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文档简介

②此处采用abahgat的实现,该实现基于Ukkonen的文章“On-lineconstructionofsuffixtrees”。通过对 文件长度,为遍历叶子节点提供参考。此处后缀树的构建算法基于abahgat。①Suffixtree-Wikipedia:②《On–lineconstructionofsuffixtrees》Esko③ 描述:原abahgat的后缀树实现中,边(Edge)类的(Lable)成员为String类型,构建后缀树的时自定义StringWrap类型:因为(Lable)的字符串包含于后缀序列,所以可以统一使用一个公共后内存开支。因StringWrap操作字符串只需要改变上下标信息,操作速度更快。如下图。结果:通过使用StringWrapString描述:由于Spark的RDD采用分布式,每个计算节点都持有某一RDD的若干分区,分区过大或以内(HDFS默认分片大小)。加上此层结果超过128M,就将累积字符串存入链表中,然后清空累积字符串后再添加此层结果。10s。描述:直观上看,递归实现更为简便,在测试数据上运行也良好,但是运行在5000*1000NK(Not

基于Ukkonen后缀树算法:

时间1234时间12345 务都是Driver来完成,没有实现彻底的分布式构建。构建完成的树体积较大,不易分布转移。对程序的优化主要体现在对数据结构的优化,基于SparkHDFS 指导老师穆老师,在学习的 StringWrap:替代String类型,用作表示边类型的内容。2、GST--master<testsparkclustermasterur

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