论文格式规定及要求

1、编号：本科毕业论文题 目：学 院：专 业：年 级：姓 名：指导教师：完成日期：三号黑体、居中/目 录小四号黑体小四号宋体 TOC o 1-5 h z 中文摘要与关键词/二:二二.Abstract and Key Words 2.引言21生物信息学研究.2.2 22.1生物信息学的产生22.2序列分析方法/ 5结果分柝.73.1高丰度表达中已知序列功能的分析结果93.2山羊KRTAP8的生物信息学分析.20结论12参考文南犬25致谢16简历17三号黑体居中小四号宋体内蒙古白绒山羊是一种优良家品种，通过EST（表达序列标签）测序在分水平上 获得大量数据，这些数挪供了内蒙古白绒此的部分基因信息为进一

2、步研究仙羊绒 生长相关基因奠定基础。本实验选择内蒙古白绒山羊毛兴盛期cDNA文库为研究材料，其中15条HGT（高 甘氨酸酪氨酸角蛋白关联蛋白的cDNA序列已被国际公共数据库GenBank数据库接 受，其中KRTAP6角蛋白关联蛋白家族6）家族成员6个，KRTAP7家族成员1个，KRTAP8 家族成员2个，KRTAP16成员6个。通过对不同物种HGT氨基酸序列的比较分析发现山羊HGT的氨基酸序列与其它哺 乳动物如人、小鼠和绵羊GT氨基酸序列有很多一致或保守的区域。分析其坦功能 位点，发现在山羊的HGT中有许多豆蔻酰化位点。通过对白绒山羊日6丁蛋白的二级结构预测，发现绒山羊日6丁和其它物种HGT的

3、二 级结构中无规则线性长链结构所占比例最多伸展结构占到了较少的部分几乎没有发 现a-螺旋的存在。小四号黑体/|小四号宋体 关键词：绒山羊；生物信息学;表达序列标签；高甘S酸酪氨酸角蛋白关联蛋白HGT）英文题目二号Times New Roman加粗、居中Research of Bioinformatics for InnerMongolianWhite Cashmere Goats三号Times NeWRoman加粗、居中Abstract小四号 Times New RmanIn this study 15 HGT cDNAsequences were submitted to the inter

4、national public database (GenBank) which were chosen from the cDNA library of the Inner Mongolia white cashmere goat during anagen with skin as study material. Among them we find 6 members in KRTAP6, 1 members in KRTAP7, 2 members in KRTAP8 6rmembers of KRTAP16.Compared the amino acids sequence of H

5、GT of different species, the results showed that the HGT amino acids sequence of goat had many conservativeor identicaldomain with Human, Mouse and Sheep. Analyzing its Motif discovers that goat HGT have many N-myristoylation site. The secondary structure of HGT was predicted, the result indicated i

6、rregular long chain had a large proportion in the HGT secondary structure of goat and other species, there were a small quantity of 。-extended structures and- (helix were almost not found.四号Times Nw Roman 加粗/小四号 Times Nw Roman/Key Words Cashmere Goat Bioinformatics EST(Express Sequenceags)；HGT(high

7、glycine/ tyrosine Keratin Associate Protein KRTAP) 引言小四号宋体我国绒山羊资源丰富，所产羊绒以其纤维细软、保暖、洁白等特点，素有黄金” 之称。在国际市场上享儒誉。内蒙用绒山羊是一种对鹳环境适应性极强而蘸为人 们提供优质纺织纤维的优良家品种，无论从基础理论还是应用疏，绒山羊都副具研 究价值的重要家畜。根据美等西方发达国家政府利界粮农组织FAO）的预测，21世 纪全球动物农业90%的品种都将通过分子育种6供，因此，建立内蒙古白绒山羊种质资源 库，开展绒山羊产绒量和绒毛品质等关的功能基因的研3对绒山羊的选育有重!的理论 和实际意义。随着人类剧组计划

8、、撤动物基因组计划糠养动物基因组计划嘛的深 入，已获得了大量基因妹平的数据。这些工作为绒山羊功能基因组研究的开展狂了基 础。利用EST表达序列标签的分析并获得全长的CDNA序列，从而得到此基因镣的蛋 白，对蛋白特征、结构的分析对阐述山羊毛或绒邮性及表达有着重要皤义。生物信息学研究进展2.1生物信息学的产生20世纪中叶以来，随f DNA双螺旋结构的提出和蛋白质空结构的解析，开始时 子生物学时代。对遗传彳息载体构成和生命功能的体现者蛋白质蒯究，成为生制学研 究的主要内容。九十年偷随着人类基因组i划在世界范围内的开1，破解人类及多种模 式生物的遗传密码已成为生物领域的重要课题 同时产生了巨辅基因组信

9、息.面对如 此巨大且具有高度复杂性的生数据，如何有效地进行管理口分析这些信息是人I基因组 研究必不可少的重要内容，从而也促进了生物信息（学ioinformatic这门生物学和信息科 学融合的新学科产生和发展（竺等，1998）。图1复杂网络拓扑结构(a)规则网(b)随机网(c)小世界网络(d)无标度网络Fig. 1. The topobgical structures of complex networks(a) regular networks (b)random networks (c)small world networks (d) scale free networks生物信息学是内涵非

10、常丰富的科，其核心是基因组信息学，包括基因组信息的获取 处理、存储、分配和解释。基因组信息学的键是读懂”基因组的核苷酸顺序，即全部基 因在染色体上的确切位置以各DNA片段的功能；同时侈现了新基因信息之屈行蛋 白质特征的分析及空间结构的测。(郝柏林2000,陈润生1999) z表1.实际网络的Scale Free现象Table 1. Scale Free Phenomena of Actual NetworkNetworkSizeroutrinl /reall randWWW723,1087.52.722.1168.85Internet】8!, router3,8882.572.482.4812

11、.158.75Internet】8, domain3015-43893.42-3.762.1-2.22.1-2.246.3Phone call9533,10三号黑居中参考文献小四号宋体加方括弧7小四号宋体施季森21世纪的生物信息学述评南京林业大学学报2001-3 vol25,2吴昊.基因组学生物信息学及其对科学和社会的响.院士论坛，vol25,5施晓秋计算机科学在生物信息学中应用.浙江工业大学学报2001 vol29,2王发生生命科学时代的生物信息学中国现代医学杂志，2002 vol10,12郝柏林 生物信息学.中国科学院院刊2000, 4期人名后和句号用英文实心句号陈润

12、生.生物信息学 生物物理学报，1999 vol15,1期包家立生物信息学数据库世界医疗器械，vol6, 1期李衍达生物信息学与21世纪的生物学科学前沿俞建新网络上的生物信息资源生物学通报2000 vol35,8期陈竺等 人类基因组计划的机遇和挑占生命的化学，1998年18卷，Kahn P. 1996.Coming to grips with genes and risk. Science； 274Lander E S. 1996. The new genomglobalviews of biologyScience, 274 536-539MarshalE. 1996.The genome p

13、rograms consnCe. Science, 274 488MarshalE. 1997. Whose DNA it, anyway? Science, 278564-567小四号 Times Nw Roman三号黑体，居中致谢小四号宋知本论文是在导师李玉荣研究员尹俊副教授的悉心才导下完成的，导师严谨的台学态 度、广博的专业知识、开阔的思路和强烈的敬业精神将使我终生3益，三年的学习生涯中 导师在科研、学习、生活方面，都给予我许多的帮助和无微不全的关怀。并且感谢导 师为我提供了一个良好的实验与学习环境。特别感谢李金泉教授、张炎茹教授在对本论文给予了很多帮助和指导。论文实施过程中，生物工程学院的邢燕平渐及师弟张燕军李长