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1、1,第十四章 核酸的生物合成,第一节 DNA的生物合成 第二节 RNA的生物合成,2,DNA是生物遗传的主要物质基础,生物机体的遗传信息以密码的形式编码在DNA分子上,表现为特定的核苷酸排列顺序,并通过DNA的复制由亲代传递给子代。在后代的生长发育过程中,遗传信息自DNA转录给RNA,然后翻译成特异的蛋白质,以执行各种生命功能,使后代表现出与亲代相似的遗传性状。,中 心 法 则,1964-1970 劳氏肉瘤病毒的 遗传方式 致癌RNA病毒、植物RNA病毒,1958年,遗传信息的单向,遗传信息的传递,3,4,复制:亲代DNA或RNA在一系列酶的作用下,生成与亲代相同的子代DNA或RNA的过程。

2、转录:以DNA为模板,按照碱基配对原则将其所 含的遗传信息传给RNA,形成一条与DNA链互补的RNA的过程。 翻译:亦叫转译,以mRNA为模板,将mRNA的密码解读成蛋白质的AA顺序的过程。 逆转录:以RNA为模板,在逆转录酶的作用下,生成DNA的过程。,5,第一节 DNA的生物合成,DNA的复制(DNA指导下的DNA合成) 逆转录(RNA指导下的DNA的合成) DNA 突变 DNA的损伤与修复(修复合成),6,一、DNA的半保留复制 (一) 定义和实验证据:由亲代DNA生成子代DNA时,每个新形成的子代DNA中,一条链来自亲代DNA,而另一条链则是新合成的,这种复制方式叫半保留复制。,半保留

3、复制的实验证据: 1958年Meselson和Stahl用同位素15N标记大肠杆菌DNA,首先证明了DNA的半保留复制。,7,DNA的半保留复制的生物学意义:,DNA的半保留复制表明DNA在代谢上的稳定性,保证亲代的遗传信息稳定地传递给后代。 DNA在代谢上的稳定性并非指DNA是一种惰性物质:在细胞内外各种物化因子均可导致DNA损伤,需要修复;在复制和转录过程中DNA会发生损耗,必须进行更新;在发育和进化过程中DNA可能进行修饰、删除、扩增和重排;在进化的角度上,DNA更是处在不断的变异和发展中。,8,(二) 复制起点、方向和方式,1、复制起点(origin , ori或 o , 复制原点),

4、复制起点:复制开始处DNA分子的特定位置. 复制子(Replicon)(复制单位 ):从一个起点到一个终点所包含的DNA区域,是基因组独立进行复制的单位。,9,原核生物的染色体和质粒、真核生物的细胞器DNA是环状双链分子,它们都只有一个固定的复制起点,都是单复制子。 真核生物染色体DNA是线形双链分子:有多个复制起点,是多复制子,每个复制子约有100-200 Kbp。人体细胞平均每个染色体含有1000个复制子。 病毒DNA多种多样,环状或线形,双链或单链,但都是单复制子。 许多生物的复制起点都是富含A、T的区段。,10,2、复制方向及方式,复制叉(Replication fork):DNA复制

5、进行时,在眼的两侧出现两个叉子状的生长点(growth point),叫复制叉。在复制叉上分布着各种与复制有关的酶和蛋白因子,它们构成的复合物称为复制体(replisome) 大多数复制是双向的,形成两个复制叉;,真核染色体DNA 线环状双链,E .coli染色体DNA 环状双链,复制眼(replication eye):电子显微镜下观察正在复制的DNA,复制的区域形如一只眼睛.,11,(三)与DNA复制有关的酶和蛋白质,1、 DNA聚合酶 2、拓扑异构酶 3、 DNA解旋酶 4、单链结合蛋白 5、引发酶及引发体 6、 DNA连接酶 目前已发现30多种酶及蛋白质因子参与DNA复制,12,1、

6、DNA聚合酶,(1)反应需要有模板的指导; (2)4种dNTP为底物,需要引物,需要有3-OH存在; (3)合成方向为5 3 (4)需要Mg2+,催化反应的特点:,13,14,在大肠杆菌中发现主要有三种DNA聚合酶,分别为: DNA聚合酶 DNA聚合酶 DNA聚合酶,E.coli DNA聚合酶,DNA聚合酶IV和V:1999年发现,当DNA严重损伤 时,诱导产生。,15,DNA聚合酶 DNA聚合酶 DNA聚合酶 亚基数目 1(单体酶) 多亚基酶 多亚基酶 53 聚合活性 + 中 + 很低 + 很高 3 5 外切活性 + + + 5 3 外切活性 + ,16,DNA聚合酶,是原核生物DNA复制的

7、主要聚合酶,该酶由10种亚基组成,其中、形成全酶的核心酶。具有5 3 DNA聚合酶活性( 亚基,速率高); 具有3 5外切酶(亚基)的校对功能,提高DNA复制的保真性。 亚基象夹子一样夹住DNA,使聚合酶在完成复制前不会脱离DNA分子。,17,拓扑异构酶:使DNA一条链发生断裂和再连接。作用是松解负超螺旋,反应不需要能量。主要集中在活性转录区,同转录有关。,拓扑异构酶:使DNA两条链发生断裂和再连接。当引入负超螺旋时需要由ATP提供能量,同复制有关。 二者共同控制DNA的拓扑结构。,2. 拓扑异构酶: 催化DNA的拓扑链环数发生变化的酶,在DNA重组修复和其他转变方面起重要作用。 除链环数不同

8、外其它性质均相同的DNA分子称为拓扑异构体,引起拓扑异构体反应的酶称为拓扑异构酶.,18,3、解螺旋酶 (解链酶):通过水解ATP将DNA两条链打开。E.coli中的rep蛋白就是解螺旋酶,还有解螺旋酶I、II、III。每解开一对碱基需要水解2个ATP分子。,4、单链结合蛋白(SSB-single-strand binding protein):稳定已被解开的DNA单链,阻止复性和保护单链不被核酸酶降解。,19,5、引发酶及引发体,引发前体:它由多种蛋白质dnaA、dnaB、dnaC、n、n、n 和i组成。 引发酶:此酶以DNA为模板合成一段RNA,这段RNA作为合成DNA的引物(Primer

9、)。实质是以DNA为模板的RNA聚合酶。引发前体再与引发酶结合组装成引发体。,引发体可以沿模板链53方向移动,具有识别合成起始位点的功能,移动到一定位置上即可引发RNA引物的合成。,20,DNA中一条链有切口,切口一端是3-OH,另一端是5-磷酸基,连接酶可催化这两端形成磷酸二酯键,使切口连接。不能将两条游离的DNA单链连接起来。,6、 DNA连接酶,DNA连接酶在DNA复制、损伤修复、重组等过程中起重要作用。,21,拓扑异构酶,解链酶,单链结合蛋白,DNA聚合酶,引物酶及引发体,DNA连接酶,引物,DNA双链,DNA复制有关的酶和蛋白质,22,拓扑异构酶,解链酶,单链结合蛋白,DNA聚合酶,

10、引物酶及引发体,DNA连接酶,引物,拓扑异构酶 与DNA双链 结合,解开 超螺旋。,DNA复制有关的酶和蛋白质,23,拓扑异构酶,解链酶,单链结合蛋白,DNA聚合酶,引物酶及引发体,DNA连接酶,引物,解链酶解开 DNA双螺旋,DNA复制有关的酶和蛋白质,24,拓扑异构酶,解链酶,单链结合蛋白,DNA聚合酶,引物酶及引发体,DNA连接酶,引物,单链结合蛋白防止复螺旋,DNA复制有关的酶和蛋白质,25,拓扑异构酶,解链酶,单链结合蛋白,DNA聚合酶,引物酶及引发体,DNA连接酶,引物,引物酶合成引物,DNA复制有关的酶和蛋白质,26,(四) DNA的半不连续复制,1968年由冈崎通过实验证明 D

11、NA复制是半不连续的,27,1、冈崎片段的发现(1968): 同位素实验,3HdT 短时间内为DNA小片段一段时间后检测到 DNA大片段。当用DNA连接酶的变异株时,检测到大量DNA片段的积累证明DNA复制中有小片段合成。,28,领头链在DNA复制时,合成方向与复制叉移动的方向一致并连续合成的链(前导链)。 随后链在DNA复制时,合成方向与复制叉移动的方向相反,形成许多不连续的片段,最后再连成一条完整的DNA链(滞后链)。这些不连续的片断,称为冈崎片断。每个冈崎片段的合成也都需要引物。 冈崎片段:真核生物中100-200个核苷酸(核小体的DNA单位)。原核生物中1000-2000个核苷酸。 半

12、不连续复制(semidiscontinuous replication)在DNA复制时,领头链是连续合成的,而随后链的合成是不连续的,这种复制方式称为半不连续复制。,29,2、半不连续复制,30,冈崎片段合成后由DNA聚合酶切除RNA引物并催化合成一段DNA填补留下的空隙。 再由DNA连接酶把他们连成一条完整的子代链,称为滞后链。,31,(五)E.coli.染色体DNA复制过程,起 始 延 伸 终 止,32,1、复制的起始,33,大肠杆菌复制的起点由245个bp构成,称为 OriC, 其序列很保守,有两组短的重复: 3个13 bp的序列和4个9 bp的序列,34,在DNA的复制原点,双股螺旋解

13、开,成单链状态,分别作为模板,合成其互补单链。,解链,35,引发体在复制叉上移动,识别合成的起始位点, 引发RNA引物的合成。领头链先引发开始合成,以原来一条DNA单链为模板(3 5),按5 3的方向合成一段RNA引物链。领头链开始合成后,随后链也开始合成其引物。在引物的3端为游离的羟基。,RNA引物合成,DnaB蛋白活化引物合成酶。引物长度约为几个至10个核苷酸,与复制叉移动的方向相同, (引物酶的底物是核苷三磷酸) 5端含3个磷酸残基,,36,大肠杆菌复制原点起始复制所需蛋白质,SSB,解链酶,引物,引物酶,拓扑异构酶,37,在DNA聚合酶的催化下,以脱氧核糖核苷酸为底物,在RNA引物的3

14、端加上脱氧核糖核苷酸。,2、DNA链的延伸,38,DNA链的延伸,39,延 伸,前导链只需要一个RNA引物,随后链的每一个冈崎片段都需要一个RNA引物。 链的延长反应由DNA聚合酶催化。 复制体:在DNA合成的生长点(既复制叉上)分布着许多与复制有关的酶和辅助因子,它们在DNA的模板链形成离散的复合物,彼此配合进行高度精确的复制。,40,、和三种亚基组成核心酶,核心酶形成二聚体 -亚基犹如一个夹子夹住DNA分子,并向前滑动,使DNA聚合酶在完成复制前不再脱离DNA,41,复制体沿着复制叉方向前进,同时进行前导链和滞后链的合成。,42,3、DNA合成的终止,E.coli 有两个终止区域,分别结合

15、专一性的终 止蛋白 tus 序列一:terE terD terA 序列二:terF terB terC 共6个终止位点。,每个区域只对一个方向的复制叉起作用 Tus蛋白-ter复合物阻止一个方向的复制叉前移(通过抑制DNA解旋酶而发挥终止作用),44,终 止,两个复制叉向前移动,最后在终止区相遇并停止复制,由DNA聚合酶填补空隙,最后由连接酶封口。结果形成两个DNA双股螺旋分子。,45,原核细胞DNA的半不连续复制过程,复制叉的移动方向,3,5,3,5,46,(六) 确保DNA复制忠实性的机制,1、采用DNA聚合酶催化聚合反应; 2、依赖DNA聚合酶核酸外切酶活性; 3、使用RNA引物; 4、

16、依赖核苷酸代谢库调节系统(保证dNTP的正常水平),多种修复系统,47,(七)真核生物染色体DNA的复制,1、真核和原核DNA复制比较,、 、 、 、 负责核DNA的复制 负责线粒体DNA的复制,较慢,较快,48,在真核细胞内有五种DNA聚合酶 (与细菌DNA聚合酶的性质基本相同:底物、模板、引物、方向) 定位 细胞核 细胞核 线粒体 细胞核 细胞核 3-5 外切 - - + + + 酶活性 功能,引物 合成,修复 作用,线粒体DNA 的复制,核DNA 的复制,修复 作用,49,2、真核生物中DNA的复制特点,1、真核生物染色体有多个复制起点,多复制眼,呈双向复制,多复制子。 2、冈崎片段长约

17、200bp. 3、真核生物DNA复制速度比原核慢。 4、真核生物染色体在全部复制完之前起点不再重新开始复制;而在快速生长的原核中,起点可以连续发动复制。真核生物快速生长时,往往采用更多的复制起点。 5、真核生物有多种DNA聚合酶。 6、真核生物线性染色体两端有端粒结构,防止染色体间的末端连接。由端粒酶负责新合成链5端RNA引物切除后的填补,以保持端粒的一定长度。,50,3、真核生物染色体DNA末端复制的问题,真核生物线状染色体在复制最后,5末端RNA引物被切除后,无法向原核那样填补空缺,如果没有特殊的机制合成末端序列,将造成5 末端序列缩短,染色体就会在细胞传代中变得越来越短。 通过端粒酶催化

18、形成端粒结构来解决,原核生物染色体DNA是环状的,其随后链的5最末端冈崎片断的RNA引物被切除后可借助另半圈DNA链向前延伸来填补,,51,端粒酶是含RNA的逆转录酶,端粒酶与细胞老化有关,端粒(telomeres) :是真核细胞染色体末端所特有的结构,有许多串(1000串或更多)短的重复序列组成,通常3末端链是富含G的短序列。,端粒酶:含有RNA和蛋白质(起DNA聚合酶的作用)两种组分,RNA分子约150 bP,含有与重复端粒结构互补的一个片断,可作为端粒链合成的模板。,52,(八)、DNA复制的其它方式,大肠杆菌双链环状DNA的复制(一个复制起点,双向复制) 真核细胞线状染色体DNA的复制

19、方式(多个复制起点,双向复制) 单向滚环式复制(噬菌体X174DNA单链环状),切开正链,以负链 为模板开始复制,53,(一)定义:以RNA为模板,按照RNA中的核苷酸顺序合成DNA称为逆转录,由逆转录酶催化进行。 1970年Temin和Baltimore同时分别从劳氏肉瘤病毒和小白鼠白血病病毒等致病RNA病毒中分离出逆转录酶,迄今已知的致癌RNA病毒都含有逆转录酶。,二、逆转录(reverse transcription),54,HIV的复制,55,(二)病毒RNA的逆转录过程 (以前病毒cDNA形式整合到宿主细胞DNA中,随细胞增殖而传给子代,引起细胞恶性转化) 病毒RNA RNA-DNA

20、杂交分子 双链DNA(前病毒cDNA),逆转录酶也和DNA聚合酶一样,沿53方向合成DNA,并要求有引物存在,还要求Mn2+、Mg2+。,56,逆转录酶是多功能酶,兼有3种酶的活性: RNA指导的DNA聚合酶活性 DNA指导的DNA聚合酶活性 核糖核酸酶H的活性,专一水解RNA-DNA杂交分子中的RNA,可沿53和3 5两个方向起核酸外切酶的作用。,57,RNA,进入细胞,逆转录,RNA,(三) 逆转录病毒的生活周期,当致癌RNA病毒侵染宿主细胞时,病毒RNA及逆转录酶一起进入宿主细胞,病毒自身带入的逆转录酶使RNA逆转录成双链DNA。,58,(四) 逆转录酶发现的理论和实践意义: 不能把“中

21、心法则”绝对化,遗传信息也可以从RNA传递到DNA。促进了分子生物学、生物化学和病毒学的研究,为肿瘤的防治提供了新的线索。目前逆转录酶已经成为研究这些学科的工具。,1983年,发现人类免疫缺陷病毒(human immune deficience virus,HIV),是一类逆转录病毒,感染T淋巴细胞后即杀死细胞,造成宿主机体免疫系统损伤,引起艾滋病( acquired immunodeficiency syndrome,AIDS获得性免疫缺陷综合症)。,59,三、DNA的突变,概念: DNA分子中的核苷酸序列发生突然而稳定的改变,从而导致DNA的复制以及后来的转录和翻译产物随之发生变化,表现出

22、异常的遗传特性,称为DNA的突变。 产生: DNA在复制中可能产生错配,但自然条件下发生的突变率非常低。 某些物理化学因素,如紫外线、电离辐射和化学诱变剂(烷化剂、碱基类似物、嵌入染料)等。,60,自然条件下发生的突变称为自然突变,突变率非常低,能提高突变的物理或化学因子称为诱变剂。 碱基类似物(base analog):5-溴尿嘧啶 碱基修饰剂(base modifier):亚硝酸 嵌入染料(intercalation dye) :吖啶橙、溴化乙锭 紫外线(ultraviolet)和电离辐射(ionizing radiation),61,突变的类型,(一)碱基置换 DNA分子上的碱基错配称点

23、突变(point mutation)。 1.转换:发生在同型碱基之间,即嘌呤代替另一嘌呤,或嘧啶代替另一嘧啶。 2.颠换:发生在异型碱基之间,即嘌呤变嘧啶或嘧啶变嘌呤。 (二)移码突变(framesshift mutation),正常人的HbA的链第六位是Glu,而病人(HbS)则被Val取代(遗传密码由CTTCAT)。,每种蛋白质分子都具有特定的结构来行使特定的功能,即使是一级结构个别AA的变化也能引起功能的改变或丧失。,63,(二)移码突变,由插入或缺失单个或2个碱基而改变整个基因序列、阅读框架的突变,称为移码突变。,64,(三)重组(recombination) DNA分子内较大片段的交

24、换,称为重组或重排。,65,四、DNA的损伤与修复,在一定条件下,生物体能使DNA的损伤得到修复:,暗修复,(1)光裂合酶修复 (2)切除修复 (3)重组修复 (4)诱导修复(SOS修复) (5)错配修复,66,光复合酶特异地和嘧啶二聚体结合,(1)DNA紫外线损伤的光裂合酶修复(光复活作用直接修复),酶被可见光激活,解聚二聚体后酶被释放,67,(2)切除修复,一般DNA的两条链只有一条受损伤,在一系列酶的作用下可将损伤部分切除,根据互补链的序列对其进行修复。,68,切除修复(excision repairing),69,DNA的重组修复,是复制后的修复 DNA链的损伤并未除去 一直只存在母链

25、上!若干 代后相当于被稀释。,胸腺嘧啶二聚体,70,SOS修复,为DNA的损伤所诱导,而产生缺乏校对功能的DNA聚合酶,它能在DNA损伤部位进行复制而避免了死亡,可是却带来了高的突变率(所以会有2种结果:修复或变异(进化) ,这属于倾向差错的修复。,71,错 配 修 复DNA在复制中发生错配,如果新合成的链被校对,基因编码信息可得到恢复;但如果模板链被校对,突变就被固定。,生物体内存在错配修复系统:能够识别“新” “旧”链!(依据甲基化),72,DNA的合成方式:,DNA的复制:以DNA为模板合成DNA。 逆转录:以RNA为模板合成DNA。 修复合成(DNA聚合酶I、连接酶、修复酶系统等),7

26、3,第二节 RNA的生物合成,一、转录 (一)概念 转录(transcription):以DNA的一条链为模板在RNA聚合酶催化下,按照碱基配对原则,合成一条与DNA链的一定区段互补的RNA链的过程称为转录。 转录的不对称性(asymmetric transcription):在RNA的合成中,DNA的二条链中仅有一条链可作为转录的模板,称为转录的不对称性。 反义链(无意义链,负链):在RNA的转录中,用作模板的DNA链称为反义链。 有义链(编码链,正链)在RNA的转录中,不作为模板的DNA链称为有义链。,74,75,转录产物:mRNA 、rRNA、 tRNA、各种小RNA 基因表达的产物:R

27、NA和蛋白质 转录起始于DNA模板的一个特定位点,并在另一位点终止,此转录区域称为一个转录单位。 一个转录单位可以是一个基因(真核)单顺反子mRNA ,也可以是多个基因(原核)多顺反子mRNA 。,76,(二) 原核生物的转录 1.E.coli RNA聚合酶:大肠杆菌的RNA聚合酶只有一种, 全酶由5种亚基2 组成,另有两个Zn2+ 因子与其它部分的结合不是十分紧密,它易与2 分离,没有、 亚基的酶称为核心酶只催化链的 延长,对起始无作用。 五种亚基的功能分别为: 亚基:与启动子结合功能。 亚基:含催化部位,起催化作用,催化形成磷酸二酯键。 亚基:在全酶中存在,功能不清楚。 亚基:与DNA模板

28、结合功能。 亚基:识别起始位点。,77,E.coli RNA聚合酶的特点:,反应底物:NTP(ATP/GTP/UTP/CTP), DNA为模板、Mg2+促进聚合反应。 RNA聚合酶不需要引物,合成方向53 。,78,2. E.coli RNA的转录过程: 起始位点的识别 转录起始 链的延伸 转录终止,79,(1)起始位点的识别,RNA的合成不需要引物。体外实验证明,不含亚基的核心酶会随机地在一个基因的两条链上启动,当有亚基时就会选择正确的起点。 亚基起着识别DNA分子上的起始信号(启动子指RNA聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA序列)的作用。启动子的结构至少由三部分组成:-35序列提供了R

29、NA聚合酶全酶识别的信号;-10序列是酶的紧密结合位点(富含AT碱基,利于双链打开);第三部分是RNA合成的起始点。,80,(2)转录起始,RNA聚合酶全酶扫描解链区,找到起始点,然后结合第一个核苷三磷酸。加入的第一个核苷三磷酸常是GTP或ATP,很少是CTP,不用UTP。完成最初的几个(2-9)核苷酸连接后,亚基就会被释放脱离核心酶。 所形成的启动子、全酶和RNA链复合物称为三元起始复合物。,因子仅与起始 有关,RNA的合 成一旦开始, 便被释放,81,(3)RNA链的延伸,DNA分子和酶分子发生构象的变化,核心酶与DNA结合比较松弛,可沿DNA模板移动,并按模板顺序选择下一个核苷酸,将核苷

30、三磷酸加到生长的RNA链的3-OH端,催化形成磷酸二酯键。转录延伸方向从5 3,82,RNA聚合酶催化的反应,A,C,G,A,C,G,U,U,模板DNA,5,3,新合成RNA,83,(4)转录终止(终止子和终止因子),在DNA分子上(基因末端)提供转录停止信号的DNA序列称为终止子(terminators),它能使RNA聚合酶停止合成RNA并释放出RNA。,终止因子,协助RNA聚合酶识别终止信号的辅助因子(蛋白质)。终止因子因子能与RNA聚合酶结合但不是酶的组分,它的作用是阻止RNA聚合酶向前移动,于是转录终止,并释放出已转录完成的RNA链。,大肠杆菌有两类终止子: (1)不依赖于因子的终止子

31、(强) (2)依赖因子的终止子(弱终止子),84,不依赖于因子的终止子有2个特征(强终止子) 在DNA中,在转录单位的终点之前都有一个回文结构,其转录本形成发卡结构,且柄部富含GC碱基对。 终点前大约有6 个连续的A,它转录成U。,85,寡聚U序列可能提供信号使RNA聚合酶脱离模板。,依赖的终止子,必需在因子存在时,才发生终止作用。终止点前无寡聚U序列,回文对称区不富含GC。,86,有些终止子的作用可被特异的因子所阻止,使酶得以越过终止子继续转录,称为通读(readthrough),能够引起抗终止作用的蛋白质称为抗终止因子(antitermination factors),因子是一个碱性的蛋白

32、,三个二聚体组成.与合成的RNA结合,移动到终止信号,再与RNA聚合酶结合,使之离开模板.,87,RNA合成过程,起始,双链DNA局部解开,磷酸二酯键形成,终止阶段,解链区到达基因终点,延长阶段,RNA,启动子(promoter),终止子(terminator),88,基本原则与原核相似,但真核基因的转录更复杂, RNA聚合酶不相同 启动子有三类,分别由RNA聚合酶I、II、III进行转录。 真核生物的启动子由转录因子,而不是RNA聚合酶识别(没有对应的因子) 转录因子:RNA聚合酶在进行转录时,常需要一些辅助因子(蛋白质)参与作用,此类蛋白质统称为转录因子。 多种转录因子和RNA聚合酶在起点

33、形成前起始复合物,起始转录。,(三)真核生物的转录,89,分子量都在50万左右,真核生物RNA聚合酶,90,二、RNA生物合成的抑制剂,1、嘌呤和嘧啶类似物:人工合成的碱基类似物能够抑制和干扰核酸的合成。如 6-巯基嘌呤,作为代谢拮抗物抑制合成酶类或直接掺到核酸分子中,形成异常RNA或DNA。,5-氟尿嘧啶,91,2、DNA模板功能的抑制物:可以与DNA模板结合,抑制其复制和转录,(1)烷化剂:使DNA发生烷基化,易引起嘌呤的水解,在DNA上留下空隙干扰复制或转录;或引起碱基错配。 (2)放线菌素:放线菌素D与DNA形成非共价的复合物,抑制其模板功能(低浓度抑制转录,较高浓度抑制复制)。 (3

34、)嵌入染料:可插入双链DNA分子相邻的碱基对之间,一般具有芳香族发色团。吖啶类染料;溴化乙锭(EB)。EB是一种高灵敏的荧光试剂,常用来检测DNA和RNA。与DNA结合后抑制其复制和转录。,92,3、RNA聚合酶抑制物,(1)利福霉素:抑制细菌RNA聚合酶活性。利福平可以高效抑制结核杆菌,杀死麻疯杆菌。 (2)利链霉素:与细菌RNA聚合酶亚基结合,抑制转录过程中RNA链的延长反应。 (3)-鹅膏蕈碱:主要抑制真核RNA聚合酶和,对细菌的RNA聚合酶作用极小。,93,三、RNA的转录后加工(post-transcriptional processing) 在细胞内,由RNA聚合酶合成的原初转录物

35、(primary transcript)往往需要一系列的变化,包括链的裂解、核苷的修饰、以及拼接和编辑等过程,才转变为成熟的RNA分子。此过程总称为RNA的成熟或称为RNA的转录后加工。,94,1、mRNA前体的加工(真核): 原核生物的mRNA转录后一般不需要加工,转录的同时即进行翻译(半寿期短)。亦有少数多顺反子的mRNA需要核酸酶切成小单位,然后再翻译。 真核生物mRNA(半寿期较长)原初转录物很大,在加工过程中形成许多分子大小不等的中间物,它们被称为核内不均一RNA(heterogeneous nuclear RNA,hnRNA),其中大约25%需要进一步进行加工修饰转化为mRNA。,

36、95,mRNA前体的加工包括: (1)3端添加polyA “尾巴”; (2)5端连接“帽子”结构(m7G5ppp5NmpNp-); (3)hnRNA被剪接,把内含子(DNA上非编码序列)转录序列剪掉,把外显子(DNA上的编码序列)转录序列拼接上(真核生物一般为不连续基因)。 (4)分子内部的核苷酸甲基化修饰。,96,97,2、tRNA前体的加工: 原核与真核生物的tRNA转录后都需要加工。包括: (1)由核酸内切酶切除前体上3和5端上多余的核苷酸; (2)由核酸外切酶逐个在3切去附加序列,进行修剪。 (3)3 端添加CCAOH序列,由核苷酸转移酶催化。 (接受活化AA) (4)对核苷的一些特定

37、的碱基和戊糖进行修饰。,98,99,原核与真核生物的rRNA转录后也都需要进行加工。 原核:刚转录的rRNA为30S,先在特定的碱基上进行甲基化(核糖2-羟基)修饰,后逐步裂解(核酸酶的切割)。 真核:45S(哺乳动物)、38S(果蝇)、37S(酵母),P16,P23,P5,16S,23S,5S(一般不含甲基化),28S,18S,5.8S,3、 rRNA前体的加工:,45S 或38S,37S,26S 17S 5.8S,rRNA原初 转录物30S,研究四膜虫rRNA前体的拼接时发现ribozyme,100,101,四、转录和复制的区别(概念),二者酶系不同:转录需要RNA聚合酶;复制需要DNA聚

38、合酶。 底物、产物不同:转录以核苷三磷酸为底物,产物为核糖核酸;复制以脱氧核苷三磷酸为底物,产物为脱氧核糖核酸;在RNA中U代替T与A配对;转录产物是rRNA, tRNA,mRNA等. 转录通常只发生在DNA的一条链上,称为不对称转录,被转录的链为模板链或负(-)链,另一条链为编码链或正链(+);而复制以DNA的两条链为模板进行的。 转录(RNA的合成)不需要引物,而复制需要引物。,102,两个阶段 (1)其单链RNA可充当mRNA,利用寄主中的核糖体合成外壳蛋白和复制酶的亚基。 (2)复制酶的亚基可与来自寄主细胞的亚基自动装配成RNA复制酶,可进行RNA的复制,以分子中单链RNA为模板(正链

39、),复制出一条新的RNA链(负链),再复制出正链,与外壳蛋白组装成新的噬菌体颗粒。,五、RNA的复制(噬菌体Q和灰质炎病毒),某些RNA病毒可以以自身RNA为模板进行复制。,不同的RNA病毒复制方式不同。,103,病毒RNA复制的主要方式,单链(+)RNA病毒的复制方式(噬菌体Q和灰质炎病毒)(只含病毒正链RNA) 单链(-)RNA病毒的复制方式(狂犬病毒)(病毒负链RNA+复制酶); 双链RNA病毒的复制方式(呼肠狐病毒)(双链RNA+复制酶); 致癌RNA病毒,104,不同RNA病毒合成mRNA的 途径可以分4类,逆转录病毒,噬菌体Q,狂犬病毒(带有复制酶),呼肠孤病毒 (带有复制酶),逆转录酶,105,RNA的合成:,转录 逆转录(致癌R

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