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文档简介
核磁应用培训笔记一、一维H谱实验操作流程1New,name:样品名称;PROCNOSolvent:不代表锁场的溶剂,只影响最后打印谱图参数中溶剂项的显示;ExpenrimentDirs:标准实验,不代表脉冲系列;User下,可以建立自己的标准实验;H谱的标准实验名称是:proton2、getprosol:把相关的脉冲参数保存在Acqupars表中:Acqupars→PL13LockLOCK剂名称直接锁场;锁场的目的?4、atma:topshim5、NS输入数值6、rga7、zazerogoNotice:调谐:做同一样品的不同谱图时需要重新做一次调谐。topshim+空格+tunea同一溶剂的样品,建议在同一时段做谱,有利于匀场。样品③溶液高度太低。8、部分参数的设置edaased①PULPROG:脉冲系列名称,zg30:30度角激发,zg:90度角激发;②AQ-mod:采样模式③TD:采样点数④NS:采样次数⑤DS:空扫:真正开始采样前先采集的次数,做一维谱时可设为0,二维谱空扫的次数设置非常重要。⑥TD0,真正采样次数,NS*TD0,TD010,NS1024,1024*10⑦SWSWAQ⑧O1P,O1,ppmHZ最右边:谱宽/2+O1P和脉冲系列有关的参数①DE值,采样结束后等待衰减的时间。做杂核时需要更改。②D1:弛豫延迟,做定量H谱时需要更改P1;PL1(dB9、谱图处理Procpars:窗口函数①efp:指数函数,em、ft、pk②gfp:高窗函数:gm、ft、pk③apk:PHC,PHC1,Notice:LBLBLB0efpLBGBGFP定标plot如何创建模板?C:\Bruker\Topspin\Plot\Layouts,先另取名字创建模板,再将模板文件夹下的默认模板删除,如H创建的模板改为默认模板的名字。二、如何做H谱的定量?与标准一维氢谱相比,需要做一下变换1、将脉冲系列zg30改为zg,2、找内标,两个峰挨的很近且基线分离,一般很难找到合适的内标物。3、调整O1P,使得O1P在两个峰之间4、NS要足够大,为了保证较好的信噪比,定量最起码要做半个小时以上。5、D1>5T1,D15T1,T1,D1C13CPD1、getprosol2、atma3sw4、rga5、zg6、trtr4,427、efp:apk8、ppf:对碳谱的全谱进行标峰。9、Mi+数字+PPF:表示强度低于该数值的不标峰。10、goGO11、和脉冲相关的参数CPDPRG2,通常情况下用Waltz16,90杂核时需要更改。Notice:看到碳谱有裂分,首先要考虑是否有同分异构体,再考虑更改CPDPRG2,选择带bi的参数。四、碳谱定量实验(1CBIG,new→ok2、将zgig30改为zgig3、DS:0五、DEPT(45°、90°、135°)1、New→C13DEPT90→OK2、getprosol3(1NS,1/4.(2)PulseprogNS4(3)DS=8,NS=4,SW:谱宽,O1P.4、rga:zgNotice:DEPT45,只出现季碳;DEPT135:CHHALTSRcopySRDEPTDEPTC六、如何将多种谱图打印在同一张图上?方法一:1、先将全谱图调出并标好化学位移。2、选择1D+1D+1Dxwp打印模板3、在data中,点击ADD,选择实验数据现在的位置,将需要的数据拖入,点击Apply,确定。方法二:1、随意拖入一张谱图,输入plot2、全选中,并删除原有谱图3、在DATA里面选谱图,APPLY→OK;4、在右侧选择多个谱图叠加的图标,三条重叠的折线;5、在空白处拖动鼠标,出现第一张谱图6Edit,steaked,输入谱图张数。Spectra:0*5,05此方法的缺点是不能单独修改每一张谱图。七、一些补充注意事项1、BBf,探头。2、新安装仪器可以做的核有H、C、P、F、N,可以直接选择标准实验,直接调用标准模板。P31CPD,全去偶,zgpg30;P31:zg。LOCK之后可以直接输入一系列命令,点击ENTER直接完成。3(1)有无脉宽和功率(2)有无标准实验;4、P的化学位移的标定:外标法。(查找网上文献P0SRSRP标准品:85%磷酸溶液。不锁场、不匀场,直接调谐、prosol。不锁场实验1BSMSlock(2sweep(即将1(2)ON-OFFOFF(3)atma;rg;zg;八、对于没有标准实验、没有脉宽和功率的杂核如何入手做?以B11为例。1、首先查询该杂核的旋磁比、天然丰度,对于天然丰度太低的要求浓度高些,或者很难做出来。Help→NMRGuid→eNMREncyclopedia→NMRApplication→NMRpenddicTable→点击要做的元素查看旋磁比和天然丰度。2CC13IGok。3、更改参数Acqpar(都是C13C)→输入edspF1C13B11,F2→Default→Save→再次回到Acqupars扫描次数SW(+-200D(经验值2S,0(D1atma,手动调谐,第一次做核时必)→Tuningatma;rga;rgazgapksrefclose(O1P)→edmac(宏命令)+空格+名称(随意命名。校准背景信号,第一段(absf1absf2+空格+absf(absf1+absf2+absfNotice:BL4、如何创建标准实验模板?wpar→userparwritenew→→OK→close→new→10%NaPtC13IG90)九、部分二维实验温馨提示:二维谱实验最重要的就是控温。(一、实验一1、NewCOSYGPMFSW:用梯度场进行相关路径的选择。其中GP粒波的好处:可以从对角峰上看到单峰的性质,简化对角峰,易于解析。2、lock3、atma;topshim;getprosol,调谐的目的是为了接收线圈的频率与中心频率保持一致,提高灵敏度。DS16Pulseprog:查看脉冲系列。TD,F2256(设高一点可以提高分辨率与采样相关的参数:TD、NS、DS、SW、O1PNS、DSased,4、rga;zg5、谱图处理xfbxf,b调进一维谱①选中一维谱,右击,选择displayAs2Dprojection。②选F1+F2点等高线调整图标(一个没有底边的三角弧形,中间几条平行线穿过)进Levelincrement1.2-1.3Numberoflevel(等高线数32;Fill→Apply→OKclev+32校准(即定标)放大谱图进行定标。proj,选择UPdatarows/colsfromdisplay→ok→calculatepositiveprojection→峰都去除噪音)(二、实验二1SWSP②TD(F2=2048,F1≥256)③SW,O1P;④D9:自旋锁定时间,默认值为0.08S,即混合时间(设短的话可能会无法调整相位)2、lock3、atma;topshim;getprosol;4、谱图处理xfb调等高线01校准(三)实验三1、New→NOESYPHSW→适用于大分子2、①NS:8*N;DS:16*N;②D8混合时间,空间<5à,峰的强度与距离的六次方成正比。对于大分子,D8=0.1~0.3S;对于小分子:D8=0.6~0.8。Notice:分子量越大,弛豫时间越短,分子量越小,弛豫时间越长,温度越高弛豫时间越短。3、lock4、getprosol5、atma;topshim;rga;zg(四)实验四1、new,标准实验选择ROESYPHSW,PH:通过相位循环可以减掉一些峰。2、具体实验步骤与前面的实验步骤大致相同,通过查看与脉冲系列相关的参数对参数进行设置。接着LOCK,getprosol;atma;topshim;rga;zg3SetEnableautomaticcommandspooling钩。可以针对一个样品的自动排列做多个实验。(五)实验五:J-Resolved1、new→cosy45sw(先借用)2、Pulprog:jresqf(消除化学位移,保留耦合常数)3、NS:4*N;DS:16;4F2(化学位移;F1(耦合常数)SW=20,SWH=50HZ,O1PF2,F15、getprosol6、lock7、atma;topshim;rga;zg;(六)实验六H-C相关的二维谱1New,选择标准实验:HSQCETGPSISP,ET梯度;SISP2、输入命令eda,进行采样参数设置:NS=1*N,DS≥16,TD,SW(F2H宽,F1CasedCNST2:HZ,C直接耦合常数的平均值。②GPZ2,C:20.1%,N15,8.1%,若有些杂核没有显gradratio3、lock4、getprosol;atma;topshim5、rga;zg(七)实验七1、New→HMBCGPND,ND表示在采样时间内不进行去耦。2(1)NS=2,DS=16,O1P=?,SW=?可以适当地减小,当看不到交叉峰时,可能该值设大了,也可能是因为二面3、lock4、atma;topshim;rga;zgNotice:HMBC谱图中可能存在HSQC的残余峰。(八)HMBCHSQC1、new→HMBCGPND,Ttitle:J-FilterHMBC2、更改脉冲系列及参数Pulprog→HMBCGPL2ndqfeda,更改采样参数,NS=2*N,DS=16,QF,TD(F1,F2),O1P输入命令ased,更改与脉冲系列相关的参数,CNST6:120HZ;CNST7180HZ,HSQCCNST13,百分比根据右侧提示填写。3、getprosol4、lock5、atma;topshim;rga;zg十、完整的二维谱图处理过程1、输入xfb,谱图变换;2、调入一维谱,选择F1+F2,→ok3、clev32,修改等高线。4、校正相位(NOESY、ROESY、TOCSY、HSQC需要校正相位,其他的不需要)点相位校正图标,选几个点,ADD,先校正红线所在的位置。5、定标:先定好一维谱,读出化学位移,再点击定标图标,找出中心位置进行定标。6T1,左边没有信号的投影。Proj→edit→update→ok→sub27F1,edp→procpars→founer→ME_mod→LPfr(LP32。此处理的缺点是可能产生鬼峰。十一、核磁的维护(一)硬件维护1、机柜里面的滤网一般一年清洗一次2、建议每周重启电脑一次3、打开机柜需要带放静电手环4、每次严格开关机,关机开机后要做一次CF。5、90度脉冲校准正常情况下半年做一次,对新仪器可能需要三个月做一次。6、field的校准,正常情况下半年一次,对于新仪器三个月做一次。(二)磁体及软件维护1、1H90度脉冲的校准,标样:0.1%EBinCDCL3new,PROTON,title:1H90callockgetprosol;atma;topshim更改参数edazg30→zg;NS=1,DS=0;O1P=2.6PPM(在乙基的四重峰中央)。asedD1=20S,RG=16;P1=10.60来(脉冲作用时间)2;PLW1PL1P1P1个谱看看。rga;zgefp;apk,处理谱图,并找到四重峰,使当前窗口只出现四重峰。dpl,定义打印区间。procpars,PH_modPK)输入命令POPT,脉冲的功率为脉宽的优化模式。勾选第三个选项即performautomaticbaseline(PARAMETERP1OPTMUM3*10.60;ENDVAL4*10.60+4;INC2,36、38Staroptimlze→Save→ok→180skipcurrentoptim…停止实验。TITLEAcquars360490prosolpulse→Save→selectallrelevant→ok→输入密码→ok→yes→ok→yes→ok,2、C1390ASTM(P48)new→PROCNO1)→C13CPD(标准实验名称)getprosol→lock→atma;topshimedazgpg30O1P=67O2P=3.5asedRG=32D1(S)=20;P1先记录下原始数值如8.8,先赋予小点的值如2uszgCH90H90Noticeprosol390new→pulsecal90closepulsecalclose4、3D匀场,标样:90%水+10%重水。new,HlockH0+DO2 2atma;topshimgui(Y)3D→After:ZX-Y-XZ-YZ-Z(Before)→Star→close。H,lock→getprosol;atma;topshimwsh→filename→write→closeNoticeDMSOTMS星峰③看溶剂本身的峰信号,越窄越好。5、lockfield的校准方法一:锁场锁氘信号,标样用10%的EBinCDCl3进样lockCDCl3BSMSlock\level→field→field(6704.3)→点ON-OFF脱锁→输入命令lopo,enter进行锁场参数的优化→选溶剂,点ok6704.3(锁场后的值。值可以使其变得对称,从交叉点出来的第一个峰都是向上的。stanby,edlock,方法二:什么溶剂都锁不上的情况下使用该方法H0+DO2 2sweepON-OFF修改采样参数,建立一个Hatma;rga;zg;efp;apk4.7procparsPH_modpk;gs,BSMSlock\levelfiled4.74.7Standby,输入命edlock,点折线图标,保存。GSstopCDCl3
样品做校准。十二、一维选择性激发实验1、实验一:针对分的比较开的峰新建一个实验,做一个一维谱。点击积分符号,在自己想要的信号上,对其进行积分。“Saveasveg”右击保存图标,保存。buttonnmrselect…setGrROESY→OK→;②cancelcancel。NS=8%N,DS=4*Nrga;zgef→相位校正,一般会出现三种信号:相关信号、吸收型信号、色散信号2、实验二:针对重叠比较严重的多重峰。CSSF:chemicalshift化学位移,selectivefilter。进样,采集一个一维谱找到重叠峰,拷贝其中的一个化学位移:所关心的峰的中间位置。O1P更改脉冲系列(pulprogselcssfzs.2→okNS=2*N,DS=16,TD0=8~16,部分参数根据右侧提示修改。CNST2=4(此值取决于峰的重叠程度)rga;zg3、实验三i,I更改脉冲系列,将selcssfzs.2→selecssfdizs.2(2zs;dicosy)D9(混合时间、NS、DS、TD0rga;zgtocsynoesyroesyhmbc角峰,只有交叉峰。十三、溶剂峰的压制1、只压制一个峰做一个一维谱,找到要压制的峰,复制化学位移。new→标准实验名称为:WATERSUP,NOESYGPPR1d→ok:低功率、长时间的功率,关键设置参数D1PL9。对NS、DSPL9=60dB(该值越大,实际功率越大;D1=2s(时谱宽要足够大。getprosol;2、压制两个峰edc→标准实验名称:LC1D12→OKO1P:1(谱图的中间)O2P:压制峰2的中间位置的化学位移值。getprosol(4)NS=8*N,DS=4,PL9=60(5)rga;zg3、如何压制多个峰?new→LC1DCWPS(标准实验名称)NS、DS、SWgetprosolL30N)xaua(自动采集一个一维谱N4、水峰的压制(与压制一个峰的步骤是一样的)new→WATERSUB→NOESGPPR1dO1PNS、DS、D1、PL9getprosollockatma;topshim;RGA→RG,RGrga;zg→fp→all→apkO1rga;zg(多次循环,直到水峰的压制达到好的状态5、实验五(1)edc(new)→NOESYPR1D(标准实验名称)(2)D8=0.1S;NSDS(O1(O1P=4.7)D11=30ms=0.03sD1=2S;PL9=50~60Db(不宜给太大的值)getprosollockatma;topshim;rga;zgINOESYGPPR1d(加梯度场实验Notice:加梯度场对锁场相位要求比较高。十四、Topspin软件介绍1re、rep、rel、repl+2、rel:打开最后一个实验名称下的实验号。Repl:实验号下面的某一处理号。3expl:2.13.04、命令.all5、E命令,选择要看的区域6ef;apk;ppf(标峰(输入一系列命令符)→excute→close。Notice:LB增宽因子指数窗函数。7、批处理积分(intser批处理积分命令)先对第一张谱图进行积分并保存intser选择第几个实验→nextoptions(calibrate:选定某一个位置;Normalizesumofintegrals归一化法)→第几个峰→定义几个→ok,归一化值加和多少,可以自己增。8、增加一个处理号(wrpCorldram9、去卷积(去卷积的峰保留在999的处理号上面)Analysis→Deconvolution→ok→options(用什么函数)(uselorentzianshape)→选择区域(阈值)→ok10、进入topspin用户名和密码的设置Set→options→admmistration→locktopspinuserinterface11、电子签名:Electromicsignaturecreationesign12、audit13、更改layout的三种途径①输入命令layout②contrl+P③处理参数中的Automation→layout14、模板保存的路径,C:\Bruker\Topspin3.0\plot\layouts15、stack1d多个谱图叠加16、parplot参数修改17、输入命令almanao打印化学位移18、利用NMRGuide自学:NMRGuide→输入关键词→搜索19、Help→manuals→1D\2Dstep-by-stepbasic十五、T1、T21、1HT1(做二维时也需要控温)H(New→getprosol→lock→atma;topshim;NS=1;DS=0;rga;zg→efp;apk12↓Iexpno1,O1P12↓zg30t1ir(实际是假二维)→点(目的是将其改为二维OK→到脉冲参数里面看采样参数:NS=8*N(此参数设置是实验的关键),DS=4,FnMODEundefined→TD(f1:变10f265536S(FF1LIST,找到VDLIST,VDLIST,edit(VDLISTVDLIST→rga;zg数据处理更改处理参数(procpars)SI{F1的一定是偶数,如16,其中SI(F1)>TD(F1);SI(F2)>TD(F2);f2)→相位调节图标,将十字线放在最下方,点鼠标右键选只需选一个点)→点RproparsF2PH_modPK→Analysis“T1/T2”图标,进入右侧FIDspectrum,弹出下一个对话slicenumber=1ok→点第二个图标peaksranges:弹出对话框,选manualintegration,弹出另一对话框,点ok分→积分后点击“带A的保存”图标,选第三个选项Exportregionstorelaxationmoduleandret→①fitingfuntionuxnmrt1②listfilename:vdlist③检查以上三项无误后输入ok,plotT1/T2,拉动左键。2、1HT2(自选回波)H(New→getprosol→lock→atma;topshim;NS=1;DS=0;rga;zg→efp;apkIexpno1,O1P都不变。12↓cpmg,将一维模式改为二维模式。NS、DS、FnmodeNS=8*N,DS=16,TD(F2=65536,F1=10),Fnmode:Nodefined,SW(6)在LISTVIDLIST()D2O
来计算,是关键,单个循环时间=2D+P180→保存。2O回到采样参数中,查看和脉冲系列相关的参数,D2O
稍微大于50*P2(注意单位换算D1T1D1>5T1,本T2②NSDS③TDS1④VVLIST的设定,最后一个循环次数由D2O
2O决定。rga;zg谱图处理(T1)更改处理参数(procpars)SI{F1的一定是偶数,如16,其中SI(F1)>TD(F1);SI(F2)>TD(F2);f2)→相位调节图标,将十字线放在最下方,点鼠标右键选只需选一个点)→点RproparsF2PH_modPK→Analysis“T1/T2”图标,进入右侧FIDspectrum,弹出下一个对话slicenumber=1ok→点第二个图标peaksranges:弹出对话框,选manualintegration,弹出另一对话框,点ok分→积分后点击“带A的保存”图标,选第三个选项Exportregionstorelaxationmoduleandret→①fitingfuntionuxnmrt1②listfilename:vclist③检查以上三项无误后输入ok,plotT1/T2,拉动左键。Notice:此时得到的T2不是真正意义上的T2,而是循环次数,因此T2实际值计算公式为:如本例中得到的值为 68.365,则T2的实际值(2D
+P2)=68.37*(2*0.00105+20.80*10-6S)=151ms,注2O 2O意单位换算,P180即为P2。CT1tlirpg十六、如何设置命令的自动排列?setEnableautomaticcommandsppoling→okset→morepreferences→statusbarprefrences→change勾选需要显示的栏目→Apply→ok→Acquisitionbaron/off态栏,关掉后再打开。十七、如何建立宏命令的图标?输入edmacedmac+空格+宏命令名称→输入①efp②apk③.All④AbSN⑤ppf→点file工具栏保存→关闭在菜单栏(目标栏)点右键,选择AdduserdefinedbuttonAdd/modifyabuttonwithtextlabel(Add/modifyabuttonwithananicon(图标)Abs:自动积分;AbSn十八、H-Pnew→AcetoneC13去偶)EDSP,13C31P→Default→Save→Close。getprosol(4)更改采样参数①sw(f1)=400;②ns=2*n,DS=16;③NUC1,f1改为31P;④O1P,O2P=-50;更改与脉冲系列相关的参数:①CNST13:8.0000(BC,关键参数)②凡是带梯度的实验,异核相关相关要设好核的梯度场,输入gradratio(改核后再修改)→弹出对话框,显示三个数值,依次填入梯度场中的参数设置中。lock:acetoneatma;topshim;rga;zgxfbdev32sref,回车,close,close。定标Notice:Nucleus1nuclOFF十九、变温实验50℃(若气流量太小,会导致样品管底部温度与上部温)能锁场即可。207%左右。用高纯氦吹十分钟左右,再迅速将铜管插入液氮杜瓦瓶中。②夏天的时候需要把气流量开大些。edte(温度控制,probu
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