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文档简介
生化核酸的结构与功能优选生化核酸的结构与功能复制翻译
蛋白质(病毒)
RNA(病毒)逆转录转录RNA翻译蛋白质DNA复制中心法则:第一节核酸的化学组成及一级结构一、核酸的化学组成核酸核苷酸核酸酶POOHOHOH磷酸:核苷戊糖:核糖或脱氧核糖碱基:嘌呤碱,嘧啶碱嘌呤碱(purine)腺嘌呤(adenine,A)鸟嘌呤(guanine,G)碱基(base)嘧啶碱(pyrimidine)胞嘧啶(cytosine,C)尿嘧啶(uracil,U)胸腺嘧啶(thymine,T)腺嘌呤(adenine,A)优选生化核酸的结构与功能(二)DNA双螺旋结构模型优选生化核酸的结构与功能核蛋白体由大小两个亚基构成,两亚基三、核糖体RNA(rRNA)的结构与功能DNA中G≡C对的含量两类核酸的基本化学组成比较β-D-2'-脱氧核糖Tm值的大小主要与下列因素有关:没有典型的细胞核结构。ACTGCT组蛋白:H1,H2A,H2B,H3,H4(Pyrimidinebases)胸腺嘧啶(T)尿嘧啶(U)H2A、H2B、H3和H4各两分子组成组蛋白八聚体,具有识别密码子功能的反密码子核心颗粒和连接区DNA及附着在连接区DNA上的没有典型的细胞核结构。碱基和核糖(脱氧核糖)通过糖苷键连接形成核苷(脱氧核苷)将DNA的稀盐溶液加热至80~95℃(或以上)数分钟戊糖(pentose)(构成RNA)1´2´3´4´5´β-D-核糖(构成DNA)β-D-2'-脱氧核糖RNA所含的戊糖是核糖,故称为核糖核酸DNA所含的戊糖是脱氧核糖,故称为脱氧核糖核酸两类核酸的基本化学组成比较
DNA
RNA
嘌呤碱
腺嘌呤(A)腺嘌呤(A)
(Purinebases)鸟嘌呤(G)鸟嘌呤(G)
碱基(Base)
嘧啶碱
胞嘧啶(C)胞嘧啶(C)(Pyrimidinebases)胸腺嘧啶(T)尿嘧啶(U)戊糖β-D-2'-脱氧核糖β-D-核糖(Pentose)
酸
磷酸
磷酸(Acid)RNA或DNA核苷酸或脱氧核苷酸核酸酶水解磷酸核糖或脱氧核糖碱基核苷或脱氧核苷1.核苷的形成碱基和核糖(脱氧核糖)通过糖苷键连接形成核苷(脱氧核苷)2OHOCHOHOH1´CNCHCCCNNHCHNH2+CNCHCCCNNHCHNH2腺苷9CNCHCCCNNHCHNH2+CNCHCCCNNHCHNH2脱氧腺苷91’核苷酸:AMP,GMP,UMP,CMP2.核苷酸(nucleotide)的结构与命名核苷(脱氧核苷)和磷酸以磷酸酯键连接形成核苷酸(脱氧核苷酸)脱氧核苷酸:dAMP,dGMP,dTMP,dCMP5’-脱氧胞苷酸(dCMP)3’-脱氧胞苷酸HO※核苷酸的命名含一个磷酸基团:核苷一磷酸(NMP)含两个磷酸基团:核苷二磷酸(NDP)含三个磷酸基团:核苷三磷酸(NTP)N代表各种碱基的名称环化核苷酸:cNMPO二、核酸的一级结构定义核酸中核苷酸的排列顺序由于核苷酸间的差异主要是碱基不同,所以也称为碱基序列5′端3′端CGA3’,5’-磷酸二酯键彼此间以磷酸二酯键相连,构成DNA的骨架DNA变性的本质是双链间氢键的断裂二、DNA的变性(denaturation)真核生物DNA的三级结构是核小体(nucleosome),由DNA和蛋白质构成真核生物DNA的三级结构是核小体(nucleosome),由DNA和蛋白质构成AMP,GMP,UMP,CMP嘌呤碱腺嘌呤(A)腺嘌呤(A)如假尿嘧啶(ψ),二氢尿嘧啶(DHU),甲基化碱基(mG,mA)等变性引起紫外吸收值的改变含三个磷酸基团:核苷三磷酸(NTP)tRNA的一级结构特点:核心颗粒和连接区DNA及附着在连接区DNA上的一、DNA的二级结构嘌呤碱(purine)ACTGCT碱基和核糖(脱氧核糖)通过糖苷键连接形成核苷(脱氧核苷)含两个磷酸基团:核苷二磷酸(NDP)稳定,不随年龄、营养状态、环境改变的影响5’-脱氧胞苷酸(dCMP)二、DNA的超螺旋结构没有典型的细胞核结构。A
G
P5PT
PGPC
PTPOH35pApCpTpGpCpT-OH
35ACTGCT
3书写方法:ACTGCT
第二节DNA的空间结构与功能(1)A=TG=CA+G=C+T(2)DNA的碱基组成具有种属特异性(3)DNA的碱基组成没有组织的特异性,且较为稳定,不随年龄、营养状态、环境改变的影响(一)Chargaff碱基组成规律一、DNA的二级结构1.DNA由两条反向平行的脱氧多核苷酸(两条链的走向为5’→3’和3’→5’),围绕一中心轴(假想轴)构成右手双螺旋结构(二)DNA双螺旋结构模型(Watson,Crick,1953)5’3’5’3’3.碱基在双螺旋内侧配对,形成碱基平面双链中相对的碱基按A=T和G≡C配对连接,形成互补2.磷酸基与脱氧核糖在外侧彼此间以磷酸二酯键相连,构成DNA的骨架3’5’3’5’磷酸二酯键碱基互补配对TAGC4.双螺旋的直径为2nm沿轴向,各碱基平面垂直于假想中心轴,平面间距为0.34nm每圈螺旋含有10.4对脱氧核苷酸,其轴向距离为3.54nm。形成大沟及小沟相间
5.维持DNA双螺旋稳定的作用力氢键维持双链横向稳定性碱基堆积力维持双链纵向稳定性(三)DNA双螺旋结构的多样性(一)原核生物没有典型的细胞核结构。被认为是原核生物DNA的三级结构超螺旋结构二、DNA的超螺旋结构DNA双螺旋链再盘绕即形成超螺旋结构碱基和核糖(脱氧核糖)通过糖苷键连接形成核苷(脱氧核苷)具有识别密码子功能的反密码子mRNA核内向胞质的转位RNA分子比DNA小得多DNA双螺旋链再盘绕即形成超螺旋结构二、DNA的超螺旋结构紫外分光光度法检测核酸的纯度嘌呤碱(purine)胞嘧啶(cytosine,C)三、核糖体RNA(rRNA)的结构与功能ACTGCT分子量最小的RNA,占RNA总量约15%(一)Chargaff碱基组成规律碱基在双螺旋内侧配对,嘌呤碱和嘧啶碱有共轭双键,都能强烈吸收紫外光,最大吸收波长为260nm与蛋白质既可分离,又可结合DNA双螺旋链再盘绕即形成超螺旋结构三、核糖体RNA(rRNA)的结构与功能260nm处的紫外吸收值升高含两个磷酸基团:核苷二磷酸(NDP)β-D-2'-脱氧核糖胞嘧啶(cytosine,C)一、DNA的二级结构嘌呤碱(purine)双螺旋DNA以左手超螺旋的方式绕核心颗粒1.ACTGCT真核生物mRNA成熟过程基因(gene):负载特定遗传信息的DNA片段优选生化核酸的结构与功能核蛋白体由大小两个亚基构成,两亚基彼此间以磷酸二酯键相连,构成DNA的骨架核心颗粒和连接区DNA及附着在连接区DNA上的(三)DNA双螺旋结构的多样性彼此间以磷酸二酯键相连,构成DNA的骨架β-D-2'-脱氧核糖G≡C碱基对的比例越高,Tm值越高(二)DNA双螺旋结构模型二、DNA的超螺旋结构基因(gene):负载特定遗传信息的DNA片段碱基在双螺旋内侧配对,形成双螺旋结构,因而A≠U,G≠C三、核糖体RNA(rRNA)的结构与功能(二)真核生物真核生物DNA的三级结构是核小体(nucleosome),由DNA和蛋白质构成核小体的组成DNA:146bp组蛋白:H1,H2A,H2B,H3,H4H2A、H2B、H3和H4各两分子组成组蛋白八聚体,构成核心组蛋白双螺旋DNA以左手超螺旋的方式绕核心颗粒1.8圈,缠绕在组蛋白核心表面,构成核心颗粒核心颗粒和连接区DNA及附着在连接区DNA上的
组蛋白H1构成核小体核心颗粒连接部位DNA一个个核小体连接成串珠状结构染色单体折叠折叠30nm三、DNA的功能以基因的形式携带遗传信息作为复制和转录的模板包括DNA编码序列、非编码调节序列和内含子序列将遗传信息通过转录传递给RNA基因(gene):负载特定遗传信息的DNA片段基因组(genome):指来自一个遗传体系的一整套遗传信息第三节
RNA的结构与功能RNA的特点:主要碱基:A、G、C和U2.RNA是单链结构,只有在局部区域形成双螺旋结构,因而A≠U,G≠C3.RNA分子比DNA小得多RNA的种类及功能核糖体RNA信使RNA转运RNA核内不均一RNA核内小RNA小干扰RNA种类功能rRNAmRNAtRNAHnRNASnRNASnoRNAsiRNA核蛋白体组分蛋白质合成模板转运氨基酸成熟mRNA的前体参与hnRNA的剪接、转运rRNA的加工、修饰参与转录后调控核仁小RNArRNAmRNAHnRNASnRNASnoRNA核蛋白体组分蛋白质合成模板转运氨基酸hnRNAmRNA
真核生物mRNA成熟过程
----由HnRNA经过剪接而成内含子(intron)
外显子(exon)一、信使RNA的结构与功能
mRNA结构特点大多数真核mRNA的5´末端均在转录后加上一个7-甲基鸟苷,形成帽子结构:m7GpppN
N及紧随其后的核苷酸,其核糖的C2羟基也常发生甲基化2.大多数真核mRNA的3´末端有一个多聚腺苷酸(polyA)结构,称为多聚A尾帽子结构(m7GpppN)OCH3多聚A尾5’“穿靴戴帽”mRNA核内向胞质的转位mRNA的稳定性维系翻译起始的调控帽子结构和多聚A尾的功能:
把DNA所携带的遗传信息,按碱基互补配对原则,抄录并传送至核糖体,用以决定其合成蛋白质的氨基酸排列顺序*mRNA的功能:DNAmRNA蛋白转录翻译原核细胞细胞质细胞核DNA内含子外显子转录转录后剪接转运mRNAhnRNA翻译蛋白真核细胞
维持DNA双螺旋稳定的作用力嘌呤碱(purine)嘌呤碱(purine)260nm处的紫外吸收值升高嘌呤碱(purine)如假尿嘧啶(ψ),二氢尿嘧啶(DHU),甲基化碱基(mG,mA)等整套遗传信息没有典型的细胞核结构。把DNA所携带的遗传信息,按碱基互补配对原则,抄录并传送至核糖体,用以决定其合成蛋白质的氨基酸排列顺序具有识别密码子功能的反密码子碱基和核糖(脱氧核糖)通过糖苷键连接形成核苷(脱氧核苷)胞嘧啶(cytosine,C)碱基在双螺旋内侧配对,戊糖(pentose)DNA的空间结构与功能两类核酸的基本化学组成比较紫外分光光度法检测核酸的纯度β-D-2'-脱氧核糖3’,5’-磷酸二酯键碱基和核糖(脱氧核糖)通过糖苷键连接形成核苷(脱氧核苷)胞嘧啶(cytosine,C)蛋白质对紫外光的最大吸收波长是280nm二、转运RNA的结构与功能
1.分子量最小的RNA,占RNA总量约15%
2.分子中含有约10%的稀有碱基tRNA的一级结构特点:如假尿嘧啶(ψ),二氢尿嘧啶(DHU),甲基化碱基(mG,mA)等
3.3’末端有CCA-OH,是携带氨基酸的部位
4.具有识别密码子功能的反密码子二氢尿嘧啶甲基化碱基假尿嘧啶tRNA中的稀有碱基尿嘧啶NHNHOONHOONH假尿嘧啶(ψ)NHOOH2H2二氢尿嘧啶(DHU)NH甲基化鸟嘌呤(mG)NNHNHNNH2OCH3DHU环Tψ环CCA-OH反密码环三叶草形
tRNA的三级结构——倒L形tRNA的功能:识别密码子,活化、搬运氨基酸到核糖体参与蛋白质的合成反密码子氨基酸臂5’3’三、核糖体RNA(rRNA)的结构与功能rRNA的结构特点:1.含量最丰富,约占总RNA的80%以上2.与核蛋白体蛋白结合成核蛋白体,rRNA
与蛋白质既可分离,又可结合3.核蛋白体由大小两个亚基构成,两亚基呈不规则形状,聚合时中间有裂缝,可通过mRNA
rRNA的功能参与组成核蛋白体,作为蛋白质生物合成的场所核酸的理化性质第四节1.核酸的粘度分子量越大粘度也越大RNA分子比DNA分子小,粘度也就小2.核酸的酸碱性磷酸残基的酸性使核酸也表现较强的酸性含氮碱基上有碱性基团碱基对之间的氢键在4.0-11.0之间最稳定一、核酸的一般理化性质嘌呤碱和嘧啶碱有共轭双键,都能强烈吸收紫外光,最大吸收波长为260nm3.核酸的紫外吸收特性蛋白质对紫外光的最大吸收波长是280nm紫外分光光度法检测核酸的纯度通过测定波长在260nm和280nm处吸光度的比值(A260/A280)来估计核酸样品的纯度DNA溶液:A260/A280=1.8~2.0RNA溶液:A260/A280=2.0二、DNA的变性(denaturation)定义:在某些理化因素作用下,DNA双链间的氢键断裂(不涉及共价键的断裂),解开成两条单链的过程。其生物学活性丧失因素:过量酸、碱,加热,变性试剂如尿素、酰胺以及某些有机溶剂如乙醇、丙酮等DNA变性的本质是双链间氢键的断裂变性引起紫外吸收值的改变增色效应:DNA变性时其溶液A260增高的现象4.丧失生物学活性1.260nm处的紫外吸收值升高2.粘度下降3.浮力、密度升高(增色效应)变性DN
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