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文档简介

DNA片段的扩增及电泳鉴定DNA片段的扩增一、PCR扩增原理1.PCR利用了DNA的热变性原理,通过调节温度来控制DNA双链的解聚与结合;PCR仪实质上就是一台能够自动调控温度的仪器,一次PCR一般要经历30次循环;2.PCR扩增DNA片段还利用了DNA半保留复制的原理。10倍浓缩的扩增缓冲液(含Mg2+)5μL20mmol/L的4种脱氧核苷酸的等量混合液(实为dNTP)1μL20μmol/L的引物Ⅰ2.5μL20μmol/L的引物Ⅱ2.5μLH2O28~33μL1-5U/μL的TaqDNA聚合酶(即耐高温的DNA聚合酶)1~2U模板DNA(用量为1pg-1μg)5~10μL总体积50μLPCR反应体系的配方DNA片段的扩增推动杆调节旋钮卸枪头按钮体积刻度吸液杆枪头(注意:加不同样品时,需要更换枪头)二、材料用具①PCR仪(自动控温,实现DNA的扩增)②微量离心管(进行PCR反应的场所)③微量移液器(用于向微量离心管转移PCR配方中的液体)④一次性吸液枪头(微量移液器吸取一种试剂更换一次枪头)DNA片段的扩增三、方法步骤DNA片段的扩增1.移液2.离心3.反应用微量移液器按照配方或PCR试剂盒的说明书,在微量离心管中依次加入各组分。三、方法步骤DNA片段的扩增1.移液2.离心3.反应待所有的组分都加入后,盖严离心管的盖子。将微量离心管放在离心机上,离心约10s,使反应液集中在管的底部。(提高反应速率)离心的目的注:离心管的盖子一定要盖严,防止实验中盖子脱落或液体外溢三、方法步骤DNA片段的扩增1.移液3.离心4.反应将装有反应液的微量离心管放入PCR仪中,设置程序进行反应。循环程序变性复性延伸预变性94℃,5min//30次94℃,30s55℃,30s72℃,1min最后一次94℃,1min55℃,30s72℃,1min预变性使DNA充分变性,以利于引物更好地和模板结合三、方法步骤DNA片段的扩增扩增1000bp片段一般设定延伸时间设定为1min,故可根据目的基因片段长度适当调整延伸的时间DNA片段的扩增及电泳鉴定1.琼脂糖凝胶电泳原理①DNA分子具有可解离的基团,在一定的pH下,这些基团可以带上正电荷或负电荷。②迁移动力与方向:在电场的作用下,带电分子会向着与它所带电荷相反的电极移动,这个过程就是电泳。一般DNA分子在一定pH的缓冲液中可以带负电荷,在电场中DNA便向正极端移动DNA片段的电泳鉴定PCR的产物一般通过琼脂糖凝胶电泳来鉴定。1.琼脂糖凝胶电泳原理③迁移速率:在凝胶中DNA分子的迁移速率与凝胶的浓度、DNA分子的大小和构象有关。④检测:凝胶中的DNA分子通过染色,可以在波长为300nm的紫外灯下被检测出来。DNA片段的电泳鉴定2.材料用具DNA片段的电泳鉴定电泳缓冲液、凝胶载样缓冲液、琼脂糖和核酸染料等核酸染料:核酸染料在紫外光照射下发荧光。核酸染料可与DNA分子形成染料-DNA复合物,其荧光强度与DNA含量成正比。电泳缓冲液:电泳缓冲液用来维持pH值,使DNA带负电。凝胶载样缓冲液(含指示剂):用于指示DNA样品可能位置2.材料用具DNA片段的电泳鉴定电泳装置(包括电泳仪、电泳槽等)DNA片段的扩增及电泳鉴定配制琼脂糖溶液DNA片段的电泳鉴定三、方法步骤根据待分离的DNA片段的大小,用电泳缓冲液配制琼脂糖溶液,一般配制质量分数为0.8%~1.2%的琼脂糖溶液,琼脂糖用沸水浴或微波炉熔化,稍冷却加入适量核酸染料混匀)。制备凝胶加样电泳观察记录核酸染料配制琼脂糖溶液DNA片段的电泳鉴定三、方法步骤制备凝胶加样电泳观察记录配制琼脂糖溶液DNA片段的电泳鉴定三、方法步骤制备凝胶加样电泳观察记录①将温热的琼脂糖溶液迅速倒入模具,并插入合适大小的梳子,以形成加样孔。②待凝胶溶液完全凝固,小心拔出梳子,取出凝胶放入电泳槽内。配制琼脂糖溶液DNA片段的电泳鉴定三、方法步骤制备凝胶加样电泳观察记录③将电泳缓冲液加入电泳槽中,电泳缓冲液没过凝胶1mm为宜。电泳缓冲液配制琼脂糖溶液DNA片段的电泳鉴定三、方法步骤制备凝胶加样电泳观察记录将扩增得到的PCR产物与凝胶载样缓冲液(内含指示剂)混合,再用微量移液器将混合液缓慢注入凝胶的加样孔内。留一个加样孔加入指示分子大小的标准参照物(marker)凝胶载样缓冲液PCR产物配制琼脂糖溶液DNA片段的电泳鉴定三、方法步骤制备凝胶加样电泳观察记录接通电源,根据电泳槽阳极至阴极之间的距离来设定电压,一般为1~5V/cm。待指示剂前沿迁移接近凝胶边缘时,停止电泳配制琼脂糖溶液DNA片段的电泳鉴定三、方法步骤制备凝胶加样电泳观察记录取出凝胶置于紫外灯下观察和照相注意事项:

1.为避免外源DNA等因素的污染,PCR实验中使用的微量离心管、枪头和蒸馏水等在使用前必须进行高压灭菌处理。2.该实验所需材料可以直接从公司购买,缓冲液和酶应分装成小份,并在-20℃储存。使用前,将所需试剂从冰箱拿出,放在冰块上缓慢融化。3.在向微量离心管中添加反应组分时,每吸取一种试剂后,移液器上的枪头都必须更换。4.在进行操作时,一定要戴好一次性手套。DNA片段的扩增及电泳鉴定五、结果分析与评价1.你是否成功扩增出DNA片段?判断的依据是什么?DNA片段的扩增及电泳鉴定五、结果分析与评价1.你是否成功扩增出DNA片段?判断的依据是什么?

可以在紫外灯下直接观察到DNA条带的分布及粗细程度来判断扩增的结果。DNA片段的扩增及电泳鉴定

理论上进行电泳鉴定的结果应该是一条条带,该片段大小约为750bp。五、结果分析与评价

如果扩增不成功,可能的原因有:漏加了PCR的反应成分,各反应成分的用量不当,PCR程序设置不当等。2.你进行电泳鉴定的结果是几条条带?如果不止一条条带,请分析产生这个结果的可能原因。DNA片段的扩增及电泳鉴定五、结果分析与评价2.你进行电泳鉴定的结果是几条条带?如果不止一条条带,请分析产生这个结果的可能原因。原因有:①模板DNA可能被污染②引物设计不合理。如:它们与非目的片段结合;③复性温度过低(引物与模板的结合位点增加----非特异性扩增);④DNA聚合酶的质量不好等。DNA片段的扩增及电泳鉴定【关键点拨】1.未出现扩增条带的主要原因2.出现非特异性扩增条带的主要原因(1)TaqDNA聚合酶失活;(2)引物出现质量问题;(3)Mg2+浓度过

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