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文档简介

什么是蛋白质?蛋白质(protein)是由许多氨基酸(aminoacids)通过肽键(peptidebond)相连形成的高分子含氮化合物。当前第1页\共有74页\编于星期六\11点蛋白质研究的历史1833年,Payen和Persoz分离出淀粉酶。1838年,荷兰科学家G.J.Mulder引入“protein”(源自希腊字proteios,意为primary)一词

1864年,Hoppe-Seyler从血液分离出血红蛋白,并将其制成结晶。19世纪末,Fischer证明蛋白质是由氨基酸组成的,并将氨基酸合成了多种短肽。当前第2页\共有74页\编于星期六\11点1951年,Pauling采用X(射)线晶体衍射发现了蛋白质的二级结构——α-螺旋(α-helix)。1953年,FrederickSanger完成胰岛素一级序列测定。1962年,JohnKendrew和MaxPerutz确定了血红蛋白的四级结构。20世纪90年代以后,随着人类基因组计划实施,功能基因组与蛋白质组计划的展开,使蛋白质结构与功能的研究达到新的高峰。当前第3页\共有74页\编于星期六\11点蛋白质的分子组成蛋白质的分子结构蛋白质结构与功能的关系蛋白质的理化性质蛋白质的分离纯化与结构分析主要内容:当前第4页\共有74页\编于星期六\11点蛋白质的生物学重要性分布广:所有器官、组织都含有蛋白质;细胞的各个部分都含有蛋白质。含量高:蛋白质是生物体中含量最丰富的生物大分子,约占人体固体成分的45%,而在细胞中可达细胞干重的70%以上。1.蛋白质是生物体重要组成成分当前第5页\共有74页\编于星期六\11点作为生物催化剂(酶)代谢调节作用免疫保护作用物质的转运和存储运动与支持作用参与细胞间信息传递2.蛋白质具有重要的生物学功能3.氧化供能当前第6页\共有74页\编于星期六\11点组成蛋白质的元素主要有C、H、O、N和S。

有些蛋白质含有少量磷或金属元素铁、铜、锌、锰、钴、钼,个别蛋白质还含有碘。当前第7页\共有74页\编于星期六\11点

各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16%。由于体内的含氮物质以蛋白质为主,因此,只要测定生物样品中的含氮量,就可以根据以下公式推算出蛋白质的大致含量:100克样品中蛋白质的含量(g%)=每克样品含氮克数×6.25×100蛋白质元素组成的特点当前第8页\共有74页\编于星期六\11点一、组成人体蛋白质的20种L--氨基酸

存在自然界中的氨基酸有300余种,但组成人体蛋白质的氨基酸仅有20种,且均属L-α-氨基酸(甘氨酸除外)。当前第9页\共有74页\编于星期六\11点H甘氨酸CH3丙氨酸L-氨基酸的通式RC+NH3COO-H当前第10页\共有74页\编于星期六\11点

除了20种基本的氨基酸外,近年发现硒代半胱氨酸在某些情况下也可用于合成蛋白质。硒代半胱氨酸从结构上来看,硒原子替代了半胱氨酸分子中的硫原子。硒代半胱氨酸存在于少数天然蛋白质中,包括过氧化物酶和电子传递链中的还原酶等。硒代半胱氨酸参与蛋白质合成时,并不是由目前已知的密码子编码,具体机制尚不完全清楚。当前第11页\共有74页\编于星期六\11点非极性脂肪族氨基酸极性中性氨基酸芳香族氨基酸酸性氨基酸碱性氨基酸二、氨基酸可根据侧链结构和理化性质进行分类当前第12页\共有74页\编于星期六\11点(一)侧链含烃链的氨基酸属于非极性脂肪族氨基酸当前第13页\共有74页\编于星期六\11点(二)侧链有极性但不带电荷的氨基酸是极性中性氨基酸甲硫氨酸当前第14页\共有74页\编于星期六\11点(三)侧链含芳香基团的氨基酸是芳香族氨基酸当前第15页\共有74页\编于星期六\11点(四)侧链含负性解离基团的氨基酸是酸性氨基酸当前第16页\共有74页\编于星期六\11点(五)侧链含正性解离基团的氨基酸属于碱性氨基酸当前第17页\共有74页\编于星期六\11点几种特殊氨基酸

脯氨酸(亚氨基酸)CH2CHCOO-NH2+CH2CH2CH2CHCOO-NH2+CH2CH2当前第18页\共有74页\编于星期六\11点半胱氨酸+胱氨酸二硫键-HH-OOC-CH-CH2-S+NH3S-CH2-CH-COO-+NH3-OOC-CH-CH2-S+NH3S-CH2-CH-COO-+NH3-OOC-CH-CH2-SH+NH3-OOC-CH-CH2-SH+NH3HS-CH2-CH-COO-+NH3HS-CH2-CH-COO-+NH3当前第19页\共有74页\编于星期六\11点三、20种氨基酸具有共同或特异的理化性质两性解离及等电点氨基酸是两性电解质,其解离程度取决于所处溶液的酸碱度。等电点(isoelectricpoint,pI)

在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性。此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点。(一)氨基酸具有两性解离的性质当前第20页\共有74页\编于星期六\11点pH=pI+OH-pH>pI+H++OH-+H+pH<pI氨基酸的兼性离子阳离子阴离子当前第21页\共有74页\编于星期六\11点(二)含共轭双键的氨基酸具有紫外吸收性质色氨酸、酪氨酸的最大吸收峰在280nm附近。大多数蛋白质含有这两种氨基酸残基,所以测定蛋白质溶液280nm的光吸收值是分析溶液中蛋白质含量的快速简便的方法。芳香族氨基酸的紫外吸收当前第22页\共有74页\编于星期六\11点(三)氨基酸与茚三酮反应生成蓝紫色化合物氨基酸与茚三酮水合物共热,可生成蓝紫色化合物,其最大吸收峰在570nm处。由于此吸收峰值与氨基酸的含量存在正比关系,因此可作为氨基酸定量分析方法。当前第23页\共有74页\编于星期六\11点四、氨基酸通过肽键连接而形成蛋白质或活性肽肽键(peptidebond)是由一个氨基酸的-羧基与另一个氨基酸的-氨基脱水缩合而形成的化学键。(一)氨基酸通过肽键连接而形成肽当前第24页\共有74页\编于星期六\11点+-HOH甘氨酰甘氨酸肽键当前第25页\共有74页\编于星期六\11点肽(peptide)是由氨基酸通过肽键缩合而形成的化合物。两分子氨基酸缩合形成二肽,三分子氨基酸缩合则形成三肽……肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合而基团不全,被称为氨基酸残基(residue)。由十个以内氨基酸相连而成的肽称为寡肽(oligopeptide),由更多的氨基酸相连形成的肽称多肽(polypeptide)。当前第26页\共有74页\编于星期六\11点+-HOH甘氨酰甘氨酸肽键当前第27页\共有74页\编于星期六\11点N末端:多肽链中有游离α-氨基的一端C末端:多肽链中有游离α-羧基的一端多肽链有两端:多肽链(polypeptidechain)是指许多氨基酸之间以肽键连接而成的一种结构。当前第28页\共有74页\编于星期六\11点+-HOH甘氨酰甘氨酸肽键当前第29页\共有74页\编于星期六\11点N末端C末端牛核糖核酸酶当前第30页\共有74页\编于星期六\11点

蛋白质是由许多氨基酸残基组成、折叠成特定的空间结构、并具有特定生物学功能的多肽。一般而论,蛋白质的氨基酸残基数通常在50个以上,50个氨基酸残基以下则仍称为多肽。当前第31页\共有74页\编于星期六\11点(二)体内存在多种重要的生物活性肽1.谷胱甘肽(glutathione,GSH)当前第32页\共有74页\编于星期六\11点GSH过氧化物酶H2O22GSH2H2OGSSG

GSH还原酶NADPH+H+NADP+GSH与GSSG间的转换当前第33页\共有74页\编于星期六\11点

体内许多激素属寡肽或多肽

神经肽(neuropeptide)2.多肽类激素及神经肽当前第34页\共有74页\编于星期六\11点蛋白质的分子组成蛋白质的分子结构蛋白质结构与功能的关系蛋白质的理化性质蛋白质的分离纯化与结构分析主要内容:当前第35页\共有74页\编于星期六\11点蛋白质的分子结构包括:

高级结构一级结构(primarystructure)二级结构(secondarystructure)三级结构(tertiarystructure)四级结构(quaternarystructure)当前第36页\共有74页\编于星期六\11点定义:蛋白质的一级结构指在蛋白质分子从N-端至C-端的氨基酸排列顺序。一、氨基酸的排列顺序决定蛋白质的一级结构主要的化学键:肽键,有些蛋白质还包括二硫键。当前第37页\共有74页\编于星期六\11点一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础,但不是决定蛋白质空间构象的唯一因素。当前第38页\共有74页\编于星期六\11点二、多肽链的局部主链构象为蛋白质二级结构蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构,即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象

。定义:

主要的化学键:氢键

当前第39页\共有74页\编于星期六\11点

-螺旋(-helix)

-折叠(-pleatedsheet)

-转角(-turn)

无规卷曲(randomcoil)

α-螺旋结构是常见的蛋白质二级结构蛋白质二级结构当前第40页\共有74页\编于星期六\11点α-螺旋结构是常见的蛋白质二级结构当前第41页\共有74页\编于星期六\11点-折叠使多肽链形成片层结构当前第42页\共有74页\编于星期六\11点-转角和无规卷曲在蛋白质分子中普遍存在-转角无规卷曲是用来阐述没有确定规律性的那部分肽链结构。当前第43页\共有74页\编于星期六\11点三、多肽链在二级结构基础上进一步折叠形成三级结构疏水键、离子键、氢键和范德华力等。主要的化学键:整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中所有原子在三维空间的排布位置。定义:当前第44页\共有74页\编于星期六\11点亚基之间的结合主要是氢键和离子键。四、含有二条以上多肽链的蛋白质具有四级结构蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用,称为蛋白质的四级结构。许多功能性蛋白质分子含有2条或2条以上多肽链。每一条多肽链都有完整的三级结构,称为蛋白质的亚基(subunit)。当前第45页\共有74页\编于星期六\11点由2个亚基组成的蛋白质四级结构中,若亚基分子结构相同,称之为同二聚体(homodimer),若亚基分子结构不同,则称之为异二聚体(heterodimer)。血红蛋白的四级结构当前第46页\共有74页\编于星期六\11点五、蛋白质的分类根据蛋白质组成成分:单纯蛋白质结合蛋白质=蛋白质部分+非蛋白质部分根据蛋白质形状:纤维状蛋白质球状蛋白质当前第47页\共有74页\编于星期六\11点蛋白质的分子组成蛋白质的分子结构蛋白质结构与功能的关系蛋白质的理化性质蛋白质的分离纯化与结构分析主要内容:当前第48页\共有74页\编于星期六\11点

天然状态,有催化活性

尿素、β-巯基乙醇

去除尿素、β-巯基乙醇非折叠状态,无活性(一)一级结构是空间构象的基础核糖核酸酶当前第49页\共有74页\编于星期六\11点一级结构相似的蛋白质具有相似的结构及功能────────────────────────

氨基酸残基序号胰岛素───────────────

A5A6A10A30────────────────────────

人ThrSerIleThr

猪ThrSerIleAla

狗ThrSerIleAla

兔ThrGlyIleSer

牛AlaGlyValAla

羊AlaSerValAla

马ThrSerIleAla────────────────────────当前第50页\共有74页\编于星期六\11点一些广泛存在于生物界的蛋白质如细胞色素(cytochromeC),比较它们的一级结构,可以帮助了解物种进化间的关系。氨基酸序列提供重要的生物进化信息当前第51页\共有74页\编于星期六\11点重要蛋白质的氨基酸序列改变可引起疾病例:镰刀形红细胞贫血N-val·his·leu·thr·pro·glu·glu·····C(146)HbSβ肽链HbAβ肽链N-val·his·leu·thr·pro·val·glu·····C(146)

这种由蛋白质分子发生变异所导致的疾病,称为“分子病”。当前第52页\共有74页\编于星期六\11点血红素与氧结合后,铁原子半径变小,就能进入卟啉环的小孔中,继而引起肽链位置的变动。二、蛋白质的功能依赖特定空间结构当前第53页\共有74页\编于星期六\11点别构效应(allostericeffect)蛋白质空间结构的改变伴随其功能的变化,称为别构效应。二、蛋白质的功能依赖特定空间结构当前第54页\共有74页\编于星期六\11点协同效应(cooperativity)一个寡聚体蛋白质的一个亚基与其配体结合后,能影响此寡聚体中另一个亚基与配体结合能力的现象,称为协同效应。如果是促进作用则称为正协同效应(positivecooperativity)如果是抑制作用则称为负协同效应(negativecooperativity)二、蛋白质的功能依赖特定空间结构当前第55页\共有74页\编于星期六\11点血红素与氧结合后,铁原子半径变小,就能进入卟啉环的小孔中,继而引起肽链位置的变动。二、蛋白质的功能依赖特定空间结构亚基配体当前第56页\共有74页\编于星期六\11点(三)蛋白质构象改变可引起疾病蛋白质构象疾病:若蛋白质的折叠发生错误,尽管其一级结构不变,但蛋白质的构象发生改变,仍可影响其功能,严重时可导致疾病发生。这类疾病包括:人纹状体脊髓变性病、老年痴呆症、亨停顿舞蹈病、疯牛病等。当前第57页\共有74页\编于星期六\11点蛋白质的分子组成蛋白质的分子结构蛋白质结构与功能的关系蛋白质的理化性质蛋白质的分离纯化与结构分析主要内容:当前第58页\共有74页\编于星期六\11点一、蛋白质具有两性电离的性质蛋白质分子除两端的氨基和羧基可解离外,氨基酸残基侧链中某些基团,在一定的溶液pH条件下都可解离成带负电荷或正电荷的基团。当蛋白质溶液处于某一pH时,蛋白质解离成正、负离子的趋势相等,即成为兼性离子,净电荷为零,此时溶液的pH称为蛋白质的等电点。蛋白质的等电点(isoelectricpoint,pI)当前第59页\共有74页\编于星期六\11点二、蛋白质具有胶体性质蛋白质属于生物大分子之一,分子量可自1万至100万之巨,其分子的直径可达1~100nm,为胶粒范围之内。颗粒表面电荷水化膜蛋白质胶体稳定的因素:当前第60页\共有74页\编于星期六\11点+++++++带正电荷的蛋白质--------带负电荷的蛋白质在等电点的蛋白质水化膜++++++++带正电荷的蛋白质--------带负电荷的蛋白质不稳定的蛋白质颗粒酸碱酸碱酸碱脱水作用脱水作用脱水作用溶液中蛋白质的聚沉当前第61页\共有74页\编于星期六\11点三、蛋白质空间结构破坏而引起变性在某些物理和化学因素作用下,其特定的空间构象被破坏,也即有序的空间结构变成无序的空间结构,从而导致其理化性质改变和生物活性的丧失。蛋白质的变性(denaturation)当前第62页\共有74页\编于星期六\11点造成变性的因素:如加热、乙醇等有机溶剂、强酸、强碱、重金属离子及生物碱试剂等。

变性的本质:——破坏非共价键和二硫键,不改变蛋白质的一级结构。当前第63页\共有74页\编于星期六\11点

应用举例:临床医学上,变性因素常被应用来消毒及灭菌。此外,防止蛋白质变性也是有效保存蛋白质制剂(如疫苗等)的必要条件。

当前第64页\共有74页\编于星期六\11点若蛋白质变性程度较轻,去除变性因素后,蛋白质仍可恢复或部分恢复其原有的构象和功能,称为复性(renaturation)。当前第65页\共有74页\编于星期六\11点

天然状态,有催化活性

尿素、β-巯基乙醇

去除尿素、β-巯基乙醇非折叠状态,无活性核糖核酸酶当前第66页\共有74页\编于星期六\11点在一定条件下,蛋白疏水侧链暴露在外,肽链融会相互缠绕继而聚集,因而从溶液中析出。变性的蛋白质易于沉淀,有时蛋白质发生沉淀,但并不变性。蛋白质变性后的絮状物加热可变成比较坚固的凝块,此凝块不易再溶于强酸和强碱中。

蛋白质沉淀蛋白质的凝固作用(proteincoagulation)当前第67页\共有74页\编于星期六\11点四、蛋白质在紫外光谱区有特征性吸收峰由于蛋白质分子中含有共轭双键的酪氨酸和色氨酸,因此在280nm波长处有特征性吸收峰。蛋白质的

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