蛋白质结构与功能实验课_第1页
蛋白质结构与功能实验课_第2页
蛋白质结构与功能实验课_第3页
蛋白质结构与功能实验课_第4页
蛋白质结构与功能实验课_第5页
已阅读5页，还剩41页未读， 继续免费阅读

下载本文档

版权说明：本文档由用户提供并上传，收益归属内容提供方，若内容存在侵权，请进行举报或认领

文档简介

实例： 对 GFAP人胶质纤维酸性蛋白 （ glial fibrillary acidic protein)进行结构与功能预测网址 ： 点击 UniProGFAP命名与起源蛋白质属性注释 OMIMISOFORM 比对信息序列注释（特征）多态性， SNP位点全序列比对三维结构分析蛋白与蛋白相互作用数据库功能预测及家族注释Protsite数据库是基于对蛋白质家族中同源序列多重序列比对得到的保守性区域，这样区域通常与生物学功能有关，例如酶的活性位点、配体或金属结合位点等。因此， Prosite数据库实际上是蛋白质序列功能位点数据库。通过对 Prosite数据库的搜索，可判断该序列包含什么样的功能位点，从而推测其可能属于哪一个蛋白质家族。 Prosite数据库实际上包括两个数据库文件，一个为数据文件即 Prosite，该文件给出了能进行匹配的序列及序列的详细信息。另一个为说明文件 PrositeDoc， PrositeDoc说明文件中给出该序列模式的生物学功能及其文献资料来源。 Prosite数据库使用正则表达式来表示序列模式，例如： GSK-F-x(2)-LIVMF-x(4)-RKEQA-x(2)-RST-x-GA-x-KN-P-x-T.这里，方括号中为可选残基，如第一个方括号 GSK中 3个残基中甘氨酸 G、丝氨酸 S和赖氨酸 L中的任意一个均可出现。 x(2)表示可以有两个任意残基。 中列出不许出现的氨基酸。因此，序列片段GFxxLxxxxRxxRxGxKPxT是其中一种可能的模式 。 如何根据蛋白质位点和序列模式 (二次数据库）来鉴别一个未知功能的蛋白质序列应该属于哪一个蛋白质家族？
人人文库> 全部分类> 教育资料 > 辅导培训

温馨提示

  • 1. 本站所有资源如无特殊说明，都需要本地电脑安装OFFICE2007和PDF阅读器。图纸软件为CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
  • 2. 本站的文档不包含任何第三方提供的附件图纸等，如果需要附件，请联系上传者。文件的所有权益归上传用户所有。
  • 3. 本站RAR压缩包中若带图纸，网页内容里面会有图纸预览，若没有图纸预览就没有图纸。
  • 4. 未经权益所有人同意不得将文件中的内容挪作商业或盈利用途。
  • 5. 人人文库网仅提供信息存储空间，仅对用户上传内容的表现方式做保护处理，对用户上传分享的文档内容本身不做任何修改或编辑，并不能对任何下载内容负责。
  • 6. 下载文件中如有侵权或不适当内容，请与我们联系，我们立即纠正。
  • 7. 本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。

最新文档

评论

0/150

提交评论