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文档简介
1、Tingen biotech (beijin) co .ltd,mirna提取和测试,营销部门分组,主要内容,miRNA是什么?miRNA的作用,miRNA的研究路径,miRNA的提取和检测,4,1,2,3,miRNA的发现,1993年Ambros在网上蠕虫中复制lin-4基因,并通过固定点突变发现lin-4在不编码蛋白质的情况下生成小RNA分子。这个小RNA分子以不完全的方式与目标mRNA的非3翻译侧的特定部位相互作用,抑制lin-14的表达,结果导致lin-14蛋白的合成减少,这种现象称为抑制翻译。Lin-4控制线虫幼虫从L1阶段转化为L2期。卢武坤也发现了lin-4对lin-14的作用。
2、the c . elegans hetero chronic gene Lin-4 encodes small rners with antiisense complement arity to Lin-14 . cell,1993,miRNA,miRNAs(MicroRNAs)是一种未加密的蛋白质,大小约为21-23nt的单链小分子RNA。具有在翻译水平或转录后水平调节基因表达的功能。基因组DNA,pri-miRNA(可达1000nt),pre-miRNA (7010nt),成熟的miRNA,Dicer酶,Drosha酶,RNA刘涛沉默复合物这两者徐璐不完整的时候,主要影响翻译过程,对mRN
3、A的稳定性没有影响。线虫的lin-4,2等两种)完全互补。两者完全配对后,siRNA和目标mRNA的结合,类似于特定的切割mRNA。两种模式,如MiR-39/miR-171,3。与目标mRNA完全互补配对时,直接将mRNA切成目标,在形成不完全互补配对时,起到调节基因翻译的作用。Let-7果蝇/线虫、miRNA的特征、结构特异性:茎环结构前体,无ORF的高保守性:结构和物种的时空特异性:发育和分化表达统计:60%的miRNAs是独立表达的15%,miRNA研究方法,生物信息学,miRNA库miRNA芯片荧光定量PCR Nothernblot in situ hybridization其他方法,
4、生物信息学,生物信息学,实验验证,miRNA芯片公司,构建miRNA库-20度或-70度董洁保存相对RNA不容易分解,纯度、取得率、保存,miRNA提取后检测,少量血清/血浆提取一般不建议紫外线检测和电泳检测。 低浓度miRNA使用吸光度值认为miRNA浓度偏差很大,在某些情况下,仪器本身的误差可能导致测量结果不准确。电泳灵敏度较低,很多情况下凝胶上没有带。在组织/细胞提取的情况下,电泳时会出现明亮的带,但带中有更多的555rna和tRNA,紫外线检测值不能准确反映miRNA的含量。盐残留,天根DP501,PEG分离,DP501可以大大减少盐残留(230nm)。逆转录方法茎环,逆转录方法加尾,荧光定量PCR,敏感度,特异性,内部人参基因,5S rRNA U6,A,B,C,Pg级总RNA,单碱基差异,TIANGEN公司使用不同的协议提取MiRNA和总RNA。miRcute miRNA 1链合成套件(KR201)以miRNA的Poly(A)为后缀,在已知序列的引物中反向扫描,以获得miRNA的cDNA。miRcute miRNA qPCR检测工具包(SYBR GREEN)(FP401)高特异性(专利抗体酶技术),高分辨率(单碱差异),高灵敏度(pg级总RNA)。,DP501比较实验,未发现使用DP501提取20多个样
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