2010超算工作汇报

超级计算中心2010年工作汇报提纲超级计算环境建设与支撑服务超级计算环境建设客户服务超级计算环境运行与维护技术支持超级计算培训科研活动与学术交流主要科研项目举办学术会议国内外交流与合作论文发表情况人才培养及团队建设党风廉政建设基层党组织建设党员队伍建设党风廉政建设2011年工作计划超级计算环境建设与支撑服务－超级计算环境建设各项建设任务已基本完成，深腾7000故障问题有望在月底彻底解决，影响项目考核指标完成情况已申请变更分中心：自2010年9月21日起，已完成7家分中心的项目验收工作（依次为：9月21日合肥、10月9日兰州、10月13日青岛、10月27日昆明、11月4日大连、11月29日深圳，1月5日沈阳）所级中心（16）已完成接入（13）：力学所（北京）、基因组所（北京）、紫金山天文台（南京）、上海药物所、上海天文台、苏州纳米所、山西煤化所、福建物构所、高能所、空间中心、微生物所（北京）、数学与系统科学研究院、新疆生地所正在接入（3）：生物物理研究所、大气物理研究所、遥感应用研究所GPU（11）已完成接入：深圳先进技术研究所、网络中心、过程所、紫金山天文台、近物所、国家天文台、电工研究所、地质与地球物理研究所、中科大、高能物理研究所、金属研究所超级计算环境建设与支撑服务－网格建设取得显著成效：两个迁移传统集群用户逐步向网格方式迁移超算内部用户逐步迁移一个证书院计算网格中间件SCE通过总参三部系统软件测评中心的第三方严格测试一次考验在深腾7000的故障事故中，通过网格中间件将总中心的部分作业调度到分中心，院超级计算环境发挥了巨大的作用，总中心任务得以分流，分中心持续提供了大量共享资源，同时也提高了自身的利用率。超级计算环境建设与支撑服务－网格建设取得显著成效：144个网格账号提交作业、完成封装网格应用65个、通过网格累计提交作业43,553个、累计使用机时4,827,938CPU小时（Walltime）单位账号作业数平均计算规模机时（CPU小时）主要使用方式化学所zhengwj179447.51600443Portal昆明植物所hjzhu714112.61113559Portal大连理工大学tiandx64153.2424142命令行扬州大学YPZeng186350.2307326命令行理论物理所itp_np130396252072命令行北京师范大学chengw28136241831命令行动物所zhucd351183.2224840命令行北京航空航天大学zhangtian19216.9213574命令行物理所T05_iop86031.6115503命令行昆明植物所zhuanghuifu31715.279787Portal超级计算环境建设与支撑服务－客户服务深腾7000账号数259个超级计算环境建设与支撑服务－超级计算环境运行与维护按月提交“面向院领导的信息化设施运维月报”有关超算内容

分中心、所级中心、GPU使用率超算中心千核应用成果一览表超级计算环境建设与支撑服务－技术支持Ⅰ.生物物理所－冷冻电镜密度数据三维结构模型分割匹配和渲染多分子模型同时显示及操作分子亚基彩虹色对称展示基于T值的自动分割功能密度数据OutOfCore镜像操作密度数据体绘制算法及相关颜色表UI操作超级计算环境建设与支撑服务－技术支持Ⅱ.紫金山天文台－所级虚拟现实可视化应用开发与环境建设、盘古计划（C4）相关筹备天文暗物质：单帧可视化绘制和后台批处理动画超级计算环境建设与支撑服务－技术支持Ⅲ.大气所－海洋数据可视化结合地形信息、时序多变量表现实时绘制超级计算环境建设与支撑服务－技术支持Ⅳ.古脊椎所－RecViewer:挖掘探方分布可视化超级计算环境建设与支撑服务－技术支持Ⅴ.空间中心多面体自适应网格管理软件（一期）自适应网格的几何多重网格求解器（二期）超级计算环境建设与支撑服务－技术支持Ⅵ.金属所，钛合金相场模拟，OpenMP程序完成4096，5120核测试。应用户要求开发数据后处理程序。协助用户在软件基础上二次开发。Ⅶ.中国科技大学、罗德岛大学，地震波模拟。与用户联系、协助模拟结果的可视化。Ⅷ.理论物理所，curvatonmodel。Ⅸ.空间中心程永宏课题组超级计算环境建设与支撑服务－技术支持Ⅹ.天津工业生物技术研究所徐自祥课题组：matlab程序实现并行化Ⅺ.动物所朱朝东课题组：讨论，协助安装Beagle、Beast软件Ⅻ.力学所超级计算环境建设与支撑服务－技术支持“中国中医科学院中药方剂配伍并行程序开发”与公安局合作的北京市科技计划项目“提升大容量指纹自动识别系统综合性能的关键技术研究”项目与smith公司合作项目超级计算环境建设与支撑服务－培训举办各类大型培训共计13次日期地点培训内容1月5日昆明高性能计算技术培训3月15日-17日兰州中科院超级计算兰州分中心高性能计算培训3月31日-4月2日北京“基于GPU的并行计算及CUDA编程”2010春季培训班6月21日-6月25日北京“第十届”高性能计算培训班9月14日-9月16日北京国家天文台高性能计算培训班10月20日-10月22日北京基于GPU的并行计算及CUDA编程”2010秋季培训班11月1日北京遥感所高性能计算培训11月22日-11月24日北京生物信息学高性能计算培训11月26日-11月28日大连计算化学培训12月11日-12月13日北京NWChem软件培训科研活动与学术交流－在建项目情况2010年合作申请一个973项目、三个863项目在建各类项目共计33项（含973、863、NSFC、院信息化专项、所基金、横向课题等）项目类型项目名称项目起止日期973项目复杂装备研发数字化工具中的计算力学和多场耦合若干前沿问题2010年1月-2014年8月863项目面向大型飞机设计的万核级流场数值模拟软件研制2009年12月～2010年12月CNGrid生物信息与计算化学科学计算社区研究与开发2009年11月～2010年12月地球系统模式中的高效并行算法研究与并行耦合器研制2010年-2012年12月科研活动与学术交流－举办学术会议国际会议7月26日-7月29日，哈尔滨，2010年科学与工程中多尺度问题的GPU应用国际研讨会10月21日-10月23日，北京，中美高性能计算应用研讨会12月5日-12月10日，哈尔滨，2010年理论和计算化学:高性能计算模拟国际学术研讨会国内会议4月26日，北京，中国国家网格重大项目工作会议7月6日，北京，高性能计算在经济社会发展中的应用研讨会7月30日-8月1日，内蒙古，中国国家网格实用化推进工作会10月27日-10月30日，北京，HPCChina2010参展11月2日，北京，国家863计划“高效能计算机及网格服务环境”重大项目成果发布会11月5日-11月9日，广西，2010年中国科学院超级计算中心用户年会科研活动与学术交流－国际合作与交流6月6日-6月17日，德国、意大利，迟学斌、金钟，ISC108月8日-8月14日，香港，陆忠华、邓笋根、姜金荣、仲倩黎、李虹，第九届分布式计算及应用国际研讨会8月9日-8月13日，美国，迟学斌、金钟、王龙，ACCESS108月26日-8月28日，香港，迟学斌，国家网格节点开幕9月19日-9月23日，美国，王龙，NvidiaGTC全球技术峰会10月16日-10月20日，美国，迟学斌、金钟，IESP第五次会议11月12-11月21日，美国，迟学斌、金钟，SC201012月7日-12月12日，日本，迟学斌，PCCluster会议科研活动与学术交流－论文发表情况【1】赵永华、迟学斌、王龙、王武，EfficientParallelAlgorithmsfortheEigenproblemSolveronThousandsofCores，2010InternationalConferenceonResourceEnvironmentandInformationTechnology，1卷，335-340页【2】单桂华、刘俊、田东、汪云海、叶良、迟学斌，冷冻电镜密度图可视化软件VAT4M，生物物理学报，26卷，7期，590-599页【3】邓笋根、张宏海、迟学斌、Guoxiao-cheng、Pengzhong，DataProcessinginSpaceWeatherPhysicsModelsintheMeridianProject，DCABES2010【4】姜金荣、张小曳、周春红、刘洪利、迟学斌，StudyonSand-dustModelCoupledwithPSU/NCARMesoscaleModelandItsApplicationinNortheastAsia，2010NinthInternationalSymposiumonDistributedComputingandApplicationstoBusiness,EngineeringandScience【5】王武、冯仰德、迟学斌，ParallelelectromagneticsimulationforelectriclargetargetbyEMS-FMM，Proceedings-5thInternationalConferenceonFrontierofComputerScienceandTechnology,FCST2010，36-39页【6】阳卫清、迟学斌、张宏海，Performance-ForecastandResource-AutonomyGridMonitoringArchitecture(PFRA-GMA)，DCABES2010科研活动与学术交流－论文发表情况【7】阳卫清、迟学斌、武虹，Compass:aDataAggregationandmendationTechnologyintheEfficientandScalableGridMonitoringSystem(ESGMS)，ProceedingsoftheInternationalConferenceonGridComputingandApplications(GCA'10)【8】刘晨、胡永宏、迟学斌，基于MPI的精确非参数检验之Fisher网络算法的并行算法研究，微电子学与计算机，27卷，3期，158-162页【9】姜金荣、张小曳、迟学斌、陆忠华，沙尘暴数值预报模式CUACE-Dust的并行与优化，华中科技大学学报，38卷，1期，47-50页【10】王小宁、肖海力、曹荣强，中国国家网格软件集成与应用服务研究，华中科技大学学报，38卷，111-114页【11】王云志、杨梅、王刚、徐东生、张鑑、杨锐，Ti6Al4V合金中α相颗粒溶解的相场模拟，中国有色金属学报，20卷，1期，491-494页【12】仲倩黎、迟学斌、张宏海、岳兆娟，IncreasingClientSatisfaction:RequestSchedulingforInformationService，2010NinthInternationalSymposiumonDistributedComputingandApplicationstoBusiness,EngineeringandScience【13】仲倩黎、陆忠华、迟学斌、张宏海，ToenhanceefficiencyofIndexServiceonSGMS:Scalablegridmonitoringsystem，2010The2ndIEEEInternationalConferenceonInformationManagementandEngineering(ICIME)，193-198页科研活动与学术交流－论文发表情况【14】李虹、迟学斌、陆忠华，TheApplicationsandTrendsofHighPerformanceComputinginFinance，DCABES2010【15】李虹、陆忠华、迟学斌，ParallelComputingforDynamicAssetAllocationbasedontheStochasticProgramming，2010WASEINTERNATIONALCONFERENCEONINFORMATIONENGINEERING，2卷，172-176页【16】常红旭、王国成、陆忠华，社会经济计算实验中的Agent行为分类器，第二届全国社会计算会议【17】赵韬、迟学斌、陆忠华、赵永华，求解大规模矩阵特征问题的并行算法研究，计算机工程，36卷，6期，12页【18】曹荣强、曹宗雁、迟学斌、肖海力，基于RMI的高性能计算网格二次开发模型，计算机应用，30卷，9期，【19】龙斌，迟学斌，肖海力，基于命令行客户端的网格软件SCE设计与实现，计算机系统应用，19卷，9期，64页【20】段启智、金钟、刘倩、迟学斌，AnIntergratedandGridBasedSolutionofChemicalApplications，InformationComputingandApplications，40-47页【21】翟艳堂、涂强、郎显宇、陆忠华、迟学斌，基于CUDA的蛋白质翻译后修饰鉴定MS-Alignment算法加速研究，计算机应用研究，27卷，9期，3409-3414页【22】张宏海、迟学斌、陆忠华，AnOpenGridResourceSchedulerbasedonEconomicSchedulingAlgorithms，DCABES2010人才培养及团队建设新增员工13人，无离职人员毕业学生：硕士生6人、博士生3人（曹宗雁