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文档简介
单细胞测序样本制备技师考试试卷及答案一、填空题(每题1分,共10分)1.单细胞测序样本制备中,分离单个细胞常用的方法有______、______和微流控法等。2.细胞悬液制备时,需去除细胞团块的常用过滤装置是______μm细胞筛。3.单细胞文库构建中,用于逆转录的酶通常具有______活性,以避免RNA降解。4.样本制备中,评估细胞活性的常用染色剂是______(活细胞染色)和______(死细胞染色)。5.10xGenomics平台中,用于捕获单个细胞的是______珠。6.单细胞RNA-seq样本制备时,需避免RNAase污染,常用的去RNAase试剂是______。7.分离外周血单个核细胞(PBMC)常用的密度梯度离心试剂是______。8.单细胞样本制备后,需检测细胞浓度,常用仪器是______。9.文库构建中,用于PCR扩增的酶需具有______活性,以提高扩增效率和特异性。10.样本制备中,若细胞活性低于______%,需重新处理样本。二、单项选择题(每题2分,共20分)1.以下哪种方法不适合分离贴壁细胞?A.胰酶消化法B.胶原酶消化法C.机械刮除法D.密度梯度离心法2.10xGenomics单细胞平台中,GEM形成的关键是?A.细胞与凝胶珠的混合比例B.微流控芯片的流速C.油相的黏度D.以上都是3.评估单细胞悬液质量的核心指标不包括?A.细胞浓度B.细胞活性C.细胞大小D.细胞纯度4.以下哪种试剂会导致RNA降解?A.DEPC处理水B.无RNAase酶的PBSC.含RNAase的缓冲液D.无DNAase的缓冲液5.分离脑组织单细胞时,常用的解离酶组合是?A.胰酶+EDTAB.木瓜蛋白酶+DNaseIC.胶原酶I+胶原酶IID.胃蛋白酶+EDTA6.单细胞文库构建中,cDNA合成后需进行的步骤是?A.片段化B.加A尾C.连接接头D.以上都是7.以下哪种样本制备后需立即进行测序?A.新鲜细胞悬液B.冻存细胞悬液C.固定细胞D.石蜡包埋细胞8.10xGenomics平台中,每个GEM包含的细胞数通常是?A.0-1个B.1-2个C.2-3个D.3-4个9.检测细胞活性时,台盼蓝染色阳性表示细胞是?A.活细胞B.死细胞C.凋亡细胞D.坏死细胞10.以下哪种方法可提高单细胞捕获效率?A.增加细胞浓度B.减少细胞团块C.降低油相温度D.增加凝胶珠浓度三、多项选择题(每题2分,共20分)1.单细胞测序样本制备的关键步骤包括?A.样本解离B.细胞悬液制备C.单细胞捕获D.文库构建2.以下哪些属于单细胞捕获方法?A.微流控法B.激光捕获显微切割(LCM)C.流式分选D.磁珠分选3.评估细胞悬液质量的指标有?A.细胞活性≥80%B.细胞浓度在10^5-10^6cells/mLC.无明显细胞团块D.细胞大小均一4.样本解离时需注意的事项包括?A.控制解离时间B.避免过度消化C.保持低温(4℃)D.及时终止酶反应5.以下哪些试剂用于RNA保护?A.RNAlaterB.TrizolC.DEPCD.乙醇6.10xGenomics单细胞文库构建的步骤包括?A.GEM形成B.逆转录C.cDNA扩增D.文库纯化7.以下哪些样本适合单细胞测序?A.新鲜肿瘤组织B.冻存PBMCC.固定的胚胎细胞D.石蜡包埋的血液样本8.细胞计数时常用的方法有?A.血细胞计数板计数B.自动细胞计数仪计数C.流式细胞术计数D.分光光度计计数9.以下哪些会影响单细胞捕获效率?A.细胞团块数量B.细胞活性C.微流控芯片堵塞D.凝胶珠质量10.文库构建中常用的接头类型有?A.通用接头B.特异性接头C.索引接头D.随机接头四、判断题(每题2分,共20分)1.酶解法解离细胞时,胰酶可用于所有组织类型。()2.细胞悬液制备后需立即进行过滤,去除细胞团块。()3.10xGenomics平台中,GEM形成后需立即进行逆转录。()4.冻存细胞悬液可直接用于单细胞捕获。()5.台盼蓝染色时,活细胞会被染成蓝色。()6.密度梯度离心法可用于分离PBMC和肿瘤细胞。()7.文库构建中,PCR扩增后需进行磁珠纯化。()8.单细胞测序样本制备中,无需考虑DNA污染。()9.激光捕获显微切割(LCM)可用于分离特定组织区域的单细胞。()10.细胞活性低于70%时,样本仍可用于单细胞测序。()五、简答题(每题5分,共20分)1.简述单细胞测序样本制备中样本解离的基本原则。2.如何评估单细胞悬液的质量?3.简述10xGenomics单细胞平台中GEM形成的过程。4.样本制备中如何避免RNAase污染?六、讨论题(每题5分,共10分)1.讨论不同组织类型(如肿瘤组织、脑组织、外周血)单细胞样本制备的差异及注意事项。2.讨论单细胞测序样本制备中细胞活性低的常见原因及解决方法。---答案部分一、填空题答案1.酶解法;机械法2.403.RNaseH4.台盼蓝;伊红5.GEM(凝胶珠-微珠复合物)6.DEPC7.Ficoll-Paque8.血细胞计数板(或细胞计数仪)9.热启动DNA聚合酶10.80二、单项选择题答案1.D2.D3.C4.C5.B6.D7.A8.A9.B10.B三、多项选择题答案1.ABCD2.ABC3.ABC4.ABD5.ABD6.ABCD7.ABC8.ABC9.ABCD10.AC四、判断题答案1.×2.√3.√4.×5.×6.√7.√8.×9.√10.×五、简答题答案1.样本解离原则:①适配酶选择(贴壁用胰酶/胶原酶,脑组织用木瓜蛋白酶+DNaseI);②控制条件(37℃/室温,10-30min),及时用含血清缓冲液终止;③轻柔机械辅助(吹打/研磨),防细胞损伤;④解离后立即40μm过滤除团块;⑤部分样本保持低温,减少RNA降解。核心平衡解离效率与细胞活性。2.悬液质量评估:①活性:台盼蓝染色,活细胞≥80%;②浓度:计数板/自动仪检测,10^5-10^6cells/mL;③纯度:无明显团块、杂质(红细胞/碎片);④完整性:RNA完整性(RIN≥7)。若不达标需重新制备。3.GEM形成过程:①准备适配浓度单细胞悬液;②混合细胞、凝胶珠(含条形码引物)、酶mix;③微流控芯片乳化形成油包水微滴;④单包(每微滴通常1细胞+1凝胶珠);⑤凝胶化稳定结构,引物结合RNA。控流速/比例提高单包率。4.防RNAase污染:①环境:RNAase-free超净台,DEPC擦拭;②试剂:DEPC处理水/无RNAase试剂,选RNaseH+逆转录酶;③操作:戴无RNAase手套,用一次性耗材;④样本:新鲜用RNAlater保护,快速处理。六、讨论题答案1.不同组织制备差异:①肿瘤:剪碎后胶原酶+DNaseI解离,除红细胞,控消化时间;②脑组织:木瓜蛋白酶+DNaseI温和解离,防研磨损伤,除髓鞘碎片;③外周血:Ficoll离心分离PBMC,防溶血。注意:肿瘤需评估纯度,脑组织保持低温,外周血控浓度。2.细胞活性低的原因
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