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文档简介

1、胃癌胰岛素等生长因子-2基因的印迹状态检测,1,基因印迹的概念在基因组DNA水平对双亲等位基因特异性的修饰作用。结果徐璐不同性别亲本(父母)的同源染色体上发生了等位基因的功能差异。驴马正反交实验结果,驴母马雄驴骡,基因组印迹现象在1960年昆虫研究中首次提出。Sciara昆虫的两个X染色体,1980年,Cattanach等发现,带两个母原11号染色体的老鼠在胚胎期比正常老鼠小,带两个母原11号染色体的老鼠在胚胎期比正常老鼠大。但是这两个老鼠胚胎都不能正常发育,死于发育阶段。1984年,McCrath等用人工单性生殖方法生产了两种特殊类型的小鼠胚胎。一个小鼠胚胎的整个染色体都来自雄性亲本,另一个

2、小鼠胚胎的整个染色体都来自雌性亲本。但是两种老鼠都在发育时期死亡。1991年,Dechiara等人进行了老鼠IGF-2基因去除实验,首次证明生物体本身具有基因组印迹基因。实验表明,如果叩诊副源IGF-2等位基因老鼠,成体个体小,但去除的等位基因来自母源,则动物个体没有变化。直到1993年,Feinberg研究所首次发现基因组印章在人类身上也存在。2,基因组印迹和肿瘤的关系IGF-2是印迹基因,正常人群体中只有父系基因表达,母系的等位基因处于静止状态。据调查,在约40%WT的患者肿瘤组织中,IGF-2等基因父母系共同表达。这种停止的基因重新激活的现象称为Loss of imprinting(LO

3、I)。结肠癌患者也能检测到IGF-2的LOI现象,这种现象不仅存在于癌组织中,也存在于癌旁组织和患者的血细胞中。因此,这种现象很可能成为该病早期诊断的指标。另外,与基因组印迹异常相关的肿瘤还发现了肝癌、卵巢癌、胃癌、肺癌、胶质瘤、前列腺癌等。目前,除了IGF-2以外,与人类肿瘤发生相关的印迹基因还具有WT1,P57KIP2,P73,NOEY2,M6P/IGF-2R等。http:/,3,IGF-2基因LOI检测方法,1,DNA水平选择性杂合2,RNA水平观察杂合是否完整,酶点:GGGCC | C GTG CCC | CCGGCACGGG,即此序列在人群中存在SNP、236 bp、173 bp、6

4、3 BP、正常(本国)正常、LOI、一、实验部署、设备双层器;双层器。3EP管;4冰盒;5手套6高速离心机试剂 1苯酚;2氯仿;3绝对乙醇;475%乙醇;5纯,操作程序,胃癌组织,洗涤200ul PBS,离心8000rpm 5min,消化180ul TE,20 ul 10% SDS 3 ul蛋白酶K,50 2h,清流100 ul,苯酚萃取300 ul苯酚青青,干燥,溶解MRNA适量TE,mRNA含量最低,半衰期短,容易分解。在RNA提取过程中,主要使用二硫酸铵等变性剂破坏细胞结构,停用RNA酶。细胞碎片、蛋白质等苯酚、氯仿等有机溶剂的提取将被去除。真核生物中的18SRNA、28SRNA经过每个

5、阵地的电泳,可以在紫外线灯下观察到两个清晰的波段。RNA提取键:可防止内源性RNA酶(如碗、试剂、手等存在的RNA酶的核酸分解作用,使用的材料、碗)进行DEPC处理(包括0.1%溶液浸泡,蒸馏水清洗和高压灭菌15 min去除)。设备 1电子秤;双层器;双层器。3EP管;4冰盒;5手套6低温冷冻高速离心机试剂 1TRIzol试剂(Invitrogen/Gibcobrl);2氯仿;3异丙醇;475%乙醇;50.1% DEPC处理水,RNA提取程序,胃癌组织,均质200ul三唑制备,孵化4 12h,盖子后晃动15sec,氯仿40 ul,冰上10min,离心12000RPM4离心12000rpm 4,

6、10分钟,商城县,洗涤沉淀75%乙醇200 ul,离心10000rpm 4,5min,空气干燥,溶解RNA DEPC水20ul,您可以使用此cDNA作为模板来增强RNA的PCR。在PCR反应中,除了要扩增的特异性基因的诱集物外,还可以将常用的-actin或GAPDH诱集物扩增为内参基因,对特异性基因的转录水平进行半定量分析。RT- PCR的原理,设备 1PCR放大器;2恒温水浴箱;3紫外线灯探测器;4EP管;5手套试剂 1特定基因讲义上游讲义:5 cttgacttgagtcaattgg3下游讲义:5 cctctgtactggg3 2rt-PCR试剂盒(Takara公司),操作程序第二,PCR反

7、应取液体10 l,放入P管,加入以下试剂混合,放入PCR增强器增强,然后用电泳鉴定PCR产物(10 l)。2 .根据以下条件进行PCR反应,实验4限制性酶和电泳检测,1,限制性酶切基本原理 SNP的存在改变了限制性酶切部位。根据IGF2基因9外显子,具有限制性核酸内切酶ApaI部位多肽性的特征,RT-PCR产物进行ApaI消化,酶产物通过琼脂糖凝胶电泳进行印迹损失检查。设备 1恒温水箱箱;2EP管;3手套试剂 1ApaI限制内切酶;210L buffer;3.纯,操作程序,RT-PCR产物酶切系统:37水浴摇床夜,1。限制性内切酶消化,2,1,琼脂糖凝胶电泳,基本原理琼脂糖凝胶电泳是分离、纯化

8、和确认DNA片段的一般方法。DNA分子在高于等电点的溶液中带负电荷,从电场向两极移动。DNA分子在电场中通过介质游泳。除电荷效应外,凝胶介质还具有与分子大小及构思相关的分子筛效果。对于线性DNA分子,在电场中的迁移率与分子量的对数值成反比。在凝胶中加入少量溴化B (EB),分子会插入DNA的碱基之间,因此可以直接在紫外线灯下观察凝胶中DNA片段的位置,通过紫外线灯下或凝胶成像系统进行观察或拍照。线性DNA片段分离的有效范围为每阵地凝胶浓度关系,记载 1水平电泳槽;2电泳装置;3紫外线透射器或凝胶成像系统试剂 11%每阵地2电泳缓冲液(1 tbe);310 mg/ml溴化b锭(EB);4电泳样品常样品缓冲液(6): 0.25%溴酚蓝,0.25%二甲苯腈,40%(W/V)甘蔗水溶液,保存在40C。1琼脂糖0.2 g,电泳缓冲液(1TBE) 20毫升,加热熔融。2在粘合剂冷到50C的时候,加入EB 2l,小心搅拌,慢慢倒入制胶模具,在胶水末端插入梳子。3胶水凝固后,拔下梳子,将明胶放入电动

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