标准解读

《GB/T 46935-2025 单细胞测序 单细胞转录组数据集》是一项国家标准,旨在规范单细胞转录组数据的生成、处理及共享过程。该标准详细规定了从样本采集到数据分析的整个流程中应遵循的原则和技术要求,确保数据的质量和可重复性。

在样本准备阶段,标准明确了样本来源、保存条件以及质量控制的要求,保证实验材料符合后续分析需求。对于文库构建部分,则具体描述了推荐使用的试剂盒类型、操作步骤等信息,同时强调了实验过程中需要注意的关键点,以减少批次效应和其他潜在的技术偏差。

关于测序环节,《GB/T 46935-2025》指出了选择合适测序平台的重要性,并提供了不同平台上最佳实践指南。此外,还对测序深度、读长等因素进行了说明,以确保获得高质量的数据输出。

在数据分析方面,该标准涵盖了从原始数据预处理到高级生物信息学分析的全流程指导。它不仅介绍了常用软件工具及其参数设置建议,也讨论了如何进行差异表达分析、细胞类型注释等核心任务。更重要的是,针对当前领域内存在的挑战,如稀有细胞类型的识别、时空转录组学研究等,提出了相应的解决方案或思路。


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....

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  • 即将实施
  • 暂未开始实施
  • 2025-12-31 颁布
  • 2026-07-01 实施
©正版授权
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GB/T 46935-2025单细胞测序单细胞转录组数据集_第2页
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文档简介

ICS07080

CCSA.40

中华人民共和国国家标准

GB/T46935—2025

单细胞测序单细胞转录组数据集

Single-cellsequencing—Datasetofsinglecelltranscriptome

2025-12-31发布2026-07-01实施

国家市场监督管理总局发布

国家标准化管理委员会

GB/T46935—2025

目次

前言

…………………………Ⅲ

范围

1………………………1

规范性引用文件

2…………………………1

术语和定义

3………………1

符号和缩略语

4……………2

符号

4.1…………………2

缩略语

4.2………………2

数据及数据文件要求

5……………………3

数据文件组成

5.1………………………3

数据文件要求

5.2………………………3

数据元目录

6………………5

属性

6.1…………………5

数据元目录公用属性

6.2………………5

数据元目录专用属性

6.3………………5

数据归档目录

7……………6

数据归档目录结构

7.1…………………6

单细胞数据归档目录要求

7.2…………6

数据安全管理

8……………7

基本要求

8.1……………7

单细胞转录组数据分级分类原则

8.2…………………7

单细胞转录组数据集的分级分类方式

8.3……………7

单细胞转录组数据集的管理方式和完整性分级关系

8.4……………8

附录资料性数据元目录

A()……………9

简介

A.1…………………9

实验信息

A.2……………9

建库测序信息

A.3……………………10

生物信息分析

A.4……………………11

质控信息

A.5…………………………13

附录资料性数据元值的范围代码表

B()………………16

文库构建策略代码

B.1…………………16

分子类型代码

B.2………………………17

是否代码

B.3……………18

文件类型代码

B.4………………………18

文库设置代码

B.5………………………18

GB/T46935—2025

文库来源代码

B.6………………………18

参考文献

……………………20

GB/T46935—2025

前言

本文件按照标准化工作导则第部分标准化文件的结构和起草规则的规定

GB/T1.1—2020《1:》

起草

请注意本文件的某些内容可能涉及专利本文件的发布机构不承担识别专利的责任

。。

本文件由全国生化检测标准化技术委员会提出并归口

(SAC/TC387)。

本文件起草单位深圳华大生命科学研究院中国测试技术研究院生物研究所杭州华大生命科学

:、、

研究院中国科学院北京基因组研究所国家生物信息中心中山大学武汉华大生命科学研究院青岛

、()、、、

华大智造科技有限责任公司广州基迪奥生物科技有限公司西北农林科技大学中国科学院武汉植物

、、、

园深圳裕策生物科技有限公司菁良科技深圳有限公司上海百英生物科技股份有限公司苏州绘真

、、()、、

医学检验有限公司江西烈冰生物科技有限公司杭州联川生物技术股份有限公司苏州百源基因技术

、、、

有限公司圣湘生物科技股份有限公司利德健康科技广州有限公司

、、()。

本文件主要起草人麻凯龙魏晓锋徐志成周李华游丽金王伟文刘石平王博谢志鲍一明

:、、、、、、、、、、

宋述慧刘姗姗张少桥李涛周煌凯姜雨石涛高志博李小强李玲徐晓凯杨涛华聪王志杰

、、、、、、、、、、、、、、

杨帆吴静静吴昊李倩一李菁华林木飞卢海松宗杰张惠丹韩斐然杨丽车团结车妍张峰

、、、、、、、、、、、、、。

GB/T46935—2025

单细胞测序单细胞转录组数据集

1范围

本文件规定了单细胞转录组数据及数据文件要求数据元目录数据归档目录和数据安全管理的

、、

要求

本文件适用于组学数据中有关单细胞转录组数据的存储管理交换和共享

、、。

2规范性引用文件

下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款其中注日期的引用文

。,

件仅该日期对应的版本适用于本文件不注日期的引用文件其最新版本包括所有的修改单适用于

,;,()

本文件

科学数据安全分类分级指南

GB/T43705

科学数据安全要求通则

GB/T43708

科学数据安全审计要求

GB/T43710

3术语和定义

下列术语和定义适用于本文件

31

.

FASTQ格式FASTQformat

是基于文本的保存生物序列通常是核酸序列和其测序质量信息的

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