计算化学中软件的应用教案课件

会计学1计算化学中软件的应用工程数学计算机科学化学药物生化有机合成石油化工选矿

高温冶金材料科学软件硬件无机化学物理化学有机化学分析化学结构化学数值分析拓扑学运筹学统计狭义：量子化学广义：计算化学是一门涉及多种学科的边缘学科计算化学什么是计算化学？2第1页/共26页3第2页/共26页计算过程5计算结果的分析和整理1文献调研2确定计算目的3计算模型的构造4计算方法的选取4第3页/共26页计算化学所需的条件5第4页/共26页GaussView的简单介绍GaussView是一个专门设计与高斯配套使用的软件。其主要用途有两个:构建高斯的输入文件和以图的形式显示高斯计算的结果。6第5页/共26页特点：通过计算机进行图形绘制和空间分子模拟，能给人增加真实感。7第6页/共26页8第7页/共26页GaussView基本功能的演示9第8页/共26页如何使用UE编辑作业：以丙氨酸为例UltraEdit是一套功能强大的文本编辑器10第9页/共26页Gaussian作业的格式：以丙氨酸为例作业名称，运行内存，运行核数计算执行路径行，包括方法,基组,任务类型title部分，标识和说明作用分子说明部分电荷和自旋多重度11第10页/共26页RouteSection（计算执行路径行）

RouteSection主要由方法，基组，任务类型三部分组成1.方法的选择12第11页/共26页2.基组的选择13第12页/共26页Sp单点能量计算（默认任务类型）ADMP&BOMP动力学计算Opt分子几何结构优化Force计算核的受力Freq振动分析Stable波函数稳定性测试Irc反应途径计算Volume计算分子体积IrcMax在指定反应途径上找能量最大值Density=CheckPoint仅计算布居分析Scan势能面扫描Guess=Only仅作分子轨道初猜Polar极化率和超极化率计算ReArchive从.chk文件中提取存档intrinsicreactioncoordinate内禀反应坐标

3.Gaussian程序能完成的任务类型14第13页/共26页Gaussian09的简单介绍程序界面点击此处即可上传作业15第14页/共26页分子说明部分电荷与多重度标题行计算执行路径返回主单并运行返回主菜单保存放弃任务检查计算执行路径Gaussian09

上传作业界面16第15页/共26页举例1.分子轨道2.原子电荷17第16页/共26页1.如何查看分子轨道？在UE中编辑输入文件时需要在计算执行路径行加pop=full

关键词1，3丁二烯注意：计算结束后，输入命令formchkxxx.chkxxx.fchk

，再用GaussieView打开fchk文件18第17页/共26页19第18页/共26页1，3丁二烯HOMO轨道20第19页/共26页1，3丁二烯LUMO轨道21第20页/共26页Isatins猜想：如果此物质要和金属配位，应该首会和哪个位点配位呢？2.如何查看原子电荷?在UE中编辑输入文件时需要在计算执行路径行加pop=nbo

关键词（即NBO电荷分析）22第21页/共26页23第22页/