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文档简介

全国高等医药教材建设研究会“十二五”规划教材供8年制及7年制(“5+3”一体化)临床医学等专业生物信息学MEDICAIELITEEDUCATION人氏卫比出版社第五章基因表达数据分析苏州大学沈百荣首都医科大学李冬果人氏卫4出版社PLOPLE'SMEDICAL第一节引言Introduction人氏卫出版耘PEOPLESMED|cAL凡基因表达组学与基因组学相比较1表达组信息是动态的2表达组学的数据,更多的是数值分析;3转录组学中除了模式识别外,系统建模也十分重要。人氏卫出版耘PEOPLESMED|cAL凡真核生物基因表达的基本方式PremR3.ProcessingcontrolNUCLEUSs修5mRNAlitycontrolb,ran2.TranscriptionalcontrolNUCLEUSprotein人氏卫出版耘PEOPLESMED|cAL凡基因表达调控示意图EnhancerDistalcontrol①transcriptionGroupofNAlymerasellinitiationcomplexRNAsynthesis人氏卫出版耘PEOPLESMED|cAL凡基因表达的时空性SPACEAnterior→Posterionanosglantkruppel□even-skippedwingless人氏卫出版耘PEOPLESMED|cAL凡基因表达测定方法RT-qPCRabsolutequantificationrelativequantificationexternalcalibrationexternalcalibrationnormalisationcurveonecolordetectiontvocolordetectionviaoneviareferencewithoutsystemystemreferenceanySYBRGreenIe.g.Probes,ROXgeneROXROXexternalcalibrationcurveRT-PCRproductithoutreal-timePCRwithreal-timePcRencycorfficiencycorrectionirvitrotranscribedRNAsyntheticRNAOligos2(△ACTREST,qGeneLCsoftare人跃卫出版法PEOPLESMED|cAL凡近20年来三种不同高通量基因表达测定技术的应用趋势800RNA-seq,[tiab]20020192000201920192019人氏卫出版耘PEOPLESMED|cAL凡高通量基因表达测定的应用实例l测定组织特异性基因表达2基因功能分类3癌症的分类和预测4.临床治疗效果预

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