生物研究生开题报告模板

xx分子标记连锁图的构建

报告人：指导教师：（研究员）主要内容1国内外研究综述2主要研究内容和研究意义3研究材料和方法4预期结果5研究进展6可行性和创新性分析7可能出现的主要问题及解决方法

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xx的基本生物学特性和产业现状

一国内外研究综述xx主打品种的亲本来源较为局限，遗传多样性缺乏；近年来xx生产中面临的问题日益严重；亟需拓宽xx的遗传多样性，培养抗病、优质新品种。一

国内外研究综述2

国内外分子生物学研究现状瓠瓜的分子生物学基础研究却远远落后于黄瓜、西瓜、甜瓜等其他瓜类作物；目前主要依赖RFLP、RAPD等分子标记对种质资源进行遗传多样性研究；最近本实验室利用Roche454技术测序了瓠瓜10%的基因组；自主开发了400对SSR标记，并构建了基于UPGMA的系统树图。一

国内外研究综述材料长度标记数连锁群数平均间隔黄瓜RIL/F2群体706cM13175.6cM西瓜测交群体1976cM360195.8cM甜瓜瓠瓜RIL群体无1116cM190155.9cM一

国内外研究综述（1）瓜类作物分子标记连锁图谱研究现状3瓜类作物分子遗传图谱研究进展（2）遗传图谱构建意义和步骤遗传图谱的构建是分子生物学和基因组学研究的重要环节，是目的基因定位、标记辅助育种、背景选择和比较基因组分析的前提；遗传图谱作图的基本原理是染色体的交换与重组。一

国内外研究综述选择适合的遗传标记

构建群体搜集遗传标记

构建连锁群数据的处理分析，构建连锁群建立一个能充分、准确反映染色体重组交换的分离群体搜集反映染色体交换信息的遗传标记一

国内外研究综述研究内容：二

研究内容和意义意义：二

研究内容和意义技术路线三研究材料和方法群体基因型分析多态性分析连锁作图带型分析U♀×♂F2分离群体SSR基因型数据化基因型F1SSR标记多态性SSR引物xx分子标记连锁图比较基因图谱已测序的模式基因组比较基因组学分析方法：DNA提取和SSRs标记分析：用改进的CTAB法提取DNA。首先在亲本间进行多态性标记筛选，选出的多态性引物进一步用于对F2群体的基因型分析。连锁作图：对获得的标记基因型资料进行赋值，用卡平方法进行分离比的适合性测验。用软件对标记资料进行连锁分析，LOD值设定为3.0。利用函数计算遗传图距(cM)。三研究材料和方法图谱特征分析：比较基因组学分析：三研究材料和方法开发SSR引物1000对以上；构建的xx分子标记连锁图骨架图和其他研究整合后，可构建一张高密度的分子标记连锁图；使用该高密度的分子标记连锁图和已定位的模式基因组克隆比较分析，可绘制出比较基因组图谱。四预期结果五研究进展现阶段，亲本已确定，而F2群体也已构建完成。SSR标记开发已完成，共开发出SSR标记1000对；亲本SSR标记筛选已完成，筛选出有多态的SSR标记200对左右。五研究进展六可行性和创新性分析可行性：创新性：

实验中出现的偏分离标记的处理

共线性被打断区域的比较基因组学分析

七可能出现的问题和解决方法起止日期主要研究内容预期结果2011.05-2011.12多态引物的筛选得到多态性SSR标记2012.01-2012.06F2群体基因型分析得到分离群体SSR标记的基因型2012.07-2012.10带型分析得到数据化基因型2012.11-2113.01连锁作图和比较基因组