文献检索-2014课件

文献检索（InformationRetrieval）病理生理学系魏伟文献资料的分类文献检索的基本概念常用的检索方法中文文献检索国际文献检索常用的搜索引擎和信息门户网站如何获取全文ISIWebofScience主要内容知识：人们通过对信息的获取,认识与掌握自然界、人类社会以及思维活动的规律，经人的大脑通过思维重新组合使信息系统化,形成知识。文献：是记录有知识信息的,且便于存贮或传递的人工载体。文献是进行科学研究的重要资源。5、实验设计（experimentdesign）6、实验观察（experimentalinvestigation）7、数据资料的积累（accumulationofrawdata)）8、数据资料的处理与统计分析（treatmentofrawdataandstatisticalanalysis）9、提出结论（conclusion)科研活动=知识创新

思考计划--------查阅文献（查新检索）科学实验--------查阅文献编写报告--------查阅文献

一个训练有素的研究人员的全部工作时间: 思考计划7.7%查阅文献50.9% 科学实验32.1%编写报告9.3%发现或提出问题——(情报线索)资料的收集——(情报源) 了解问题的历史和现状——(情报汇集分析)

综述,研究报告——(高级情报产物）科学家=情报专家一.文献资料的分类*二次文献(检索工具)=情报线索

对一次文献进行搜集、整理、加工，编制而成，以检索工具的形式发表，包括目录、索引、文摘等。主要的一次文献信息源图书

期刊

报纸

专利文献

标准文献

产品样本

会议文献

档案文献

科技报告

政府出版物

学位论文

各种数据库二.文献检索的基本概念文献加工存储文献检索利用二次文献

一次文献三次文献检索系统或检索工具图书情报机构用户检索语言是文献信息资源系统(数据库、网络信息等)中标识和检索文献信息的计算机识别语言。文献信息检索语言

题名著者序号引文分类检索主题检索关键词检索从文献外部特征进行检索从文献内部内容进行检索题名著者序号分类检索主题检索关键词检索描述文献内容特征的检索语言：1.分类检索语言：按学科、专业集中文献，从知识分类的角度揭示多种不同文献在内容上的区别和联系，提供以学科分类为出发点的文献信息检索途径。（美国国会图书馆图书分类法、杜威十进分类法、中国图书馆分类法、国际疾病分类等）

《中图法》和《资料法》依一定的思想观点，以学科分类为基础，综合图书资料的内容、特点，分门别类组成分类表。5大类：马克思主义、列宁主义、毛泽东思想、邓小平理论；哲学；社会科学；自然科学；综合性图书。下分22个大类（一级类目），用22个汉语拼音字母（A-K、N-V、X、Z）列出：如A为马列毛邓，B为哲学宗教，G为文化、科学、教育、体育，O为数理科学、化学，Q为生物科学，R为医药卫生，Z综合性图书等。在字母后用阿拉伯数字表示下位类目的划分。可细分至六、七级类目，如：R6外科学R65外科学各论R655胸部外科学R655.1胸壁R655.2胸膜R656腹部外科学

R656.1急腹症R656.2腹部疝

R656.3腹壁R656.31腹壁炎症R656.32腹壁损伤2.主题检索语言：

（1）直接选用相对应的、专指的名词（如学科类别名称、药物名称、疾病名称、检验与实验名称、地名、人名、机构名、产品名等）作为检索词。（2）当没有直接对应的和专指的词可选时，有两种选词方法供选择：其一，直接选用上位概念的词；其二，考虑选择两个或两个以上的相邻概念词进行交叉组配，组配结果所表达的概念应该清楚、准确，只能表达一个主题概念。（3）注意用规范词，若用自选主题词检索结果为零，应考虑所选词可能不规范，改用规范的词。主题词与关键词的区别:主题词是规范化的检索语言，它对文献中出现的同义词、近义词、多义词以及同一概念的不同书写形式等进行严格的控制和规范，使每个主题词都含义明确，以便准确检索，防止误检、漏检。如：白介素2、白细胞介素2、IL2、IL-2等表达同一概念的不同书写形式规范为“白细胞介素2”。如果选择关键词途径来进行检索，欲达到较高的查准率和查全率，就得查找“livercancer”、“livercarcinoma”、“liverneoplasm”、“livertumor”、“hepaticcancer”、“hepaticcarcinoma”、“hepaticneoplasm”、“hepatictumor”等词，另外还得考虑像cancer、carcinoma、neoplasm、tumor等词还有复数形式；而如果选择主题词途径进行检索就只需查找“liverneoplasms”一词就行了，这一词就包括了以上所提及的不同的表达形式。由此可见，选用主题词途径检索，既能满足较高的查准率、查全率，又能提高检索速.医学索引

INDEXMEDICUS（IM）曾经是一名军医的JohnShawBillings结合目录学,创造性地运用自己的医学专业特长，于1879年编制了一部卫生科学期刊文献指南，这就是当今世界上最著名的题录式医学文献检索期刊－－医学索引INDEXMEDICUS（IM）。从本世纪二十年代以来一直使用主题词（MeSH）。目前IM收录有世界上主要国家和地区用44种语言文字发表的生物医学及与医学有关的科技期刊三千余种,年文献量约30万条，其中70%为英文文献。

美国的医学泰斗WilliamH.Welch曾经指出：十九世纪美国对医学有四大贡献：麻醉术的发展，昆虫传播疾病的发现，现代公共卫生实验室的建立和军医署图书馆的发展及馆藏索引目录（INDEXMEDICUS,IM）的编制。他认为这最后一项是这四大贡献中最重要的一项。美国国立医学图书馆(NationalLibraryofMedicine,NLM)前身是美国军医署图书馆,始建于十九世纪三十年代，1922年改名为军事医学图书馆。1952年再次改名为陆军医学图书馆，1956年美国总统批准“建立国家医学图书馆,促进医学进步,提高国家卫生和福利水平”的法案成为法律,正式成为美国的三个国家图书馆之一(国会图书馆,国立农业图书馆,国立医学图书馆),归属美国国立卫生研究院（NIH）。MEDLINE1971年MEDLARS发展成为联机检索系统-Medline目前收录期刊4300种收录了1966年至今的1000多万条记录PubMedPubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH）的平台上。该系统通过网络途径免费提供包括MEDLINE在内的自1950年以来全世界70多个国家4300多种主要生物医学文献的书目索引和摘要，并提供部分免费和付费全文链接服务。1997年克林顿宣布提供Internet免费检索-PubMed三.常用的检索方法(一)文献检索的基本步骤明确检索需求，分析检索主题。选择相应的检索工具或数据库执行检索。确定执行检索的检索词。构造检索表达式。提交检索表达式。显示与优化检索结果，若对检索结果不满意，修改检索表达式再次执行检索，直到检索到合适的结果。(二)文献检索基本方法

布尔检索字段检索二次检索全文检索模糊检索通过分类，以及/或者对题名、著者、关键词等进行检索目前常用的检索基本方法主要有：布尔逻辑运算规则：1、AND、OR、NOT必须大写。E-coliANDhamburger；vitaminCORzinc；traceelementNOTzinc2、逻辑符的运算次序是从左至右，括号内的检索式可作为一个单元，优先运行。3、布尔逻辑检索允许在检索词后面附加字段标识例如：dna[mh]ANDcrick[au]AND1993[dp]4、查带文摘的文献检索词ANDhasabstract例如，NeoplasmsANDhasabstract

扩检与缩检扩检与缩检是检索过程中经常面临的问题。用户在检索前应该拟定好扩检与缩检的策略，也就是说，在拟定检索策略时，应该同时考虑如命中文献太少或太多时如何处理的办法。扩检

扩检是指初始设定的检索范围太小，命中文献不多，需要扩大检索范围的方法。扩检的方法主要可以有以下几种：①概念的扩大②范围的扩大③增加同义词④年代的扩大。缩检缩检是指开始的检索范围太大，命中文献太多，或查准率太低，需要增加查准率的一个方法。缩检与扩检相反，即概念的缩小、范围的限定、年代的减少等。此外，还可以通过以下方法进行限定： ①核心概念的限定 ②语种的限定 ③特定期刊的限定四、中文文献检索中国知网

中文期刊:1994年开始五、英文文献检索大部分医学文献为英文文献目前多数中国人完成的优秀科研成果也发表在英文期刊上良好的英文阅读能力和检索能力对医学科研工作者来说是必不可少的（一）PubMed数据库

（NCBI在Entrez系统中的数据库之一） （NationalCenterforBiotechnologyInformation，NCBI)

PubMed概述

PubMed＝Public+Medicalinformation,是免费向公众开放的医学信息资源。无论何时何地，你只要在浏览器地址栏中输入：

就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。收录范围

1.MEDLINE2.PreMEDLINE3.Publishersuppliedcitations

MEDLINE收录了全世界70个国家和地区的4600余种生物学期刊，起始时间1953年，目前文摘条目1200万篇，年报道量近40万条，英文刊物占90%、3/4有英文摘要，每周更新。内容涉及：医学、药学、牙医学、护理学、卫生保健、兽医学等专业。记录标注[PubMed-indexedforMEDLINE]PreMEDLINE

是临时性医学文献数据库，每天接收新数据，经MeSH词表标引后，每周向Medline移加一次。记录标注[PubMed-inprocess]PublisherSuppliedCitation出版商直接向PubMed递送的电子记录。记录标注[PubMed-assuppliedbypublisher]备注：提供的数据如果超出MEDLINE数据库的收录范围，如在综合性科学杂志（Science，Nature）上发表的地理学文章等，将不被采用。PubMed的特点自动词语匹配链接点多，部分在网上可免费获得全文也可以直接定购原文PubMed的主界面检索区主要功能区辅助功能区检索区主要功能区辅助功能区JournalBrowser期刊浏览

MeShBrowser可以用它来分层流览MeSH表

SingleCitationMatcher输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。

BatchCitutionMatcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。

ClinicalQueries这一部分为临床医生设置，通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围： 治疗、诊断、病原学与预后

检索步骤：输入检索词，点[Go]按钮或按回车检索词的输入形式：输入单词或短语或表达式如，aspirin；stomachulcerIddmANDapoptosis著者姓名：wangjz、“wangjz”[au]刊名标题：刊名全称、缩写、ISSNJournalofBiologicalChemistry、JBiolChem、0021-9258字段标识符AB-Abstract LA-LanguageAD-Affiliation MH-MeSHTermsAU-Authors PMID-PubMedUniqueIdentifierCY-Country PT-PublicationTypeDP-PublicationDate SO-SourceEDAT-EntrezDate TA-JournalTitleAbbreviationGS-GeneSymbo TI-TitleIS-ISSN UID-UniqueIdentifiers备注：检索词[字段标识符]AutomaticTermMapping词汇自动转换功能1、MeSHTranslationtable Vitaminc转换为“ascorbicacid”[MeshTerms]ORvitaminc[TextWord]2、JournalsTranslationtable NewEnglandJournalofMedicine转换为 “NEnglJMed”[Journal]3、PhraseList在前两个表中均未找到，可在短语列表中找到这个词如bloodsugar4、AuthorIndex姓（全称）+名（首字母缩写）smithjc当一个短语在前三个表中都找不到匹配词，并且有1或2个字母在词后时，PubMed就在该索引中查找。5、截词检索：*例：输入bacter*，检出bacteria、bacterium等备注：将不执行转换功能；截词检索只限于单词，对词组无效6、如果在短语上加双引号，将不执行转换功能例如：“singlecell”“oxygenfreeradicals”截词：截词有多种用途。-词尾截断可得到该单词所提及的所有词语（单数和复数）-词间切断或通配符：可找到该单词的所有变化形式或不同拼法。?=一个字符*=0个，一个或多个字符右端截断词间截断（通配符）Diseas*DiseaseDiseasesDiseasedLap*roscop*LaparoscopicLaproscopicLaparoscopyPUBMED检索类型

•

词语（主题）检索: 如键入vitaminc

•

著者检索: 格式为著者姓空格名字首字母 缩写，例如smithj 输入Smithj将会同时检索出Smithja,Smithjb,Smithjc等等作者的文献，如果出现这种情况的话，你应该把Smithj置于引号中，即“Smithj”就可以避免这种偏差。

•

刊名检索: 在检索框中键入刊名全称或MEDLINE形式的简称、ISSN号, 例如：molecularbiologyofthecell, 或molbiolcell,或1059-1524

•

日期或日期范围检索: 日期的录入格式为YYYY/MM/DD；如：1999/09/08,也可以不录月份和日子，如：2000或1999/12。在这里可以进行以下设定：

•

将搜索范围设定在一个特定的域。

•

将搜索范围设定在特定的年龄组、性别组、人类或动物学范围。

•

也可以将搜索限定在某一语种出版的或某一特定的文章类型（如综述）。

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设定只搜索包含摘要的文献。

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设定搜索Entrez数据库或Publication数据库。

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设定搜索范围为PubMed数据库的某一子数据库（如AbridgedIndexMedicus或AIDS相关的条目）。

2．AdvancedSearch按钮

按下AdvancedSearch按钮之后，我们可以看到：

3．PubMedHelp按钮

一个在线听生物医学学术报告的美国NIH的官方网站

Pubmed教程全套视频

六、常用的搜索引擎和信息门户网站1、

2.生命科学学科信息门户

3.化学学科信息门户

4.国家科技图书文献中心

4.常见网上专业搜索引擎（1）GoogleScholar：Google为搜索学术文献建立的搜索引擎，可搜索各个学科领域的论文、专著、文摘、技术报告。网址：（2）Scirus：国际互联网上最全的科学专用搜索引擎。涉及学科领域广泛，可搜索专利、技术报告、全文等。网址：（3）EELS：瑞典科技大学网上工程图书馆。可查询土模工程、机械工程、电子工程、化学及化学工程、数学、物理、环境工程与科学和工程管理等工程类网络信息资源。网址：（4）SciCentral：提供网上生物学、物理学、化学、医学、地球学、空间学及工程技术方面资源搜索。网址：（5）Infomine：学术网络资源集。提供生物、农业、医药、商业、经济、文化、电子期刊、政府信息、教育资源、物理、工程、计算机、数学、社会科学、人类学、表演艺术等学术信息。网址：网络期刊文献全文获取用户如果不能得到原始文献或原文复印件，通过先进手段迅速检索到的医学信息就失去价值！

检索七、

如何获取全文

(一)PubMed

PubMed上约有5％的文献是可以免费看到全文的，通常这些文献的左上角会有一个FreeFullText的小标记。二、免费提供全文的期刊

著名的美国Science（科学）杂志与中国有关方面达成协议，使在中国大陆的读者都可以在网上免费看到Science的全文。(二)利用一些高校图书馆网站

(三)FreeMedicalJournals各种可能搜集到 的免费全文期刊的列表。网址是:

(四)向作者索要

这种方法究竟效率如何，没有人统计过， 不妨试一试。(五)作者主页

有些作者会在他们的个人主页或实验室 主页上放上所发表论文的全文。(六) 最传统的办法，即到图书馆、资料室去查 阅期刊文献，闻闻印刷品的特殊香味。

部分免费的全文数据库:http://（号称全球最大免费科学文献数据库）http://

(核心期刊比较多eg；circulJ）http:///（免费注册，包含circulationresearch等共1600多种杂志http://八、ISIWebofScience是美国ISI公司基于WEB开发的产品，包括三大引文库（SCI、SSCI和A&HCI）和两个化学数据库（CCR、IC），以ISIWebofKnowledge作为检索平台。

（）(ScienceCitationIndex,SCI)是由美国科学信息研究所(ISI)1961年创办出版的引文数据库.SCI(科学引文索引)、EI(工程索引)、ISTP(科技会议录索引)是世界著名的三大科技文献检索系统。

ISIWebofScience是全球最大、覆盖学科最多的综合性学术信息资源，收录了自然科学、工程技术、生物医学等各个研究领域最具影响力的超过8700多种核心学术期刊。利用WebofScience丰富而强大的检索功能--普通检索、被引文献检索、化学结构检索等，您可