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文档简介
第三章基因工程载体演示文稿现在是1页\一共有35页\编辑于星期五优选第三章基因工程载体现在是2页\一共有35页\编辑于星期五
(1)在宿主细胞内能独立复制,ori。(3)多克隆位点:外源基因插入的单一限制酶位点。2.基因工程对载体的要求(7)具有较好的安全性,不能任意转移。(2)有选择性标记
Ampr、Tetr、Kanr等。(4)分子量小,可容纳较大的外源基因片段。(5)拷贝数多,方便外源基因在细胞内大量扩增。(6)具有对受体细胞的可转移性。现在是3页\一共有35页\编辑于星期五载体的种类
基因工程中常用的载体有5类:
质粒(plasmid)
单链DNA噬菌体M13
噬菌体的衍生物柯斯质粒(cosmid)
动物病毒(virus)
现在是4页\一共有35页\编辑于星期五第一节
质粒载体
一、质粒(plasmid)独立于染色体以外的能自主复制的双链闭合环状DNA分子(CovalentlyClosedCircularDNA,ccc
DNA)。并不是细胞生长所必需的,但可以赋予细胞某些抵御外界环境因素不利影响的能力,如抗生素抗性、对重金属离子的抗性、分泌细菌毒素等。分子量在1-500kb之间广泛存在于细菌。现在是5页\一共有35页\编辑于星期五现在是6页\一共有35页\编辑于星期五5.根据基因工程的特殊要求加装特殊的基因元件三、质粒载体的构建1、质粒构建基本策略1.加入合适的选择标记基因,如两个以上,易于选择转化体2.增加或减少合适的酶切位点,便于重组3.缩短长度,提高导入效率,增加装载量4.改变复制子,变严紧为松弛,变少拷贝为多拷贝现在是7页\一共有35页\编辑于星期五现在是8页\一共有35页\编辑于星期五1.pBR322:p:质粒;BR:质粒两位主要构建者姓氏的第一个字母;322:实验编号人工构建载体三个亲本质粒:pMB1:出发质粒(ColE1)pSF2124:AmprpSC101:TetrpSF2124pMB1pSC101四、经典的大肠杆菌质粒载体现在是9页\一共有35页\编辑于星期五氨苄青霉素和四环素抗性24个单一克隆位点。9个导致Tetr基因失活3个会导致Ampr基因失活现在是10页\一共有35页\编辑于星期五氯霉素扩增之后,每个细胞可达1000~3000copies③
安全失去了转移蛋白基因mob(mobilization)。不能通过接合转移。②高拷贝数
①
分子小,克隆能力大长度4363bp,易于纯化,可以携带6-8Kb的外源DNA片段。④具有较多的单一酶切位点(24种)现在是11页\一共有35页\编辑于星期五4、pUC质粒载体1987年,J.Messing和J.Vieria采用MCS技术在pBR322基础上构建的结构:(1)来自于pBR322的Ori(2)氨苄青霉素的抗性基因(ampr)。
但核苷酸序列发生了变化(3)LacZ′基因
编码β—半乳糖酶的α—肽链(4)MCS区段
(MCS)区段位于lacZ’基因中的靠近5’-端的一段多克隆位点。但它并不破坏该基因的功能。现在是12页\一共有35页\编辑于星期五与pBR322相比,pUC质粒载体优点:(1)具有更小的分子量和更高的拷贝数
如pUC8为2750bp,pUCl8为2686bp,控制质粒复制rop基因的缺失,平均每个细胞即可达500~700个拷贝(2)适用于组织化学法检测重组体
通过-互补作用,利用菌落颜色筛选重组子。而pBR322质粒的重组子要进行两步的选择。
(3)具有多克隆位点区段(MCS)
适合不同粘性末端的DNA片段插入,不必连接接头
现在是13页\一共有35页\编辑于星期五
释放出的蓝色物质可以将整个菌落染成蓝色,非常容易辨别,如果LacZ’插入外源基因被破坏,菌落则是白色的
。组织化学法检测重组体X-Gal-半乳糖苷酶IPTG诱导物异丙基-β-D-硫代半乳糖苷
半乳糖
5-溴-4-氯-靛蓝+现在是14页\一共有35页\编辑于星期五现在是15页\一共有35页\编辑于星期五第二节噬菌体载体组成:蛋白质、核酸.结构:蛋白质外壳、尾巴尾巴上的微丝可以把噬菌体的DNA注入细菌内。是比细菌还小得多的微生物,噬菌体侵犯细菌,可以认为它是细菌里的“寄生虫”。Bacteriophage(phage)现在是16页\一共有35页\编辑于星期五一、大肠杆菌的λ-噬菌体DNA(1)线状双链DNA,两端各有一个12bp的互补单链(粘性末端,cohesive-endsite),称λcossite,粘性末端粘连接变成环状DNA。(一)λ-噬菌体的生物学特性1、由外壳包装蛋白和λ-DNA组成λcos位点是噬菌体包装必需序列。
2、λ-DNA的物理图谱48.5kb现在是17页\一共有35页\编辑于星期五(2)功能相近的基因在基因组中聚集在一起
目前已经被确定的基因至少61种,一半为必需基因现在是18页\一共有35页\编辑于星期五(二)λ噬菌体载体的构建1.选用λ噬菌体作为构建克隆载体材料的依据是一种温和噬菌体。能承载比较大的外源DNA片段λDNA分子上有多种限制酶的识别位点2.构建λ噬菌体克隆载体的技术路线用限制酶切去λDNA上的非必需区在λDNA上非必需区内插入选择标记基因建立λDNA分子体外包装系统现在是19页\一共有35页\编辑于星期五现在是20页\一共有35页\编辑于星期五
(1)插入式载体只具有一个可供外源DNA插入的限制酶位点的λ噬菌体。常用:λgt10、λNM1149等载体.(2)置换型载体(取代型载体)具有成对的限制酶位点,在这两个位点之间的λDNA区段可以被外源插入的DNA片段所取代。
常用:EMBL3、EMBL4二.λ噬菌体载体的主要类型现在是21页\一共有35页\编辑于星期五三、λ-DNA作为载体的优点可在体外包装成噬菌体颗粒,高效转染大肠杆菌λ-DNA载体的装载能力为25kb,远远大于质粒的装载量重组。λ-DNA分子的筛选较为方便。
λ-DNA载体适合克隆和扩增外源DNA片段,常用于构建基因文库缺点:(1)需要包装比较麻烦,包装率又不稳定,购买包装蛋白的费用又高;(2)没有质粒的用途广泛。现在是22页\一共有35页\编辑于星期五第三节、人工染色体克隆载体
基本元件:含有质粒克隆载体所必需的第一受体(大肠杆菌)的质粒复制起始点;第二受体(如酵母菌)染色体DNA着丝点、端粒和复制起始点的序列.合适的选择标记基因。
利用染色体的复制元件来驱动外源DNA片段复制的载体。酵母人工染色体(YAC)细菌人工染色体(BAC)现在是23页\一共有35页\编辑于星期五(一)酵母人工染色体(YAC)
把酵母染色体与基因复制和表达有关的主要组件都组装在质粒上,令质粒行使酵母chr的转录功能和复制功能。
装载量为350-400kb含有的元件:酵母自主复制序列(ARS)着丝粒序列(cen)四膜虫端粒(tel)质粒选择标记酵母系统的选择标记质粒复制起点现在是24页\一共有35页\编辑于星期五一、YAC的基本序列元件酵母染色体DNA自主复制序列(ARS)酵母染色体的着丝粒序列(CEN)酵母染色体的端粒序列(TEL)酵母人工染色体(YAC)YAC载体主要是用来构建大片段DNA文库,特别用来构建高等真核生物的基因组文库,并不用作常规的基因克隆。
现在是25页\一共有35页\编辑于星期五酵母自主复制序列(ARS)一段特殊的序列,含有酵母菌中DNA进行双向复制所必需的信号。
现在是26页\一共有35页\编辑于星期五酵母着丝点(CEN)在YAC中起到保证一个细胞内只有一个人工染色体的作用。pYAC4:酵母第四条染色体的着丝粒。现在是27页\一共有35页\编辑于星期五正常酵母人工染色体含有:*四膜虫端粒(tel)定位于染色体末端一段序列,用于保护线状的DNA不被胞内的核酸酶降解,形成稳定的结构。现在是28页\一共有35页\编辑于星期五二、
YAC载体的选择标记主要采用营养缺陷型基因TRP1:色氨酸生物合成基因缺陷型
URA3:尿嘧啶生物合成基因缺陷型
LEU2:亮氨酸合成基因缺陷型
SUP
4:赭石突变抑制基因
现在是29页\一共有35页\编辑于星期五克隆位点:位于sup4基因内SuP4是一个赭石突变(UAA)抑制基因。宿主酵母菌的胸腺嘧啶合成基因带有一个赭石突变ade2。在赭石突变宿主中,没有外源基因插入时,sup4基因抑制赭石突变,则形成正常白色菌落;有外源基因插入时,sup4基因遭破坏,则形成红色菌落,十分容易挑选出有DNA插入片段的红色菌落,建成YAC文库。现在是30页\一共有35页\编辑于星期五YAC克隆DNA片段的过程是:目的基因在限制性内切酶酶解后变成大片段DNA,克隆进酵母载体DNA,转染酵母缩主细胞,扩增后,根据标记性状筛选出重组的人工染色体。三、克隆策略现在是31页\一共有35页\编辑于星期五酵母人工染色体的使用现在是32页\一共有35页\编辑于星期五四、酵母人工染色体(YAC)缺点首先,在YAC载体的插入片段会出现缺失和基因重排的现象。其次,容易形成嵌合体。嵌合就是在单个YAC中的插入片段由2个或多个的独立基因组片段连接组成。嵌合克隆约占总克隆的5%~50%。第三,YAC染色体与宿主细胞的染色体大小相近,就很难从中分离出来,影响了YAC载体的广泛应用。
现在是33页\一共有35页\编辑于星期五(二)细菌人工染色体(BAC)
1992年Shizuya利用F因子的复制起点和氯霉素抗性标记基因,在F质粒(pMBO131)基础上构建了第一代BAC人工染色体。能够克隆和保持大于
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