PubMed基本功能及检索

1、PubMed基本功能及检索,读者培训系列讲座之PubMed,重庆医科大学图书馆信息技术部 谢丹玫,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,总结,检索结果的处理,一、简介,由美国国立医学图书馆（NLM）所属国家生物技术信息中心(NCBI) 建立；,/pubmed/,收录范围,MEDLINE 记录标注PubMed - indexed for MEDLINE PreMedline 是临时性医学文献数据库，每天接收新数据，经MeSH词表标引后，每周向medline移加一次。 记录标注Pu

2、bMed - in process Publisher supplied citations 出版商直接向PubMed递送的电子记录中不被Medline收录的部分。 记录标注PubMed - as supplied by publisher,MEDLINE数据库由美国国家医学图书馆（National Library of Medicine，简称NLM）编制，是印刷刊Index Medicus（医学索引）、Index to Dental Literature（牙科文献索引）和Internationgal Nursing Index（国际护理索引）的光盘版，数据摘自3700种期刊，是生物医学的主要

3、数据库。时间跨度1966年至今。,简介,PubMed的特点,二、PubMed的特点,免费提供题录和文摘 可与提供原文的网址链接 (部分免费获取） 提供检索词自动转换匹配 操作简便、快捷,自动转换匹配： PubMed对输入检索框中的检索词进行智能化地校对，将其逐步地与其数据库中的各类术语匹配的原则。,MeSH Translation Table 主题词注释表,Journals Translation Table 期刊注释表,Common Phrase List 常用词组表,Author Index 作者索引表,No Mapping,检索词拆分AND,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面

4、,基本检索输入框,特征栏提供辅助 检索功能,侧栏提供其他检索如期刊数据库检索、主题词数据库检索、特定文献检索,执行检索按钮,Journals DatabaseMeSH DatabaseSingle Citation MatcherBatch Citation MatcherClinical QueriesSpecial QueriesLinkOutMy NCBI,三、PubMed检索界面,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,PubMed基本检索功能,（一）单词、短语、词组检索,（二）作者姓名检索,（三）期刊名称检索,（四）截词检索,（五）带逻辑运算符的复合检索,在PubMed基本检

5、索里面的前面四项其实也就是告诉我们在基本检索输入框中，可以输入任何具有实质性意义的词语，比如说：自由词、主题词、人名或者刊名，系统都会智能化地同系统中词表的进行匹配后完成检索。,在基本检索里面，PubMed能够完成：,1、单词、短语、词组检索,2、作者检索,3、期刊名称检索,4、截词检索,5、带逻辑运算符的复合检索式,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,PubMed基本检索功能,（一）单词、短语、词组检索,检索出文章总篇数,综述类文献总篇数,单词检索,系统自动进行转换匹配后生成的检索式,Liver cancer,固定搭配 词组检索,可以保证查全率,自动转换匹配后，进行逻辑或的运算,

6、短语检索,自动转换匹配后的结果,强制短语/词组检索,针对特定的短语和词组的检索，需要在短语或者词组上加上双引号。,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,PubMed基本检索功能,（一）单词、短语、词组检索,（二）作者姓名检索,作者姓名检索,格式：姓+名缩写(不用标点)，如要查找王智彪教授发表的文章，输入格式为：wang zb，系统会自动在作者字段内进行检索。,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,PubMed基本检索功能,（一）单词、短语、词组检索,（二）作者姓名检索,（三）期刊名称检索,建议期刊检索使用期刊名称检索字段标识ta或者是so,这是因为： 如果期刊名称正好是一个

7、MeSH中的词，系统会将其作MeSH词进行检索。 如果期刊名称是一个单词，系统会在所有字段中进行检索。,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,PubMed基本检索功能,（一）单词、短语、词组检索,（二）作者姓名检索,（三）期刊名称检索,（四）截词检索,在词的末尾加“*”号，PubMed就会检索出以该词为词根的所有的词。截词检索将关闭自动词语匹配功能。,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,PubMed基本检索功能,（一）单词、短语、词组检索,（二）作者姓名检索,（三）期刊名称检索,（四）截词检索,（五）带逻辑运算符的复合检索,如我们要检索肿瘤的诊断和治疗方面的文献，我们可以

8、在基本检索输入框中输入：cancer AND (diagnosis OR therapy)，点击“Go”进行检索。,复合检索式检索,布尔逻辑运算符有: AND，OR或NOT,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,限制字段和条件检索,检索史管理,预检索及浏览索引检索,详细匹配过程,剪贴板,界面介绍,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,限制字段和条件检索（Limits）,输入检索词，系统默认空格为AND关系,子文档,检索词字段,出版类型 选择限制,文献发表日期,只要有文摘的文献,语种,研究对象

9、年龄,限制字段和条件检索（Limits）,性别,数据输入时间,研究对象,将检索词限制在一个特定范围,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,限制字段和条件检索（Limits）,预检索/浏览索引检索（Preview/Index）,检索式,预检索/索引加词检索,预检索按钮,索引检索按钮,预检索/浏览索引检索界面（Preview/Index）,检索结果数量,therapy,预览检索结果，修改和增删检索词,步骤2 输入待选词,步骤1 点击预览/索引按钮,hepatitis b,步骤3 点击index按钮,步骤5 确定与检索栏中检索提问的逻辑关系,步骤4

10、 索引选词,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,限制字段和条件检索（Limits）,预检索/浏览检索（Preview/Index）,检索史管理（History）,检索历史回顾,检索式,检索时间,检出篇数,点击预检索按钮,#1 and therapy,用于查看检索记录和检索结果的数量，并进行各种逻辑运算。,检索史管理界面（History）,检索号,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,限制字段和条件检索（Limits）,预检索/浏览检索（Preview/Index）,检索史管理（Histor

11、y）,剪贴板管理（Clipboard）,剪贴板管理界面（Clipboard）,暂存需下载或者是打印的记录，多项检索后集中存盘或者打印。最多允许存储1000条。,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,限制字段和条件检索（Limits）,预检索/浏览检索（Preview/Index）,检索史管理（History）,剪贴板管理（Clipboard）,详细匹配过程（Details）,详细匹配过程界面（Details）,点击后，系统可以把我们真正执行了自动匹配转换功能的检索式显示出来，可以看见系统详细的转换过程。,数据库匹配过程,规范词转换,你输入的检

12、索式,检索明细,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,期刊浏览检索,主题词浏览检索,单个引文匹配器,临床查询,期刊浏览检索,主题词浏览检索,单个引文匹配器,批引文匹配器,临床查询,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,期刊浏览检索,（一）期刊浏览检索 （Journal database）,cancer,点击,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,期刊浏览检索,主题词浏览检索,（二）主题浏览检索 （M

13、esh Database）,功能： 确定规范检索词 查看词义注释、树状结构表 副主题词、扩展、主要主题词,主题词数据库检索,1.输入检索词,3.点按此处可获详细注解,2.执行浏览,主题词注释,可选副主题词,限定作为主要主题词检索,不进行下位词扩检,该主题词所替代的非规范词形式,主题词树形结构表,发送至检索框,通过MeSH Database 检索的结果，其中32篇综述文献,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,期刊浏览检索,主题词浏览检索,单个引文匹配器,（三）单个引文匹配检索 （Mesh Database）,输入题录信息，查找特

14、定文献。 刊名要准确，缩写要标准 著者姓名大小写不敏感 如查找：王智彪教授1997年发表在Ultrason Sonochem期刊上的一篇文章的其他作者的名字,单个引文匹配检索,Ultrason Sonochem,1997,Wang zb,得出其他著者,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,期刊浏览检索,主题词浏览检索,单个引文匹配器,临床查询,（四）临床查询 （ Clinical Queries ）,检索临床研究方法学（循证医学）文献，主要涉及治疗、诊断、病因、和预后四个分类，并提供强调选择，即敏感度（强调查全）或专指度（强调查

15、准）。,有三个方面的内容： 研究类别查询：治疗、诊断、病因学及预后 系统评价查询 医学遗传学查询 ：诊断 、临床描述、管理、基因、分子遗传学、基因测试等内容。,研究类别查询,系统评价查询,医学遗传学查询,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,检索结果的处理,显示检索结果(Display),输出检索结果（send to ),输出到文本（send to Text),输出到文件（send to File ),输出到E-mail（send to E-mail),简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed

16、基本检索功能,其他辅助检索,检索结果的处理,显示检索结果(Display),显示检索结果(Display),检索格式选择,显示记录数,排序方式,有摘要,有free全文,无摘要,全文链接图标,点击下载PDF 格式的全文,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,检索结果的处理,显示检索结果(Display),输出检索结果（send to ),检索结果输出（send to ),Text：当前网页所显示记录的文本格式，用浏览器文件菜单中的保存文件的功能保存文件。 File：所有记录纯文本文件格式，用对话框保存。 Clipboad： 剪贴板

17、，暂存需下载记录，多项检索后一起保存。 Email： 通过邮件发送文献，最多500篇文献。,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,检索结果的处理,显示检索结果(Display),输出检索结果（send to ),输出到文本（send to Text),检索结果输出（send to Text)：当前网页所显示记录的文本格式，用浏览器文件保存。,保存该文本文件,打印该文本文件,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,检索结果的处理,显示检索结果(Display),输出检

18、索结果（send to ),输出到文本（send to Text),输出到文件（send to File ),检索结果输出（send to File )：以纯文本文件保存，注意的是，在display中的显示格式就是存盘的格式,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,检索结果的处理,显示检索结果(Display),输出检索结果（send to ),输出到文本（send to Text),输出到文件（send to File ),输出到E-mail（send to E-mail),检索结果输出（send to E-mail)：通过邮件发送检索结果。,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,总结,检索结果的处理,八、总结,Preview/