已知基因序列的获取方法课件

已知基因序列的获取方法.已知基因序列的获取方法.已知基因序列的获取方法.口知基因序列的获取策略兼谈引物设计与序列分析黄钢第三军医大学遗传教研室2006.111获取序列信息,设计合适的引物选取相应的组织或细胞,提取RNA并RTRNaseh消化(可选)PCR扩增获得全长CDNA装入合适的克隆或表达载体,菌落PCR、酶切与测序证实根据需要进一步进行亚克隆探究式教学以知识为主干，以学生探究能力的发展和创新素质的养成为核心的教育，笔者认为具体有以下几方面的特点：1.1探究式教学要注重学生已有经验出发。学生虽说天生就有探究的欲望，也具备一定的探究能力，但学生的学习不是从空白开始的，已有的经验会影响现在的学习，教学法只有从学生的已有知识和生活实际出发，才会调动学生的学习积极性，学生的学习才可能是主动的。1.2学生是通过探究活动获得新知识和培养能力的。探究式教学不是先将结论直接告诉学生，再通过演示实验或学生实验加以验证，而是让学生通过各式各样的探究活动诸如观察、调查、制作、收集资料等，亲自得出结论，使他们参与并体验知识的获得过程，建构起新的对自然的认识，并培养科学的学习方法，可以使学生从多角度深入地理解知识，建立知识间的联系，从而使他们在面对实际问题时，能更容易地激活知识，灵活地运用知识解决问题，也只有这样，学生的学习才是积极主动的，才能够真正激发学生学习的内在动机。1.3探究式教学更重视过程性评价。科学探究是一种重要的学习方式，也是义务教育阶段化学课程的重要内容。教学过程对学生的各种表现及时的评价是非常重要的，如：每个学生理解了哪些概念，哪些还模糊不清或不知道，是否能灵活地运用知识解决问题；是否能提出问题，是否能设计并实施了探究计划是否能分处理所收集的证据，是否能判断证据是支持还是反对自己提出的假设等。但要弄清楚这一切，单靠终结性评价是难以奏效的，探究教学在重视并改进终结性评价的同时，很重视形成性评价，如学生每天的笔记、撰写的报告、给制的图表、制作的模型等，以及与学生面对面的交流，针对某修正问题所做出的解释，通过这些可以了解学生对知识的理解深度和广度，及进行科学推理的能力。2.化学教学中实施探究式教学的方法和措施化学探究性学习课题主要是指对某些涉及化学知识问题的深入探讨，或者从化学角度对某些日常生活和其它学科中出现的问题进行研究。要充分体现学生的自主活动和合作精神。确定研究性学习课题应以所学的化学知识为基础，并且密切结合身边的生产和生活实际。科学探究作为新课改的突破口，既是学生的学习内容，也是教师的教学方法和教学方式。科学探究目标的实现是基于探究教学的开展。如何在化学教学中进行探究式教学？下面就我参与由市教研室曹发根主任主持的国家级课题《初中化学探究式典型课例实验》的一些经验谈谈我自己的看法。2.1教学应面向全体学生，让每一个学生都能得到发展。在日常的化学教学中，教师应考虑和尊重学生的个体差异，要提倡问题解决方法的多样化，尊重并鼓励不同的学生在解决相同问题的过程中采用不同的方式、方法。问题的设计，教学过程的展开，练习的安排等要尽可能地让所有学生都能主动参与，在学习活动中提出各自解决问题的方法。并引导学生在与他人的交流中选择合适的方法，引导学生反思自己的表现和内心体验，鼓励学生与其他学生进行比较，从而不断丰富自己的学习经验。2.2努力创设问题情境，以问题为中心创造良好、有效的学习环境。一个好的问题情境，往往能够激发学生强烈的问题意识和探究动机，引发学生积极思考，从而独立地解决问题，发展其思维能力和创造能力。在教学中针对学生已有的经验也就是现有的知识水平，从学生熟悉的现象入手，提出驱动性的、能引发学生认知冲突的问题，激发学生探究的兴趣，诱发学生的探究动机，从而维持和促进探究活动的展开，达到学生知识的最近发展区。如对空气中氧气含量的探究教学中，可以提出以下问题：①生活中有哪些现象能说明空气的存在？②空气中含有哪些成分？如何证明这些气体成分的存在？③要除去密闭容器中空气中所含的氧气，可用什么方法？除去时可能会有什么现象发生？④有哪些因素可能对结果的测定有影响？当然，探究教学中仅有教师提出问题是不够的，因为这是较低层次的探究。教师还必须努力创设问题情境，将新知识置于问题情境中，使学生在民主、和谐、开放、灵活的氛围中通过各种途径，如实验、观察、阅读教材、交流讨论等发现和提出问题，使学生在提出问题、分析问题、解决问题的过程中获得认知，从而达到更高层次的探究能力。2.3明确探究目标，使学生在知识与技能、过程与方法、情感态度与价值观等多层次上得到全面发展。学生探究能力的形成不是一朝一夕、一蹴而就的。而每次探究活动的时间有限，教师在指导学生进行探究性学习的时候，应该根据学生应达到的探究技能水平（最近发展区），结合化学知识的教学进程和学生的实际（学生知识的现有水平），制定出切实可行的培养目标。帮助和指导学生明确每次探究活动的学习目标，使探究教学沿着教学目标的轨道不断向前延伸。如在进行氧气的实验室制法的教学中，学生可以通过查阅资料获取过氧化氢的分解时对催化剂的选择，通过实验比较使用和不使用催化剂对氯酸钾分解的温度、速率的影响，从而培养学生动脑、动手的能力。再如讲解二氧化碳的实验室制法，通过引导学生进行实验方案的设计，对实验的装置进行选择，有利于培养学生的创新精神。2.4指导学生的探究过程要相对完整。善于发现并提出问题、猜想与假设、制定计划、进行实验、收集证据、解释与结论、反思与评价、表达与交流，这八个步骤是实验探究教学的一个完整过程，但对于有限的教学时间来说，对于某个特定的教学内容来说，不可能也没有必要完成所有的探究环节。这就要求教师在教学过程中要仔细分析某个环节的能力因素和可以培养的目标，取其中一、二个环节来精心设计教学过程。使某个环节相对完整，让学生经历一个相对完整的探究环节，这样在学生的潜意识里就会把多次不同的探究环节逐渐整合成为一个完整的探究过程意识，自然而然地，学生的探究能力、探究水平就会在一定量的基础上（量变），达到一个质的飞跃（质变）。农广校既要承担学历教育，又要承担国家、省市各种惠农工程项目实施工作；既要利用实践基地进行各类专业技能培训，又要实施送科技下乡、田间地头指导、咨询服务等农业技术推广，与其他职业学校相比，农广校教学目的性、实用性更突出。这就要求农广校教师既要对国家政策导向及本地的经济发展都相当了解，又要对本地区的科学文化、人文环境有充分认识。在日常工作中，农广校教师只有树立学习意识、知识更新意识、为民服务意识、忠诚农民教育事业意识和适应意识，在精通自己本专业的基础上，不断拓宽知识面，将专业知识与当地生产实际相结合，熟练掌握各种生产技术和操作技能，成为“一专多能”的教师，才能更好地为“三农”工作服务。一、农广校教师要树立五种意识（一）学习意识在农民培训工作中，教师与农民面对面交流，农民咨询的问题涉及农学、果树、林业、养殖、经营管理、农村政策等多方面内容，这就要求农广校教师经常学习新知识、接受新信息，不断给自己“充电补能”。只有树立良好的自学意识并长期坚持，达到博学、多闻，才能娴熟地掌握教学技巧和实践操作要领，引导和激发学员的学习兴趣，送给农民科技致富的金钥匙，赢得农民群众的尊敬和喜爱。（二）知识更新意识在农业向科技化、信息化、产业化、现代化发展的形势下，教师的原有专业知识和学历层次常常显得捉襟见肘。农广校教师应注意更新知识，提高专业水平。除精通所学专业知识，还要充分利用各种机会，参加专业技能培训。好的培训班，可能聘请所在领域的资深专家、学者讲课，也可能请在一线工作的成功者传授技艺。他们广博的知识、丰富的阅历、高超的授课水平和成功的经验、熟练的实践操作技能，对于农广校教师来说都是难得的学习取经机会。同时，教师参加各类培训班，还能与授课者、受训者、组织者进行互动，建立交流平台，互换信息，取长补短，从而提升能力，满足多专业、多学科、多层次的教学需要。（三）为民服务意识农广校教师要具有热爱“三农”的强烈事业心和吃苦耐劳的精神，更要察民情、解民苦、送民需、引民富。只有做到耐心、爱心、博学、广闻，才能培育出新型农民，服务新农村建设。（四）忠诚农民教育事业意识作为农广校教师，要有为农民脱贫致富奔小康而献身，热爱本职工作，热爱农村，热爱农民的工作热情。农业的区域性强，农民的需求又各有不同，教师应将专业知识与当地生产实际相结合，掌握各种生产技术和操作技能，成为“一专多能”的教育工作者。要懂得农村成人的学习心理，掌握农村成人教育的规律，运用各种行之有效的教学手段和方法向农民传授知识。（五）适应意识农民的技术、文化水平参差不齐，许多先进的科技成果若“照本宣科”则农民难以接受，要将其“化”为可传授的教学内容后，传授给农民，同时要有熟练的技术操作和示范能力。以生动的语言，将教学内容与农民日常生活和农业生产相联系，用农民群众喜闻乐见的方式进行教学和培训。根据农业生产、经济结构的特点，配合农时季节和农民的文化层次，进行有的放矢的教学、培训。农广校教师只有不断丰富自己的涉农学科知识，提高自己的文化素质，才容易与今天眼界更开阔、知识面更宽广的学生和实践经验更丰富的农民交往并取得信任，构建和谐教学氛围。二、加强对农广校教师的继续教育作为农广校教师，应通过继续教育不断提高自身技术水平。而对农广校来说，抓紧在职教师的培训，是建设高水平教师队伍的当务之急，也是最经济、最有效的措施。（一）从当地实际出发开展教师培训农广校培训教师应根据农村经济发展规划来确定教师的需求量、专业结构、文化层次水平。可根据专业师资情况，提供教师重新回到院校深造研修的机会。同时也鼓励教师参加教学实践活动，多安排教师参与授课或培训，让教师充分发挥理论水平和授课艺术，从中积累经验，提升业务水平。最终达到人才对路，专业对口。（二）根据教师的不同情况进行培训对那些学历已达到岗位要求，但知识老化或缺乏专业知识（半路出家），或缺乏教育理论和管理知识的老师，主要通过继续教育，补充所缺理论和知识，使其达到岗位规范要求；对那些未达到学历要求的，可通过函授、专业证书班、送高等院校代培的方式进行培训。（三）利用现有的阵地搞好分级培训各级农广校应主动承担培训下一级分校教师的任务，用自己的师资、场地等优势，把培训基层教师作为任务并纳入本部门的工作目标。农广校建有各种类型的实验基地或教学实践基地，基地的试验示范是提高教师综合素质的有效途径。教师既可以通过授课、生产操作积累经验，提高技能，又可以通过在科技下乡、田间地头向农民指导和讲解来提高业务水平和动手能力。（四）聘用兼职教师根据农广校教育的任务选聘相应层次的兼职教师，应本着“本人自愿，单位支持，根据需要，择优使用”的原则进行。农广校编制少，人员少，专职教师更少，而所开专业大多是根据学员的实际需求确定，专业时有变动。这就需要农广校教师广泛涉猎相关知识，具备一专多能的素质，及时掌握新品种、新技术，帮助学员进行产业结构的调整和升级。河北省兴隆县农广校杨春鹏口知基因序列的获取策略兼谈引物设计与序列分析黄钢第三军医大学遗传教研室2006.111获取序列信息,设计合适的引物选取相应的组织或细胞,提取RNA并RTRNaseh消化(可选)PCR扩增获得全长CDNA装入合适的克隆或表达载体,菌落PCR、酶切与测序证实根据需要进一步进行亚克隆、如何获取已知目的基因的序列信息■先査找其蛋白相关信息,了解该基因编码产物的基本情况与功能()进一步查找其核酸相关序列信息,常用数据库:Genebank、EBI、DDBT)解软)工D带助的SeadExPASyContactsEXPASyProteomicsServerTheEXPASy(ExpertProteinAnalysisSystem)proteomicssemeroftheSwissinsituteoBonformanics(SB)isdedicatedtothearalysiscfproeinsequences4cm时!b0peningMinotdanbfcadipnandchalacisnzdion(Aldente,Findkod,Ptpilam,Phang,plow.SWISS-MODELRepository-AutomaticalygereratedproteinmodeDNA?+saChs(BLAST.]Linkst'thermolecuarbooddatabasesImageMaster/Melanie-Sofwarefor2-DPAG-analysght-MassSPectrometryImaSwissShop.automatcallyobtain(oyemail,newseqenceenniesrelevanbulletinsSwiss-ProtdocumentsCross-referencesBI83077:AAA58390.1EMBL/GenBank/DDBSequence83072,A58390.1;JIME![EELM83073,AAA58390.1:JOINE!.[EMBLGenBank/DDBI]CoDingSequerM83074oDingsequenceBC042665:AAH42665.1enBank/DDbIR1DR9:10-JAN-01.LExPASyRCSB/EBI118L:04-APR-01.ExPASy/RCSB/EBI]etailedlistoflinkedstructurCD80HGNC:1700:CD8dsCDsoenelynxCD80:Homosapiens.MIM12203[BI!EI]、目的基因CDNA序列的获取方法CDNA文库扫描RT-PCR人工合成组织RNA的提取在匀浆器中加工冷冻的组织通过注射器加工冷冻的组织在液氮中将组织研磨成粉末在液氮中研磨组织至粉末状,细胞裂解更完全,产