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文档简介
生物医学工程生物科技研发研发工程师实习报告一、摘要
2023年7月1日至2023年8月31日,我在一家生物科技企业担任研发工程师实习生,参与新型生物标志物筛选项目。核心工作成果包括完成2000份临床样本的基因组测序数据分析,通过机器学习模型识别出3个与疾病相关的潜在生物标志物,相关数据经内部验证后准确率达到89%。在实习期间,应用了生物信息学工具进行数据处理,熟练掌握Python编写自动化脚本,优化了数据处理流程效率提升40%。提炼出的标准化数据分析流程可应用于后续同类研究中,为生物标志物发现提供了可复用的方法论。
二、实习内容及过程
2023年7月1日到8月31日,我在一家生物科技公司做研发工程师实习。公司主要做基因测序和生物标志物研究,有500多人,实验室设备挺全乎,二代测序平台、液相色谱仪都挺新。我跟着团队做新型生物标志物筛选,具体是分析肺癌患者的血浆样本。
实习初期,导师让我先把前半年积累的1500份样本数据整理出来,用Python写脚本自动提取基因表达量。我之前只会用Excel,每天对着海量数据挺头疼,感觉好几个星期都没啥进展。后来自己琢磨,又看了公司给的几篇文献,学了Pandas库怎么处理bed格式文件,效率果然提上来了,原本要两周的事,我6天就搞定了。
重点项目是参与一项临床试验数据验证。团队给我200份新样本,要求在3周内完成基因分型和生物信息学分析。有个样本重复测序结果偏差太大,一开始我以为是仪器问题,后来查资料发现是样本降解了,赶紧联系临床重新取了样本,最后数据重分析准确率恢复到92%。这个经历让我明白,做实验不能光靠设备,还得懂样本处理细节。
公司的流程挺规范的,从样本接收到数据上报有严格SOP,但有时候培训挺模糊的,比如细胞培养那块,没系统教怎么优化培养基比例,我就自己瞎试,踩了不少坑。另外,岗位要求里说要懂机器学习,但我实际用得不多,更多是帮忙跑现成模型,感觉跟学校学的有点脱节。
这次实习最大的收获是学会了怎么把理论转化为实际工作,比如我知道了如何通过ROC曲线评估生物标志物的诊断价值,之前只觉得是个数学模型。现在看,做研发得脚踏实地,不能光想当然。不过公司管理上,我觉得培训可以更系统些,比如把常用实验的失败案例整理成手册,避免新人走弯路。
三、总结与体会
这8周,从2023年7月到8月,实习经历像给我上了堂生动的实践课。刚去的时候,总觉得书本知识够用,来了才明白,实验室里每一步操作都得精准,差一点点结果可能就完全不一样。比如有一次处理测序数据,因为我对某个基因家族的数据库不熟,跑了好几天模型都没效果,最后导师点醒我补充特定注释文件,效率立马提上来。这让我真切感受到,做研发不能光靠聪明,得沉得下心,还得知道去哪找答案。
实习最大的收获是,我开始理解什么是真正的生物标志物开发流程。从2000份样本的基因组数据筛选,到用ROC曲线验证那个潜在靶点(准确率89%),每一步都让我对“转化医学”这个词有了更深的体会。以前觉得这些概念挺遥远的,现在自己亲手参与过,才知道其中的不易。也认识到,现在做这类研究,单打独斗根本不行,需要多学科合作,比如基因编辑技术跟AI算法结合,效率才会上去。
这段经历让我对职业规划更清晰了。以前想当科学家,现在觉得更想往临床转化方向发展。接下来打算补一补机器学习这块,9月开始会系统学Python的scikitlearn库,争取明年考个基因编辑相关的证书。实习也让我明白,学校里学的只是基础,真正本事得在工作中磨炼。比如高压环境下怎么跟导师沟通问题,怎么在deadline前协调资源,这些职场课比书本有用多了。
看着实验室里那些在显微镜前忙活的师兄师姐,突然觉得,自己以后也要这样日复一日地做下去。这不仅是工作,更是为患者寻找希望。虽然知道现在自己还差点火候,但至少知道路该怎么走了。
四、致谢
在这8周实习期间,特别感谢公司给我这个机会,让我接触到了真实的研发环境。导师的指导非常关键,特别是在处理那个测序偏差样本时,他点醒我的方法
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