject,Yixue LiNew Technology subproject,Yukui ZhangAntibody subproject,Qi-Hong SunLocalization MappingSubproject, Xuemin Zhang第七十六张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月More than 10 works

50、hops have been held第七十七张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Brief progress of some subprojects Protein modification Protein localizationProtein structureNew proteomics technologies第七十八张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Analysis of protein phosphorylation by combination of IMAC, Phosphatase with Biological Mass Spectrometrym/

51、zPeptide mixtureProteinsCandidate phosphopeptidesIdentification of phosphorylated sitesDIGESTIMACMALDI-TOF MS AnalysisPhosphatase digestMS/MS Analysis and Database Searchingm/zPhosphopeptide Confirmationm/zMetastable ions of phosphopeptides第七十九张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月O60716 GSLApSLDpSLRKP15924GLPSPYN

52、MSpSAPGpSR O75379NLLEDDpSDEEEDFFLRRApSpSKGGGGYTC*QSGSGWDEFTKO95210HSpSWGDVGVGGSLKP16157RDpSRDVDEEKELLDFVPKP02671ADpSGEGDFLAEGGGVRP35221TPEELDDpSDFETEDFDVRP02730YQpSSPAKPDSSFYKQ13813WRpSLQQLAEERYQSSPAKPDSSFpYKQ15019IYHLPDAEpSDEDEDFKEQTRYQSSPAKPDSpSFYKQ16828SNIpSPNFNFMGQLLDFERRYQSSPAKPDpSSFYKQ99959RLE

53、ISPDpSpSPERAHYTHSDYQYSQRP04792GPpSWDPFRLPEEWSQWLGGSSWPGYVRPLPPAAIEpSPAVAAPAYSRQ9H3Z4SLpSTSGESLYHVLGLDKTr:O95810SLEETLHTVDLpSpSDDDLPHDEEALEDpSAEEKVEESR P05386KEEpSEEpSDDDM*GFGLFDKEEpSEEpSDDDMGFGLFDTr:Q8NEN5pSQpSLPTTLLSPVR P08559YHGHpSMSDPGVSYRTr:Q9HAP4ESEALPEKEGEELGEGERPEEDAAALELpSpSDEAVEVEEVIEESR P1

54、1277TpSPVSLWSRLpSpSSWESLQPEPSHPYTr:Q9NQA7WLDEpSDAEMELR Identified phosphopeptide sequences from HFL第八十张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Protein isolation and purification by lectin (Glycosylation)第八十一张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Co-localization and locomotion of the GFP fusion protein and DsRedDsRed-Mem Green mergeG

55、FPGFP-fused PrTNF- treatedGFP-fused mutantTNF- treatedGFP-fused Pr第八十二张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Structural proteomicsCloned 900 genes from liver Expressed products of more than 100 genesDetermined the structures of 3 proteins by X-rayDetermined the structures of 2 proteins by NMR第八十三张，PPT共一百一十六页，创作于202

56、2年6月Diphosphoglycerate mutase (DPGM) X-rayProgrammed cell death 5 (PDCD5)NMR第八十四张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Beijing (National) Proteome Research CenterChinese Proteome Development Center第八十五张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月The Antibody Bank of Human Liver Proteome ProjectEstablishment, characterization, and applic

57、ation of antibodies against human liver proteins Qi-Hong SunBeijing Institute of Radiation Medicine (BIRM)Beijing Proteome Research Center (BPRC)第八十六张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月AntigensMyeloma cellsHybridoma cellsmAbsDiagnosticsTherapeuticsProteomics Research Profiling Identification Quantification Local

58、ization Modification Interaction FunctionLarge antibody collection for proteomics第八十七张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Antibody DatabaseAntibody BankSamples5000 liver proteinsHLPP Antibody Bank Antibody chips第八十八张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月10% of HLPP Antibody Bank Standards and database of HUPO HLPP/HAIMicroarray

59、and other antibody-based technology90%10%HLPP Antibody Bank at Pilot Phase第八十九张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月Antigen preparation Fractionated liver proteins - Unknown/native/multi-antigensRecombinant proteins Synthesized peptidesAntibody generationHybridoma cell lines mAbs (murine/rabbit)Polyclonal antibodi

60、es IgG (Rabbit)/ or IgY (chicken)Antibody characterization and applicationClass and subclass, ELISA, IH, WB, and IPAntibody microarray and other antibody-based technologyGeneral Approach第九十张，PPT共一百一十六页，创作于2022年6月AdultFetalDiseasedIH characterization of mAbs against human liver proteins第九十一张，PPT共一百一十