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文档简介

初学perl语言，感觉提取文本矩阵的某些行或者列还是比较有用的。下面是举一些具体的例子，供大家学习参考。第一：提取含有某个关键字的行：复制代码代码如下:#!/usr/bin/perlopen FILE, E:/SNP.txt ;open OUT1,+E:/file3.txt;foreach () pairs=split(/ /, $_);$count=pairs;if($pairs$count-1 = m/reference$/) print OUT1 $_,n;close(FILE);close(OUT1);第二：提取指定的某些列（提取1 2 3 5列）：复制代码代码如下:#!/usr/bin/perlopen(INFILE, E:/file3.txt);open(OUTFILE, E:/file4.txt)| die Cannot open the newfile: $!n;while () a = split( ); print OUTFILE $a0t $a1t $a2t $a4n;exit;第三：去掉文本中有空行的命令：复制代码代码如下:#!/usr/bin/perlopen(INFILE, E:/file3.txt);open(OUTFILE, E:/file4.txt)| die Cannot open the newfile: $!n;while () if (!/$/) print OUTFILE $_;exit;第四：自己编写的提取文本中含有某个关键字的命令（感觉比较实用）：复制代码代码如下:#!/usr/bin/perlopen FILE, E:/chr_2.txt ;open OUT1,+E:/chr_2_refference.txt;foreach () if(/reference$/) print OUT1 $_,n;close(FILE);close(OUT1);第五：提取文本中非字符行的命令：复制代码代码如下:#!/usr/bin/perlopen(INFILE, E:/最后得到的SNP/chr_X.txt);open(OUTFILE, E:/去掉LOC以后得到的最后SNP/chr_X.txt)| die Cannot open the newfile:
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