生物学生物研发中心生物技术实习生实习报告

生物学生物研发中心生物技术实习生实习报告一、摘要2023年6月5日至8月22日，我在生物技术研发中心担任生物技术实习生。核心工作成果包括完成3个细胞系的全基因组测序数据初步分析，处理并整理约1.2TB实验原始数据，参与构建2项新型分子检测流程，并独立优化PCR反应体系使特异性提高15%。期间应用生物信息学软件进行数据分析，熟练掌握R语言和Python在基因表达谱可视化中的应用，通过文献调研提出3项实验改进方案，其中1项被团队采纳用于提升实验效率。提炼出标准化的数据质控流程，包括使用FastQC和Trimmomatic对测序数据进行质量评估与修剪，确保后续分析准确性。二、实习内容及过程2023年6月5日入职，实习周期8周。1实习目的主要是想看看实际研发环境跟学校实验室有啥不一样，多接触点真实验项目，提升动手能力，特别是想摸摸基因测序那块，看看自己适不适合往这个方向整。2实习单位简介这地方主要搞新型生物诊断试剂研发，团队不大但挺拼，实验设备新旧都有，测序仪是那套老款Illumina，但数据量还行。3实习内容与过程初期跟着师兄做细胞系培养，学的是标准的单层贴壁培养，传代啥的，大概做了10来次，手感慢慢熟了。6月12号开始参与一个流感病毒基因分型项目，主要是处理测序数据。拿到原始数据后，先用FastQC看看质量，发现N比例有点高，然后用Trimmomatic裁剪，裁剪掉后保留了大概70%的数据量。接着用R语言跑PCA和聚类分析，把样本分成了3个主要簇，跟预期差不多。期间遇到个坑，是某个样本的扩增曲线特别平，后来发现是模板量太低了，调整了模板浓度和PCR循环数才搞定，这让我意识到反应体系优化不能瞎来。7月10号左右开始接触分子检测流程搭建，帮着把一套qPCR试剂的引物退火温度优化了，从原来的60℃调到62℃，特异性提升挺明显，结果里非特异性扩增条带少了一大半。4实习成果与收获完成了3个细胞系的全基因组测序数据预处理，整理了1.2TB测序原始数据，参与搭建的分子检测流程被团队小范围试用，效果还不错。最大的收获是摸清了从样本到数据的整个流程，特别是测序数据质控那块，总结了个自己的检查清单，跑FastQC、检查GC含量分布、看聚类图，这些挺实用的。5遇到的问题及应对开始时对测序数据量有多大没概念，处理数据时电脑老卡，学用了多线程跑分析脚本，效率高不少。还有一次是跑qPCR实验，结果一直不对，特异性差，查了半天文献，发现是引物二聚体问题，调整了引物设计参数才解决，这让我明白做实验不能光靠重复，得动脑子分析。6对职业规划的启发这段经历让我看清了研发岗跟实验室技术员有区别，需要更强的分析能力和解决问题的能力，以后想往这个方向多发展，得多学点生物信息学和实验设计那块。7单位问题及建议这地方管理上挺随意的，比如实验记录有时候没人盯着，容易出错。建议可以搞个标准化的电子记录系统，强制填些关键节点，效率可能更高。另外培训机制可以完善下，比如生物信息学那块，我来了之后才知道团队用R，但我只会点基础Python，要是实习前能有个简单的培训，可能上手更快。三、总结与体会2023年8月22日结束的这8周实习，像是在学校理论和现实之间搭了座桥。1实习价值闭环最直观的感受是，那些在学校觉得拗口的实验流程和数据分析方法，真用到手边就完全不一样了。比如处理那1.2TB测序数据，光看教程是没用的，实际操作时发现FastQC的报告得自己一个个指标核对，Trimmomatic的参数还得根据实际数据调整，这个过程让我把文献里学的统计方法用活了。现在回头看，当初做的每个小调整比如把某个样本的测序深度从50调整到80最后都影响了结果的准确性，这种因果链条的体验是书本给不了的。2职业规划联结这段经历让我更清楚自己想干嘛了。之前对基因测序挺好奇，但实习后发现自己对数据处理和流程优化更感兴趣。团队里那个老员工做数据分析，他教我写Python脚本自动处理质控结果时，我发现自己挺乐在其中的。现在想清楚，后续学习得往这个方向倾斜，可能要考虑报个生物信息学的短期课程，至少先把R语言再啃下来。实习最后那两天，我在想如果真能留在这里做数据分析，得赶紧把机器学习那块补上，不然还是会被淘汰。3行业趋势展望感觉现在做研发，光会跑实验不行，得懂点技术转移和知识产权。我参与的那个分子检测流程优化，最后写报告时师兄让我多提专利点，我才意识到这行不是做完实验就完事，还得考虑怎么让成果落地。现在看行业新闻，发现很多公司都在搞数字化转型，像AI辅助药物设计、高通量筛选这些，我这实习经历让我觉得，以后不管在哪儿，都得持续学新东西，否则很快会跟不上节奏。4心态转变以前做实验觉得按部就班就行，现在明白每个步骤都得有责任心，特别是测序数据，处理不好可能整个项目白费。7月15号那会儿，有个样本的聚类结果特别奇怪，我反复检查了三遍代码，最后发现是某个R包版本更新导致的结果不同，这让我第一次体会到工作里的责任感。现在写实验记录会特别仔细，生怕哪天别人拿我的数据说事。这种心态转变可能比学会什么新技能更重要。5未来行动实习最后那周，我在想怎么把这里的经验变成自己的资本。比如那个数据处理清单，我打算回去整理成文档，以后写论文或者做项目直接用。另外，团队用的某个在线序列比对工具效率很高，我打算下学期试着用课程设计做个小项目，把数据处理和可视化结合起来，争取能拿个成果。这8周让我明白，实习不是走过场，得主动去学，去创造点东西，不然回来就是打酱油的。四、致谢1感谢生物技术研发中心提供这次实