基因组学实验-课程教学大纲

ADDINCNKISM.UserStyle《基因组学实验》课程教学大纲（实验课程）一、课程基本信息课程号1223S00069开课单位生命科学学院课程名称（中文）基因组学实验（英文）GenomicsExperiments课程性质必修考核类型考查课程学分1课程学时34课程类别专业核心课程适用专业（类）生物信息学二、课程描述及目标（一）课程简介基因组学是生物信息学专业的专业核心课程，其是一门实验性很强的新兴学科，《基因组学实验》课程是基因组学理论课程的必要补充。本实验课程的目的是使学生通过实验掌握基因组学的相关原理、基本方法与技术，巩固和加深对课堂理论知识的理解。培养学生独立进行科学研究的基本技能，提高学生的动手能力及分析问题、解决问题的能力，养成严谨的科学态度，为以后的工作打下坚实的基础。（二）教学目标课程目标1：掌握基因组学实验的基本操作，基本技能和必要的实验技术。课程目标2：掌握独立进行科学研究的基本技能。课程目标3：提高动手能力及分析问题、解决问题的能力，养成严谨的科学态度。三、课程目标对毕业要求的支撑关系毕业要求指标点课程目标1-5：了解生物信息学的发展历史、学科前沿和发展趋势，掌握生物信息学基本原理、基本方法和相关技术。熟悉生物信息学及其产业的相关方针、政策、法规。课程目标1，22-2：具有综合运用所掌握的理论知识和技能，从事生物信息学及其相关领域科学研究和技术开发的能力；课程目标23-3：具备良好的专业素质，受到严格的科学思维训练，有求实创新的精神、批判性思维和可持续发展理念；课程目标3四、教学方式与方法以教师讲解、示范为主，个别指导为辅。五、教学重点与难点（一）教学重点基因组数据分析综合实验，包括基因组数据的质量控制，组装，基因组特性分析，变异分析，基因预测，基因功能注释与富集分析，比较基因组分析。（二）教学难点基因组数据分析综合实验中的变异分析，基因预测，基因功能注释与富集分析。六、实验内容、基本要求与学时分配序号实验项目名称实验内容与要求学时类型对应课程目标1一代测序数据分析了解一代测序ABIF格式数据的主要信息。掌握一代测序ABIF格式数据的主要信息的提取及分析方法。2验证性课程目标1，22基因组数据分析了解基因组数据分析相关原理，包括质量控制，组装，基因组特性分析，变异分析，基因预测，基因功能注释与富集分析，比较基因组分析的基本原理，掌握以上分析的方法。28综合性课程目标1，2，33转录组组装与分析了解有参和无参转录组的分析原理，掌握无参转录组的组装和分析方法。4验证性课程目标1，2合计34七、学业评价和课程考核（一）考核类型：考试考查（二）考核方式：实验报告实验作品其它：期末作业（三）成绩评定：考核依据建议分值（百分比）考核/评价细则对应课程目标过程考核70出勤12满勤10分，缺勤1次扣4分。课程目标1预习报告189次预习报告，每次2分。课程目标1实验报告40实验1：2分；实验2：7×5=35分；实验3：3分课程目标1，2期末考核30数据分析代码15分数据分析结果15分课程目标1，2，3八、课程目