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文档简介
1、肿瘤基因检测与个体化用药,精准医学研究所 洛阳中科信息产业研究院,肿瘤防治形势-严峻,2,2012中国肿瘤登记年报,我国每年新发肿瘤病例约为:,肿瘤三大治疗手段,3,约90%肿瘤患者在治疗过程中会用到抗肿瘤药物,抗肿瘤药物使用原则,卫计委抗肿瘤药物临床应用指导原则,不同肿瘤药物疗效比较,5,Medical College of Wisconsin #099 Chemotherapy: Response and Survival Data, Author(s): David E Weissman, Charles F von Gunten, April 2009.,药物不良反应严重,占据全球主要
2、死亡原因第4-6位 我国因药物不良反应住院人数250万/年 因药物不良反应死亡人数约20万/年,6,循证医学模式下的抗肿瘤用药,以群体医疗数据为依据,其实存在个体差异; 治疗方案的选择依据的是肿瘤的解剖学部位,应着重考虑同一肿瘤的基因差异;,7,临床中使用的个体差异检测手段,8,传统基因检测方法的临床局限性,第一代测序检测不到低频突变,假阴性率高 一次只能测一个基因 所需样本量大,穿刺样本耗尽,患者失去其它基因检测和个体化治疗的机会,9,第二代测序,10,美国第二代测序临床应用-举例,11,临床病历资料 女性, 58岁,病理诊断为转移性胸腺癌; 胸腔和肝内病灶增大迅速,基因检测结果 KIT基因
3、突变(在此种肿瘤非常罕见),临床治疗 KIT蛋白激酶抑制剂伊马替尼,一天一次,连续1月 RECIST标准疗效评价,SD(疾病稳定),伊马替尼治疗前,伊马替尼治疗1个月,12,产品简介,13,通过第二代测序检测患者肿瘤组织和正常组织的88个基因,找出体细胞突变和 某些多态性位点,结合患者的其他临床信息,借助晶云的药物基因组知识库和大数据 算法,为医生提供最优的用药方案参考。,为什么是88个基因,药物基因组数据库、文献挖掘 国内外靶向药伴随诊断的基因 化疗药代谢有关基因 化疗药有效性的标记基因 国内药物临床试验入选标准中提到的基因 文献中报道的可能耐药基因,14,自主研发的药物基因组知识库,基于P
4、harmGKB、SNPedia数据库,加上文献挖掘,收录对药物在人体内吸收、代谢、疗效及不良反应产生影响的基因变异 国内外药物临床试验数据库,15,个性化用药分析报告,16,临床分析报告中的三大内容,推荐合适的靶向药、化疗药 提醒靶向药原发性耐药 推荐患者参加国内外药物临床试验,17,推荐合适的靶向药,18,EGFR-TKI药物与EGFR基因敏感性突变,埃克替尼的适应症 本品单药适用于治疗表皮生长因子受体(EGFR)基因敏感突变的局部晚期或转移性非小细胞肺癌(NSCLC)患者的一线治疗 不推荐本品用于EGFR野生型非小细胞肺癌患者 埃克替尼的用药问题 10% EGFR基因敏感突变的患者原发性耐
5、药,19,靶向药原发性耐药提醒,EGFR-TKI药物原发性耐药的机制 EGFR T790M ALK基因重排 RAS基因突变 BRAF基因突变 PTEN基因突变,20,推荐合适的化疗药,21,ERCC1, CDA多态性与铂类药物使用,22,推荐患者参加国内外药物临床试验,23,服务流程,24,25,感谢,26,27,肿瘤组织样本要求,28,一、石蜡组织标本 手术样本(大样本):切片25张以上(防脱玻片),厚度5m,肿瘤细胞占比50%,坏死组织区域10%; 穿刺样本(小样本):切片35张以上(防脱玻片),厚度5m,肿瘤细胞占比50%,坏死组织区域10%。 切片时注意对切片机及台面进行消毒处理,不同
6、样本更换新刀片,防止交叉污染。 切片时摊片即可,无需烤片处理,切片编号规范清晰。 为保证石蜡标本DNA提取的成功率,请尽可能送检1年以内的蜡块或6个周以内的石蜡切片。 标本存放于塑料玻片盒中,4-8保存、运输。,肿瘤组织样本要求,29,二、新鲜组织标本 手术样本(大样本):肿瘤组织50mg,肿瘤细胞占比50%,坏死组织区域10%; 穿刺样本(小样本):穿刺1针以上,肿瘤细胞占比50%,坏死组织区域10%。 收到组织后立即用至少5倍体积的10%中性福尔马林固定液固定,置于贴好标签的标本瓶中,于4-8条件下72h内送达实验室(穿刺样本尽量48h内送达)。,肿瘤组织样本要求,30,三、胸水 胸水细胞沉渣:胸水沉渣3000rpm离心5min,将沉渣所得细胞转入1.5mlEP管中,封口膜封管口,管盖和管壁标记姓名编号,4-8条件下保存、运输。 胸水细胞沉渣石蜡切片:将胸水细胞沉渣制作成石蜡包埋蜡块,4-8条件下送检蜡块或按照石蜡组织样本要求切片后送检。,产品升级,临床应用 推荐合适的靶向药、化疗药 靶向药抗药性预测 推荐患者可参与的药物临床试验 依据本产品使用者的反馈,推荐标准治疗方案 科学研究 发现驱动基因 发现预后基因,31,32,精准医学的核心内涵是三个集成: 1.基因蛋白与代谢组学的集成; 2.临床和
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