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本文格式为Word版,下载可任意编辑——RNA提取方法及其对比Trizol法
1)将新鲜叶片约100mg放入液氮预冷过的1.5ml的Eppendorf管中,用带有200ul枪头的加样枪迅速将材料捣
碎成粉末(捣碎过程中Eppendorf管部分浸在液氮中),然后参与1mlTrizol试剂。振荡,充分混匀后,冰浴静置15min。
2)参与200ul预冷的氯仿,振荡混匀,冰浴静置5min。4℃,12000g离心15min。
3)吸取上清,参与与上清液成0.6倍体积的高盐溶液(1.2mol/L氯化钠和0.8mol/L柠檬酸钠)轻轻颠倒混匀,再
参与与高盐溶液等体积的异丙醇,轻轻颠倒混匀,-20℃静置15min。4℃,12000g离心5min。
4)弃去上清,参与1ml70%的乙醇洗涤沉淀。4℃,7500g离心5min。5)弃去上清,将沉淀枯燥5min,参与40ulDEPC水溶解沉淀。
CTAB-LiCl法:取0.2g新鲜组织或-70℃保存的样品,在液氮中充分研磨成粉末状,将磨好的粉末迅速转移至65℃预热的含有600μlCTAB提取液的离心管中,马上涡旋振荡30s,使其混匀;置65℃水浴中2~5min,期间涡旋振荡3~5次;稍微冷却后参与等体积的氯仿/异戊醇涡旋振荡1min后,4℃,12000r/min离心15min;取上清液,参与等体积的氯仿/异戊醇涡旋振荡1min,4℃,12000r/min离心15min;将上清转移到一新的离心管中,参与1/3体积的8mol/LLiCl,使其终浓度为2mol/L,4℃过夜沉淀;4℃,12000r/min离心20min,弃上清;分别用70%乙醇,无水乙醇洗沉淀,室温晾干,加30~50μlDEPC-H2O溶解沉淀。
CTAB-异丙醇法:步骤同CTAB-LiCl法,用等体积的异丙醇沉淀。
CTAB-LiCl及CTAB-异丙醇法都能成功的提取拟南芥及烟草幼嫩种子的总
RNA,只有Trizol法没有提取成功。在Trizol法提取的RNA中,未检测到28SrRNA和18SrRNA,只检测到5SrRNA,说明Trizol法不适合提取拟南芥及烟草幼嫩种子的总RNA。
在CTAB-LiCl及异丙醇法中,28SrRNA和18SrRNA条带明了,28SrRNA的亮度基本为18SrRNA的2倍,说明提取的总RNA很少降解。CTAB-异丙醇法提取的5SrRNA条带较CTAB-LiCl法明显。CTAB-异丙醇法提取的RNA电泳检测时,在点样孔下方有明显的亮带,说明该方法提取的RNA有较多的基因组DNA污染;CTAB-LiCl法所提取的总RNA基本无基因组DNA污染,但是对小分子RNA的沉淀效果不如CTAB-异丙醇。
反转录是检测RNA质量的良好方法,由于多糖等
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