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文档简介
1、,组织dna提取,tissue dna extraction,实验目的是学习从生物组织中提取dna,为研究dna的理化性质和结构功能打下基础。dna提取的一般原则:确保一核酸一级结构的完整性。2其他生物大分子(如蛋白质、多糖、脂肪分子)的污染必须最小化。3核酸样品中不应有抑制酶的有机溶剂和高浓度金属离子。其他核酸分子,例如4 rna,也应该尽量去除。、浓度情感,(a值为1时50g/ml双链dna,40g/ml单链dna或rna,20g/ml单链寡聚核苷酸),各种碱的紫外线吸收光谱,2)适用于荧光分光光度法低浓度核酸溶液的定量分析。(1-5ng),eb和dna的结合,从500l全血中提取的基因组
2、dna电泳,从动物组织中提取基因组dna,确认纯度,紫外线分光光度法:如果260nm和a260低于值,就可以知道制剂中仍有蛋白质成分。高于此值表示存在rna剩馀量。纯rna a260和a280的比率必须为2.0。a260/a280比是纯度检查的重要指标。完整性确认(integrity identification),凝胶电泳法:基因组dna电泳,在电场中游泳缓慢,分解发生的话,电泳也可能发生脱发现象。总rna电泳观察每个带的含量,告诉我们是否有rna降解。如果额外的槽有带状,则可能是dna污染。核酸的储存dna保存,1)短期保存:4或-20保存在te(tris和edta)缓冲液中。te缓冲液的
3、ph与dna储存有关,ph为8可以减少dna脱氨反应,ph低于7.0时dna容易变性。2)长期存储:te缓冲液中-存储70年;在dna溶液中添加一滴氯仿可以有效地防止细菌和核酸的污染。每个组织的ml分解液组织菌机,匀浆2.0ml均质,等体积苯酚-氯仿,摇匀5min,2,500rpm 10min,水摄取量,等体积氯仿-异丙醇,摇匀5min,2,500rpm如果a260nm/a280nm等于1.6,则表明有蛋白质或苯酚污染,应进一步纯化。定量,dna浓度(g/ml)=a260nm 50稀释倍数1/光光*1od值等于50g/ml dsdna、40g/ml ssdna或rna,2og/ml升高核苷酸。
4、浓度计算,1 .分解液: 10 mmol/l ph 8.0 tris-hcl 1 mmol/l edta 0.1mol/l nacl 1% sds er聚合细胞中核蛋白降解;蛋白质和复合物的形成,2 .酚-氯仿(phenol-chloroform):酚:强蛋白质变性剂氯仿:蛋白质变性剂,不与水互溶,可与酚相互溶解,拿走剩下的酚。,为什么苯酚要严重饱和才能用于dna分离?苯酚在空气中经常氧化,形成自由基,可直接用于dna分离,磷酸二酯键断裂,dna分解。要氧化苯酚,必须在高温下再蒸,去除氧化物,用tris-hcl饱和苯酚中性调节。3 .氯仿-异丙醇:降低分子表面张力,减少萃取过程中泡沫的生成,异
5、丙醇帮助分相,保持离心后的上层水、中间层改性蛋白质、下层有机溶剂稳定。4。冰无水乙醇(absolute ethonal)和70%乙醇(70% ethonal):无水乙醇夺走dna周围的水分子,使dna失去水分,容易聚合。可以去除残留物的氯仿。70%乙醇洗涤去除残留的盐离子,盐离子的存在不容易溶解,抑制酶反应。5 .te缓冲(te buffer):10 mmol/l ph 8.0 tris-hcl 1 mmol/l edta缓冲不会对tris-hcl产生金属离子干扰,从而使edta稳定dna的激活。6.20%十二烷基磺酸钠(sds):抑制dnase活性,7.10mg/ml蛋白酶k(protase
6、 k):蛋白质分解,细胞膜破坏8.10mg/mlrna酶(rnase)dna释放不完全。离心力的小方面分离不完全。dna降解的原因样本不新鲜。采集物质在旧样品本身有大量dna酶提取dna的生物活性的原因吗?提取的基因组dna盐浓度过高的基因组dna中乙醇没有清除的纯基因组dna中,可能有其他抑制因素提取基因组dna,有时因为添加蔗糖的原因添加多糖保护dna长度,注意事项,1。处死动物后,要取出使用的器官,尽快放入液氮中,以免dnase引起dna分解。在纯化过程中,应加入核酸酶抑制剂(eg.edta),防止dna自身分解。2.组织要尽量磨细。颗粒太大,细胞不能完全分解,随后dna会严重分解。3 .真核细胞dna分子量很大,机械张力容易引起dna分子
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