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2026年上海生命科学研究院分子细胞卓越中心褚晏伊组招聘考试笔试题库附答案解析一、单项选择题(每题2分,共20分)1.以下哪种组蛋白修饰通常与基因转录激活相关?A.H3K27me3B.H3K9me3C.H3K4me3D.H3K36me2答案:C解析:H3K4me3(组蛋白H3第4位赖氨酸三甲基化)是经典的转录激活标记,常见于基因启动子区;H3K27me3(抑制性标记)和H3K9me3(异染色质标记)与转录抑制相关;H3K36me2主要与基因体区转录延伸相关。2.下列关于CRISPR-Cas9系统的描述,错误的是?A.sgRNA由tracrRNA和crRNA融合而成B.Cas9蛋白的HNH结构域切割与sgRNA互补的DNA链C.脱靶效应可通过优化sgRNA设计或使用高保真Cas9突变体降低D.该系统仅能在真核细胞中实现基因编辑答案:D解析:CRISPR-Cas9系统最初在原核生物(如链球菌)中发现,现广泛应用于真核细胞(如哺乳动物、植物)和原核细胞的基因编辑,因此D错误。其他选项均正确:sgRNA为tracrRNA与crRNA的融合;HNH结构域切割互补链,RuvC结构域切割非互补链;高保真Cas9(如eSpCas9)可减少脱靶。3.单细胞RNA测序(scRNA-seq)中,“批次效应”主要来源于?A.不同细胞的基因表达异质性B.测序仪型号差异C.样本处理时间或实验条件不一致D.细胞裂解效率差异答案:C解析:批次效应指因实验条件(如不同日期、不同操作者、不同试剂批次)导致的非生物学差异,是scRNA-seq数据分析中需重点校正的问题;细胞异质性是生物学信号,非批次效应来源;测序仪型号和裂解效率差异可能影响数据质量,但非主要批次效应来源。4.若需研究某转录因子(TF)在小鼠胚胎干细胞(mESC)向神经前体细胞分化中的调控网络,优先选择的实验技术是?A.ChIP-seq(染色质免疫共沉淀测序)B.RNA-seq(转录组测序)C.ATAC-seq(转座酶可及染色质测序)D.Hi-C(染色体构象捕获测序)答案:A解析:ChIP-seq可直接检测TF在基因组上的结合位点,结合分化不同阶段的RNA-seq数据,可构建TF的调控网络;RNA-seq反映基因表达变化,但无法直接关联TF结合;ATAC-seq检测染色质开放性,间接提示调控区域;Hi-C研究染色体三维结构,与TF直接调控关系较弱。5.以下哪种实验方法可用于检测蛋白质与RNA的相互作用?A.Co-IP(免疫共沉淀)B.RIP(RNA免疫沉淀)C.GSTpull-downD.ChIP答案:B解析:RIP(RNAImmunoprecipitation)通过抗体捕获与目标蛋白结合的RNA,可检测蛋白质-RNA相互作用;Co-IP检测蛋白质-蛋白质相互作用;GSTpull-down通过融合蛋白捕获互作蛋白;ChIP检测蛋白质-DNA相互作用。6.在WesternBlot实验中,若目标蛋白分子量为50kDa,应选择的分离胶浓度(聚丙烯酰胺)约为?A.5%B.8%C.12%D.15%答案:B解析:聚丙烯酰胺凝胶浓度与分离蛋白分子量负相关:5%胶适用于>200kDa,8%适用于50-200kDa,12%适用于15-100kDa,15%适用于<30kDa。50kDa蛋白通常用8%胶分离效果最佳。7.下列关于细胞周期检查点的描述,正确的是?A.G1/S检查点主要监测DNA损伤B.G2/M检查点主要监测细胞大小和营养状态C.M期检查点(纺锤体组装检查点)确保染色体正确附着于纺锤体D.检查点失调仅导致细胞周期阻滞,不会引发癌变答案:C解析:M期检查点通过监测动粒是否正确附着纺锤体微管,阻止细胞进入后期,确保染色体均等分离;G1/S检查点主要监测细胞大小、营养状态及DNA损伤(如UV诱导的损伤);G2/M检查点监测DNA复制完成情况及DNA损伤;检查点失调(如p53突变)会导致基因组不稳定,是癌变的重要机制。8.表观遗传调控不包括以下哪项?A.DNA甲基化B.组蛋白乙酰化C.mRNA可变剪接D.染色质重塑答案:C解析:表观遗传调控指不改变DNA序列的可遗传基因表达调控,包括DNA甲基化、组蛋白修饰(乙酰化、甲基化等)、染色质重塑及非编码RNA调控;mRNA可变剪接是转录后调控,属于RNA加工过程,不涉及DNA或染色质的可遗传修饰。9.若需验证某长链非编码RNA(lncRNA)通过与组蛋白修饰酶互作调控靶基因表达,最直接的实验组合是?A.RNA-seq+qPCRB.RIP+ChIP-qPCRC.荧光原位杂交(FISH)+流式细胞术D.双荧光素酶报告基因实验答案:B解析:RIP可验证lncRNA与组蛋白修饰酶(如EZH2)的结合;ChIP-qPCR可检测该酶在靶基因启动子区的组蛋白修饰(如H3K27me3)水平变化,从而证实lncRNA通过招募修饰酶调控靶基因;RNA-seq和qPCR仅反映表达变化,无法直接关联互作;FISH用于定位lncRNA,流式检测细胞周期等;双荧光素酶用于验证转录因子或miRNA与靶基因3'UTR的结合。10.以下关于原代细胞与细胞系的描述,错误的是?A.原代细胞保留更多体内特性,增殖能力有限B.细胞系通常经历永生化,可能发生基因型改变C.原代细胞传代后可长期保存为细胞系D.肿瘤组织来源的原代细胞可能较易建立细胞系答案:C解析:原代细胞(Passage0-3)是直接从组织分离的细胞,增殖能力有限(一般<50代);细胞系是原代细胞经永生化(自发或人工)后获得的可无限增殖的细胞,可能发生遗传变异;原代细胞传代后若未永生化,仍会衰老死亡,无法直接成为细胞系;肿瘤细胞因增殖失控,更易建立细胞系。二、简答题(每题8分,共40分)1.简述PI3K-AKT-mTOR信号通路的激活机制及其在细胞存活中的作用。答案:PI3K-AKT-mTOR通路激活始于生长因子(如EGF、IGF)与受体酪氨酸激酶(RTK)结合,RTK自身磷酸化后招募并激活PI3K(磷脂酰肌醇3激酶)。PI3K催化PIP2(磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸)转化为PIP3(磷脂酰肌醇-3,4,5-三磷酸),PIP3招募AKT(蛋白激酶B)和PDK1(磷酸肌醇依赖性激酶1)至细胞膜。PDK1磷酸化AKT的Thr308位点,mTORC2进一步磷酸化AKT的Ser473位点,使AKT完全激活。激活的AKT通过磷酸化下游靶标发挥作用:①抑制促凋亡蛋白BAD(使其与14-3-3蛋白结合,无法激活Bax/Bak);②激活mTORC1(通过抑制TSC1/TSC2复合体),促进蛋白质合成和细胞生长;③抑制GSK3β(减少促凋亡蛋白BIM的表达)。综上,该通路通过抑制凋亡、促进生长维持细胞存活。2.设计实验验证某分泌蛋白(SP)通过旁分泌作用促进肿瘤细胞增殖,需包含关键步骤及预期结果。答案:实验设计步骤:(1)获取SP条件培养基:将过表达SP的细胞(实验组)或转染空载体的细胞(对照组)培养48小时,收集上清,经0.22μm滤膜过滤去除细胞碎片,得到含SP的条件培养基(SP-CM)和对照条件培养基(Ctrl-CM)。(2)功能验证:将肿瘤细胞接种于96孔板,分别加入SP-CM、Ctrl-CM及无血清培养基(空白对照),培养24/48/72小时后,通过CCK-8法或EdU掺入实验检测增殖能力。(3)中和实验:在SP-CM中加入SP特异性中和抗体(实验组)或无关IgG(对照组),孵育2小时后加入肿瘤细胞,检测增殖变化。预期结果:SP-CM组肿瘤细胞增殖显著高于Ctrl-CM和空白组;加入中和抗体后,SP-CM的促增殖作用被抑制,与Ctrl-CM无显著差异,证实SP通过旁分泌发挥作用。3.比较RNA-seq与ChIP-seq数据分析的核心差异,至少列出3点。答案:(1)数据类型:RNA-seq测序对象是RNA(反转录为cDNA),反映基因表达水平;ChIP-seq测序对象是TF或组蛋白修饰结合的DNA片段,反映基因组结合位点。(2)比对目标:RNA-seq需比对到参考转录组或基因组(考虑外显子剪接);ChIP-seq直接比对到基因组,关注峰(Peak)区域。(3)分析重点:RNA-seq核心是差异表达基因筛选(如DESeq2、edgeR);ChIP-seq核心是峰识别(如MACS2)、峰注释(如与启动子、增强子的重叠)及motif分析(预测结合的TF)。(4)生物学意义:RNA-seq回答“哪些基因表达变化”;ChIP-seq回答“哪些区域被调控蛋白结合”,可关联调控机制。4.简述CRISPR-Cas12a(Cpf1)与Cas9的主要区别(至少3点)。答案:(1)识别位点:Cas9依赖PAM(如NGG),位于靶序列3'端;Cas12a依赖PAM(如TTTN),位于靶序列5'端,更适合AT富集区域。(2)切割方式:Cas9产生平末端;Cas12a产生粘性末端(5'突出),可能提高同源重组修复(HDR)效率。(3)RNA需求:Cas9需要sgRNA(tracrRNA+crRNA);Cas12a仅需crRNA(无需tracrRNA),更易实现多基因编辑(单个转录单元表达多个crRNA)。(4)酶活性:Cas12a具有“顺式切割”(切割靶DNA)和“反式切割”(非特异性切割单链DNA)活性,可用于核酸检测(如DETECTR技术);Cas9无反式切割活性。5.解释“代谢重编程”在肿瘤细胞中的表现及意义。答案:肿瘤细胞的代谢重编程指其偏离正常细胞的氧化磷酸化,转向以糖酵解为主的代谢模式(即使在有氧条件下,也大量摄取葡萄糖并提供乳酸,即Warburg效应)。具体表现:①葡萄糖摄取增加,糖酵解速率升高;②线粒体氧化磷酸化活性降低;③谷氨酰胺分解(谷氨酰胺成瘾)增强,为三羧酸循环提供中间产物;④脂代谢异常,脂肪酸合成增加以支持膜提供。意义:①快速产生ATP满足增殖需求;②糖酵解中间产物(如6-磷酸葡萄糖)进入戊糖磷酸途径,提供NADPH和核苷酸,支持生物合成;③乳酸分泌营造酸性微环境,促进肿瘤侵袭;④代谢产物(如柠檬酸、α-酮戊二酸)作为表观遗传修饰的辅酶(如影响组蛋白去甲基化酶活性),调控基因表达。三、实验设计题(每题15分,共30分)1.课题组发现某新基因X在肝癌组织中高表达,且与患者预后不良相关。请设计实验验证X通过调控上皮间质转化(EMT)促进肝癌转移,要求包含体内外实验及关键分子机制验证。答案:实验设计框架:体外实验:(1)功能获得/缺失实验:构建X过表达质粒(pcDNA3.1-X)和小干扰RNA(siX),转染肝癌细胞系(如HepG2、Huh7),分为对照组(空载体/siNC)、过表达组(pcDNA3.1-X)、敲低组(siX)。(2)EMT表型检测:①细胞形态观察:EMT细胞由上皮样(铺路石状)变为间质样(梭形),显微镜下拍照记录。②分子标记检测:WesternBlot检测上皮标记(E-cadherin)、间质标记(N-cadherin、Vimentin)及转录因子(Snail、Twist)的蛋白水平;qPCR检测对应mRNA表达。③迁移/侵袭能力检测:Transwell实验(无Matrigel为迁移,有Matrigel为侵袭),计数穿膜细胞数。体内实验:(1)转移模型构建:将过表达X、敲低X及对照的肝癌细胞(荧光标记,如GFP)尾静脉注射裸鼠(每组6只),8周后通过活体成像观察肺转移灶数量,HE染色验证肺组织转移结节。(2)原位移植模型:将细胞接种于裸鼠肝被膜下,12周后观察肝内转移及远处(肺、淋巴结)转移情况。机制验证:(1)X与EMT调控因子的关联:通过Co-IP或RIP检测X是否与Snail/Twist结合(若X为蛋白),或通过RNApull-down检测X(若为lncRNA)是否与SnailmRNA结合;ChIP-qPCR检测X是否影响Snail在E-cadherin启动子区的结合(如X促进Snail核转位,增强其与E-box的结合)。(2)信号通路验证:检测X对EMT相关通路(如TGF-β/Smad、Wnt/β-catenin)的影响,通过WesternBlot检测通路关键分子(如p-Smad2/3、β-catenin核内水平)的表达变化;使用通路抑制剂(如TGF-β受体抑制剂SB431542)处理细胞,观察X过表达的促EMT作用是否被逆转。预期结果:过表达X的细胞E-cadherin降低,N-cadherin、Vimentin及Snail升高,迁移/侵袭能力增强;敲低X则相反。体内实验中,过表达组肺转移灶更多,敲低组减少。机制上,X可能通过激活TGF-β通路,促进Snail表达并结合E-cadherin启动子,抑制其转录,从而诱导EMT。2.现有一株疑似携带p53突变(R273H)的结肠癌细胞系,需全面鉴定其p53功能状态,并设计实验验证突变是否导致p53失活(包括DNA结合能力、转录激活功能及促凋亡能力)。答案:实验步骤及验证方法:(1)p53突变鉴定:①Sanger测序:提取细胞基因组DNA,扩增p53外显子7(R273位于外显子7),测序确认是否存在c.818G>A(R273H)突变。②免疫印迹:检测p53蛋白表达水平(突变型p53通常稳定性增加,蛋白水平升高)。(2)DNA结合能力验证:①ChIP-qPCR:设计p53经典靶基因(如p21、BAX)启动子区的p53结合位点引物,使用p53抗体进行ChIP,qPCR检测富集倍数。野生型p53可结合这些位点,突变型(如R273H)因DNA结合域缺陷,富集显著降低。②电泳迁移率变动分析(EMSA):合成含p53响应元件(如p21启动子区5'-PuPuC(A/T)(T/A)GPyPy-3')的生物素标记探针,与细胞裂解液共孵育,电泳后检测DNA-蛋白复合物条带(突变型p53无法形成复合物)。(3)转录激活功能验证:①荧光素酶报告基因实验:构建含p53响应元件的荧光素酶报告质粒(pGL3-p53RE),转染细胞后检测荧光素酶活性(野生型p53激活报告基因,突变型无激活能力)。②qPCR/WesternBlot:检测p53下游靶基因(p21、BAX、PUMA)的mRNA和蛋白水平(突变型p53无法诱导这些基因表达)。(4)促凋亡能力验证:①血清饥饿或DNA损伤诱导(如5μM顺铂处理24小时):流式细胞术通过AnnexinV/PI双染检测凋亡率(野生型p53细胞凋亡率显著高于突变型)。②线粒体膜电位检测:使用JC-1染料,流式细胞术分析线粒体膜电位变化(野生型p53诱导线粒体膜电位下降,促进细胞色素c释放)。③凋亡蛋白检测:WesternBlot检测cleavedcaspase-3、cleavedPARP的表达(突变型p53细胞中这些蛋白水平降低)。预期结果:测序确认存在R273H突变;ChIP和EMSA显示突变型p53无法结合靶基因启动子;荧光素酶报告基因活性及p21/BAX表达无显著变化;顺铂处理后,突变型细胞凋亡率低于野生型对照(如正常结肠上皮细胞),cleavedcaspase-3水平降低,证实R273H突变导致p53失活。四、论述题(10分)结合近年研究进展,论述表观遗传药物在肿瘤治疗中的应用及挑战。答案:表观遗传药物通过调控DNA甲基化、组蛋白修饰等可逆过程,恢复肿瘤抑制基因表达或抑制致癌通路,已成为肿瘤治疗的重要方向。应用进展:(1)DNA甲基转移酶抑制剂(DNMTi):如5-氮杂胞苷(5-aza-CR)和地西他滨(5-aza-dC),通过整合入DNA并抑制DNMT1,降低肿瘤抑制基因(如p
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