《医学文献检索》PPT课件.ppt

医学文献检索,黄芳 首都医科大学图书馆 83911295,主要内容,1 常用数据库介绍 2 检索方法与技术 3 获取全文的途径 4 文献管理软件,1 常用数据库,中文文摘数据库：SINOMED、CMCC 中文全文数据库：CNKI、万方、维普 英文文摘数据库：PUBMED、EMBASE、SCI、 IPA 英文全文数据库：Sciencedirect、Springer、 EBSCO、Nature、BMJ、LWW 引文数据库：SCI、CMCI 循证医学库: EBMR、 BMJ Best Practice,视频数据库 好医生视频库 知识视界 网上报告厅,事实数据库：MD Consult、 MICROMEDEX事实数据库、 临床医药学知识互动平台（CMKD）、 Imaging Consult影像学数据库 Springer Protocols实验室指南,中文文摘型数据库-SINOMED,中国生物医学文献数据 中国医学科普文献数据库（收录2000年以来国内出版的医学科普期刊近百种 ） 北京协和医学院博硕学位论文库（收录1981年以来协和医学院培养的博士、硕士研究生学位论文，可在线浏览前30页全文 ） ,检索途径,基本检索 主题检索 分类检索 期刊检索 作者检索 检索历史,特点：文摘型数据库，收录医学和生物学文献全，检索途径多，有主题词检索，有部分全文链接 是查新的必查数据库,国内主要全文数据库,收录有原始文献全文的数据库，以期刊论文、会议论文、政府出版物、研究报告、法律条文和案例、商业信息等为主 可以直接从数据库里获取全文,CNKI的中国学术文献网络出版总库 万方数据资源系统 维普中文科技期刊数据库,共同的特点,CNKI和维普有自己的专用格式，必需安装专门的CAJ和VIP浏览器 全文都可以用PDF格式的浏览器阅览，软件为Acrobat Reader，免费软件 三大出版商收录期刊的重复率较高 检索功能不够强大,万方独有的数据库-中华医学会数字化期刊,中华医学会主办且享有版权的 115 种医学期刊。 53 种期刊入选北京大学图书馆2004年版中文核心期刊要目总览。 84 种期刊入选为2007年版中国科技期刊引证报告（核心版）的统计源期刊。 19 种期刊入选“第六届中国百种杰出学术期刊（医药卫生类共计28种）”，12篇论文入选“第一届中国百篇最具影响优秀国内学术论文”。,英文文摘型数据库,PUBMED EMBASE WEB OF KNOWLEDGE,外文文摘型数据库PUBMED,PubMed由国立医学图书馆 （National Library of Medcine)下属的美国国立生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information，NCBI)开发的网络检索系统 基于Entrez检索平台提供服务,其中PubMed于1997年6月开始在因特网上向全球用户免费开放，访问网址为：/pubmed,英文文摘型数据库-EMBASE,EMBASE是由荷兰阿姆斯特丹市的艾斯维尔科学出版社（Elsevier Science B.V.）编辑出版的大型生物医学及药学文献书目数据库 目前EMBASE收录了1974年以来70多个国家或地区出版的3800多种期刊上的医药文献题录和文摘，覆盖各种疾病和药物信息，药物文献尤其突出，约占40%以上 收刊范围广泛，涵盖了大量欧美国家的医学刊物,数据库特点 EMBASE突出药物文献和药物信息，而MEDLINE更侧重于临床医学、牙科、卫生护理学等方面； EMBASE涵盖了更多欧洲和远东地区的文献，而MEDLINE是全面权威的北美文献汇总； EMBASE与MEDLINE大约有30%多的文献交叉重复；,英文文摘型数据库-SCI,也是引文数据库 平台是WEB OF KNOWLEDGE 以Web of Science ( ISI 著名的三大引文索引 Science Citation Index Expanded, Social Science Citation Index, Arts & Humanities Citation Index)为核心,独特的引文检索、主题检索、化学结构检索、基于内容与引文的跨库交叉浏览、检索结果的信息分析、定题跟踪Alerting服务、检索结果的信息管理 ( EndNote, Reference Manager, ProCite, WriteNote) 等,（1）通过文献间的引用和被引用关系，了解某一学术问题或观点的起源、发展、修正及最新的研究进展。,（2）评价科学文献、学术期刊和专著的学术水平的参考工具。 一般来说，高质量的学术期刊的被引频次较高。根据引文索引提供的引证数据有助于评价科技期刊的质量，确定某个学科的核心期刊。,（3）作为科研机构和科研人员绩效评价的参考工具。 引文索引有助于评价科学著作的价值和生命力、科学工作者的能力及其研究工作所产生的社会效果。 科研机构被SCI收录的论文总量，反映整个机构的科研、尤其是基础研究的水平；个人的论文被SCI收录的数量及被引用次数，反映他的研究能力与学术水平。,（4）作为文献检索的一种工具 引文索引提供了一种全新的文献检索手段，即从已知的某一作者的一篇论文开始，查到所有引用过这一论文的其他论文，再以这些引用论文的作者为新的检索起点，查到更多的被引论文。经过多轮循环，可以检索到大量相关的文献线索。,包括JCR（期刊引用报告）和ESI JCR对包括SCI收录的3500种期刊在内的4700种期刊之间的引用和被引用数据进行统计、运算，并针对每种期刊定义了影响因子（Impact Factor）等指数加以报道。 JCR客观地统计Web of Science收录期刊所刊载论文的数量、论文参考文献的数量、论文的被引用次数等原始数据，再应用文献计量学的原理，计算出各种期刊的影响因子、被引半衰期等反映期刊质量和影响的定量指标。,Essential Science Indicators 分为四个主要部分： 引文排名：使用合计引用次数和每篇论文的引用次数，确定被引频次最多的作者、机构、国家/地区和期刊的排名。 最常引用的论文：此分析提供一系列引用最频繁的论文和热门论文。论文是基于特定科学领域和时间段的百分比排名选择的。 引文分析：此分析包括“原始资料”和“研究趋势”以识别常被引用的论文并跟踪当前的研究趋势。 评论：这些简短评论为数据分析和解释提供指南。这些信息增强了前几部分提供的表、图表和其他数据集的效用。,英文文摘型数据库-IPA,IPA（国际药学文摘）由美国卫生系统药剂师协会主办 ，收录内容主要包括世界上全面的药学科学和健康相关文献的书籍目录、三十年来世界药学领域的参考文献、药学专业期刊以及一些重要的药学会议上的演示稿摘要等。 收录1970年以来的约350,000条记录，且以每天10,000条记录的速度增长 数据每月更新。 OVID平台,英文全文数据库,一类是数据库集成商（如EBSCO等），由数据库集成商提供的电子期刊全文数据库，往往会存在“滞后（embargo, delay）”现象，即出版商出于版权考虑，限制全文上网的时间，使得某些电子期刊最初只能提供给读者文摘或部分全文，影响读者查阅。 二类是出版商（如Elsevier, LWW等），由出版商提供的电子期刊全文数据库不存在“滞后”现象。,ScienceDirect电子期刊：1664种、 Springer-LINK：1158种（274种） EBSCO Academic Search Premier数据库： Nature电子期刊：39种 BMJ电子期刊：23种 美国冷泉港实验室电子期刊：5种 美国化学学会电子期刊：24种 英国皇家化学学会电子期刊：25种 LWW电子期刊：267种,引文数据库,CMCI 将原CMCC、CMCI功能进行整合，并实现了文献检索、引证分析、相关文献查询一体化，可出具引证报告。 新增词义扩展检索、检索结果统计分析等实用功能，并提供全文接口。,循证医学库,“循证医学是慎重、准确和明智地应用当前最佳的研究证据来确定患者的治疗措施”。 Prof. David Sackett , 1996年发表于BMJ “Evidence based medicine is the “conscientious, explicit and judicious use of current best evidence in making decisions about individual patients”. Sackett DL et al 1996,EBM特点： 1.任何临床决策都建立在科学研究证据的基础上； 2.注重将最佳证据与临床经验结合，灵活应用于病患个体； 3.以病患为中心，既考虑病患的身体，还要考虑心理承受能力； 4.病患对医生的诊疗有知情权;也有权力和能力了解最佳证据。,检索证据常用的主题词： 随机对照试验 临床对照试验 双盲法 单盲法 随机分配 Meta分析(主题),一次研究证据：Pubmed embase cbm NRR等 二次研究证据： 数据库：Cochrane Library（两个平台： wiley平台和Ovid平台） 期刊：EBM ACP journal club(ovid平台) 指南：NGC,事实数据库,MICROMEDEX 3个数据库为美国国会指定的官方医药百科全书 DrugDex Poisindex DiseaseDex Emergency Medicine,第一类：Drug Information（药品信息咨询）,包括的专门数据库有DRUGDEX System（药品报道）、DRUG-REAX System（药物相互作用）、MARTINDALE（药典）、PDR（医师药物参考）、Index Nominum System（全球药物字典）、P&T QUIK Reports（药事委员会报告）、USP DI（药物参考指南）、IDENTIDEX System（片剂及胶囊辨识系统）、IV INDEX System（混合静脉注射指南）、KINETIDEX（治疗性药物监测）、MSDS from USP（原料安全资料报告）、Dosing & Therapeutic Tools（药物剂量换算及疾病诊疗经典工具）等,以上数据库涵盖了临床各科用药（含全球西药及部分中药）的最新药物评价，包括给药剂量、药代动力学、药物使用的注意事项、药物交互作用、药效分析比较等信息，并提供正在进行临床试验的新药信息等。,第二类：Disease Information（疾病信息咨询）,包括的专门数据库有DISEASEDEX General Medicine System（一般疾病诊疗信息）、DISEASE Emergency Medicine System（急诊医学诊疗信息),以上数据库主要提供门诊、住院医生一个完整的病史疗程建议，其中包含平常的卫生保健、病发时的诊疗方式、疾病发展的预测等，也提供急诊医学信息，通过提供临床症状描述、生化检验结果、治疗模式等信息，使医生能在最短时间内作出快速有效地诊断及治疗判断,第三类：Toxicology Information（毒理学信息咨询）,包括的专门数据库有POISINDEX System（毒物、药品及生物产品鉴定及毒物管理系统）、TOMES（毒理学、职业医学及环境系统）、REPRORISK System（化学物质对生殖及胎儿影响）。,以上数据库主要提供百万多种商品药物、毒物的成分鉴定、中毒治疗、毒物管理、造成胎儿致畸的药物和化学物质等信息,第四类：Complementary & Alternative Medicine Information（另类/传统医学信息咨询）,包括的专门数据库有：AltMedDex System（草药及补充疗法系统）、AltCareDex System（病患另类/传统医学教育系统）、AltMed-REAX for the Patient及AltMed-REAX for the Professional（草药与其它物质交互作用信息）。,以上数据库提供传统中草药、维他命、矿物质、其它健康食品医疗等相关信息，也包括草药与西药、食物、酒精等交互作用的相关信息,第五类：Patient Education Information（病患教育信息咨询）,包括的专门数据库有CareNotes System（病患疾病及服药咨询） 以上数据库提供病人疾病和服药的相关知识、入院及出院注意事项及长期医疗照顾需知,HealthCare Series系列数据库的检索方法简介,一般术语、疾病、状态、药物、症状或副作用。 例子： 疾病：lymphocytic 药物：taxol, tenormin 症状：fever, rash 副作用：incontinence, vomiting 毒物：fertilizer, sulfuric acid 注意：请勿键入and、or,检索结果,MARTINDALE - The Complete Drug Reference,MD CONSULT 爱思唯尔公司于1997年推出的医学咨询平台，包含50多部著名医学参考书，88种全文医学期刊和北美临床系列杂志，10000篇患者手册，1000份诊疗指南，以及持续更新的药品信息，医学新闻，并支持PDA功能，为医生解答医学及科研问题，让医生紧贴第一手医学发展信息，并迅速以其优质的内容和方便时效的服务赢得了很高的声誉。,MD Consult包含哪些内容？,一、First Consult 二、参考书籍（Books） 三、医学期刊（Journals） 四、北美临床杂志（The Clinics） 五、病人教育（Patient Education）,六、药物库（Drugs） 七、诊疗指南（Guidelines） 八、医学图片（Images） 九、医学新闻（News） 十、继续医学教育（CME）,视频数据库,好医生医学点播课堂 引进美国医学教育学术视频，同时结合国内医学的真实案例，开发出医学点播课程系列产品，把国际国内最新，最前沿的医学教育资源提供给在校师生。,2 检索方法与技术,检索途径 主题词检索 美国国立医学图书馆（National Library of Medicine，简称NLM）编辑的医学主题词表（Medical Subject Headings，MeSH） 中国中医研究院的中医药主题词表,分类检索 关键词（或自由词）检索 著者检索 引文检索 机构检索 刊名检索 序号检索,布尔逻辑检索 布尔逻辑检索是应用布尔逻辑运算符（boolean operators）对检索词进行逻辑组配，表达检索词之间的逻辑关系的一种检索技术。 常用的组配符有：AND（与）、OR（或）、NOT（非）三种,位置算符 位置算符（proximity operators，positional operators，adjacent operators）又称邻近符，表示限制检索词在记录中的间隔距离。,字段限定 字段限定检索则是在指定的字段中进行检索，这样使检索结果更加精确。,截词检索和通配检索 为使检索时不遗漏相关词，提高检索效率，一般信息检索系统都利用了截词技术 利用截词符（truncation symbol）或通配符（wildcard symbol）,在不同的检索系统里用不同的符号，一般为：*、?、#、$ 用逻辑OR对词头同、词尾不同的词汇进行检索 可以避免漏检，另一方面也避免了多次输入的麻烦,全文检索 直接对全文进行检索，从而更加深入到语言细节中 它扩展了用户查询的自由度，使用户能对原文的所有内容进行检索 检索更直接、彻底,优先算符 nesting（ ） 用括号将优先检索的检索式括起来，系统首先检索括号中的概念 优先级别最高,3 获取全文的途径,中西文电子期刊目录及馆藏目录 利用网络免费资源 利用联合目录 全文传递 直接向作者索取,查找全文的方法,1.利用图书馆主页上的中西文电子期刊目录及馆藏目录 若馆藏有要找的刊，可以到相应阅览室或数据库中查找需要的文献,2.利用网络免费全文资源,通过GOOGLE 学术搜索 直接在搜索栏里输入文章的Title，如果有免费链接直接下载文章,3.利用我馆提供的全文传递服务,NSTL国家科技图书文献中心 BALIS全文传递中心,利用联合目录,例如：statistics in medicine 全国期刊联合目录41/Union/ 图书馆主页上“馆藏数据库”中的CCCCALIS西文期刊目次数据库/ 在联合目录里查询到所需文献的收藏馆以后，直接通过电话、传真、电子邮件等方式与收藏有该文献图书馆的馆际互借工作人员联系，通过馆际互借获得全文,直接向作者索取,现在检索出的文献一般有著者的联系方式，如通讯地址和电子邮箱等。如果所需文献确实难以找到，可以直接和著者联系以获取原文,4 文献管理软件,Endnote Reference Manager ProCite 历史久，起步早，功能强大 对中国人使用环境和习惯考虑不周，学习成本较高 NoteExpress北京爱琴海软件公司 容易上手，对中文环境支持非常好,文献管理软件,文献管理软件集文献检索、收集、整理以及导入、导出功能于一体，能帮助用户高效管理和快速生成参考文献,NoteExpress 是国内专业的文献检索与管理软件，完全支持中文 NoteExpress 可以帮助读者通过各种方途径高效，自动的搜索（含互联网），下载，管理文献资料和论文。 该软件可