版权说明:本文档由用户提供并上传,收益归属内容提供方,若内容存在侵权,请进行举报或认领
文档简介
1、蛋白质三维结构预测3生物信息学pGenTHREADER http:/bioinf.cs.ucl.ac.uk/psipred 半自动穿线法: pGenTHREADER+SwissModelpGenTHREADER http:/bioinf.cs.ucl.ac.uk/psipred 半自动穿线法: pGenTHREADER+SwissModel半自动穿线法: pGenTHREADER+SwissModel半自动穿线法: pGenTHREADER+SwissModelSWISS-MODEL 73半自动穿线法: pGenTHREADER+SwissModelSWISS-MODEL 半自动穿线法: pG
2、enTHREADER+SwissModel如何获得蛋白质的三级结构2. 计算方法 - 从头计算法蛋白质结构 - 三级结构预测从头计算法:1973年 Anfinsen 科学:蛋白质的三维结构决定于自身的基酸序列,并且处于最低自由能状态。需要1-2天的时间QUARK /QUARK 从头计算法: QUARKQUARK /QUARK 从头计算法: QUARKRobetta综合了同源建模法和从头计算法两种方法。(全自动) 如何获得蛋白质的三级结构2. 计算方法 - 综合法蛋白质结构 - 三级结构预测ROBETTA: 如何获得蛋白质的三级结构2. 计算方法 - 综合法蛋白质结构 - 三级结构预测Robet
3、ta综合了同源建模法和从头计算法两种方法。(全自动)模型质量评估软件(Model Quality Assessment programs, MQAPs) 对于通过计算方法获得的模型,必须进行必要的模型质量评估,以确定模型的可靠性。A model on hand, finish? a random model (a low quality model) = maybe如何获得蛋白质的三级结构2. 计算方法 - 预测结果的质量评估蛋白质结构 - 三级结构预测I-TASSERC-score 的取值范围是 -5,2,分值越高模型越可靠。Swiss-ModelQMEAN4的取值范围是 0,1,分值越高模型越可靠。QUARKTM-score 0.5 说明模型的可靠,而TM-score95% 就很没问题!三维模型质量评估软件QMEAN: /qmean/模型的每个氨基酸位置打分0,1如何获得蛋白质的三级结构2. 计算方法 - 预测结果局部结构精修ModLoop /modloop 蛋白质结构 - 三级结构预测如何获得蛋白质的三级结构2. 计算方法 - 预测结果局
温馨提示
- 1. 本站所有资源如无特殊说明,都需要本地电脑安装OFFICE2007和PDF阅读器。图纸软件为CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
- 2. 本站的文档不包含任何第三方提供的附件图纸等,如果需要附件,请联系上传者。文件的所有权益归上传用户所有。
- 3. 本站RAR压缩包中若带图纸,网页内容里面会有图纸预览,若没有图纸预览就没有图纸。
- 4. 未经权益所有人同意不得将文件中的内容挪作商业或盈利用途。
- 5. 人人文库网仅提供信息存储空间,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对用户上传分享的文档内容本身不做任何修改或编辑,并不能对任何下载内容负责。
- 6. 下载文件中如有侵权或不适当内容,请与我们联系,我们立即纠正。
- 7. 本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。
最新文档
- 阀门修理施工方案(3篇)
- 中国市政中南院2026届春季校园招聘备考题库附完整答案详解(夺冠)
- 2026四川宜宾长宁县淯江文旅集团有限公司招聘员工20名备考题库附参考答案详解【轻巧夺冠】
- 2026山东德州市宁津县招聘教师23人备考题库及答案详解(真题汇编)
- 2026辽宁省债务管理办公室面向机关事业单位选调5人备考题库往年题考附答案详解
- 2026河南安阳高新区就业见习单位及就业见习岗位招募备考题库附答案详解【巩固】
- 2026江西吉安安福县事业单位编外工作人员公招聘5人备考题库附答案详解(巩固)
- 国金证券2026届春季校园招聘备考题库(各地真题)附答案详解
- 2025湖南湘潭韶山市友谊桥污水处理有限责任公司招聘专业技术人员现场及笔试历年难易错考点试卷带答案解析
- 2026江西九江市瑞昌市国有投资控股集团有限公司财务专员招聘1人笔试备考试题及答案解析
- 2025年重庆市政府采购评审专家考试真题含答案
- 2025年鄂尔多斯职业学院单招职业技能考试模拟测试卷附答案
- 2026年湖南高速铁路职业技术学院单招职业倾向性测试模拟测试卷附答案解析
- 呼吸系统药物临床试验肺功能指标的智能化质量控制体系
- 观鸟日记课件
- 无人机吊运培训课件
- 2025年河南工业和信息化职业学院单招职业技能测试题库及参考答案
- 光伏维护清洗合同范本
- 2025年宁波市事业单位招聘考试教师招聘考试生物学科专业知识试卷
- 职称申请课件
- 2025年江苏法院书记员招聘笔试真题及答案
评论
0/150
提交评论