NCBI资源介绍及使用手册

NCBINCBI本文名目:NCBI〔美国国立生物技术信息中心〕简介NCBINCBINCBI－CoffeeBreakNCBI－基因和疾病NCBI－UniGeneClusterofOrthologousGroupsofproteins〔COG)介绍GeneExpressionOmnibus〔GEO〕介绍LocusLink关于RefSeq：NCBI参考序列NCBI〔美国国立生物技术信息中心〕简介介绍理解自然无声但精妙的关于生命细胞的语言是现代分子生物学的要求。通过只有四个字母来代表DNA化学亚基的字母表,消灭了生命过程的语法，其最简单形式就是人类.说明和使用这些字母来组成的“单词和短语”是分子生物学领域的中心焦点。数目巨大的分子数据和这些数据的隐秘而精细的模式使得计算机化的数据库和分析方法成为确定的必需.挑战在于觉察的手段去处理这些数据的容量和简单性，并且为争论人员供给更好的便利来获得分析和计算的工具,以便推动对我们遗传之物和其在安康和疾病中角色的理解。国立中心的建立后来的参议员ClaudePepper1988114〔NCBI〕的立法。NCBI是在NIH〔NLM)的一个分支。NLM是由于它在创立和维护生物信息学数据库方面的阅历被选择的，而且这可以建立一个内部的关于计算分子生物学的争论打算.NCBI的任务是进展的信息学技术来帮助对那些掌握安康和疾病的根本分子和遗传过程的理解。它的使命包括四项任务:建立关于分子生物学，生物化学，和遗传学学问的存储和分析的自动系统实行关于用于分析生物学重要分子和复合物的构造和功能的基于计算机的信息处理的，先进方法的争论加速生物技术争论者和医药治疗人员对数据库和软件的使用。全世界范围内的生物技术信息收集的合作努力。NCBI通过下面的打算来实现它的四工程的：根本争论NCBI有一个多学科的争论小组包括计算机科学家，分子生物学家,数学家，生物化学家，试验物理学家，和构造生物学家，集中于计算分子生物学的根本的和应用的争论.这些争论者不仅仅在根底科学上做出重要奉献，而且往往成为应用争论活动产生方法的源泉。他们一起用数学和计算的方法争论在分子水平上的根本的生物医学问题。这些问题包括基因的组织，序列的分析,和构造的预测。目前争论打算的一些代表是：检测和分析基因组织，重复序列形式,蛋白domain建立人类基因组的基因图谱，HIV感染的动力学数学模型，数据库搜寻中的序列错误影响的分析，开发的数据库搜寻和多重序列对齐算法，建立非冗余序列数据库，序列相像性的统计显著性评估NCBI争论者还坚持推动与NIH内部其他争论所及很多科学院和政府的争论试验室的合作。数据库和软件199210,NCBIGenBankDNA序列数据库的责任.NCBI工作人员通过来自各个试验室递交的序列和同国际核酸序列数据库〔EMBL和DDBJ)交换数据建立起数据库。同美国专利和商标局的安排使得专利的序列信息也被整合.GenBank是NIHDNA序列的注释过的收集。GenBankDNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。这三个组织每天交换数据.GenBank14GenBank拥有来自47,00030孟德尔人类遗传(OMIM〕,三维蛋白质构造的分子模型数据库〔MMDB〕，唯一人类基因序列集合〔UniGene)，人类基因组基因图谱，分类学扫瞄器,同国立癌症争论所合作的癌症基因组剖析打算〔CGAP〕。EntrezNCBIEntrez同时也供给序列和染色体图谱的图形视图。EntrezNCBIPubMed检索的MEDLINE。EntrezPubMed获得，PubMedMEDLINE接到参与的出版商网络站点的全文文章。BLAST是一个NCBI开发的序列相像搜寻程序,还可作为鉴别基因和遗传特点的手段。BLAST能够在15DNA数据库执行序列搜寻.NCBI器〔ORFFinder)PCR，和序列提交工具，SequinBankItNCBI具可以从WWWFTPNCBI还有E—mail库一种可选方法。教育和训练NCBI沟通。一个科学访问学者工程已经成立，来培育同外部科学家的合作。作为NIH内部的局部争论工程，也供给博士后工作位置。NCBIDatabaseGenBankOverview根本信息什么是GenBank?GenBank是一个有来自于70，000多种生物的核苷酸序列的数据库.每条纪录都有编码区〔CDS〕特征的注释，还包括氨基酸的翻译.GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织，EMBLDDBJ。纪录样本-关于GenBankEntrezGenBank—通过EntrezNucleotidesaccessionnumber，作者姓名，物种，基因/蛋白名字，还有很多其他的文本术语来查询.关于Entrez更多的信息请看下文.用BLAST来在GenBankE-mailEntrezBLASTQueryBLASTFTPGenBank增长〕小节。公布通知,最-最近和马上有的变化，GenBankGenBank遗传密码—15GenBank〔向〕GenBank〔数据〕关于提交序列数据，收到accessionnumber，和对纪录作更的一般信息.BankIt—用于一条或者少数条提交的基于WWW〔请在提交前用VecScreen载体〕Sequin—提交软件程序,用于一条或者很多条的提交，长序列，完整基因组，alignments，人群/种系/突变争论的提交。可以独立使用，或者用基于TCP/IP“networkaware“模式，可以链接到NCBIEntrezPowerBLAST。〔请在提交前用VecScreen〕ESTs-表达序列标签，短的、单次〔测序〕cDNARACEcDNA序列。GSSs-测序阅读的DNAexontrap末端，及其他。HTGs—来自于大规模测序中心的高通量基因组序列，未完成的〔0，1，2〕和完成的〔阶段3〕序列。(留意：完成的人类的HTG序列可以同时在GenBankHumanGenomeSequencing页面问.)STSs-序列标签位点.短的在基因组上可以被唯一操作的序列，用于产生作图位点。注:SNPs—人类的和其他物种的遗传变异数据可以提交到NCBI数据库的单核苷酸多态性库中〔dbSNP)。国际核苷酸序列数据库合作组织GenBank，DDBJ，EMBL—合作打算的概述，并链接到相应的主页.GenBank，DDBJ(DNADataBankofJapan〕，andEMBL〔EuropeanMolecularBiologyLaboratory〕数据库共享的数据是每天都交换的，因此他们是相等的。数据纪录的格式和搜寻方式可能会不一样，但是accessionnumber，序列数据和注解都是一模一样的。即，你可以用accessionnumberU12345GenBank，DDBJ或EMBL中查找相应纪录，得到的结果是完全一样的序列数据，参考内容等等。DDBJ/EMBJ/GenBank特性表—特性表格式和标准被合作数据库用在序列记录的注释上，使得数据共享成为可能，包括具体的描述生物特性和特性限定语的附录，以及IUPAC规定的核苷酸和氨基酸的代号。FTPGenBankandDailyUpdatesGenBank一般文件格式-参见GenBankGenBank公布通知中的具体描述，下载大多数最近的完全公告和日常积存或非积存更数据。ASN.1格式—摘要句法记号1，国际标准组织〔ISO〕数据表示格式，下载大多数最近的完全公告和日常积存或非积存更数据。FASTA〔readme文件,包括nt。Z〔每天更的非冗余BLASTGenBank+EMBL+DDBJ+PDBEST,STS，GSS,orHTGS〕,nr。Z〔每日更的非冗余蛋白质〕，est.Z,gss.Z，htg。Z，sts.Z，和其它文件。分子数据库概览核酸序列Entrez核酸-accessionnumber,作者姓名,/核酸序列记录〔在GenBank+PDB中〕.更多的关于Entrez的信息见下。假设要检索大量数据,也可使用BatchEntre〔批量Entre。RefSeq—NCBI数据库的参考序列。校正的,DNAcontigs，基因的mRNAs.Accessionnumbers用NT_xxxxxx,NM_xxxxxx，NP_xxxxxx，NC_xxxxxx的形式来表示。dbEST—表达序列标签数据库,短的、单次〔测序)阅读的cDNA序列。也包括来自于差异显示和RACE试验的cDNA序列。dbGSS—基因组调查序列的数据库，短的、单次〔测序〕阅读的cDNA序列,exontrap获得的序列,cosmid/BAC/YAC末端，及其他。dbSTS—序列标签位点的数据库，短的在基因组上可以被唯一操作的序列,用于产生作图位点。dbSNP-单核苷酸多态性数据库，包括SNPs，小范围的插入/缺失,多态重复单元，和微卫星变异。完整的基因组参见下面Genome和Maps局部，包括各种物种资源，人，小鼠，大鼠，酵母，线虫,疟原虫,细菌，病毒，viroids，质粒。UniGene-被整理成簇的ESTmRNA序列，每一个代表一种特定的或假设的人类基因,有定位图和表达信息以及同其它资源的穿插参考cluster形式在Unigene网页下载，完整的数据可以从FTP站点repository/UniGene名目下下载。人类UniGene小鼠UniGene大鼠UniGene斑马鱼UniGeneBLAST—将你的序列同核酸库中的的序列比较，检索相像的序列 .〔更具体的信息见下面Tools/Sequence相像搜寻局部〕蛋白序列Entrez蛋白-accessionnumber，作者姓名,物种，基因/蛋白名字，以及很多其它的文本术语来搜寻蛋白序列记录(在GenPept+Swiss—Prot+PIR+RPF+PDB中Entrez的信息见下。假设要检索大量数据，也可使用BatchEntrez批量Entre。RefSeq-NCBI数据库的参考序列。CuratedDNAcontigs,基因的mRNAs和蛋白，在将来，整个的染色体.AccessionnumbersNT_xxxxxx,NM_xxxxxx，NP_xxxxxxNC_xxxxxx的形式来表示。FTPGenPept-下载“genpept。fsa.Z”文件,GenBank/EMBL/DDBJ记录中翻译过来FASTA格式的氨基酸序列,这些记录都有一到两个CDS特性的描述.完整基因组参见下面Genome和Maps局部，包括各种物种资源,人，小鼠，大鼠，酵母，线虫,疟原虫，细菌，病毒，viroids，质粒。Entrez基因组—供给了一个编码区的概要和各种物种的分类表TaxTabl基因组中全部的的蛋白,并供给链接到FASTA文件和BLAST。分类表总结了蛋白BLAST分析的结〔参见下面’GenomesMaps，’局部Entrez基因组的一般描述〕FTP基因组蛋白—ftpgenbank/genomes名目下下载各种物种的FASTA格式的氨基酸序列＊。faa和蛋白表文件*。ptt.readme文件.蛋白表也可以在Entrez基因组中看到。PROW—Web上的蛋白资源,200种人类的CD细胞外表分子的简短官方向导。相互检索,为每个CD20中标准信息的分类〔生化功能，配体，等等〕BLAST—将你的序列同蛋白库中的的序列比较，检索相像的序列。 〔更具体的信息见下面Tools/Sequence相像搜寻局部〕构造构造主页—关于NCBI构造小组的一般信息和他们的争论打算，另外也可以访问分子模型数据库〔MMDB)和用来搜寻和显示构造的相关工具。MMDB：分子模型数据库—一个关于三维生物分子构造的数据库，构造来自于X—ray晶体衍射和NMR.MMDB是来源于Brookhaven(PD,排解了那些理论模型。MMDB重组织和验证了这些信息，从而保证在化学和大分子三维构造之间的穿插参考。数据的说明书包括生物多聚体的空间构造,.利用将化学，序列，和构造信息整合在一起,MMDB打算成为基于构造的同源模型化和蛋白构造推测的资源效劳.MMDB的记录以ASN1Cn3D,RasmolKinemage来显示。另外,数据库中类似的构造已经被用VAST确认，的构造可以用VASTsearch来同数据库进展比较.Cn3D—“Seein3—D”，一个用于NCBI3-D构造和序列—构造或构造-构造同源比较.Cn3D用起来就象你扫瞄器上的一个帮助工具。VAST-矢量同源比较搜寻工具—NCBI开发的计算算法，用于确定相像的蛋白三维构造。每一个构造的“构造邻居”都是预先计算好的，而且可以通过MMDB的构造概要页面的链接访问。这些邻居可以用来确认那些不能被序列比较识别的远的同源性。VAST搜寻-构造—构造相像搜寻效劳。比较一个解出的蛋白构造和在MMDB/PDB数据库中的构造的三维坐标。VAST搜寻计算一系列可能会被交互扫瞄的构造邻居,用分子图形来观看重叠和同源相像。分类学NCBI的分类数据库主页—NCBI分类学家合作的外部治理者的列表.分类扫瞄器-搜寻NCBI的分类数据库包括大于70000个物种的名字和种系这些物种都至少在遗传数据库中有一条核酸或蛋白序列。可以检索一个特定种或者更高分类〔如属，科〕的核酸，蛋白，和构造记录。假设有物种的序列数据被放到数据库中，这个物种就北加到〔分类 )数据库中.NCBI的分类数据库的目的是为序列数据库建立一个全都的种系发生分类学。文献数据库概要PubMed-一个关于生物医药科学的检索系统，包括引用，摘要，和杂志的索引术语。它包括直接由出版商供给应NCBI的文献引用以及链接到在出版商网址上的全文的URLs。PubMed包括MEDLINE和PREMEDLINE的完整内容.MEDLINE认为超出范围的文章和杂志，〔这些文章或杂志)PubMed是比MEDLINE的更大的.杂志扫瞄器—允许你去查找收录到PubMedMEDLINEISSN号码。PubRef〔开发中〕—一个关于来自于宽阔范围的科学杂志的数目记录，和链接到出版商网址的全文.PubRef包含了PubMEd,加上了来自其它学科的杂志出版商供给的引用和摘要。因此它是比PubMedNAS要求为科学领域的电子杂志供给一个“白皮书“效劳。PubMed中心(开发中〕-PubMed中心是一个无障碍的NIH资源，用于在生命科学领域中2023PubMed中心的材料将由目前任一主要的摘要和索引效劳中列出的杂志供给，或者在编辑委员会中拥有3个以上有主要资金机构的OMIM—在线人类孟德尔遗传—常常更的人类基因和遗传失调的名目，有链接到其它相关的文献参考，序列记录，和相关数据库。书籍—同书籍出版商合作NCBI为网络改编了教科书PubMed—生物医药书目数据库.这是为了给PubMed供给,这样使用者可以探究在PubMed搜寻结果中不生疏的概念。目前收录的书有：MolecularBiologyoftheCell,3rded.AlbertsB.,BrayD。,LewisJ。,RaffMRobertsK。,WatsonJ。D.，1994,GarlandPublishing—Entrez中的特定的文章,杂志,或生物数据到外部网址的链接.URL，资源名字,关于他们网址的简要的描述,和关于从NCBIEntrez有效的布尔查询来写,也可以用特定的文章或序列的标志列表来写。这样NCBIPubMed的用户将可以通过“NCBI小房间”效劳(开发中来选择哪个外部链接在他们的搜寻中是可见的。引用匹配—允许你找到任何一篇在PubMed数据库中的文章的PubMedIDMEDLINEUID，给出书目信息(〕.单篇文章的引用匹配。很多文章的批量引用匹配。E-mail引用匹配也是可以的，也可以用于单篇或很多文章。假设要获得帮助文件,citation_matcher@写一封只有内容为HELP的E-Mail.GenomesandMapsOverviewEntrez基因组：人，小鼠，大鼠，酵母，线虫,疟原虫，细菌，病毒，viroids,质粒,和真核细胞器。Entrez基因组〔各种物种〕Entrez基因组-800种在GenBank中被完整测序的物种，包括大于50025种细菌，酵母,和很多viroids，质粒,和细胞器。还包括正在进展中的基因组，比方人，小鼠，线虫，疟原虫，果蝇，利什曼原虫,水稻,和玉米。供给完成的基因组/染色体的图形概览，并可以探究那些逐步细化的区域。也供给那些已经被NCBI工作人员分析过的物种的编码区的摘要和TaxTables.另外，EntrezMapViewer，Entrez基因组的一个软件组成局部，供给整合的果蝇〔细胞遗传学和序列图谱〕和人类〔细胞遗传学，遗传连锁,序列，放射杂交，和其它图谱〕的染色体图谱的扫瞄.通过每个物种的Entrez基因组页面来下载〈350kb的基因组。NCBIftp站点来下载〉350kb的基因组—genbank/genomesreadme文件，ftp链接在每个物种的Entrez基因组页面上也有。NCBI站点地图—-—HumanGenome人类基因组数据介绍向导人类基因组资源向导—可用的人类基因组数据资源概览。包括关于人类基因组的公告和进展报告和供给对以前分别的数据的集中访问。人类基因组序列数据的状态—描述了目前在GenBank基因组序列数据的争论.染色体人类基因组测序—每一条染色体，概述了人类基因组打算的测序进展〔图示和统计。供给对基因组序列数据的访问，也有链接到参与的国际基因组中心，各种STS图谱，疾病基因信息，和选择出的参考文献。列出完成的contigContig可以被显示出来，以表示组成他们的GenBanke-PCRSTS标记。Contig用在GenBankHTG序列记录来组装起来，组装的方法是用Jang,etal描述的过程，并给于一个NT_＊的accessionnumber，作为RefSeq打算的一局部。关于各期HTG序列的具体说明见HTG网页。Entrez图谱扫瞄器—整合的染色体图谱—图谱扫瞄器是Entrez基因组的一个软件组成局部，用来显示一个或多个用共同标记或基因名字相互align过的图谱，以及用一样序列进展比较过的序列图谱.在人类基因组数据和搜寻技巧文件中有关于20种序列，细胞遗传，遗传连锁，放射杂交，和其它的图谱。Entrez图谱扫瞄器的帮助文件供给了关于如何使用这个工具的一般说明。FTP—每个染色体都有一个文件名目包含各种格式的完成的基因组contiNT_记录hs_chr＊。asnASN。1格式(descriptionabove)hs_chr＊。fna.gzFASTA格式〔descriptionabove〕hs_chr＊。gbk.gzGenBankflatfile格式〔目前注解包括STS标记，和预期的基因将被在将来几个月中参加〕hs_chr＊.gbsGenBanksummary格式〔这个格式不含有序列数据，但是包含一个“CONTIG“字段，说明这个contig是如何有独立的GenBank〕BLAST人类基因组序列数据BLAST人类染色体—将一个核酸或蛋白序列同已经完成的HTGcontigContig用在GenBank中处于第三期的HTG序列记录来组装起来，组装的方法是用Jang，etal描述的过程，并给于一个NT_＊的accessionnumber，作为RefSeq打算的一局部。关于各期HTG序列的具体说明见HTG网页。同人类染色体作BLAST是人类基因组测序页面的一个组成局部。BLASThtgs数据库-将一个核酸或蛋白序列同未完成的HTG序列(0，1,2期〕进展比较〔关于HTG序列的具体说明见HTG网页〕.htgs数据库包含有来自很多物种的序列,你可以使用AdvancedBLAST页面来限定你的搜寻只在人类。BLASTgss数据库—将一个核酸或蛋白序列同随机的“〔测序阅读”的基因组调查序列比较，cosmid/BAC/YAC末端序列,exontrap获得的基因组序列，和AluPCR序列.尽管gss数据库包含有来自很多物种的序列,你可以使用AdvancedBLAST页面来限定你的搜寻只在人类。基因〔LocusLink〕-LocusLink给每个位点公布一个稳定的IDaccesssionnumber，表型,EC号码，OMIM号码，Unigene簇，图谱信息，和相关的网址。LocusLinkNCBI，人类基因命名委员会，OMIM和其它组织的合作结果。LocusLink目前包含人类，小鼠,大鼠,斑马鱼,和果蝇的位点，物种可以被分开或合在一起查询。OMIM—在线人类孟德尔遗传—常常更的人类基因和遗传失调的名目，有链接到其它相关的文献参考,序列记录，和相关数据库.RefSeq—NCBI数据库的参考序列。校正的，非冗余集合，包括基因组DNAcontigs，基因的mRNAs.Accessionnumbers用NT_xxxxxx,NM_xxxxxx，NP_xxxxxx，NC_xxxxxx的形式来表示.UniGene—被整理成簇的EST和全长mRNA,有定位图和表达信息以及同其它资源的穿插参考cluster形式在Unigene网页下载，完整的数据可以从FTP站点repository/UniGene名目下下载.序列人类基因组测序-每一条染色体，概述了人类基因组打算的测序进展〔图示和统计。供给对基因组序列数据的访问，也有链接到参与的国际基因组中心，各种STS图谱，疾病基因信息，和选择出contigContigGenBank中的记录的成分,或者那些由e-PCR确定的位于其上的STS标记.Contig用在GenBank中处于第三期的HTG序列记录来组装起来，组装的方法是用Jang，etal描述的过程，并给于一个NT_＊的accessionnumber，作为RefSeq打算的一局部.关于各期HTG序列的具体说明见HTG网页。RefSeq—NCBI数据库的参考序列。校正的，非冗余集合，包括基因组DNAcontigs，基因的mRNAs和蛋白，在将来，整个的染色体。Accessionnumbers用NT_xxxxxx，NM_xxxxxx，NP_xxxxxx，和NC_xxxxxx的形式来表示。Entrez—对GenBankEMBL,DDBJ,PIR—InternationalPRFSwiss-ProtandPDB数据库中的核酸和蛋白序列数据供给整合的访问,同时供给对3D蛋白构造，基因组图谱信息和PubMedMEDLINE的访问.Entrez包含了对每个数据库记录的预先计算好的相像搜寻，产生一个相关序列，构造，和MEDLINE记录的表.包括了来自>70000个物种的序列数据，可以用物种字段来限制记录只在人类搜寻。克隆克隆登记-由多方人类基因组测序中心使用的数据库，用来记录哪些克隆已经被选来测序,哪些正在被测序，哪些已经完成，哪些已经被送到GenBank中去了.包括BACs,PACs,cosmids，fosmids。使用统一的克隆名字表示克隆在微量板上的位置〔板号，行，和列位置前面加上库的缩写，来产生唯一的名字.包括了克隆定购的信息。基因组图谱Entrez基因组-Entrez基因组同时包括了一个人类线粒体的视图〔通过真核细胞器来访问，可以查看完整状况或查看逐步具体的信息。Entrez图谱扫瞄器—整合的染色体图谱—图谱扫瞄器是Entrez基因组的一个软件组成局部，用来显示一个或多个用共同标记或基因名字相互align过的图谱，以及用一样序列进展比较过的序列图谱.在人类基因组数据和搜寻技巧文件中有关于20种序列，细胞遗传,遗传连锁，放射杂交，和其它的图谱。Entrez图谱扫瞄器的帮助文件供给了关于如何使用这个工具的一般说明.GeneMap’99-〉35000个人类基因标记的物理图谱，由国际放射杂交图谱联合用全都的RH试剂和方法建成.〔富含基因区)100名科学家的国际合作努力。NCBIRH图谱—NCBI整合的RH图谱,GeneMap’99的G3和GB4的RH23723个标记.1084个框架标记〔一个G3GB4共同的子集〕被绘制。全部的标记被统一在GB4的尺度上.R。Agarwalaetal。的文章供给了具体的整合策略，以及评估整合图谱质量的方法。Mitelman癌症染色体变异摘要—Drs。Mitelman，Mertens，和Johansson建立的基因组范围NatureGeneticsVol.15(Spec。No):417—74(April1997)的超文本版本.OMIM基因图—遗传染色体位点来搜寻。可以从OMIM页面问。OMIM致病图—按字母排列的疾病和相应的细胞遗传图位点，链接到OMIM的条目。可以从OMIM页面访问.人类/小鼠同源图—UniversityofCaliforniaatDavisM.F。Seldin建立，一张比较人和老鼠在同源区段DNA上基因的表，按在每个基因组上的位置排列.绘制的标记dbSTS—序列标签位点的数据库，短的在基因组上可以被唯一操作的序列，因而可以确定在物理图谱上的特定位置。电子PCR〔e—PCR〕—DNA序列上觉察STS位点计算过程。GeneMap”99-〉35000个人类基因标记的物理图谱，由国际放射杂交图谱联合用全都的RH试剂和方法建成。供给了突出了染色体上关键标志〔富含基因区〕的框架，从而加速了测序，代表了超过100名科学家的国际合作努力。人类基因组测序—绘制的标记已经用e—PCR自动被放到完成的HTG序列组成的contig来源于dbSTS，GeneMap’99〔基于基因的标记)，StanfordG3RH单子〔又有基因标记也有非基因标记WhiteheadGB4RH单子和AC〔又有基因标记也有非基因标记Genethon和一些染色体特异的图谱,NHGRI7号染色体图谱，WashingtonUniversity的X染色体图谱。OMIM基因图-被报道的和被很多定位方法打算的基因的细胞遗传位点。可以用基因代号或细胞遗传染色体位点来搜寻.可以从OMIM页面问。基因表达CGAPcDNA表达谱-在UniGene簇和cDNA库中的ESTs分布。可以在CGAP页面问。SAGEmap—CGAPSAGE〔SerialAnalysisofGeneExpression)库的差异显示.也包含了对在人类GenBankSAGE标签的完整分析，在人类GenBankUniGene的标志被安排给了每个含有一个SAGE标签的人类序列遗传变异dbSNP—单核苷酸多态性数据库,包括SNPs，小范围的插入/缺失，多态重复单元,和微卫星变异。DbSNP包含种族特异的频率和基因型数据，试验条件，分子上下文,及中性多态和临床变异的定位信息。OMIM—在线人类孟德尔遗传-900OMIM记录的等位变异。为了查看这些OMIM记录的列Gaucher＆0001.位点特异突变数据库—OMIM主页和相关的LocusLink条目链接到很多外部数据库.失调基因和疾病—介绍遗传因素和人类疾病的关系。有约60种遗传疾病的概要信息，以及链接到相关数据库和组织。Mitelman癌症染色体变异摘要—DrsMitelman,Mertens，和Johansson建立的基因组范围的NatureGenetic，Vol.1Spe。No.417-74April199〕的超文本版本。OMIM—在线人类孟德尔遗传—常常更的人类基因和遗传失调的名目，有链接到其它相关的文献参考，序列记录，和相关数据库。OMIMMorbidMap—alphabeticallistingofdiseasesandcorrespondingcytogeneticmaplocations，withlinkstoOMIMentries。AccessiblefromOMIM〔seeGenes).OMIM致病图-OMIM的条目.可以从OMIM页面访问。癌症争论CCAP-癌症染色体变异打算-打算用来加速同恶性转移相关的显著染色体变异的定义和具体的特征描述。CGAP—癌症基因组剖析打算—cDNA库，鉴定在不同癌症阶段的人类基因表达，和打算正常，癌前和恶性细胞的分子表达谱.是NCI，NCBI和其它很多试验室的合作.Mitelman癌症染色体变异摘要-由Drs.Mitelman,Mertens，和Johansson建立的基因组范围的人类癌症中染色体断裂位点图谱。参见NatureGenetics,Vol.15〔Spec.No〕:417—74(April1997〕的超文本版本。SAGE分析—在癌症库中的SAGE标签的差异表达NCBI站点地图--—其他基因组数据介绍小鼠基因组小鼠基因组资源向导—,隆信息以及指向小鼠种系和突变资源的指针.小鼠基因组测序-小鼠基因组打算的测序进展，HTG序列contigs〔可以用大小和染色体号来扫瞄〕由测序中心的数据建立，可以contig或染色体的形式来下载。小鼠UniGene-被整理成簇的EST和全长mRNA有定位图和表达信息以及同其它资源的穿插参考cluster形式在Unigene网页下载，完整的数据可以从FTP站点repository/UniGene名目下下载〔LocusLink〕-LocusLink给每个位点公布一个稳定的IDaccesssionnumber,UnigeneLocusLinkNCBI,人类基因命名委员会，OMIMLocusLink目前包含人类，小鼠,大鼠,斑马鱼，和果蝇的位点，物种可以被分开或合在一起查询。Entrez-包括了来自〉70000个物种的序列数据，可以用物种字段来限制记录只在小鼠搜寻。人类/小鼠同源图—UniversityofCaliforniaatDavisM。F.Seldin建立，一张比较人和老鼠在同源区段DNA上基因的表,按在每个基因组上的位置排列.大鼠基因组UniGene-ESTmRNA序列，每一个代表一种特定的或假设的基因,有定位图和表达信息以及同其它资源的穿插参考.cluster形式在Unigene网页下载,完整的数据可以从FTP站点repository/UniGene名目下下载位点链接〔LocusLink)-为校正过的序列和遗传位点的描述信息供给一个单次查询界面.LocusLink给每个位点公布一个稳定的ID，并供给官方的命名，序列accesssionnumber，Unigene簇，图谱信息，和相关的网址.LocusLink是NCBI，人类基因命名委员会，OMIM和其它组织的合作结果.LocusLink目前包含人类，小鼠，大鼠，斑马鱼,和果蝇的位点,物种可以被分开或合在一起查询。斑马鱼基因组斑马鱼UniGene-被整理成簇的EST和全长mRNA有定位图和表达信息以及同其它资源的穿插参考cluster形式在Unigene网页下载，完整的数据可以从FTP站点repository/UniGene名目下下载位点链接〔LocusLink〕—为校正过的序列和遗传位点的描述信息供给一个单次查询界面。LocusLink给每个位点公布一个稳定的IDaccesssionnumber,Unigene簇，图谱信息，和相关的网址.LocusLink是NCBI，人类基因命名委员会，OMIM和其它组织的合作结果。LocusLink目前包含人类，小鼠，大鼠，斑马鱼，和果蝇的位点，物种可以被分开或合在一起查询。果蝇