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文档简介

1、.1、SRAP和SSR分析石斛种质资源遗传多样性的研究进展,名称:廖宏宇,学号:2010071136,专业:生物教育,指导教师:陈美霞(讲师,2,论文框架,石斛引种遗传多样性分子标记未来研究方向,1,2,3,4。1,石斛引种,石斛是兰科第二大属,多年生草本植物。石斛具有药用价值、观赏价值等开发价值和经济价值。我国以云南、贵州、广西等为主要分布地的76种变种分布,大部分分布在450900米的温良湿地上,受小环相对湿度、温度、光照等气候因素的影响,在与相关植物混合的条件下生长得最好。石斛是珍贵的中药材和外贸出口药材,具有很高的药用价值,中国和世界各地著名的花卉也具有很高的观赏价值。石斛的药用功能:

2、滋阴清热、生津益胃、润肺止咳、明目强身、抗衰老、抗肿瘤、对机体免疫力的耐受、血管扩张和抗血小板作用。石斛也可以作为良好的保健产品。第二,遗传多样性,遗传多样性是生物界所有遗传变异的总和,遗传多样性的来源主要是包括染色体变异和分子变异在内的生物多样性的基础和最重要的组成部分。遗传多样性是生物遗传改善的源泉,是生物多样性的重要组成部分,是适应物种或群体进化潜力和环境的基础,也是物种可持续与否的重要基础。第三,分子标记,定义:分子生物学技术的发展为植物育种提供了基于DNA变异的新基因标记DNA分子标记或简单的分子标记。分子标记是分子生物学的快速发展,是通过检测DNA碱基序列变异来确认研究材料的新基因

3、标记。应用于7,1.SRAP分子标记和石斛,2 .应用于SSR分子标记和石斛,8,SRAP分子标记简介,SRAP(相关序列扩增多态性)是美国加拿大大学蔬菜系Li和Quiros博士2001年在布拉谢卡植物上开发的一种新的基于PCR的标记系统,称为序列的扩增多态性,这是其核心,在SRAP引物集中使用“CCGG”序列进行解释盒(ORFs)反向引物的第3面包含AT区域序列的启动子和插入者以特定方式组合的核心序列“AATT”。内含子、启动子和间隔序列在每个物种之间发生了显着变化,应用于Dendrobium,具有扩大基于integration和exconson的SRAP多态标记的正向引物,应用于Dendr

4、obium。潘洪红等人首次将SRAP标记技术应用于铁皮石斛遗传多样性研究中,对包括铁皮石斛3个类群在内的9种试石斛进行了研究,在分类状态下,铁皮石斛与铁皮石斛更接近。浙江、云南、湖南三个群体的铁皮石斛中,浙江栖息地和云南的血缘关系更加密切。结果表明,SRAP标记技术可完全应用于药用石斛的遗传多样性和遗传关系。接着10、作者对SRAP技术和RAPD技术在石斛多种植物中的应用进行了比较分析,利用40个SRAP引物组合和36个RAPD引物进行了试验对象的9种石斛遗传多样性研究,1977个SRAP引物组合的总扩增条带,多态性比为90.2%,遗传相似系数RAPD引物共扩增了281条,多态比例为87.1%

5、,GS值变化范围为0.49420.7731。用两个标记得到的聚类结果有一定的差异,将SRAP聚类结果与基于传统形态特征的分类结果进行比较,更好地反映了试验品种的遗传关系、地理特性。SRAP标记在石斛遗传多样性和遗传关系研究中表现出较大的优越性。,11,ren Yu等使用SRAP技术分析海南9种石斛种质资源的遗传多样性。从30对SRAP引物的筛选中得到18对多形性引物,通过SRAP-PCR扩增共得到285个多形性条带,每个引物平均产生15.8个多形性条带,种间遗传相似系数的变化范围为0.179-0.636,表明海南省分布的石斛遗传多样性丰富。聚类分析可以将试验品种分为四类。以铁皮石斛9种野生物种

6、84种植物作为研究资料,丁等人发现,在纸张层面,遗传多样性高,人口水平差异低。利用两种聚类软件的分析结果一致,可将试验资料分为两大类。上述研究结果表明,SRAP技术能在分子水平上很好地揭示石斛种质资源的遗传背景和遗传关系。12,SSR分子标记简介,简单重复序列(SSR s)或微卫星(m icrosatellite)序列是最多几十个核苷酸序列重复序列,由多个核苷酸(1-6)构成重复单元。在植物中,广泛分布在整个真核生物基因组的徐璐不同座位上,这种级联重复序列根据原语的重复次数形成的多态性称为简单序列长度多态性(sslp)。SSR的重复次数在同一物种的不同基因型之间差别很大,因此表现出高多态性,很

7、快就会成为新的分子标记。13、将SSR分子标记应用于石斛的Yue等开发了14个SSR多态性标记,并将其用于石斛品种的鉴定,结果表明,这些SSR标记可以完全用于分子生态学研究、遗传图谱构建和遗传辅助育种,今后还可以用于石斛新品种的保护。鹅等在两个富含微卫星的文库中分离和识别12个微卫星标记,以研究李氏石斛群体中的22个个体为对象,这些标记具有多态性,每个标记出现312个等位基因,首次出现在铁皮石斛中,14、谢明露等利用磁珠富集法开发了60对石斛的SSR引物。其中15对多态位点丰富,花纹鲜明,重复性好的底漆,对贵州铁皮石斛野生居群48种材料进行遗传分析,共检测到92种等位变异,PIC值0.702表明,这些标记具有分析铁皮石斛居群水平的充分潜力。接着,该15利用SSR引物对20种石斛试验物质进行了种间扩增,对除XML004、XML007以外的其他13对SSR引物具有一定的多态性,并具有种间通用性。最后,作者选择了分辨率高的4对SSR引物,在集约过程中检测了500种石斛组培苗的种质纯度。结果

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