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文档简介

1、聚合酶链反应(一)PCR技术(聚合酶链反应) 原理:PCR技术实际上是DNA体外扩增技术,其原理为: 以提取的DNA为模板,在94解链变性后提供单链DNA模板(模板变性) 将特定设计的与待扩增DNA模板两端序列互补的两个引物(短链互补DNA引物)经低温退火使引物与模板DNA互补结合(模板与引物退火连接) 在PCR反应中,在Taq酶(DNA聚合酶)作用下,使加入的游离单核苷酸(dNTPs)由引物5 3方向按碱基配对原则,沿DNA模板形成两条互补DNA链。(引物沿模板互补延伸)如图 新合成的DNA链又可作为下一轮PCR反应的模板,这种经热变性-复性-延伸的过程就是一个PCR循环,经反复多次循环可产

2、生2n的指数扩增,使微量模板达可见量用于实验。 其引物设计、 PCR反应条件、仪器稳定性、技术性强,对环境要求严,以防假阳性产生。1PCR种类:种类多、用途多而广泛,列举常用法 逆转录PCR(RT-PCR):又称RNA-PCR 先将从细胞总提取的总RNA,在逆转录酶的作用下合成cDNA(序列用mRNA)以提供PCR模板。然后以cDNA为模板在互补的两个引物的引导下,在Taq酶作用下,将加入的dNTPs按碱基配对原则,沿cDNA 模板扩增DNA(见上图) 优点:只需少量mRNA 模板cDNA cDNA中已不含内含子 对构建cDNA文库非常有利 锚定PCR:当mRNA cDNA后,用末端转移酶在c

3、DNA3末端加上poly(dG)作锚位,然后用带有酶切位点的poly(dC)作锚定引物 ,进行PCR扩增。 优点:可克隆和扩增未知的DNA/RNA、基因序列,便于组装,免受基因两端序列限制。2反向PCR:能将位于已知基因序列两侧的未知序列(转座子、插入序列、易位整合的插入基因)扩增获得。 方法:选择已知序列内部没有该酶切位点的内切酶,对DNA进行酶切,经环化后,将环化分子用与已知序列两端的互补反向引物进行PCR扩增,可获大量的未知DNA片段,进一步测序。(图) 反向PCR 对研究转座子、反转录病毒插入序列以及所有可以整合或转位到基因组(已知序列)中的插入序列DNA片段(如原癌基因)。3随机引物

4、PCR 以合成一系列不同随机排列的寡核苷酸链(通常为10聚体)为引物,对基因组DNA进行PCR扩增。扩增产物经丙烯酰胺或琼脂糖凝胶电泳,EB染色显条,分析DNA多态性。 此法可通过扩增产物DNA片段多态性,可分析基因组相应区域的DNA多态性,被命名为随机扩增的多态性DNA(RAPD)。 RAPD可用于基因组指纹图的构建,可应用于系统进化研究、物种鉴定和亲缘关系分析,法医可用来作亲子鉴定。4单链构象多态性PCR(SSCP) 不同肿瘤由于单链DNA分子中因单一核苷酸不同,其DNA的二级结构的构象有差异。 PCR产物电泳后的DNA迁移率不同,其电泳条带上有差异。通过比较DNA的电泳类型,即可测出基因

5、的点突变、插入、缺失突变等。 此时若用Southern印迹杂交更为精确。其他PCR技术 差异显示RT-PCR:复杂、引物多、费用大、操作技术要求高、假阳性高,不常用。 俘获PCR:技术复杂,不常用。5核酸分子杂交 Southern blot(又称Southern印迹杂交) 提取基因组DNA,经酶切后电泳分离,将分离定位在凝胶上不同分子量DNA条带,用碱变性处理,使双链拆开,再如图转移到硝酸纤维素膜上,用标记的目的DNA探针进行同源DNA杂交。带有核素标记的DNA探针结合后,经洗涤仍留在膜上,经X-光片显影定影,根据标记信号,证实基因组DNA靶分子上是否含有目的基因探针的基因片段。 方法:虹吸印

6、迹法:利用毛细管虹吸作用将凝胶上DNA片段转移到膜片上,转移时间长,需过夜或在1218h之间,探针与膜杂交。 真空转移法:采用抽真空技术将凝胶上缓冲液引流至下槽中,可快速将凝胶上DNA片段转移到膜片上。方法凝胶在下,膜片在上,方法凝胶在上,膜片在下。如图 6Northern-blot(又称Northern印迹杂交) Sorthern杂交样品是DNA,而Northern杂交样品是RNA。 RNA样品的变性、电泳转移方法与Southern杂交法相同,其标记的杂交探针可以是DNA,也可以用RNA特异探针。 本法可从RNA水平研究基因的表达。斑点杂交 是Sorthern-blot 法衍生而来的快速、简

7、便的鉴定微量DNA样品的技术。 可直接将样品DNA点于硝酸纤维素膜上,固定后先预杂交,再用核素标记的特异探针在密封袋中进行杂交,有斑点产生者为阳性。还可根据斑点大小,进行相对定量分析。 具有快速、简便、只需微量样品、反应体积小、无需转膜及其相关设备。 缺点:难于确定被测基因片段的分子位置。7原位杂交:用标记已知DNA序列的探针,使其与细胞或组织切片中核酸进行杂交。此法因基因组DNA各基因位置未发生改变,故称原位杂交。 有两种方法: 核素标记的DNA探针滴在细胞涂片或组织切片上,43作用18h。经洗涤干燥后,涂核4乳胶,于4自显影,定影,Giemsa染色。计算镜下的银色颗粒数。也可用图像仪进行灰度分析,可定点、定量分析。 地高辛标记DNA探针的原位杂交 方法与上述基本相同,只是探针不用核素标记该用地高辛标记,杂交后经洗涤再加入酶标记的抗地高辛抗体,作用20min洗涤,并用EDTA液终止反应,再加入相应底物显色,镜检。891011感谢您的浏览需要相关抗体试剂的可以访问Fantibody全球抗体搜索引擎:fantibody全球抗体搜索引擎是一个供公共检索的抗体数据库,其抗体信息数据来源于全球范围的研究机构与商业公司。该引擎由商品化抗体数据库与抗体应用评价数据库两部分组成,以帮

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