实验六蛋白质结构分析与预测

1、实验6:蛋白质结构分析和预测，基因和蛋白质组学数据分析，1 .学习交换PPT，实验6:蛋白质结构分析和预测1。实验目的和要求：掌握蛋白质二级和三维结构预测服务器的使用和结果分析；掌握常用高分子空间结构显示软件的使用；2、研究和交流PPT，实验内容1，蛋白质二级结构预测，以人基质金属蛋白酶P14(Matrix methyl methyl mathematic P14)序列为例，介绍SOPMA的二级结构预测方法。人基质金属蛋白酶(mmp14)氨基酸序列的fasta形式可从NCBI蛋白质数据库(gi | 4826834 | ref | NP _ 004986.1 |基质金属蛋白酶14前蛋白人类)获得

2、。3、学习交流PPT和SOPM二级结构预测方法，(1)进入SOPM主页()；(2)在“在下面粘贴一个蛋白质序列”的空白处提交蛋白质序列(原始序列)，并设置参数以满足我们的要求，然后点击“提交”按钮进行分析；4、学会交流PPT、人民卫生出版社8年计划和7年计划等专业生物信息学，(3)检查结果，主要包括螺旋(Hh)-螺旋、延伸链(Ee)延伸链、转角(Tt)-转角、随机卷曲(Cc)随机卷曲。Hh含有150个氨基酸，占25.77%。Ee有110个氨基酸，占18.90%；Tt含有52个氨基酸，占8.93%；Cc含有270个氨基酸，占46.39%。Hh、Cc和Ee贯穿整个氨基酸链，Tt主要分布在氨基酸链的

3、第300个氨基酸之后。5、学习交换PPT和SoMPa预测结果，6、学习交换PPT，第1步：进入SWISS-MODEL三级结构预测服务器主页，实验内容2、以人MMP-14序列为例应用SWISS-MODEL服务器自动模式，第2步：选择“开始建模”粘贴MMP-14蛋白序列；您可以在这里填写电子邮件地址，将结果发送到电子邮件，或者直接在新网页上显示；7，学习与PPT、MSPAPPPRCLLLPLLTLGTALSAGSAGSSAKSSPEAWLQQYGYPPGDLRTHTQRSPQSLSAIAAAMQKFYGVTQVTGKADATMKAMRPRCGVPDKFGAEIKANRKYRYIQKWHNEITFQ

4、NYTPKVGEYEAIRKVVW ESATPREFFREYAIREGEKQADIMIFFAEGHDSPDGFDGEPDGEFFRAGHAYFPGPNIGGDTHEIGHTSFEDVERTVERNEDLGNDILVAVHELGALLGELSDPAIMAPPASAPAP在什么二级结构中？在186-192区间氨基酸的二级结构是什么？2.用瑞士模型预测其三级结构，用Pymol观察三级结构，写出模板蛋白的PDB编码，并将它们之间的双序列比较结果整理成实验报告。mgntllealnvrvgngervlahgfgtdqsawqrlypyflphfriilyldlvcagsvnpdyfdfrrytldaff

5、dllnildalgdrcavyghsvsamighligsprflndhdyhgefegefegefekifsamean Ydawvhgfaplgavgdavaavrrtlfnmpditlfvsrtifnsdlrgvlvkvpcictakdvptsvalylknhlggrntvemvelphlghlsappvlavlrlarsr 3。观察并绘制pymol获得的三维结构图。这种蛋白质通过卡通展示出来。这种蛋白质包含多少螺旋和折叠？将图片组织成实验报告。将标准普尔500指数预测的结果与瑞士模型预测的结果进行比较，两个结论是否相同？行业，16，学习交换PPT和实验报告，从在线教学平台-基因和蛋白质组学数据分析-B 2100029-教材-实验课件下载基因和蛋白质