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文档简介
1、第九章,基因信息的表达与传递,第一节 DNA复制,遗传物质:人 46条DNA链 3109碱基对 复制形式:半保留复制、半不连续性复制 复制方向: 5 3 ,DNA的复制过程,复制泡形成:DNA解螺旋,双链打开膨大 复制叉:松开的两股链和未松开的两股链外形如“Y”字形 复制子:起始点和复制叉共同构成的一个单位,叫复制子,引发体 引发酶(引物合成酶)催化合成RNA引物 RNA引物与蛋白质形成引发体 RNA引物的长度一般为412个核苷酸,DNA复制过程,前导链和后导链,前导链: 从5 3 方向是连续合成的,合成的子链叫前导链。 后随链:与53母链互补,不连续性合成许多片段,称冈崎片段。冈崎片段最后由
2、DNA连接酶连接成一条完整的链,称做后随链。,半不连续性复制前导链:由5 3 方向连续合成;后随链:分段合成冈崎片段,最后连接,(二)复制所需的引物和酶,1. 引物:RNA引物,DNA引物 2. 酶:异构酶、解旋酶、聚合酶、连接酶、 单链DNA结合蛋白(SSB)、拓扑异构酶 3. 引发酶(RNA引物合成酶)和引发体 dnaA、B、C 4. 原料: 4种核苷酸,2.DNA聚合酶,DNA聚合酶 催化合成DNA。 (1)DNA聚合酶:原核细胞有、型。主要由型负责DNA链的延伸,型有5-3 和3 -5 外切酶活性,负责RNA引物的切除。 (2)核苷酸选择:根据摸板的碱基序列,从细胞中选择相应的游离核苷
3、三磷酸进行DNA链的合成,此过程叫“核苷酸选择”。,第二节 RNA转录,基因(gene):遗传物质的表达单位,一段特定序列的核酸片段,具有指导RNA或(和)蛋白质合成的生物学功能。 1909年丹麦遗传学家W. Johannsen提出 基因组(genome):单倍染色体所有基因的总称 蛋白质组(proteome):细胞内所有蛋白质的总称,一、基因结构 (一) 基本结构: 1. 启动子 原核:Pribnow box -10bp TATAATG CAT box -35bp TTGACAT 真核: TATA box -25 - 50bp CAAT box -70 - 80bp 2. 编码区: 起始密码
4、子 至 终止密码子 3. 终止子: 提示转录终止的序列 依赖终止因子 终止因子非依赖,增强子 启动子 外显子,(二)转录调节序列,增强子(enhancer) 沉默子(silencer) 转录因子结合序列,2. 编码区: 起始密码子 至 终止密码子 开放阅读框(open reading frame) 断续(裂)基因 (split gene) 外显子(exon) 内含子(intron),原核生物的转录终止:两种方式 1.依赖因子的转录终止 2.非依赖因子的转录终止,因子参与的转录终止过程,RNA的发卡结构与转录终止,真核生物转录后的加工,5端戴帽:在成熟mRNA 5端加上甲基鸟苷(m7GpppG)
5、的帽子 3 端加尾巴: 3 端生成poly A尾巴,增加mRNA稳定性,3. 终止子: 提示转录终止的序列 依赖终止因子 终止因子非依赖 (二)转录调节序列: 增强子(enhancer) 沉默子(silencer) 反应元件(response element):转录因子结合序列,Examples of transcriptional activators in mammals.,*Pu = Purine (A or G); Py = Pyrimidine (C or T); N = any,(三)原核细胞基因组结构特点,1. 只有一个DNA分子,裸DNA形式存在 2. 结构简单,编码区比例高
6、3. 基因多为单一序列 4. 基因以操纵子结构存在 操纵子(operon):多个性质相同的基因串联在一起形成基因簇,在一套调控系列控制下转录表达 5. 存在重叠基因,(四)真核基因组结构特点,1. 基因组DNA比较庞大,结构复杂 2. 基因组DNA中非编码序列占绝大部分 3. 基因多为断续基因(split gene),编码 区中含有内含子(intron) 4. 不存在重叠基因 5. 含有大量的重复序列 低度重复序列 中度重复序列 高度重复序列,第二节 基因的转录,(一)转录 1. 粗转录阶段(由RNA聚合酶催化) hnRNA mRNA 2. 加工阶段 剪接:切除内含子和尾部区序列,5GU,3A
7、G 戴帽:对mRNA 5端进行修饰+G,7-N甲基化, 1位碱基2-O甲基化 加尾: 在mRNA3加一段多聚腺苷酸(poly A) 尾巴。150200bp,3. 逆转录: 以RNA为模板转录合成cDNA的过程 端粒的合成 病毒遗传物质的复制,三、真核基因的转录,特点 多种RNA聚合酶参与不同的RNA合成 有多种类型的启动子 有多种转录因子参与 转录后加工过程复杂,第三节 蛋白质的生物合成,蛋白质的生物合成又称为翻译 以mRNA为模板,在核糖体上进行,一、遗传密码子 遗传密码子(genetic code ): Nirenberg(1961)等发现 四种碱基 4364 种排列, 20种氨基酸 起始
8、密码(AUG) 终止密码(UAA,UGA,UAG),遗传密码(genetic codon),遗传密码的特征,1. 方向性:5 3 2. 简并性: 多个密码子编码同一氨基酸 3. 通用性: 所有生物基本相同,比较表 但线粒体CUA苏氨酸(亮) AUA甲硫氨酸(异亮) UGA色氨酸(终止) 4. 连续性:密码子的阅读不重叠、不间隔,(二)遗传密码的特征,1. 方向性:5 3 2. 简并性: 多个密码子编码同一氨基酸 3. 通用性: 所有生物基本相同,比较表 但线粒体 CUA苏氨酸(亮) AUA甲硫氨酸(异亮) UGA色氨酸(终止) 4. 连续性:密码子的阅读不重叠、不间隔,二、多肽链合成场所核糖体
9、,核糖体(ribosome):嗜碱性染料颗粒 形态:圆形或椭圆形1530nm 原核小、真核大 结构: 大亚基:中心突、柄、嵴、中央管 小亚基:头、基、平台,核糖体的形态,头 平台 裂沟,中心突 嵴 柄,功能区: mRNA结合位点: 原核生物:小亚基16S rRNA,能与mRNA结合 5端SD(Shine-Dalgarno)序列(核糖体结合位点,RBS)结合 真核生物:18S rRNA, A位:受位、氨基酰位 P位:供位、肽基位 T因子:肽基转移酶位 E位:tRNA释放位点,三、多肽链的合成,(一)氨基酰tRNA的合成 1.氨基酸活化 氨基酸ATP氨基酰腺苷酸 注:原核为甲酰甲硫氨酸,真核为甲硫
10、氨酸 2.氨基酰tRNA合成 氨基酰 + tRNA氨基酰tRNA 氨基酰tRNA合成酶有高度的特异性,特异性识别氨基酸和有特定反密码子的tRNA 同功受体tRNA:,(二)肽链合成的起始,1. mRNA与小亚基的结合 小亚基(30S)、IF3、IF1 + mRNA(RBS) IF3-mRNA-30S三元复合物 2. 30S起始复合物的形成 IF2 + GTP + IF3-mRNA(AUG) + fMet-tRNA 3. 70S起始复合物的形成 30S起始复合物50S亚基 GTP酶水解、IF1-3解离 30S + 50S + mRNA + fMet-tRNA,(三)肽链的延长 进位 fMettR
11、NAP位 下一个氨基酰tRNA进入A位 肽键形成 在23S rRNA肽基转移酶催化下,A位与P位氨基酰形成肽键 移位 在EF-G GTP酶催化下,A位氨基酰tRNA移到P位,并于E位释放从P位离开的tRNA 进位 空出的A位接纳下一个氨基酰tRNA,肽链的延伸,多聚核糖体,核糖体与多肽链的合成,(四)肽链的终止和释放 终止密码子出现释放因子(RF1、3)催化下肽链合成终止 (原核细胞),(五)多肽链合成后的加工和修饰 去除甲硫氨酸fMet,Met 折叠:氢键、离子键、二硫键 共价修饰:磷酸化、甲基化、乙酰化 剪接,第三节 基因表达的调控,原核基因的表达调控 操纵基因:实为一段阻遏物结合序列 调
12、节基因 表达调节蛋白 负调节 正调节 阻遏物 激活物 诱导物,操纵子基因表达调控机制 操纵基因:阻遏蛋白结合部位 操纵子 启 动 子:RNA聚合酶的结合部位 调节基因:编码阻遏蛋白的基因 结构基因:编码功能蛋白的基因 乳糖代谢 Z:控制-半乳糖苷酶合成 结构基因 Y:控制半乳糖通透酶合成 A:控制乙酰基转移酶合成,(一)转录水平调控,反式作用因子(trans-acting factor):转录因子 顺式作用元件(cis-acting element):调控DNA序列 启动子 增强子 沉默子 反应元件(response element):反式作用因子结合序列,(二)基因转录水平调控因素 (1)环境因素 (2)激素、细胞因子、神经递质 (3)染色质结构的
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