工具软件IARC-CHECK的使用.ppt

1、肿瘤登记工具软件IARC-CHECK的使用,2011年4月 南京,软件的获得,软件可从如下网址下载： 肿瘤登记工具软件（IARC/IACR Tools for Cancer Registries)可以免费使用,IARC/IACR Cancer Registries Tools,有关技术文档，Check and Conversion Programs for Cancer Registries，可从如下网址下载电子文件： .fr/TR42.htm,软件的安装,目前最新版本为2.05: iarccrgtools_205.zip， 将下载的文件, 解压缩到一个临时文件夹中，点击setup安装，一路N

2、ext下去, 完成安装。,软件的运行,程序安装完毕后，在windows开始菜单，点击：IARCcrgTools运行程序。,Conversions编码转换,肿瘤分类编码历史发展,ICD-6 1946,ICD-7 1955,ICD-8 1965,ICD-9 1975,ICD-10 1992,ICD-O-3 2000,ICD-O-2 1990,ICD-O-1 1976,MOTNAC 1968,SNOP 1965,SNDO 1951,1961,以解剖学为主,以形态学为主,解剖学和形态学,MOTNAC 1951,STAT CODE 1956,第二章 肿瘤,第二章 肿瘤,第二章 肿瘤,IARC/IACR

3、Cancer Registries Tools 提供了如下编码转换,ICD-9 (1975) to ICD-O-2 (1990) ICD-9 (1975) and ICD-O-1 morphology (1976) to ICD-O-2 (1990) ICD-10 (1992) to ICD-O-2 (1990) ICD-10 (1992) and ICD-O-2 morphology (1990) to ICD-O-2 (1990),IARC/IACR Cancer Registries Tools 提供了如下编码转换,ICD-O-1 (1976) to ICD-O-2 (1990) ICD

4、-O Field Trial Edition (1988) to ICD-O-2 (1990) ICD-O-2 (1990) to ICD-O-3 (2000) ICD-O-2 (1990) to ICD-9 (1975) ICD-O-2 (1990) to ICD-10 (1992) ICD-O-3 (2000) to ICD-10 (1992),编码转换需注意的问题,编码必须准确和完整 对解剖学部位要求使用ICD四位数编码，要编到小数点后一位； 对形态学编码，要求有第5位行为编码，否则会造成编码转换过程中的错误和汇总统计分析错误。 编码转换软件不能将所有编码全部转换，有一部分编码，需要由人

5、工转换。,编码转换需注意的问题,男性阴茎癌ICD-9编码三位为187，四位编码为187.1-9，而无187.0编码，若编码为187.0，则会在编码转换时报错。 The following cases cannot be converted to ICD-O-2 20010571 187.0 1 1964-07-06 37 2001-08-25 6 ? 20011875 187.0 1 1937-05-19 64 2001-05-19 6 ? 20021877 187.0 1 1942-02-17 60 2002-02-07 6 ?,编码转换需注意的问题,女性卵巢和其他子宫附件癌的ICD-9编码

6、为183，卵巢癌的编码为183.0； 若在编码时编仅编三位码183，则会在ICD-9转ICD-10时，转换成C57.9（女性生殖器官,未特指），而非卵巢癌的C56 。,Tools工具,IARCcrg Tools软件工具,IARC CHECK 程序 Check程序对登记的病例记录的变量分二步进行审核, 一是检查变量是否完整并在编码范围内的有效性检查，二是对不同变量之间是否合乎逻辑的一致性进行检查。 IARC CHECK 程序最早是为了审核五大洲发病率第六卷数据，由Dr.Parkin等人编写的。 先前的版本对解剖学部位和形态学编码的审核是基于ICD-O-1和ICD-O-2，当前版本是基于ICD-O

7、-3。,IARCcrg Tools软件工具,Multiple primaries check 程序 按照 IARC/IACR 多原发肿瘤定义规则，检查多原发肿瘤。 File Transfer 程序 若在使用编码转换 (Conversions ）或数据审核（Check）程序时，提示数据文件格式不对，可以用File Transfer 程序修正数据格式； File Transfer可将逗号、制表键、分号等分隔各字段的文本文件，转换成程序可用的固定格式文件。,Check 程序变量的有效性审核,出生日期：必须是按照指定格式的有效日期，如1968/07/01； 发病日期：必须是按照指定格式的有效日期，如2

8、006/03/08 ； 发病年龄：必须是数字格式，不大于105岁；如果出生日期和发病日期完整，年龄可以通过计算获得；如果出生日期不详，则年龄字段必须是空白或是999（年龄不详）； 性别：必须是有效编码，如1、2或9(不详)，不能有其它；,Check 程序变量的有效性审核,解剖学部位编码：必须是有效的ICD-O-3编码，如气管编码为C33，或C33.9，不能编码为C33.0、C33.8 ； 形态学编码：必须是有效的ICD-O-3编码，如没有8006/3这个编码 ； 行为编码：必须是0, 1, 2, 3 (或特殊编码 6 或 9) ； 分级编码：必须是有效的ICD-O-3编码 。,Check 程序

9、变量的一致性审核,Age/Incidence and birth dates 年龄/出生日期与发病日期 Age/Site/Histology (ICD-O-3) 年龄/部位/组织学 Site/Histology (ICD-O-3) 部位/组织学 Sex/Site 性别/部位,Check 程序变量的一致性审核,Sex/Histology (ICD-O-3) 性别/组织学 Behaviour/Site (ICD-O-3) 行为/部位 Behaviour/Histology (ICD-O-3) 行为/组织学 Grade/Histology (ICD-O-3) 分级/组织学 Basis of diag

10、nosis/Histology (ICD-O-3) 诊断依据/组织学,IARC/IACR Cancer Registries Tools 使用对数据格式的要求,数据库文件必须以文本格式存放, 变量以间固定格式分隔； 每一病例用一行,要求必须包括以下变量: (1)登记号； (2)性别； (3)年龄； (4)出生日期； (5)发病日期； (6)解剖学部位编码(ICD-O-3)； (7)组织学编码(ICD-O-3)； (8)肿瘤行为编码(ICD-O-3)； (9)肿瘤分级编码(ICD-O-3)； (10)诊断依据编码；,数据格式举例,200301001 2 70 19321022 20030405

11、20030722 7 0 C20. C209 8010 39 C209 8010 39 200301002 1 39 19630911 20030205 20030811 2 0 C22.9 C220 8000 39 C220 8000 39 200301003 1 64 19380413 20030106 20030708 2 0 C34.9 C349 8000 39 C349 8000 39 200301004 2 44 19590530 20031002 20040525 7 0 C66. C669 8010 39 C669 8010 39 200301005 2 65 19380714

12、 20030723 20040205 2 0 C20. C209 8000 39 C209 8000 39 200301006 1 76 19261025 20030509 20040124 2 0 C34.0 C340 8000 39 C340 8000 39 200301007 1 59 19431003 20030410 20030521 2 0 C22.9 C220 8000 39 C220 8000 39 200301008 2 78 19241125 20030122 20030805 2 0 C22.9 C220 8000 39 C220 8000 39 200301009 1

13、83 19191119 20030506 20030807 2 0 C16.9 C169 8000 39 C169 8000 39 200301010 1 72 19310209 20031005 20050818 7 0 C22.9 C220 8010 39 C220 8010 39 200301019 2 84 19180511 20030225 20040208 7 0 C53.9 C539 8070 39 C539 8070 39 200301020 1 74 19290116 20030819 20040419 7 0 C16.1 C161 8010 39 C161 8010 39

14、File specification: 1- 9 Year and ID11-11 Sex13-15 Age 17-24 Date of birth26-33 Date of diagnosis35-42 Date of death 44-44 Basis46-46 DCO48-52 ICD-10 54-57 ICD-O259-62 ICD-O2-morphology64-65 I CD-O2 Behavior and grade 67-70 ICD-O372-75 ICD-O3-morphology77-78 ICD-O3 Behavior and grade,使用crg Tools编码转换

15、,打开IARCcrgToolsConversionsICD-0-3-ICD10 点击Input File栏下的Browse按钮，选取Input文件(以文本格式存放,固定列宽) 在Output File栏中键入输出文件名 下一步,编码转换示例ICD-O-3到ICD10,定义字段 Registration Number Sex (male 1,female 0） Topography Histology Behaviour Grade,编码转换示例ICD-O-3到ICD10,编码转换示例ICD-O-3到ICD10,程序生成3个文件: 结果输出文件：fbie03_o3to10.txt 错误的记录文件

16、： fbie03.eo3to10 需要注意的记录文件：fbie03.wo3to10,编码转换示例ICD-O-3到ICD10,输出文件与原文件相比,多出一列ICD-10编码,编码转换示例ICD-O-3到ICD10,有5条错误的编码无法进行转换, 程序在转换过程中, 实际上也是对原编码进行了一次检查.,程序可对错误信息做出提示,编码转换示例ICD-O-3到ICD10,有1条需要注意的记录,程序认为是”不太常见的行为编码”, 需要对原始病例进行核实.,程序可对错误信息做出提示,使用crg ToolsCheck示例,打开IARCcrgToolsToolsIARC/IACR Check 点击Input

17、File栏下的Browse按钮，选取Input文件(以文本格式存放,固定列宽) 在Output File栏中键入输出文件名 下一步,使用crg ToolsCheck示例,定义字段 Registration Number Sex Topography (ICD-O-3) Histology (ICD-O-3) Behaviour (ICD-O-3) Grade (ICD-O-3) Basis of Diagnosis Incidence date Birth date Age,使用crg ToolsCheck示例,定义性别编码 定义年龄不明编码 定义诊断依据形态学编码 定义日期格式,使用crg ToolsCheck示