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文档简介

微专题11PCR技术和基因编辑技术1.

RT-PCR(逆转录PCR)常规的PCR过程是由DNA依赖的DNA聚合酶以DNA作为模板进行扩增的,而逆转录PCR则由依赖RNA的DNA聚合酶(逆转录酶)来完成。首先,由

逆转录酶将RNA单链转录为与其互补的DNA(cDNA),再通过常规PCR

和相应引物进行另一DNA链的合成以及DNA双链的扩增。逆转录PCR是一

种很灵敏的技术,可以检测很低拷贝数的RNA,广泛应用于遗传病的诊

断,并且可以用于定量监测某种RNA的含量。2.

重叠延伸PCR技术重叠延伸PCR是一种通过引物之间重叠的部分互相搭桥、互为模板,通过

多次PCR扩增,从而获得目的基因的方法。利用重叠延伸PCR可以实现基

因的定点突变。如图所示:①PCR扩增DNA的过程中,

PCR1应选择引物F1和R1,PCR2应选择引物F2

和R2,第二步中延伸不需引物,通过PCR3大量扩增突变产物应选择引物

F1和R2。②重叠延伸PCR通过在引物R1和F2上引入突变实现定点突变。PCR1和

PCR2不能在同一个反应体系中进行,原因是引物R1和引物F2可以互补配

对,导致引物失效。3.

反向PCR技术(1)条件:当DNA的某些序列已知,而需要扩增已知序列两端的未知序

列时,可采用反向PCR技术。(2)原理:用限制酶切割该DNA,随后使用DNA连接酶将获得的酶切产物环化,这样就获得了已知序列两侧携带有未知序列的环状DNA分子。以该已知序列为模板设计一对相反方向的特异性引物,该引物对已知序列反向,但对未知序列却是相向的,从而得以扩增出未知序列。PCR反向扩增后,经测序可以确定未知序列。反向PCR可用于检测目的基因在受体细胞基因组上的插入位点等未知DNA片段。具体流程如图(以EcoRⅠ酶切为例):4.

实时荧光定量PCR(1)原理①获取cDNA。从样本中提取mRNA,通过逆转录酶将样本的mRNA逆转录

为cDNA。再以cDNA为模板进行PCR。②PCR扩增cDNA。在PCR复性过程中探针和引物一起与模板结合,探针两侧分别带有荧光基团和抑制荧光发出的淬灭基团。探针完整时,荧光基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;新链延伸过程中,DNA聚合酶会破坏探针,导致荧光基团与淬灭基团分离而发出荧光(如图甲)。(2)检测:每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子产生。通过该技术检

测某病毒感染时,检测到的荧光强度变化如图乙,荧光到达预先设定阈值

的循环数(Ct值)越小,说明病毒核酸浓度越高。5.

大引物PCR大引物PCR需要用到三条引物进行两轮PCR,这三条引物分别是突变上游引物、常规上游引物和常规下游引物。第一轮PCR利用突变上游引物和常规下游引物进行扩增,得到不完整的含有突变位点的DNA片段;第二轮PCR利用第一轮扩增产物中的一条DNA链作为下游大引物,它与常规上游引物一起扩增得到完整的含有突变位点的DNA片段。原理如图。6.

不对称PCR不对称PCR是利用不等量的一对引物经PCR扩增后产生大量的单链DNA的

过程,这对引物分别称为非限制性引物和限制性引物,两条引物的比例通

常为100∶1,这样随着PCR反应的进行,浓度低的引物很快被消耗光,高

浓度引物随即产生大量的目的单链DNA。低浓度引物的加入保证了扩增过程具有足够多的模板,而高浓度引物则保证了单链DNA的大量合成。7.

基因编辑技术CRISPR/Cas9基因编辑技术能对基因进行定点编辑,其原理是由一条单链向导RNA(sgRNA)引导内切核酸酶Cas9到一个特定的基因位点进行切割(如图)。CRISPR复合体中的sgRNA的主要功能是与靶向基因(目的基因)上特定碱基序列互补,从而定向引导Cas9蛋白与靶向基因结合,并在特定位点切割DNA。脱靶问题,即对基因组非特异性切割的有效解决方法:适当增加sgRNA的

长度,设计出特异性较强的sgRNA。CRISPR/Cas9基因编辑技术培育转基因生物,与传统的基因工程相比,其

明显优点是可将目的基因定点插入所需位点,避免了因目的基因随机插入

宿主细胞DNA引起的生物安全性问题。CRISPR/Cas9基因编辑技术在基因

治疗、基因水平进行动植物的育种、研究基因的功能等方面有广阔的应用

前景。

1.

(2025·广东佛山质检)PCR定点突变技术是一种基因工程技术,它可以通过人工合成的引物,使目标DNA序列发生特定的突变,从而实现对基因的精确编辑。PCR定点突变技术的过程如图所示(图中对应的字母为引物,黑点为定点诱变的位点)。下列叙述错误的是(

)A.

获得片段1所需要的引物为F和R_m,且2次循

环即得片段1B.

获得片段2所需要的引物为R和F_m,且1次循

环即得片段2C.

图中两种引物F_m和R_m之间,能够进行碱基

互补配对D.

图中PCR扩增所需要的引物F和R最好不配对√解析:根据图示过程可知,获得片段1所需要的引物为F和R_m,且2次循环即得片段1,A正确;获得片段2所需要的引物为R和F_m,且2次循环即得片段2,B错误;结合题图分析,引物F_m和R_m之间,能够进行碱基互补配对,C正确;图中PCR扩增所需要的引物F和R最好不配对,以防引物发生碱基互补配对,从而不能与模板结合,D正确。2.

(2025·山东滨州高三模拟)某病毒的检测可以采用实时荧光RT-PCR

(逆转录聚合酶链式反应)的方法,RT-PCR的具体过程如图。下列有关叙

述错误的是(

)A.

过程①以mRNA为模板合成单链DNAB.

过程②③拟对单链cDNA进行第n次循环的

扩增,理论上需要n个引物BC.

该技术用于对某些微量RNA病毒的检测,

可提高检测的灵敏度D.

游离的脱氧核苷酸只能从引物的3'端开始连接√解析:过程①是以mRNA形成单链DNA的过程,表示逆转录,A正确;过程②③拟对单链cDNA进行第n次循环的扩增,根据DNA分子半保留复制特点可知,该过程理论上至少需要2n-1个引物B,B错误;利用实时荧光

RT-PCR技术对某些微量RNA病毒进行检测时可提高检测的灵敏度,是因为

增加了待测RNA逆转录产生的DNA的数量(或浓度),便于检测,C正

确;游离的脱氧核苷酸只能从引物的3'端开始连接,D正确。3.

(2023·江苏高考22题)为了将某纳米抗体和绿色荧光蛋白基因融合表

达,运用重组酶技术构建质粒,如图1所示。请回答下列问题:(1)分别进行PCR扩增片段F1与片段F2时,配制的两个反应体系中不同的

,扩增程序中最主要的不同是

⁠。模板(片段F1、片段F2)、引物

退

火温度

解析:PCR反应进行的条件:引物、酶、dNTP、模板和缓冲液(其中需要Mg2+)。分别进行PCR扩增片段F1与片段F2时,配制的两个反应体系中不同的有模板(片段F1、片段F2)、引物。PCR过程需要两种引物,能分别与目的基因两条链的3'端通过碱基互补配对结合。不同的PCR反应体系中,模板和引物是不同的:扩增程序中依据不同引物设置不同的退火温度是最重要的环节,恰当地选择退火温度,尽量避免引物与模板的非特异性结合,以保证目的产物的有效扩增。而对于延伸时间而言,以常用的Taq

DNA聚合酶为例,催化DNA延伸的速度为1

000~2

000

bp/min,通常在实验室中可根据目的片段大小在30

s~2

min的时长内大致设置延伸时间,一般不需要精确控制。(2)有关基因序列如图2。引物F2-F、F1-R应在下列选项中选用

⁠。EGFP基因序列:5'ATGGTGAGCAAGGGC……GACGAGCTGTACAAG3'AnB1基因序列:5'CATGTCCAGCTGCAG……CCAAAACCACAACCA3'图2A.ATGGTG……CAACCAB.TGGTTG……CACCATC.GACGAG……CTGCAGD.CTGCAG……CTCGTCCD

解析:由图1可知,引物F2-F用于扩增F2片段,引物F1-R用于扩增F1片段,C选项中5'-GACGAG-3'能与AnB1中左侧部分碱基进行碱基互补配对,因此引物F2-F选用C。D选项中5'-CTGCAG-3'能与EGFP中的右侧部分序列进行碱基互补配对,因此引物F1-R选用D。(3)将PCR产物片段与线性质粒载体混合后,在重组酶作用下可形成环化

质粒,直接用于转化细菌。这一过程与传统重组质粒构建过程相比,无需

使用的酶主要有

⁠。解析:传统重组质粒构建需要使用限制性内切核酸酶(限制酶)切割质粒使其具有与目的基因相同的黏性末端,之后再用DNA连接酶将目的基因和质粒连接成重组质粒。将PCR产物片段与线性质粒载体混合后,在DNA连接酶的作用下可形成环化质粒,不需要使用限制性内切核酸酶(限制酶)。限制性内切核酸酶

(4)转化后的大肠杆菌需采用含有抗生素的培养基筛选,下列叙述错误

的有

⁠。A.

稀释涂布平板需控制每个平板30~300个菌落B.

抗性平板上未长出菌落的原因一般是培养基温度太高C.

抗性平板上常常会出现大量杂菌形成的菌落D.

抗性平板上长出的单菌落无需进一步划线纯化ABC

解析:转化后的大肠杆菌需采用含有抗生素的培养基筛选,用稀释涂布平板法筛选时,菌落数可能低于30,A错误;培养基冷却后才能接种,抗性平板上未长出菌落,一般不是培养基温度太高所致,B错误;转化后的大肠杆菌需采用含有抗生素的培养基筛选,一般含有重组质粒的大肠杆菌才能发展为菌落,故不会出现大量杂菌形成的菌落,C错误;稀释涂布平板法和平板划线法均为分离纯化细菌的方法,用稀释涂布平板法在抗性平板上长出的单菌落无需进一步划线纯化,D正确。(5)为了验证平板上菌落中的质粒是否符合设计,用不同菌落的质粒为

模板,用引物F1-F和F2-R进行了PCR扩增,质粒P1~P4的扩增产物电泳结

果如图3。根据图中结果判断,可以舍弃的质粒有

⁠。P3、P4

解析:EGFP为720

bp,AnB1为390

bp,二者的总大小为720

bp+390

bp=1

100

bp,用引物F1-F和F2-R进行了PCR扩增,其大小接近于P1、P2,根据图中结果判断,可以舍弃的质粒有P3、P4。(6)对于PCR产物电泳结果符合预期的质粒,通常需进一步通过基因测序

确认,原因是

⁠。解析:琼脂糖凝胶电泳技术仅能用于分析待检测DNA分子的大小,无法确定待检测DNA分子的碱基序列,因此对于PCR产物电泳结果符合预期的质粒,通常需进一步通过基因测序确认。琼脂糖凝胶电泳技术仅能用于分析待检测DNA分子的大

小,无法确定待检测DNA分子的碱基序列4.

(2021·海南高考25题)CRISPR/Cas9是一种高效的基因编辑技术,Cas9

基因表达的Cas9蛋白像一把“分子剪刀”,在单链向导RNA(SgRNA)引

导下,切割DNA双链以敲除目标基因或插入新的基因。CRISPR/Cas9基因

编辑技术的工作原理如图所示。(1)过程①中,为构建CRISPR/Cas9重组质粒,需对含有特定SgRNA编码

序列的DNA进行酶切处理,然后将其插入到经相同酶切处理过的质粒上,

插入时所需要的酶是

⁠。解析:基因工程所需的工具酶有限制酶和DNA连接酶,限制酶负责切割,DNA连接酶负责连接,因此为构建CRISPR/Cas9重组质粒,需对含有特定SgRNA编码序列的DNA进行酶切处理,然后将其插入到经相同酶切处理过的质粒上,插入时所需要的酶是DNA连接酶。DNA连接酶

(2)过程②中,将重组质粒导入大肠杆菌细胞的方法是

⁠。解析:大肠杆菌是原核生物,属于微生物,将目的基因导入微生物细胞的方法是感受态细胞法。感受态细胞法

/Ca2+处理法

(3)过程③~⑤中,SgRNA与Cas9蛋白形成复合体,该复合体中的

SgRNA可识别并与目标DNA序列特异性结合,二者结合所遵循的原则

。随后,Cas9蛋白可切割

序列。解析:根据题图可知:在CRISPR/Cas9基因编辑技术中,SgRNA是根据靶基因设计的引导RNA,准确引导Cas9切割与SgRNA配对的靶基因DNA序列。Cas9能借助SgRNA分子与目标DNA进行特异性结合的原因在于SgRNA分子上的碱基序列与目标DNA分子上的碱基序列可以通过碱基互补配对原则,实现SgRNA与目标DNA特定序列的特定识别,进而定位;由此可见,Cas9在功能上属于限制酶,可切割目标DNA特定的核苷酸序列。碱基互补配对

目标基因

(4)利用CRISPR/Cas9基因编辑技术敲除一个长度为1

200

bp的基因,在

DNA水平上判断基因敲除是否成功所采用的方法是

,基因敲除成功的判断依据是

⁠。解析:可利用DNA分子杂交技术判断基因敲除是否成功,即利用经编辑过的DNA片段(从受体细胞中提取的基因组DNA)与标记的目标(对应)基因(探

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