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文档简介

微难点5PCR相关问题分析

核心提炼

1.PCR过程模型

DNA

十出野匚人田变性再与合成

样品DNA人+合成引物复性DNA

变性再与合成引物复性DNA广.I

引物管性DNA/---------------------

待产筮望

的DNA

第1轮免制第2轮复制第3轮复制

图形显示一轮循环产生的子链长度小于互补链的长度,只有第三轮循环时,才会合成出

2个两条脱氧核昔酸链等长的子代DNA,即第〃轮循环,合成等长的DNA分子数为2〃

—2«o

2.引物的归类分析

(DDNA的复制需要引物的原因:DNA聚合酶只能催化脱氧核糖核甘酸加至已有单链的

游离3,一羟基上,而不能使脱氧核糖核甘酸自身发生聚合。

①引物是一小段单链DNA或RNA,它能与DNA母链的一段碱基互补配对。

②细胞内DNA复制以RNA作引物,它的合成是由一种特殊的RNA合成酶——引物酶

所催化的。

③PCR反应一般以DNA作引物(因为RNA易降解)。

⑵设计引物的主要原则

①引物长度应大于16个核甘酸(通常为20〜30个核昔酸),可防止随机结合。

②引物与靶序列间的7XDNA熔解温度)不应过低。

③引物不应有发夹结构,即不能有4bp以上的回文序列。

④2个引物间不应有4bp以上的互补序列或同源序列,在3,端不应有任何互补的碱基。

⑤引物中碱基的分布尽可能均匀,G+C含量接近50%。

(3)引物的处理

由于引物延伸从3,端开始,3,端不能进行任何修饰,引物5,端对扩增特异性影响不大。

有时需要使经PCR扩增的目的基因能与载体正常结合,需要在2种引物的5,端添加不

同的限制酶的识别序列,保证目的基因定向插入载体并可避免目的基因自身环化。

(4)引物的选择和互补链的判断

DNA聚合酶只能特异性地复制处于2个引物之间的DNA序列,弓|物5,端的碱基与DNA

母链3,端的碱基进行碱基互补配对,可作为DNA复制的起始点,DNA子链的合成方向

是从引物开始由5,端向3,端延伸。

3.PCR技术中的数量关系

物质(复制)1次2次3次n次

DNA分子数2482〃

含引物的DNA分子数2482"

含引物A(或B)的DNA分子数1=2-13=22—17=23—12n~\

同时含引物A、B的DNA分子数0=2」22=22—26=23—22K—2

共消耗的引物(A和B)数量2=22—26=23—214=2f2"+1—2

两条单链等长的DNA分子数0=21—20=22—42=23—62n~2n

DNA分子种类2455

举题固法

考向1PCR的过程与引物设计

题1(2021・江苏卷)某小组为研究真菌基因m的功能,构建了融合表达蛋白M和tag标签

的质粒。请结合实验流程回答下列问题:

SmaI

引物P2/上游同源序列CCCGGG下游同源序列

5r5,-GGAnCTAGA;ACTAGTGGATCCCCCCCC|!GGGGAAAATTTATATTTT|CAAGGTCAAT-3,

沟而1

3I-CCTAAGATCT!TGATCACCTAGGGGGGGG!!CCCCTTTTAAATATAAAA!GTTCCAGTTA-5,

基因加y-----------------------------—

1PCR扩增、、、、、经单酶切

5'

3_________----------

添加同源序列的6载体A启动子tag序列

酶处理URA3AmpR

R43:酵母筛选标记基因,

缺失该基因酵母无法合成尿嗓咤

Amp--.大肠杆菌筛选标记,

氨茉青霉素抗性基因

UR43用结合体AmPR

A-tag序列:编码特定氨基酸序列,

|导入大肠杆菌可被特异性抗体识别

((.fj,X切,导入酵母

II扇动子tag序列II~~-----------

URA3_培养筛选融合tag标签

获得目的菌株的童白M

重组质粒Am

(1)目的基因的扩增

①提取真菌细胞RNA,经逆转录获得cDNA,进一步获得基因机片段。

②为了获得融合tag标签的蛋白M,设计引物P2时,不能包含基因机终止密码子的编

码序列,否则将导致蛋白M上不含tag标签。

③热启动PCR可提高扩增效率,方法之一是先将除ThqDNA聚合酶(7hq酶)以外的各成

分混合后,加热到80。。以上再混入酶,然后直接从94℃开始PCR扩增。下列叙述

正确的有.BC。

A.Kzq酶最适催化温度范围为50〜60℃

B.与常规PCR相比,热启动PCR可减少反应起始时引物错配形成的产物

C.两条子链的合成一定都是从5,端向3,端延伸

D.PCR产物DNA碱基序列的特异性体现了Taq酶的特异性

(2)重组质粒的构建

①将S/naI切开的载体A与添加同源序列的机混合,用特定DNA酶处理形成黏性末

端,然后降温以促进.黏性末端碱基配对一,形成A—m结合体。将A—机结合体导入

大肠杆菌,利用大肠杆菌中的DNA聚合酶及DNA连接酶等,完成质粒的环化。

②若正确构建的重组质粒A—机仍能被S/naI切开,则SmaI的酶切位点可能在

因加的连接处、基因加的内部_。

(3)融合蛋白的表达

①用含有尿喀咤的培养基培养UR43基因缺失型酵母,将其作为受体菌,导入质粒A—

m,然后涂布于无尿喀咤的培养基上,筛选获得目的菌株,其机理是.受体菌在无尿喀

陡的培养基上无法生长,导入重组质粒的受体菌含有UR43基因,可以长成菌落一。

②若通过抗原一抗体杂交实验检测到酵母蛋白中含tag标签,说明.融合基因表达(或

融合基因正确解码),后续实验可借助tag标签进行蛋白M的分离纯化。

解析:(1)①以逆转录获得cDNA的方式,要先从真菌细胞中提取基因m转录出来的

mRNAo②从构建好的重组质粒上看,tag序列位于目的基因下游,若机基因的转录产

物mRNA上有终止密码子,核糖体移动到终止密码子时多肽链就断开,则不会对tag序

列的转录产物继续进行翻译,蛋白M上就不含tag标签。③hq酶在延伸阶段发挥作用,

最适催化温度范围为72℃左右,A错误;PCR反应的最初加热过程中,样品温度上升

到70℃之前,在较低的温度下引物可能与部分单链模板形成非特异性结合,并在

KzqDNA聚合酶的作用下延伸,结果会导致引物错配形成的产物的扩增,影响反应的特

异性,热启动可减少引物错配形成的产物扩增,提高反应的特异性,B正确;DNA分

子复制具有方向性,都是从5,端向3,端延伸,C正确;hq酶对碱基序列没有特异性,

与普通的DNA聚合酶相比,酶更耐高温,D错误。(2)①从图上看,载体A只有一

个SmaI的酶切位点,故被SmaI切开后,载体由环状变为链状DNA,将SmaI切开

的载体A与添加同源序列的机混合,用特定DNA酶处理形成黏性末端,然后降温以

促进载体A与添加同源序列的m的黏性末端碱基互补配对。将A-m结合体导入大肠

杆菌,利用大肠杆菌中的DNA聚合酶及DNA连接酶等,完成质粒的环化。②重组质

粒中,载体A被S/nal切开的位置已经与基因机相连,原来的酶切位点已不存在,若

正确构建的重组质粒A-m仍能被SmaI切开,则SmaI的酶切位点可能在基因m的

连接处或基因m内部。(3)①筛选目的菌株的机理是导入了质粒A—机的目的菌株由于

含有URA3基因,能在无尿喀陡的培养基上存活,而URA3基因缺失型酵母则不能存

活。②若通过抗原一抗体杂交实验检测到酵母蛋白中含tag标签,位于tag标签上游的

基因机应该正常表达,说明融合基因表达(或融合基因正确解码)。

审答指导

流程图的解题步骤:①搞清图例或特别说明;②根据单箭头分析流程的变化;③了解每

个特殊步骤的文字说明的目的或指向;④小题干的小情境中,寻找填空处前后的逻辑关

系;⑤没有明显逻辑关系的,则需要从流程图中寻找答案。

座式(2020.江苏卷)如果已知一小段DNA的序列,可采用PCR的方法,简捷地分析出

已知序列两侧的序列,具体流程如下图所示(以EcoRI酶切为例)。请据图回答问题:

染色体DNA

5~~短有序列E记知序列1未知序列(片段F

n连接DNA连接酶

已知序列、

PCR引物环状DNA

IU扩增|TagDNA聚合酶

&PCR产物

IV测序、分析|

,片段F的

完整序列

⑴步骤I用的EcoRI是一种限制性内切核酸(或限制)酶,它通过识别特定的―核

昔酸序列一切割特定位点。

⑵步骤H用的DNA连接酶催化相邻核甘酸之间的3,一羟基与5,一磷酸间形成.磷酸二

酯键一;PCR循环中,升温到95℃是为了获得DNA单链;K/qDNA聚合酶的作

用是催化以DNA为模板的DNA链的延伸o

(3)若下表所列为已知的DNA序列和设计的一些PCR弓I物,步骤DI选用的PCR引物必

须是一②④_(从引物①②③④中选择,填编号)。

DNA序列(虚线处省略了部分核昔酸序列)

已知

5AACTATGCGCTCATGA•••GCAATGCGTAGCCTCT-3'

iiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii

序列3,-TTGATACGCGAGTACT-CGTTACGCATCGGAGA-5,

①5,一AACTATGCGCTCATGA—3'

PCR②5,一GCAATGCGTAGCCTCT—3'

引物③5,一AGAGGCTACGCATTGC—3'

④5'-TCATGAGCGCATAGTT—3'

⑷对PCR产物测序,经分析得到了片段F的完整序列。下列DNA单链序列中(虚线处

省略了部分核甘酸序列),结果正确的是_L。

A.5'—AACTATGCG...AGCCCTT—3'

B.5f-AATTCCATG...CTGAATT-3f

C.5'—GCAATGCGT…TCGGGAA—3'

D.5'—TTGATACGC...CGAGTAC—3'

解析:DNA连接酶是在相邻的核甘酸之间形成磷酸二酯键。引物与对应的模板链能够

碱基互补,且方向相反,步骤ni需要扩增出片段F的完整序列,需要包括已知序列两端

的未知序列,所以需要引物②(其3,端与环状DNA内链已知序列的5,端互补)和④(其3,

与环状DNA外链已知序列的5,端互补)。观察图知,片段F两侧均有EcoRI切割后的

末端,EcoRI的识别序列是G1AATTC,所以F片段一条链的5,端开始肯定是AATTC,

只有B符合。

审答指导

引物的选择或设计类问题的解决

(1)一定要知道的原则:引物延伸的方向是不变的,子链一定从5,端向3,端延伸。

(2)具体操作:①沿着引物的方向确定模板DNA;②确定引物延伸得到的目标DNA;③

找到引物与模板DNA的结合位置;④引物一定是模板链的互补链,且方向一定是从夕

端—3,端。

考向2PCR技术中的数量关系

无(20H.江苏卷节选)请回答基因工程方面的有关问题:

(1)利用PCR技术扩增目的基因,其原理与细胞内DNA复制类似(见下图)。图中引物为

单链DNA片段,它是子链合成延伸的基础。

n变性

vu

①理论上推测,第四轮循环产物中含有引物A的DNA片段所占的比例为15/16。

②在第」一轮循环产物中开始出现两条脱氧核甘酸链等长的DNA片段。

(2)设计引物是PCR技术关键步骤之一。某同学设计的两组弓I物(只标注了部分碱基序歹U)

都不合理(见下图),请分别说明理由。

第1组1「弓1物1...............................................

引物CAGGCT

【引物D•---------r-T—r-T-r-1--------------

AGCCTG

「耳|物I\..................................................................

第2组J

引物+AACTGCAGTT

CGACTGATTA

①第]组:引物I和引物n局部发生碱基互补配对而失效;

②第2组:引物「自身折叠后会出现局部碱基互补配对而失效。

(3)PCR反应体系中含有热稳定DNA聚合酶,下面的表达式不能正确反映DNA聚合酶

的功能,这是因为DNA聚合酶只能将单个脱氧核昔酸连续结合到双链DNA片段的

引物链上

解析:(1)①由图可知,由原来的每条母链为模板合成的两个新DNA分子中,只含有引

物A或引物B,而以新合成的子链为模板合成新DNA分子时,两种引物都含有,故第

四轮循环共产生16个DNA分子,其中含有引物A的分子是15个,占15/160②PCR

过程需引物,画出反应过程如下图所示:

两条链等

长的DNA

片段

-----两条链等

-----长的DNA

-----片段

第一轮第二轮第三轮

由图示可知,第一、二轮循环合成的DNA的两条链长度均不同,第三轮循环产生的DNA

分子存在等长的两条核甘酸链。(2)在第1组引物中,引物I的部分碱基序列是一

CAGGCT-,引物H的部分碱基序列是一AGCCTG—,若利用这两个引物进行DNA扩

增,会因其中的这部分碱基发生碱基互补配对而使引物失效。在第2组引物中,引物「

的部分碱基序列是一AACTG—和一CAGTT一,该引物一旦发生自身折叠,也将会出现

部分碱基互补配对而使引物失效。(3)图中直接将两个脱氧核甘酸合成DNA单链,这不

能反映DNA聚合酶的功能,因为DNA聚合酶只能在DNA模板存在的条件下,将单个

脱氧核甘酸连续结合到DNA片段的引物链上。

考向3新情境下PCR技术

题3(2023•常州期末)重叠延伸PCR技术是常规PCR技术的衍生,它依据需要连接的基

因中核昔酸序列(或基因片段)设计出多对具有互补末端的引物,先分段对模板进行扩增,

再将PCR产物混合,其中的重叠链将相互搭桥、互为模板而延伸,最终实现不同来源

的扩增片段重叠拼接起来的目的,如图1所示。请分析并回答下列问题:

引用1I⑧

I@引说

—1

—1-

外显子AB

图1

吆心

5'^——■夕

35,

5'引物A,55|^c3

蛋白A基因及设计的四种引物

图2

⑴图1中的过程②在2个反应体系中进行,原因是引物互补影响PCR结果。经

过程②后,体系中存在不同长度的DNA片段,获取所需DNA的方法是(琼脂糖凝胶)

电泳分离一。①中引物2和引物3的游离部分分别与.外显子B、外显子A-的部分序

列同源。

⑵图1中的过程⑥一不需要.(选填“需要”或“不需要”)另加引物,原因是两条DNA

的交错部分即可作为其延伸的引物一。进行②⑥⑧⑩过程时,需要在一定的缓冲溶液中

进行,⑩过程除图示条件还需要加入.原料(四种脱氧核昔酸)、耐高温的DNA聚合酶

(ThgDNA聚合酶)。

(3)重叠延伸PCR技术可用于基因的定点突变。基因定点突变是根据目的基因(如图2蛋

白A基因)的序列,设计4条单链寡核昔酸片段为弓|物(图2中的引物A-D),原理是取

弓I物A、B进行PCR1反应,以及弓I物C、D进行PCR2反应,然后将需要的两个片段

混合、延伸并大量扩增。图2引物B和引物C中的“人”代表.突变碱基一,引物B和引

物C碱基序列间存在的关系是一互处

解析:(1)过程②中的引物2和引物3会发生部分互补,需要2个反应体系。分离不同

长度的PCR产物,可通过琼脂糖凝胶电泳进行。由图1可知,①中引物2和引物3的

游离部分分别与外显子B、外显子A的部分序列同源。(2)由于引物2有一部分与外显

子A重叠,另一部分与外显子B重叠,可作为其延伸的引物,所以图1中的过程⑥不

需要另加引物。②⑥⑧⑩为PCR过程,除了图中的引物、模板、缓冲液外,还需要添

加四种脱氧核甘酸和ThqDNA聚合酶。(3)基因定点突变是根据目的基因的序列,使基

因上的某碱基缺失、增添或替换,故图2引物B和引物C中的“A”代表突变碱基。分

析图2可知,引物B和引物C碱基序列间存在互补关系。

问题

»(2023・江苏卷)为了将某纳米抗体和绿色荧光蛋白基因融合表达,运用重组酶技术构

建质粒,如图1所示。请回答下列问题:

拟构建的注:EGFP荧光蛋白

基因结构—AnBl纳米抗体

PCR引物及

“目的产物片段

线性质粒

基因重组载体

克隆流程

注:—表示PCR引物;

相同背景方框表示

同源序列。

01

(1)分别进行PCR扩增片段F1与片段F2时,配制的两个反应体系中不同的有模板、

引物,扩增程序中最主要的不同是.退火温度.。

(2)有关基因序列如图2。引物F2—F、Fl—R应在下列选项中选用CD。

EGRP基因序歹!J:5"ATGGTGAGCAAGGGC...GACGAGCTGTACAAG3"

基因序歹U:5'CATGTCCAGCTGCAG...CCAAAACCACAACCA3'

图2

A.ATGGTG...CAACCA

B.TGGTTG...CACCAT

C.GACGAG...CTGCAG

D.CTGCAG...CTCGTC

(3)将PCR产物片段与线性质粒载体混合后,在重组酶作用下可形成环化质粒,直接用

于转化细菌。这一过程与传统重组质粒构建过程相比,无需使用的酶主要有.限制酶、

DNA连接酶。

(4)转化后的大肠杆菌需采用含有抗生素的培养基筛选,下列叙述错误的有ABC。

A.稀释涂布平板需控制每个平板30〜300个菌落

B.抗性平板上未长出菌落的原因一般是培养基温度太高

C.抗性平板上常常会出现大量杂菌形成的菌落

D.抗性平板上长出的单菌落无需进一步划线纯化

(5)为了验证平板上菌落中的质粒是否符合设计,用不同菌落的质粒为模板,用引物F1

—F和F2—R进行了PCR扩增,质粒P1〜P4的扩增产物电泳结果如图3。根据图中结

果判断,可以舍弃的质粒有P3、P4o

.MPlP2P3P4

Dp,‘‘'’]’》‘,

300()—

2()0()—

100()———

500

250—

图3

(6)对于PCR产物电泳结果符合预期的质粒,通常需进一步通过基因测序确认,原因是

电泳只能测定DNA长度,不能确定碱基序列。

解析:本题主要考查基因工程的相关知识。⑴PCR反应进行的条件包括引物、酶、dNTP、

模板和缓冲液(其中需要Mg2+)等。分别进行PCR扩增片段F1与片段F2时,配制的两

个反应体系中不同的有模板(片段F1、片段F2)和引物。PCR过程包括变性、复性和延

伸三个阶段,通过温度的变化进行控制,由于引物和模板存在差异,扩增程序中最主要

的不同是退火温度。(2)据图分析可知,PCR扩增片段F1与片段F2后,需要通过重叠

延伸的方式构建融合基因。引物F2-F的部分序列与引物F1-R的部分序列可互补,

且引物F2-F的部分序列与F1片段(EGFP)靠近右侧(3,端)的序列一致;引物F1-R的

部分序列与F2片段(AnBl)靠近左侧(5,端)的序列互补配对,因此引物F2—F和引物F1

-R的序列分别与C和D对应。(3)传统重组质粒构建需要使用限制酶切割质粒使其具

有与目的基因相同的黏性末端,之后再用DNA连接酶将目的基因和质粒连接成重组质

粒。将PCR产物片段与线性质粒载体混合后,在重组酶的作用下发生同源重组形成环

化质粒,不需要使用限制酶和DNA连接酶。(4)采用含有抗生素的培养基筛选,利用稀

释涂布平板法接种,可能形成的菌落数较低,不在30〜300的范围内,A错误;抗性平

板上未长出菌落的原因可能是重组质粒未能成功导入大肠杆菌,B错误;转化后的大肠

杆菌需采用含有抗生素的培养基筛选,一般含有重组质粒的大肠杆菌才能发展为菌落,

故不会出现大量杂菌形成的菌落,C错误;稀释涂布平板和平板划线法均为分离纯化细

菌的方法,用稀释涂布平板法在抗性平板上长出的单菌落无需进一步划线纯化,D正确。

(5)EGFP为720bp,AnBl为390bp,二者的总大小为720bp+390bp=l110bp,用引

物Fl—F和F2-R进行了PCR扩增,Pl、P2的扩增产物与电泳结果符合,可以舍弃

的质粒有P3、P4。(6)琼脂糖凝胶电泳技术仅能用于分析待检测DNA分子的大小,无法

确定待检测DNA分子的碱基序列,因此对于PCR产物电泳结果符合预期的质粒,通常

需进一步通过基因测序确认。

题2(2022.江苏卷)纤毛是广泛存在的细胞表面结构,功能异常可引发多种疾病。因此,

研究纤毛形成的作用机制具有重要意义。请回答下列问题:

⑴纤毛结构如图I所示,由细胞膜延伸形成的纤毛膜主要由脂质和蛋白质.组成。基

体由中心体转变而来,中心体在有丝分裂中的功能是发出星射线,形成纺锤体(与纺

锤体的形成有关]。

(2)某病人肾小管上皮细胞纤毛异常,为了分析纤毛相关基因X是否发生了变异,对基

因X进行了PCR扩增与产物测序。从细胞样品中分离DNA时,可通过交替调节盐浓

度,将与核蛋白结合的DNA分离出来,溶液中添加NaCl至2.0mol1-1的目的是—渣

解DNA。PCR扩增时,需在一耐热/耐高温的DNA聚合酶(hqDNA聚合酶)催化

下,在引物的3,端进行DNA链的延伸,获得扩增产物用于测序。

(3)为研究蛋白质X在细胞中的定位,构建绿色荧光蛋白GFP与X的融合蛋白,融合蛋

白具有绿色荧光,可指示其在细胞内位置。将x—GRP基因融合片段M导入如图n所

示载体质粒Y,构建Y—M重组质粒(在EcoRV位点插入片段)。请完成下表。

限制酶识别序列

BamHIG^GATCC

EcoRVGAT,ATC

HindIIIA^AGCTT

5g/IIA^GATCT

序列编号Y—M连接处测序后部分序列

QI5\..AGATCTCCGATATT...3"

Q25L..AGATCTCCAAGCTT..3

Q35\..AAGCTTCCGGATCC...3"

Q45"...AAGCTTCCGATATC...3'

图m

分步实验目标简易操作、结果、分析

①选择图II引物.a、b;②PCR目的产物约为

PCR鉴定正向重组质粒Y—M

100bp

确保M及连接处序列正确③质粒测序,图ni中正确的是04(选填序列编号)

④对照质粒Y—GFP(仅表达GFP)与实验质粒Y—M

分别导入细胞,发现对照组整个细胞均有绿色荧光而

检测融合蛋白定位

实验组荧光集中在纤毛基部,说明蛋白质X在细

胞中定位于纤毛基部

(4)为研究另一纤毛病相关基因Z表达的变化,采用荧光定量PCR法检测健康人与病人

基因Z的转录水平。采集样本、提取总RNA,经逆转录形成cDNA作为模板,PCR

扩增结果显示,在总cDNA模板量相等的条件下,健康人。值为15,而病人。值为

20(。值是产物荧光强度达到设定阈值时的PCR循环数)。从理论上估算,在PCR扩增

20个循环的产物中,健康人样品的目的产物大约是病人的倍。

解析:(1)纤毛膜是由细胞膜延伸而来,故成分是一样的,主要是脂质和蛋白质。中心体

与有丝分裂过程中纺锤体的形成有关,动物细胞有丝分裂前期,中心体发出星射线,形

成纺锤体。(2)DNA在0.14mol-L-1的NaCl溶液中溶解度最低,而可溶于2.0moLL-i的

NaCl溶液,故添加NaCl至2.0molL-i的目的是溶解DNA。PCR扩增时,需在耐高温

的DNA聚合酶(即TaqDNA聚合酶)的催化下,在引物的3,端进行DNA链的延伸(DNA

的合成方向是从5,端到3,端)。(3)由图中限制酶切位点和引物箭头方向可知,PCR应选

择图H中的引物a和引物b,则PCR目的产物长度约为300+800=1100bp。在EcoR

V位点插入片段构建Y—M重组质粒,则Y—M的连接处上游应含有HindHI+EcoR

V的识别序列,下游应含有EcoRV+及/机HI的识别序列,根据图HI中各限制酶识别

序列,表中序列Q4符合。实验组荧光集中在纤毛基部,说明蛋白质X在细胞中定位于

纤毛基部。(4)RNA经逆转录形成cDNA。。值是产物荧光强度达到设定阈值时的PCR

循环数,健康人。值为15,而病人。值为20,说明病人基因Z表达较弱,达到同样

强度时,健康人比病人多5个循环,故从理论上估算,在PCR扩增20个循环的产物

中,健康人样品的目的产物大约是病人的25=32倍。

审答指导

表格型试题的考查主要以实验设计和操作步骤、结果结论的分析为主体,因此对探究性

实验要整体和局部相结合,要点和易错点相结合,分析卡点,疏通堵点,抓住增分点,

建立操作要点和实验目的之间的“因果循环关系”。基因工程和PCR问题中常以此形式,

或结合其他情境进行综合考查。

衍射训练

由于C4途径有更高的光合作用能力,科学家正试图采用基因工程手段将C4植物的相关

基因克隆到水稻(C3植物)中以提高产量。下表是相关研究中的一些步骤,请根据题意完

成以下表格。

实验目的方法步骤要点

获得目的基因PCR扩增出目的基因片段

构建载体质粒将目的基因克隆进Ti载体质粒

大量培养水稻细胞①进行植物细胞培养获得愈伤组织

转化细胞用农杆菌转化

转基因细胞筛选②用含抗生素的培养基筛选(或用选择培养基筛选)

③调控培养基中生长素与细胞分裂素的比例诱导形成完整

诱导植株形成

植株.

转基因植株分析④PCR鉴定基因、酶活力测定、测定光合作用能力一

配套精练

1.(2023•扬州中学)某实验利用PCR技术获取目的基因,实验结果显示除目的基因条带

(引物与模板完全配对)外,还有2条非特异条带(引物和模板不完全配对)。为了减少反

应非特异条带的产生,以下措施中有效的是(D)

A.增加模板DNA的量B.延长热变性的时间

C.延长延伸的时间D.提高复性的温度

解析:增加模板DNA的量可以提高反应速度,但不能有效减少非特异条带;延长热变

性的时间和延长延伸的时间会影响变性延伸过程,但对于延伸中的配对影响不大,故不

能有效减少反应非特异条带;非特异产物增加的原因可能是复性温度过低,造成引物与

模板的结合位点增加,故可通过提高复性的温度来减少反应非特异条带的产生。

2.循环阈值(。值)是通过PCR等技术手段,使病毒的核酸扩增产物达到可检测水平所

需的循环次数。下列说法错误的是(B)

A.Ct值为40和Ct值为35的核酸扩增产物的量可能相等

B.G值越高,则表示所检测的样本中病毒浓度越高,检测所需的时间越长

C.PCR反应过程中每次循环都要消耗两种引物

D.PCR反应缓冲液中添加的Mg2+可以激活耐高温的DNA聚合酶

解析:由于样品中的核酸含量不同,则。值为40和。值为35的核酸扩增产物的量可

能相等,A正确;。值越高,则表示所检测的样本中病毒浓度越低,检测所需的时间越

长,B错误;PCR产生的DNA分子是双链的,每条链都需要一种引物,则PCR反应过

程中每次循环都要消耗两种引物,C正确;用PCR扩增目的基因时,反应缓冲液中一

般要添加Mg?+来激活耐高温的DNA聚合酶,D正确。

3.(2024•连云港调研)数字PCR技术通过将一个样本分成几十到几万份,分配到不同

的反应单元,每个单元最多包含一个拷贝的目标分子(DNA模板),在每个反应单元中分

别对目标分子进行PCR扩增,扩增结束后对各个反应单元的荧光信号进行统计学分析,

如下图所示。下列相关叙述错误的是(B)

O无荧光

稀释、分装荧光PCR・有荧光

待分析PCR每个反应单元中最检测荧光并计数,

反应体系多含有1个DNA分子得出目标分子起始拷贝数

A.PCR每一循环包括变性、复性(退火)和延伸三步

B.数字PCR可以在常温下进行,降低了检测成本

C.每个反应单元有无荧光取决于是否含有目标分子

D.数字PCR可实现对样品中目标分子的绝对定量分析

解析:PCR每一循环都包括变性、复性和退火三步,A正确。数字PCR也是体外DNA

复制,需要高温使DNA变性,B错误。每个单元最多包含一个拷贝的目标分子,如果

反应单元中有目标分子,经PCR可以扩增大量目标分子,利用荧光检测时出现荧光信

号。如果反应单元中没有分配到目标分子,反应单元不进行DNA复制,没有产物,利

用荧光检测时不出现荧光信号,C正确。起始待测样品分配时,待分析PCR反应体系

每个反应单元中最多分配有1个DNA分子,所以检测时,有多少单元有荧光信号,待

测样品中起始就有多少DNA分子,所以数字PCR可实现对样品中目标分子的绝对定

量分析,D正确。

4.(多选)(2024.淮安调研)引物在极大程度上决定了PCR的成败,下列关于引物的说法,

正确的有(ABD)

A.PCR和生物体内的DNA合成都需要引物,PCR引物一般是单链DNA

B.若引物的CG碱基含量相对较高,PCR退火步骤的温度需要适当升高

C.在PCR的退火步骤,两种引物分别结合在模板链的3,端和夕端

D.若初始有10个胰岛素基因,PCR中进行10轮循环,至少需要20460个引物分子

解析:PCR和生物体内的DNA合成都需要引物,体内的DNA复制引物通常是RNA,

PCR引物一般是单链DNA,A正确;G与C之间有3个氢键,稳定性高,若引物的CG

碱基含量相对较高,PCR退火步骤的温度需要适当升高,B正确;在PCR的退火步骤,

两种引物都结合在模板链的3,端,C错误;若初始有10个胰岛素基因,PCR中进行10

轮循环,得到10x21°个=10240个DNA分子,共1024x2=20480条链,由于初始的

20条链不需要引物,故至少需要20480—20=20460个引物分子,D正确。

5.(多选)(2023・南通期末)多重PCR是指在反应体系中加入多种引物,最终扩增出多种

目的DNA片段的技术,如图。相关叙述正确的是(ACD)

一科白母基因A

弓[物^

一寸小川基因B

引物对c

0一尸产A尸基因C

_丁基因D

A.多重PCR加入的引物之间不能互补配对形成局部双链

B.不同对引物的退火温度差异越大,扩增的特异性越强

C.多重PCR扩增出的大小不一的DNA片段可用电泳检测

D.多重PCR可用于多种病原体感染的检测

解析:多重PCR加入的不同引物的碱基排列顺序不能互补,如果互补,就会造成引物

之间形成双链,不能与模板链结合,降低扩增的效率,A正确;一般而言,引物的GC

含量越高,结合特异性越强,扩增的特异性越强,B错误;电泳技术可分离不同大小的

DNA分子,故多重PCR扩增出的大小不一的DNA片段可用电泳检测,C正确;PCR

鉴定病原体的原理是碱基互补配对,该体系中加入多种引物,最终扩增出多种目的DNA

片段,故多重PCR可用于多种病原体感染的检测,D正确。

6.(多选)(2024•南通10月质监)交错PCR能实现同源基因的重组(如图,仅示单链)。第

一轮延伸15s,获得短产物①②。在第二轮开始时(95℃)产物①②与原来模板分开,然

后(55℃)随机地与不同模板交错结合,延伸15s,合成交错产物③④。每一轮扩增仅延

伸一小段,经过多轮“产物一模板”交替结合、延伸,最终扩增出交错重组基因产物。相

关叙述正确的是(AB)

引物引物

A.交错PCR原理是DNA半保留复制

B.交错PCR延伸温度设定为55℃可增加交错次数

C.上一轮交错产物需与模板链严格配对才能继续下一轮扩增

D.若交错循环20轮,一共产生220个DNA分子

解析:交错PCR是PCR技术的延伸,利用了DNA半保留复制,A正确;在第二轮开

始时(95℃)产物①②与原来模板分开,然后(55℃)随机地与不同模板交错结合,延伸15

s,合成交错产物③④,故延伸温度设定为55℃可增加交错次数,B正确;交错延伸PCR

与普通PCR技术的区别是每轮扩增仅延伸一小段,经过多轮“产物一模板”交替结合、

延伸,最终扩增出交错重组基因片段混合产物,故上一轮交错产物不需与模板链完全配

对也可继续下一轮扩增,交错循环20轮,也可能只产生1个DNA分子,C、D错误。

7.基因定点突变是指按照特定的要求,使基因的特定序列发生插入、删除、置换、重

排等变异。图甲是一种PCR介导的基因定点突变示意图,图乙是研究人员利用基因Ml

构建基因表达载体的过程。请回答下列问题:

|引物|引物2

;二二一二J基因M

丽^/引物4

AnB

----------基因M]

BamHlGJGATCC

注:|代表酶切位点,HindmA|AGCTT

--------代表两段特定DNA序列PstlCTGCAIG

甲乙

(1)进行基因定点突变的PCR反应体系中,除加入引物和模板DNA外,一般还需要加

入预酶、dNTP(缓冲液、M『+)等,图甲所示的基因定点突变技术需要3次PCR,

获得产物A需要的引物是引物1和引物3。

(2)研究人员对PCR的中间产物A、B进行纯化后,利用图中相关酶对基因M和产物

A、B进行充分酶切后得到不同的片段,长度(kb)如下表,则图中基因敲除片段的长度

为。23kb,基因Ml的长度为6.09kb。

基因MAB

长度3.24、2.8、0.15、0.132.8、0.093.24、0.05

(3)通过图甲过程获得的基因Ml仍需要大量扩增,此时选择的引物是引物1和引物

2,为了与图乙中的Ti质粒相连,还需要分别在它们的5端引入限制酶H泳HH、

Ps/I的识别序列。

(4)构建基因表达载体时,Ml基因必需插入Ti质粒的T—DNA中,原因是Ti质粒

上的T—DNA能够转移并整合到受体细胞的染色体上。

解析:(1)进行基因定点突变的PCR反应体系中,除加入引物和模板DNA外,一般还

需要加入Taq酶、dNTP(缓冲液、Mg?+)等。从图甲可以看到,从加入引物到获得基因Ml

总共经历了3

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