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第四章 微生物优良菌种的选育,2019,-,1,微生物发酵的一般流程,2019,-,2,提纲,微生物优良生产菌种的特征 自然突变选育 诱变选育 原理 基本方法 杂交育种 细菌 放线菌 霉菌 酵母菌 原生质体融合 基因工程技术 基因表达系统 利用大肠杆菌的基因表达系统 利用酵母菌的基因表达系统 基因工程菌的稳定性,2019,-,3,优良菌种应具备的特征,对菌种的要求 天然菌种的生产性能较低,一般需要进行选育。 1.生产力:能在廉价的培养基上迅速生长,所需的代谢产 物的产量高,其它代谢产物少 2.操作性:培养条件简单,发酵易控制,产品易分离 3.稳定性:抗噬菌体能力强,菌种纯,不易变异退化 4.安全性:是非病源菌,不产有害生物活性物质或毒素,2019,-,4,优良菌种应具备的特征,选择生产菌种应注意的因素 1.原料方面:广,转化率高; 2.产物方面:目的产物含量高,副产物少; 3.菌体方面:生长快、繁殖力强,耐受力强,抗污染、抗噬菌体能力强,遗传特性稳定 4. 设备方面:产泡沫少,适宜大罐生产。 (培养条件异,周期短,需氧量小,抗污染能力强),2019,-,5,一、自然选育,利用微生物自然突变进行的菌种选育。 原因:多因素低剂量的诱变效应; 互变异构效应 结果:负变大于正变,应经常分离纯化 方法:菌悬液平板分离上摇瓶检测 选种保藏 优点:简单易行,可与生产同步进行。 缺点:频率低,10-810-9 /次分裂。,2019,-,6,二、诱变选育,诱导微生物发生突变进行的菌种选育,包括诱变和筛选两个步骤。 原理:染色体畸变;基因突变。 影响诱变的因素: 出发菌株(有一定生产能力,形态、生理强壮) ; 诱变剂的种类(单一或复合)与剂量(不宜过高和过 低,致死率:70-80)。 诱变剂:能提高基因突变频率的物理、化学、生物因子。 筛选比诱变更重要。 筛选的方法:通过选择/鉴别培养基加以识别。 初筛复筛确定最佳发酵条件(负变多,正变少),2019,-,7,、营养缺陷型突变株筛选,酶缺陷,结果造成中间产物积累; 解除协同反馈,使另一分支末端产物积累; 渗漏型突变(酶未完全丧失活性,下降),末端产物少,中间产物积累。,2019,-,8,、抗反馈阻遏和抗反馈抑制 突变株筛选,调节基因或操纵基因突变,产生的阻遏蛋白与终产物不能结合或结合; 结合,但不发生作用; 结构基因突变,使结构酶无结合能力但有催化活性; 方法:末端产物结构类似物筛选;(未突变者 死,突变为抗者,生并产菌落) 营养缺陷型回复突变株筛选。 (活性复,结构改变),2019,-,9,、组成型突变株筛选,诱导型依赖诱导物。组成型不依赖诱导物。 突变发生在调节基因或操纵基因,解除对诱导物的依赖,可获组成型突变株。 筛选方法:设计条件使组成型优势生长,或通过菌落分辨。 加诱导酶合成抑制物 交替培养法 显色反应法,2019,-,10,筛选方法,加诱导酶合成抑制物 如:加邻硝基-D-岩藻糖苷,抑制-半乳糖苷酶合成。 诱导型不能利用乳糖,不长;组成型产酶,能利用乳糖,生长,被富集。 交替培养法 含诱导物(乳糖)中培养组成型快不含诱导 物(葡萄糖)中培养诱导型失酶反复。 显色反应法 不含诱导物平板培养加底物分解(有颜色变 化)检出。,2019,-,11,.抗(敏感)性突变株筛选,包括:抗生素、金属离子、温度、噬菌体 抗生素抗性突变:提高产量; 抗噬菌体突变:消除噬菌体污染; (与噬菌体存在与否无关) 条件抗性突变:如温度,可提高产量; (温度敏感突变,高温呈营养缺陷表型) 物敏突变: 如:氟乙酸抑制顺乌头酸酶,氟乙酸敏感突变型, 顺乌头酸酶活性极低,更敏感,异柠檬酸产量 少,柠檬酸积累。,2019,-,12,三、杂交育种,长期诱变会使菌种生活能力下降。 借助有性重组,使不同菌株的遗传物质 得以交换(获优良性状集中的重组体)。 1.细菌的杂交育种 方法:转化、转导、F因子转导、R因子转移、接 合。获部分合子。 出发菌株需带遗传标记:营养缺陷、抗生素抗性、 温敏、发酵性能,2019,-,13,、放线菌的杂交育种,基因重组过程近似细菌,育种方法与霉菌相似 放线菌的遗传体系和杂交原理: 异核现象:同一细胞(菌丝)含不同基因型的核。无 重组体出现。 接合现象:发生部分染色体转移(交换),形成部分 合子。整+部分、部分+部分。 异核系的形成:部分合子产生的无性繁殖系。能在基 本或选择培养基上生长。 (单交换,二体区) 重组体的形成:异核系不稳定,可经过双交换形成重 组子,产生重组子孢子。,2019,-,14,放线菌的杂交方法,混合培养法:两互补缺陷型亲株混合培养,制孢 子悬液,选择性平板分离。 平板杂交法:一亲株培养,形成孢子,影印至已 分别铺有另几种孢子的平板上,获 孢子后再影印至选择平板上。 玻璃纸转移法:两亲本需要双标记,混合带纸培 养,未长气生菌丝时,纸移至一选 择平板,获异核系。解剖镜下,小 针收集小菌丝,于完全平板涂布, 获分离子。,2019,-,15,、霉菌的杂交育种,准性生殖过程:不通过有性生殖的基因重组过程 异核体的形成:两不同性状细胞(菌丝)连接,导致一 细胞存在两个不同遗传型核。 杂合二倍体形成;异核体偶尔发生不同核的融合,形成 杂合核,为双倍体。 菌丝成斑点、扇面扇变。 体细胞重组:杂合二倍体只具有相对稳定性,繁殖过程 发生染色体交换,单倍化,形成各种分 离子。 准性生殖的单倍体化是一个渐变过程,需要多次分 裂,形成双倍体、非整倍体、单倍体等分离子。,2019,-,16,霉菌的杂交技术,诱变获具标记的亲本。 异核体的形成:基本培养基上,强迫进行 营养互补。还可用多种方法。 双倍体检出:可从扇面上挑孢子分离。 分离子检出:杂合二倍体单孢子平板分 离,检菌落斑点或扇面,斑点处挑孢 子至斜面,再纯化鉴别。,2019,-,17,、酵母菌的杂交育种,双单特性:存在单倍体和二倍体的生活史 二倍体生活力强,生产能力高,可 通过杂交得二倍体来育种。 方法:获单倍体细胞;杂交。 杂交方式:孢子与孢子;孢子与单倍体细胞; 单倍体细胞间。,2019,-,18,四、原生质体融合育种,借助原生质融合技术实现遗传物质的交换 .原生质体融合的优越性: 受限制小; 重组频率高; 遗传物质传递更充分; 可先用理化因子处理; 其诱变率更高。 .原生质体融合法: 原生质体制备 原生质体融合和再生 融合子的检出 .原生质体融合技术在微生物育种中的应用: 选育高产优质菌株 产生新的产物,2019,-,19,五、基因工程育种,定向育种,技术含量高,应用面广。 应用:解决了一些药物或材料来源困难,或制造技术复杂,或造价昂贵而无法大量生产和应用的问题。 产生了巨大的经济和社会效益。 工业生产的意义: 基因的表达产量; 表达产物的稳定性; 产物的生物活性; 产物分离纯化。 (一)基因表达系统 从育种的角度考虑,最重要的是目的基因的高效表达。 .原核表达系统;.真核表达系统,2019,-,20,、原核表达系统,原核生物不适宜表达需后加工处理的那一部分真核基因 不能切除mRNA的内含子; 不能进行蛋白质的糖基化; 不能对氨基酸进行修饰。 大肠杆菌:遗传背景清楚;基因操作简便; 易培养,世代短,生长快;适宜大规模生产 注意:真核蛋白后修饰; 多为胞内产物;产物分离纯 化困难;内毒素;蛋白酶破坏产物;免疫反应。 枯草芽孢杆菌:分泌能力强;胞外蛋白酶强 链霉菌:使用安全;分泌能力强;具有糖基化能力,2019,-,21,、真核表达系统,产生的蛋白质与天然蛋白质具有一致的生理生化功能 酵母:真核生物蛋白质的最佳表达系统 优点:基因组小,操作方便; 世代周期短,易培养; 有单、双倍体形式;能糖基化;能分泌产物到胞外。 应用:干扰素、乙肝表面抗原基因已经成功表达; 酿酒酵母研究、应用最广泛。 丝状真菌: 特点:能进行翻译后加工; 表达产物分泌能力强; 安全; 发酵、纯化工艺成熟。,2019,-,22,(二)利用大肠杆菌的基因表达系统,.表达载体 条件: 能独立复制; 有灵活的多克隆位点和方便的筛选标记,位点位 于 起动子后; 有很强的起动子,能被大肠杆菌的RNA聚合酶识别; 有使起动子受抑制的阻遏子,受诱导时才转录,可人 为的通过理化因素选择启动时机; 有很强的终止子,使RNA聚合酶集中力量转录克隆 的外源基因;克服质粒高转录引起的质粒不稳定。 产生的mRNA须有翻译的起始信号,即起始密码 AUG和SD序列。,2019,-,23,、影响目的基因在大肠杆菌中表达的因素,目的基因的表达产量与每个细胞平均表达量 和细胞浓度正相关。 影响因素: 外源基因的拷贝数; 外源基因的表达频率: 启动子的强度; AUG和SD序列的间距; 密码子的组成; 核糖体结合位点的有效性 表达产物的稳定性; 细胞的代谢负荷。,2019,-,24,、在大肠杆菌中真核基因的表达形式,融合蛋白:N端原核序列,C端真核序列 表达高效、稳定,但影响免疫原性,可酶切。 非融合蛋白:保持生物活性,但易被水解 N端常带甲硫氨酸,引起人体免疫反应。 分泌表达蛋白:使外源基因位于原核蛋白 信号肽下游(连接、构建)。 在周质空间酶切,释放产物。,2019,-,25,(三)利用酵母菌的基因表达系统,.载体系统:多用穿梭载体,同时带有细菌和酵母复制原点和选择标记,在两者中复制、选择。 克隆载体的复制序列 酵母附加质粒(YEP) 酵母复制型质粒(YRP) 酵母着丝粒质粒(YCP) 酵母整合型质粒(YIP),2019,-,26,.载体系统,表达载体 在克隆载体中插入酵母表达盒和终止子等调控序列,即 可构建酵母表达载体。 需糖基化才有生物功能的重组蛋白必须是分泌型蛋白. 要在外源DNA上游加前导肽序列。 用啤酒酵母表达分泌型外源蛋白时,要求前导肽C端是赖精,其内切酶可识,切。 如:水蛭素(强抗凝剂,溶栓药物)用al因子前导肽(编码酵母交配类型因子的前导肽)基因附加型质粒载体,在酵母细胞中成功表达。,2019,-,27,、影响外源基因在酵母中表达的因素,外源基因的拷贝数:拷贝数,稳定性,整合位置; 外源基因的表达频率: 启动子:有上游激活序列、TATA序列、起始密码子; 分泌信号:包括信号肽、前导肽序列; 终止序列:合成基因须加或利用载体上的; 外源蛋白的糖基化:分泌过程中发生N-糖苷键和O-糖苷键连接的两种糖基化,其产物与天然产物完全相同 宿主菌株的影响:生长力强、内源蛋白酶弱、性能稳定、分泌力强,用二、多倍体。,2019,-,28,(四)基因工程菌的稳定性,分裂不稳定:分裂时,出现一定比例不含质粒的子代菌; 结构不稳定:指外源基因从质粒上丢失、碱基重排或缺失。 1.产生原因:(常见是分裂不稳定) 产不含质粒的子代菌的频率; 两种菌的比生长速率。 质粒拷贝数低时,可增加,但不宜太高(生长负势 )。 条件有利,高比生长速率,拷贝数降低,但更稳定。 质粒拷贝数过高,增加转录、翻译负担,产物未必增加。 2.提高质粒稳定性的方法: 两段培养法(先长菌,后表达); 控制培养条件(温度、PH、培养基组分、溶解氧)。,2019,-,29,本章知识结构,1、微生物优良生产菌种的特征 2、自然突变选育 3、 诱变选育 4、 杂交育种 5、原生质体融合

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