《MEDLINE教学幻灯》PPT课件.ppt

Ovid MEDLINE 检索系统,授课教员： 图书馆 孙金立,对研究生基本要求,能够说出MEDLINE特点 能够阐述MEDLINE运算符含义 能够阐述该数据库主题词表功能,一概况,点击,点击,1.一般情况,收录的期刊数等 是中等规模的数据库 但是最权威的生物医学外文数据库,基础医学 临床医学 环境医学 营养卫生 职业病学 药学 医疗保健 护理学 牙科学等,收录的范围,1.一般情况,1.一般情况,IM,EM,BA,CA,IM,MEDLINE,PubMed,MEDLINEPLUS,MEDLINE数据库有许多种商业公司的版本，Ovid MEDLINE是国内引进最多的。 由美国国立医学图书馆编辑出版NLM: National Library of Medicine.。 NIH、 NLM 、NCBI,年限:1948年以来 查更早的文献可以参考手工检索工具刊 也可查pubmed-old medline,包括三种重要索引,INDEX TO DENTAL LITERATURE,INTERNATIONAL NURSING INDEX.,2背景知识,LSTRC “文献选摘技术评述委员会”,负责IM的文献选择,主题词的增、删、改,各主题领域的覆盖情况,期刊评选与筛选等工作。,主题词:SUBJECT TERM (HEADINGS) 叙词: DESCRIPTOR; 款目词: ENTRY; 副主题词:SUBHEADING。,主题词表, MeSH: MEDICAL SUBJECT HEADINGS.,主题词 对同义词的规范 cancer carcinoma tumor 用neoplasms,近义词:education; teaching 下位词: Hepatitis , Alcoholic Chronic see Hepatitis , Alcoholic。 主题词表结构：（以MeSH为例） 字顺表：alphabetic list 范畴表：tree structure,副主题词 副主题词是规定的 而且只能同一定的主题词相配,二、数据库结构,请注意限定性字段与 非限定性字段的区别 限定性字段由MEDLINE规定,AB Abstract AD Address of Author AN Accession Number AU Author CM Comments CN Contract or Grant Numbers CP Country of Publication GS Gene Symbol IS International Standard Serial Number LA Language MESH Medical Subject Descriptors MIME Minor MeSH Descriptors MJME Major MeSH Descriptors,NM Name of Substance PS Personal Name as Subject PT Publication Type PY Publication Year RN CAS Registry Number or EC Number SB Subset SH Subheadings SI Secondary Source Identifier SO Source TG Check Tags TI Title UD Update Code XREC Record Features,限定性字段可以进行精确检索 limit 1 to “review articles“ -+Search terms used: eye Tree electric eye electric eyes eyes private eye private eyes,eyeball globe eyeball structure ocular structure eye structure Search Returned: 1947 results,注意精确检索与非精确检索（IN）的区别，非精确检索可用于限定性字段及非限定性字段 LA = ENGLISH EYE IN TI,三功能键映射的操作,F1：帮助：在检索中遇到困难，可随时寻求帮助，F1中有各种检索指令、策略、功能键的说明。 F2：基本检索：可以对任意词进行检索，包括自由词、主题词、著者、符号等进行独立检索，可以用运算符进行组配检索。 F3：在单机版中为数据库使用指南，介绍数据库结构、各字段一览表、禁用词等。在联机版中可以联想指南，在菜单中。 F4：显示检索结果，并可对记录进行标记。,3MEDLINE光盘功能键,F5：索引：除禁用词外，对记录中的一切单词、连接词进行排序，为选择检索词提供检索。 F6：打印全部记录、指定范围记录或选中记录。 F7：重新启动检索系统。 F8：重新选择检索年代。,F9：主题词表，用于主题词检索，不同于自由词检索。 F10：在单机版中显示命令菜单。 F11：对全部记录、指定范围记录或选中记录进行存盘。 F12：清除检索式。,四MEDLINE光盘 检索运算符,布尔逻辑 and A and B A、B检索词同时出现于同一个记录中。,布尔逻辑检索,AND：A AND B 例如：eye and laser,EYE AND LASER 10384,EYE adj3 LASER 296,EYE adj4 LASER 741,EYE adj5 LASER 2784,EYE AND LASER 10384,MEDLINE光盘 检索运算符,adjn,A adjn B,A、B最多插入n-1个词，词序可以颠倒。,MEDLINE光盘 检索运算符,布尔逻辑 or A or B 记录中出现A或B中的一个或两个均为命中。,OR：A OR B 例如: eye or nose,not A not B：记录中出现A不出现B,MEDLINE光盘 检索运算符,NOT：A NOT B 例如：human not animal 优先级运算 （）NOTANDOR,字段限定符： Search Fields 复选或下拉菜单,MEDLINE光盘 检索运算符,无限截词和有限截词 $: comput$ $n: comput$2,MEDLINE光盘 检索运算符,通配符 强制通配符# 必须出现 Wom#n 可选通配符？： 可以出现或不出现 colo?r,MEDLINE光盘 检索运算符,词频 blood.ti./freq=3 双引号 括号,MEDLINE光盘 检索运算符,1.MEDLINE是最重要的外文数据库 2.操作部分到实习课去解决 3.检索运算符要能够熟练使用,要点提示,IM引用期刊表:list of Journals indexed in IM Journal action Abbreviation listing Full title listing Subject headings list Subject listing Geographic listing,五、来源期刊,American heart journal pISSN: 0002-8703 eISSN: 1097-6744 Title Abbreviation: Am Heart J ISO Abbreviation: Am. Heart J. NLM ID: 0370465,Related Journals Circulation. J Am Coll Cardiol Am J Cardiol N Engl J Med,Only PubMed Journals Currently indexed in MEDLINE PubMed Central Journals PubMed Central Forthcoming Journals Consumer Health Journals Core Clinical Journals (AIM) Dental Journals Index Medicus Journals (IM) Journals Indexed from the Electronic Version Nursing Journals,Title: Ai zheng = Aizheng = Chinese journal of cancer,据研究，MEDLINE收录的科技期刊中，99.1%要求有摘要。 要求摘要是结构式摘要的占有摘要总论文数的64% 要求按照“目的、方法、结果、结论”来写摘要的占结构式摘要的73%。,MEDLINE收录中文期刊 373种,六、主题词表,1简介,关于主题词、副主题词、叙词表（主题词表）的有关概念请复习有关部分。 MEDLINE的机检主题词表将美国国立医学图书馆（U.S. National Library of Medicine）出版的医学主题词表（MeSH）制作在系统内上，有的系统出现Thesaurus，常译为叙词表。,主题词表是显示主题词词间语义关系的规范化、动态性检索语言词表，主题词经过严格规范并每年更新，参照关系严密。,语义关系,同义关系：两个或两个以上的词表达的概念相同，彼此之间可以相互替代的一种关系。如狂犬病与恐水症,语义关系,属分关系：概念外延包容与被包容的关系。上位概念与下位概念之间可称为广义词与狭义词,相关关系：表达交叉、矛盾、对立与统一、形式与内容、本质与现象、原因结果等概念之间内在联系的关系。,语义关系,交叉：平均寿命与期望寿命 近义：传染病与流行病 对立：污染与净化 因果：吸烟与肺肿瘤 人与事物：易感人群与预防接种 理论应用：免疫学与移植免疫,2轮排索引 （1）简介,轮排索引是主题词及款目词（非正式主题词）的字顺表，即将主题词、款目词（非正式主题词）完全按照其英文的字顺排列，而不管其它因素。主题词每年更新，一般在16000个左右。,主题词在有英美等不同拼写方法时一般采用美式拼法，如用color而不用colour。主题词或款目词可以是词组型，可以是自然语序，如Lung Abscess(肺脓肿)等。 而为了使概念相近主题词集中排列，便于族性检索，对某些词组型复合主题词采用与自然语序不同的倒置形式,（2）用代参照,在轮排词表片段中，有很多如：cancer of the bone see bone neoplasms形式出现，其表示的是一种参照关系，用参照符号“see“表示的参照关系称之为用代参照。 用代参照将不规范的款目词(自然词)转化为规范的主题词, 一般可规范同义关系、近义关系及包含关系。,同义关系规范最常见，如： AIDS see Acquired Immunodeficiency Syndrome (简称见繁称) Vitamin C see Ascorbic Acid (俗名见学名) 近义关系规范也非常重要，如 Cancer see Neoplasms表示了对概念接近的两个名词进行的规范。 包含关系规范如：Hepatitis , Alcoholic Chronic see Hepatitis , Alcoholic。,（3）轮排的含义与意义,轮排的含义为：对于词组型的主题词，其组成词组的每一个单词都可作为入口词参与排序，而不是仅仅依照其自然语序的第一个词作为入口词进行排序。 轮排的意义在于使词组型的主题词出现频率增多，使检索到该主题词的几率增加，从而增加检索效率。,3. Scope Note,可进入注释界面,（1）主题词注释,Term notes: 注释 一系列的项目,（2）主题词定义,DEFINITION OF TERM 机检主题词表为绝大多数的主题词提供了英文的定义，如输入航空航天医学Aerospace Medicine，可见： SCOPE: That branch of medicine dealing with the studies and effects of flight through the atmosphere or in space upon the human body and with the prevention or cure of,（2）主题词定义,physiological or psychological malfunctions arising from these effects. (from NASA Thesaurus) NOTE: specialty; med, physiol or psychol aspects of AVIATION go here but med, physiol or psychol aspects of space flight go under SPACE FLIGHT or other space related terms: Manual 28.8; DF: AEROSPACE MED,Antibodies, Monoclonal DEFINITION OF TERM: Antibodies produced by clones of cells such as those isolated after hybridization of activated B LYMPHOCYTES with neoplastic cells. These hybrids are often referred to as HYBRIDOMAS.,Hybridomas DEFINITION OF TERM: Cells artificially(人工的） created by fusion of activated lymphocytes with neoplastic cells. The resulting hybrid cells are cloned and produce pure or “monoclonal“ antibodies or T-cell products, identical to those produced by the immunologically competent parent, and continually grow and divide as the neoplastic parent.,仔细阅读主题词定义是非常重要，如在机检主题词表中输入DIC这个常见的英文缩写，本意是要检索播散性血管内凝血，但词表通过用代参照将之引导到Dacarbazine下。,主题词定义,其定义为An antineoplastic agent. It has significant activity against melanomas. (from Martindale, The Extra Pharmacopoeia, 31st ed, p564)，是一种抗种瘤制剂。如果没有注意到其定义就检索，就会造成误检。 少数的常见的主题词没有定义，如eye、mouth等,（3）不同词源的词根相关参照,由于相对应的同一个主题的词根具有多个不同的词源，机检主题词表为此设置了相关参照，如输入heart一词，可见：consider also terms at CARDI- and MYOCARDI-，这为正解选择主题词提供了方便。,Lung consider also terms at PNEUMO- and PULMON- Kidney consider also terms at GLOMERUL-, NEPHR-, PYEL-, and RENAL.,Brain consider also terms at CEREBR- and ENCEPHAL-. Liver: consider also terms at HEPAT-.,款目词中也有 不同词源线索 如:”光”,（4）历史注释,由于主题词是不断更新的，有增、删、改的变化，机检主题词表为此设立了注释。如单克隆抗体在不同的时期有不同的主题标引，输入Antibodies, Monoclonal 一词，可见PREVIOUS INDEXING: Antibodies (1975-1981); B Lymphocytes (1975-1981) ，说明在1975-1981年要用Antibodies一词或B Lymphocytes进行主题词检索。,Dacarbazine PREVIOUS INDEXING: Amides (1966-1974); Azo Compounds (1966-1972); Imidazoles (1966-1974); Triazenes (1972-1974)TREE NUMBERS:,（5）树状结构号,树状结构号决定了主题词在树状结构表中的位置，在手工检索主题词表MeSH中是字顺表与范畴表（树状结构表）的联系点，在一些光盘数据库、联机数据库中可以进行检索，在本光盘版本中主要起标识的作用。,（6）相关参照,相关参照是在具有某种相关关系的主题词与主题词之间建立起参照联系，相关关系可以是交叉、矛盾、因果关系等。 如输入eye，可见,相关参照,RELATED TERM(S): Eye Manifestations Intraocular Pressure Refraction, Ocular Vision 与这些词建立了相关参照关系的主题词。,stomach,RELATED TERM(S): Fundoplication Gastrectomy Gastroenterostomy Gastrost .,用代参照逆参照,Aerospace Medicine USED FOR: Aviation Medicine Space Medicine Medicine, Aerospace Medicine, Aviation Medicine, Space,PHARMACOLOGIC ACTION,Antibodies, Monoclonal Immunologic Factors,4树形结构表,（1）含义,树状结构表亦可称为范畴表（Category Index）,是一种分类表。它将完全按字顺排列的主题词、副主题词（不包括款目词），按照其词义范畴及学科属性分入相应的类目中。,（2）类目,共15个大类,四大类 解剖、生物 疾病、药物,（3）显示,在数据库界面中，可显示所选主题词在树状结构中的位置，包括族首词(最上位的词)、直接上位词、直接下位词。,（3）显示,每个主题词可以在若干个词树中出现，依其本身的词属性而定。可显示全部树，+号后数字代表其下位词还有更下一位的词，在这一体系内，通过移动鼠标可以很方便的扩大或缩小检索主题词词树范围，而每一词树的上下位词及数量均可不同。,（4）检索,选定主题词后，可选择扩展检索或单个词检索，扩展检索（可选择向第几词树检索）亦可称为族性检索，即对选定词及其所有的下位词进行检索。主题词在树状结构表中的位置还决定了其可组配的副主题词范围，通过点击检索按钮即可选定副主题词。,（4）检索,还可选择加权检索 检索主要主题词,5副主题词表,共有82个副主题词，与主题词组配进行检索。 每个副主题词均有其使用范围，用树状结构号规定。 副主题词分类表可参考中文献检索，分类表将意义相近的副主题词集中排列起来。,要充分注意副主题词 自然成类属性,治疗 诊断 组织解剖 ,七、数据库检索,1、检索工具（主题词表） 2、基本检索 3. 高级检索,4、引文检索 5、多字段检索,1检索课题类型,（1）单主题词检索 （2）主题词与副主题词组配检索 （3）多主题词检索 （4）自由词检索 （5）自由词与主题词组配 （6）文中词检索 （7）其它：,（1）单主题词检索 检索atrophic gastritis萎缩性胃炎。经查该词的主题词形式为倒置型：gastritis， atrophic ，并有其定义、历史、树状结构号、树状结构等按菜单提示，配以全部副主题词（all subheadings）检索即可。,（2）主题词与副主题词组配检索 检索萎缩性胃炎诊断方面的文献 主题词萎缩性胃炎配以副主题词诊断 gastritis,atrophic/diagnosis 还可考虑的副主题词有：radiography, ultrasonography, radiomclide imaging, ultrasonography.,（3）多主题词检索。 肿瘤与PCR的关系 CANCER、CARCINOMA、TUMOR等用NEOPLASMS PCR用全称, 有下位类需要扩展,并配以全部副主题词 肿瘤需要扩展并配以全部副主题词： #1 explode neoplasms/all subheadings #2 explode “Polymerase-Chain-Reaction“/ all subheadings #3 pcr #4 #1 and (#2 or #3),（5）自由词与主题词组配 见（3） （6）文中词检索 如检索者仅提供了MTX（一种甲氧类化合物），仅能检索到84篇，浏览文摘见到METHOTREXATE（MTX）字样，选择该词，再检索，文献变为302篇。,（4）自由词检索 allo derm; alloderm* 中医：仅有medicine, chinese traditional等非常少的主题词可供使用，必须使用自由词。,（7）其它： 用 INDEX选词、CANCER IN SO、LIVER NOT HEPATITIS。 著者：注意姓名的标准写法 SUN JIN LI-JINLI SUN-SUN JL KELODE MATTSON-MATTSON