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中山大学博士学位论文绪连彩 中文摘要 钌( i i ) 多吡啶配合物具有丰富的光化学、光物理性质、独特的d n a 结合能力, 在生物领域具有广泛的潜在应用,如可以作为峪结构探针、d n a 分子光开关、 肿瘤基因治疗、d n a 光裂解试剂等。自从上世纪7 0 年代,a d 锄s o n 报道了钌( i i ) 联吡啶配合物可以作为光敏化试剂之后,人们合成了大量不同结构的钌( i i ) 多吡 啶配合物,其中中山大学生物无机化学组就合成了上百种的钌( i i ) 多吡啶配合物。 这些配合物大多具有d n a 光裂解性能,然而,其光裂解d n a 的机理与规律在 实验上尚未真正弄清楚,在理论上的研究更为罕见。因此,在实验的基础上,进 行钌( i i ) 多吡啶配合物d n a 光裂解的机理与效率的理论研究,对于指导新型钌( i i ) 多吡啶配合物的d n a 光裂解试剂的设计及作用机理分析具有十分重要的意义。 本论文运用g a u s s i 肌0 3 程序包,采用密度泛函理论( d f t ) 、含时密度泛函 理论( t d d f t ) 、h f ( h a r t r e e f o c k ) 从头计算及单组态相互作用的( c i s ) 方法, 对若干系列钌( i i ) 多吡啶配合物的d n a 光裂解机理与效率进行理论研究。通过研 究实验上报道的具有聊叮a 光裂解性能的插入型钌( i i ) 多吡啶配合物的基态和激 发态的几何结构、电子结构、激发态的氧化还原势等方面的性质,解释了这些配 合物d n a 光裂解的机理与效率,获得了这些配合物d n a 光裂解效率的一些调 控规律,如主配体上不同取代基、取代基的不同位置、主配体骨架上引入n 原 子以及辅助配体等对光裂解d n a 效率的调控等。 本论文共包括五章: 第一章绪论。综述了量子化学的基本方法和钌多吡啶配合物的研究进展, 特别是钌( i d 多吡啶配合物d n a 光裂解的研究现状及其理论研究进展,从而阐明 本论文所选课题的意义。 第二章钌多吡啶配合物 r 蚶l e n ) 2 ( 6 一r - d p p z ) 】2 + ( i 净o h ,n 0 2 和h ) 对d n a 光裂解机理及取代基效应。主要采用d f t 、h f 和c i s 方法,通过研究配合物 r u q h e n ) 2 ( 6 - r d p p z ) 】2 + ( r 芦o h ,n 0 2 和h ) ( 1 3 ) 基态与激发态几何构型、自然电 荷分布、以及计算得到的基态和激发态电化学数据,解释了不同取代基钌( i i ) 多 吡啶配合物可能的d n a 光裂解机理以及光裂解效率。计算结果表明,对于配合 烈 中文摘要 物1 和3 ,其裂解能力主要取决于相应激发态的还原势;对于硝基取代配合物2 , 其光裂解d n a 的能力除了决定于激发态的还原势外,还受到激发态几何构型畸 变的影响。 第三章主配体不同位置取代的钌配合物 r u 唧y ) 2 ( l ) 】2 + ( l = 节i p o - m o p i p , p - m o p i p ) 对d n a 的光裂解及其效率。采用d f t 厂r d d f t ,h f 和c i s 方法计算了 【r u ( b p y ) 2 ( l ) 】2 + ( l _ = p i p ,o - m o p i p ,p - m o p i p ) ( 1 3 ) 的基态和激发态的几何与电子结 构,用理论计算的方法获得了它们基态( s o ) 和最低三重激发态( t 1 ) 的氧化还 原势。计算得到这些钌配合物( 1 3 ) 激发态还原势大于重叠鸟嘌呤的氧化势,且 其顺序为e 牛戚( 1 ) “2 ) ,( 1 ) ) ,也可以解释它们不同的d n a 光裂解效率。 第四章插入配体骨架上氮原子【r u o h 饥) l 】2 + ( l _ p i p ,p y i p ,p z i p ) 对钌配合 物d n a 光裂解效率的理论研究。采用d f t ,h f 和c i s 方法计算了【r u e 1 1 ) l 】2 + ( l = 甲i p ,p y i p ,p z i p ) ( 1 3 ) 的几何与电子结构,用理论计算方法获得了它们基态 ( s o ) 和激发态( t 1 ) 的氧化还原势。从理论上推测了在主配体上增加1 个氮原 子到增加3 个氮原子,可能的d n a 光裂解效率的倾向。 第五章不同辅助配体钌( i i ) 多吡啶配合物d n a 光裂解效率的理论研究。选 择了三个系列钌配合物进行研究,采用d f t ,h f 和c i s 方法计算了它们的几何 与电子结构,用理论计算的方法获得了它们基态和激发态( t 1 ) 的氧化还原势, 讨论了辅助配体对钌( i i ) 配合物d n a 光裂解效率的调控作用。 本论文创新之处:( 1 ) 通过计算得到钌配合物的基态和激发态的几何及电子 结构( 如电荷分布) 的变化,在理论上解释了插入型钌多吡啶配合物的d n a 光 裂解机理,为实验上的光诱导氧化还原机理提供了理论支持。( 2 ) 计算了钌多吡 啶配合物激发态的氧化还原势,并从计算的配合物激发态的电化学、光化学性质 以及几何畸变三个方面很好地解释了若干系列钌( i i ) 多吡啶配合物d n a 光裂解 的效率,得到的结果与实验事实一致。( 3 ) 通过理论研究获得了钌( i i ) 多吡啶 配合物d n a 光裂解的一些调控规律。如从主配体取代基、取代基位置、辅助配 体及在配体上引入杂原子等方面进行调控。 本论文尚有一些不足之处,如研究的一些系列配合物缺乏在同实验条件下 测定的可作定性定量比较的数据,使论文的深入讨论、调控规律的总结以至论 v 中山大学博士学位论文绪连彩 文的学术水平受到一定的影响。钌多吡啶配合物d n a 光裂解机理与效率的研究 是当前国际生物无机化学领域的一个前沿、交叉及具有广阔应用前景的课题,本 论文的研究工作及其所获得的规律还是很初步的,今后在理论与实验上要更加紧 密地结合起来,才能深入进行该课题的研究工作。 关键词:钌多吡啶配合物,d n a 光裂解,密度泛函理论( d f t ) ,从头计算( h f ) ,单组态 相互作用( c i s ) a b s t 嬲 t h e o r e t i c a ls t l l d i e so nt h em e c h a n i s ma n de m c i e n c yo fd n a p h o t o c l e a v a g eb yr u ( i i ) p o l y p y r i d y lc o m p l e x e s m a j o r :p h y s i c a lc h e i i l i s t r y n a m e :l i a n c a ix u s u p e r v i s o r :p r o f e s s o rk a n 分c h e n gz h e n g a p p c a t i o nd e g “地:p h d a b s t r a c t i h ( i i ) p 0 1 ) ,p 妒d y lc o m p l e x e sh a v ee x c e l l e n tp h o t o p h y s i c a l 锄dp h o t o c h e m i c a l p r o p 鳅i 懿嬲w e l l 舔p 枷c u l a rd n a - b i n d i n gb c h a v i o r s ,r e s u l t i n gi i lt 晡rp o t e 而a l 印p l i c a t i o n s 嬲d n as 仃u c t u r a lp r o b e s ,d n am o l e c u l a r“l i g h t s w i t c h e s ”, 觚t i m e t a s t a t i ca g e n t so fp h o t o c h e m i c a l 仃e a _ n i l e n t s ,a l l dd n a p h o t o d e a v a g er e a 刚s e t c 1 1 119 7 0 s ,a d 锄s o nr e p o r t e dm a t 【r u ( b p y ) 3 】z 十w 鹤me x c e l l e n tp h o t o s s i t i z a n dn 1 饥ag r e a td e a lo fs t u d i e s0 nr u ( i i ) p o l y p 舛d y lc o m p l e x 骼h a v i i l gv 撕0 u s s 仃u c t i l r 鼯h a v eb e e nr c p o r t e d h lp a n i 吼d a r l eb i o i n o r g a i l i cr e s e 疵h 粤伽po fs u n y a t s 吼u i l i v e 倦时h a v er e c e n t l ys y n m e s i z e dm o r em a i lh :u 1 1 d r e d so fn o v e lr u ( i i ) c o m p l e x e s ,a n dm o s to ft h e mc 趾i n d u c ed n ap h o t o c l e a v a g eu n d e ru v 二s 跏撕o n h o w e 峨m em 如a i l i s mo fd n ap h o t o c l e a v a g eb ym o s tr u ( i i ) c o m p l e x e sr e m 咖u l l c l e a ry e ti n 唧鲥m e n t ,a n ds of a r ,m em e o r e t i c a ls t i l d i e so nm e d n a p h o t o c l e a v a g ea r cm o f ei n 矗嘲u e n t 7 n l e r e f o r e ,0 nm eb 船i so fa 伊韶tn 啪b c fo f m ee x p e r i m e n t a lw or ! k s ,m e o r e t i c a ls t u d yo nd n ap h o t o c l e a v a g e 锄dp h o t o d e a v a g e e 伍c i 铋d e sb yr u ( i i ) p o l y p 舛d y lc 0 m p l e x e si sav e 巧i n t e i 髑t i i l ga n ds i 嘶f i c a n tw o r k f o ru i l d e r s t 锄d i n gm ed n a - p h o t o c l e a v a g em e c h a l l i s ma n dd 蛐gn l ed e s i 印o f 1 1 0 v e ld n a p h o t o d e a v a g er e a g 饥t s t h et l l e o r e t i c a ls t i l d i 豁o nd n a p h o t o d e a v a g em e c h a i l i s m 孤dp h o t o c l e a v a 雩r e e 伍c i 既c yb ys e v e r a ls 耐懿o fr u ( i i ) p o l y p 妒d y l 鲫n p l e x e sw 啪c 锄l :i c d0 u tw 洫 v 中山大学博士学位论文绪连彩 d e n s i t y 劬c t i o n a lm e o 巧( d f d ,t i m e d e p e i l d e n td f t ( t d d f t ) ,c o n f i g u r a t i o n i n t e r a c t i o ns i n 西e s ( c i s ) m e m o d s ,h a m e e f o c k ( m e m o d ) h 1 “sd i s s 哦a t i o n ,m e s t u d i e dr u ( i i ) c o m p l e x e sa r es u c hat y p eo fc o i n p l e x e sw l l i c hi n t e r a c tw i t hd n ai n i n t e r c a l a t i v em o d ea 堇l dm e yc a ni n d u c ed n a p h o t o c l e a v a g e t h eg e o m e t r i e s ,m e e l e c 乜o n i cs 缸u c t u r e s ,a 1 1 dt l l er c d o xp o t 髓t i a l so ft h e s ec o m p l e x e smt l l eg r o u n ds t a t e a 1 1 dm e1 0 w e s te x c i t e ds t a t ew e r ec a l c u l a t e dw i t hq u 咖c h 砌s 缸ym e t h o d si ng 0 3 p r o 笋锄p a c k a g e t h ec a l c u l a t e dr c s u l t sw e r eu s e dt oe x p l a i nt h em e c h a n i s mo fd n a p h o t o c l e a v a g e 弛dt h ed n a - p h o t o c l e a v a g ee 伍c i e n c i 骼b yt l l e e x c i t e dr u ( i i ) c o m p l e x e s 1 1 1 i sd i s s e n a t i o nm a i l l l yc o n t a i l :1 sf i v ec h a p t e 强 耽e 丘r s tc h 印t c ri sm ei 1 1 t r o d u 嘶o n s o m em e t h o d so fm eq u a l l t u mc h e m i s 仃ya 1 1 d m ec l m e 】n t p r o g r e s so nt l l e s t u d i e so fr u ( i i ) c o m p l e x 懿a r ep r e s c n t e d h e r e ,n l e e x p 甜m 曲t a lb a c k g r o u n do nd n ap h o t o c l e a v a g eb yr u ( i i ) c o m p l c x 懿锄dt l 心r c c e n t t l l e o r e t i c a ls t i l d i e so nt l l i s1 f i e l d sw e r ep r e s e n 砌 t h es e c o l l dc h a p t e ri sm et h e o r e t i c a ls t u d i e so n l em e c h a i l i s m 赳1 ds u b s t i t u e m 抵to fd n a p h t o t c l e a v a g eb yr u ( i i ) c o m p l e x e s 【r u 哪2 ( 6 一r d p p z ) r ( r = o h , n 0 2 ,h ) ( 1 3 ) q ) h 胁= 1 ,1 0 - i h c i l a 珊瑚1 i n e ;d p p z = d i p 如d o - 【3 ,2 - a 2 ,3 - c 】一p h c i l 硒n e ) t h eg e o m e t r i c 锄dd e 曲r o n i cs 仃u c t i m 谘,t l l er e d o xp o t 训a l so fm e s ec o m p l e x 鹤i n 也e g r o u n ds t a t e ( s o ) ,t l l e 觚ts i n 酉e te x c i t c ds t a t e ( s 1 ) a n dt 邱1 e te x c i t e ds t a t e s ( t 1 ) w e r e c a m e do u tu s i n gm ed 铋s 毋缸l 以o n a l 廿l e o 巧( d f d ,h a r 争f o c k ( h f ) a l l d c o n f i g u r a t i o ni n t e r a c t i o ns i i l 哲e s ( c i s ) m e t l l o d s t h ec a l c u l a t e dr e s u l t ss l l o wt l l a tt l l e e x c i t e dr e d o xp o t e n t i a l so f r u e n ) ( 6 一r d p p z ) 】计( i p o ha n dh ) ( 1 3 ) a r em a i l l l y r c s p o n s i b l e f o rt l l ed n ap h o t o d e a v a g e ,w l l i l et 】h ed n ap h o t o d e a v a g e b y 【r u ( 1 ) h e n ) ( 6 _ n 0 2 - d p p z ) 】z + ( 2 ) a r ea l s od o s c l yr e l a t i v et 0 戗l eg e o m e 时d i s t o r t i o no f i t se x c i t e ds t a t e 叻e l i r dc h a p t e fi st h en 啪删c a l 咖d i e so nd n a - p h o t o d e a v a g eb yr u ( i i ) c o m p l e x e s 【r u ( b p y ) 2 ( l ) 】计( l = p i p ,d - m o p i p 锄dp - r n o p i p ) ( 1 3 ) 唧y = 2 ,2 - b i p 蜘d i i l e ; l : p i p = 2 - p h 伽明砌d 配o 【4 ,5 胡 1 ,l0 】- p h 咖t 1 1 r 0 1 i 1 1 e d m o p i p = 2 一( 2 一m e m o x y p h 即【y 1 ) i i i l i d a z o 【4 ,5 一f 】1 ,10 1 ) h 踟a n m f o l i i 地a n dp - m o p i p = 2 一( 4 - m e n l o x y p h e n y l ) i m i d a z 0 【4 ,5 - f 】 1 ,1o 】p h e n 锄也r o l i n e ) h lo r d e rt 0u n d e r s t 舡l dm c i r d n a p h o t o d e a v a g em e c h a n i s m 觚d 旬枷,t h et l l e o r e 缸c a ls t u d i 髓o nt 1 1 eg e o m e t r i c 锄【de l e c t r 0 i l i cs 协l c 咖懈o fn l 髓ec 0 m p l c x 鹪i i lt l l e 孕o u i l ds t a t e ( s o ) ,m ef i l 赋幽增e t e x c i 伽s t a t e ( s1 ) a n dt r i p l e tc x c i t c ds t a t 髓( t 1 ) ,w e 佗c a r r i e do u t 璐i n gm ed e 船i t y 丘m c d o n a ln 瑚巧( d m d 兀) ,h a r t r 静f o c k ( h f ) a n dc o n f i g u r a t i o ni n t 删i o n v m s i l l 西e s ( c i s ) m e 妇1 0 d s t h er e d o xp o t e 埘a l so ft l l eg r o u n ds t a t e ( s o ) 锄d 吐圮l o w e s t t r i p l e te x c i t e ds t a t e ( t 1 ) w e r ec a l 砌a t e d 也e o r e t i c a l l y t h er 懿u l t ss h o wt l l a t 廿1 e d u c t i o np o t e i l t i a l so fm ec x c i t e dc o m p l e x 髓f e a c hn l em e o r e t i c a l 珊g eo fo x i d 娩i n g 廿l es t a c k i n gg u a i l i n e ,锄dm e yf o l l o w l eo r d e ro f 上芦删( 1 ) 姐宰捌( 2 ) e 木脚( 3 ) t h e g e n e r a lt l l e o r e t i c a le x p l a n a n o no nm e i rd n a - p h o t o c l e a v a g em e e h a l l i s m 嬲w c l l 嬲n l e e x p l a n a t i o n m e 饥m di nm e i r d n a - p h o t o c l e a v a g ee 确c i e i l c i e s , i e , 吠1 ) “1 ) t h ef o m t l l c h a p t e ri s 翻h cm e o r e t i c a ls 砌i e s o nd n ap h o t o c l e a v a g eb y r u 吣e n ) 2 ( l ) 】z 十( 【砷i p ,p y i p 锄d p z i p ) l 3 ( p y i p _ 2 一( 2 - p y r i d y l ) i m i d a z o 5 ,6 一句1 ,1o p h 饥锄m r 0 1 i i l e ,p z i p = 2 - ( 2 - p y r a z i n y l ) i 1 1 1 i d a z o - 5 - 6 - f 】l - 1o - p h 肌a n l r o l i n e ) t h e 舯e t r i ca n de l e c t r o i l i cs 饥l c t i 鹏s ,m e r e d o xp o t e n t i a l so fm e s ec 伽叩l e x e si nm eg r o u n ds t a t e ( s o ) ,t l l ef i r s tt r i p l c te x c i t c d s t a t e s ( t 1 ) ,w e r ec a r r i e do u tu s i n g l ed e i l s i 够劬c t i o n a lm e 0 巧( d f d ,h a r 眈e f o c k ( h f ) 雒dc o n 丘g u r a t i o ni i l t e m c t i o ns i n 百e s ( c i s ) m e t l l o d s 1 1 1 er e d o xp o t e n t i a l so f t 1 1 e g r o u n ds t a t e ( s o ) 锄d 廿l ee x c i t e ds t a t e ( t 1 ) w e r ec a l l a t e dm e o r e t i c a l l yt h e c a l c u l a t e dr e s u l t ss h o wm a tt h en 硼曲e ro fna t i d m so nm ei n t e r c a l a t i v el i g a n dh 嬲a c o n s i d 鼬l ee 毹c t0 n 廿l e 川o xo fm ee x c i 伽s t a t e ,a n dn l a t l ed n a p h o t o d e a v a g e e 伍c i 铋c yb e c o m e sm o r e 缸dm o r e1 l i 曲丘- 0 m 廿l ec 0 m p l e x1t 0c o n l p l e x3 1 kf i f l hc h a p t e ri s 廿1 em e o r e t i c a ls t u d i e so fc o - l i g a n de 侬斌o nt l l ed n a p h o t o c l e a v a g e t h eg e o m e t r i c 姐de l e c 灯o i l i c 蛐m c t u r e s ,t l l er e d o xp o t e n t i a l so fn l r e e s e r i 髓o fi h ( i i ) c o m p l e x e si i lm eg r o u n ds t a t e ( s o ) 锄dm ef i r s tt r i p l e te x c i t 砸s t a t 鹪 ( t 1 ) ,、v e r ec 锄i c do u tl l s i n g 缸l ed e i l s 埘觚砸o n a lt 1 1 e 0 巧( d f t ) ,h a r l r e c - f o c k ( h f ) 锄dc 0 n f i g u r a t i o ni n t e r a c t i o ns i i 西懿( c i s ) m e 廿1 0 d s 1 1 圮c a l c u 1 a t e dr e s u l t ss h o wa l a t n l ec 0 - l i g 肌d sh a v ea l s oac o l l s i d 唧b l ee 任e c to nm er e d o xo ft l l ee x c i t c ds 协t e ( t 1 ) , t l l a t i st 0s a y ,r u ( i i ) c o i n p l e x c o n t a i l l i n gd i 侬粕n tc o l i g a n d sh a v ed i 妇眩td n a p h o t o c l e a v a g ee 伍d 锄d 锱t h eo b t a j n e dt l l c o r e t i c a l 础湖t sa r ei n9 0 0 da g f i e e m e n t w i lt l l ee x p e r i m e n t mr e s u l t s h l l i sd i s s e r t a t i o n ,t l l em o s tc r e a t i v ep o i i 】t sa r e 酬毗l m a r i z e d 嬲f o l l o w s :( 1 ) t h e m e c h a n j s mo nm ed n a p h o t o c l e a v a g eb ys 锄er u ( i i ) c 0 m p l e x 懿i ni n t e r c 面撕v e m o d e ,w l l i c hi sa t t i i b u t e dt oap h o t 0 - i n d u c i l l go x i d i z a t i o n - 刷u c t i o nm e c h 觚i s mi n e x p 幽饥t s ,c 趾b er e 弱0 n a b l ye x p l a i l l e di nd e t a i lv i a 锄a l y z i n gt l l ec h a i 增懿i l lt l l e 中山人学博l :学位论文绪连衫 c h a r g ed i s 劬u t i o n s 锄dt h eg e o m e t r i e so fm ec o m p l e x e si nt 1 1 eg r o u n ds t a t 鹤锄d c x c i t e ds t a t e s ( 2 ) t h er e d o xp o t e l l t i a l so ft i l ee x c i t e dr u ( i i ) c o i n p l e x e sw e r e 矗r s t l y m e o r e t i c a l l yc a l c u l a t e d ,a i l dt h e 慨d s i nd n ap h o t o c l e a v a g eb yt l l e i 沁( i i ) c o m p l c x 铝w e r ea l s or e 弱o n a b l yc x p l a i n e da c c o r d i n gt 0t h ec a _ l c u l a t e dd a t ao f e l e c t r o c h e m i s 仃y g e o m 酏呵d i s t o r t i o na i l dp h o t o c h e m i s t 哆m o r e 0 v e r ,t 1 1 et 1 1 e o r e t i c a l r e s u l t sa r ei nc o l l s i d e r a b l ea g r e e i i l e n tw i t hm ee x p e r i m e n t a lr e s u l t s o nm eo t h e rh a i l d ,t h e r ea r es o m e1 i m i t a t i o n si nt l l i sd i s s e r t a t i o n ,f o re x 锄p l e ,t h e a b s 饥c eo f l ec o m p a r a b l eq u a i l t i t a t i v ed a t a0 b t a i n e du n d e rt h es a m ec x p e r i m e i l t a l c o n d i t i o n s ,r e s u l t i n gi nt h ed i f n c u l t yi n 丘l n h e rd i s c u s s i o no nm ec a l c u l a t e dr e s u l t s a t p r e s e 峨t 1 1 ed n ap h o t o c l e a v a g eb yr u ( i i ) c o m p l e x e si s ap o p u l a rs 1 j b j e c ti n i n t e n l a t i o n a lb i o i n o 玛a n i cc h 锄i s t r y d u et oi t sp o t e n t i a la p p l i c a t i o l l s t h es t u d yo n m ed n a p h o t o c l e a v a g cb yr u ( i i ) c 0 m p l e x e si nm i sd i s s e r t a t i o ni so i l l yap n m 叫 w o r k h lo r d e rt o 如r t h e rs t u d y 虹l ed n a - p h o t o c l e a v a g em e c h a i l i s mb yr u ( i i ) 唧l e x 懿a i l dt h e 慨l d ,i ti sv e f yi m p o r t 锄tt h a tt od o s e l yc o m b i n em em e o r e t i c a l r e s e a “i h e sw i mt l l ee x p e r i m e n t a lw o r k s k e yw o r d s :r u ( i i ) p o l y p r i d y lc o m p l e x e s ,d n ap h o t o d e a v a g e ,d f t h f ,c i s x 论文原创性声明 论文原创性声明 本人郑重声明:所呈交的学位论文,是本人在导师的指导下,独 立进行研究工作所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外,本论 文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品成果。对本文 的研究作出重要贡献的个人和集体,均已在文中以明确方式标明。本 人完全意识到本声明的法律结果由本人承担。 学位论文作者签名:结焦够 日期:矽口苫年6 月歹日 中山大学博士学位论文绪连彩 知识产权保护声明 本人郑重声明:我所提交答辩的学位论文,是本人在导师指导下 完成的成果,该成果属于中山大学化学与化学工程学院,受国家知识 产权法保护。在学期间与毕业后以任何形式公开发表论文或申请专利, 均需由导师作为通讯联系人,未经导师的书面许可,本人不得以任何 方式,以任何其它单位作全部和局部署名公布学位论文成果。本人完 全意识到本声明的法律责任由本人承担。 学位论文作者签名绕缝彩 日期:秒d 暑年e 月歹日 学位论文使用授权声明 学位论文使用授权声明 本人完全了解中山大学有关保留、使用学位论文的规定,即: 学校有权保留学位论文并向国家主管部门或其指定机构送交论文的 电子版和纸质版,有权将学位论文用于非赢利目的的少量复制并允许 论文进入学校图书馆、院系资料室被查阅,有权将学位论文的内容编 入有关数据库进行检索,可以采用复印、缩印或其他方法保存学位论 文。 学位论文作者签名:结选彩 日期:2 0 0 苫年月岁日 导师签名:粹孕q 日期:乙纩以每多月f 日 第一章绪论 1 1 量子化学计算方法 第一章绪论 量子化学计算是利用量子力学基本原理研究原子、分子、晶体的分子结构、 电子结构、化学性质以及各种光谱波谱的理论。近2 0 年来,随着电子计算机技 术的发展,量子化学计算方法有了很大的发展,量子化学计算方法能计算的体系 越来越大,计算的精度也越来越高。目前,小于l o o 个原子的小分子,。均可以使 用从头计算的方法( 幻伽泐) 和中等大小的基组( 如6 3 l g 幸) 进行量子化学计 算。所以,量子化学已经发展成为研究无机和有机化合物、生物分子、功能材料 的结构和性质的一门科学,被广泛的应用到生物、能源、化工、环境、激光技术 等领域。 1 1 1s c h 6 r d i n g e r 方程 量子化学计算的基础是量子力学,量子力学可对电子行为进行准确的数学描 述。从理论上讲,使用量子力学方程可以准确预测单一原子或分子的任何与电子 结构有关的属性,比如光谱和电子能谱等。但事实上并非如此,量子力学方程只 能得到单个电子体系的精确解。也就是说,即使像h e 原子这样简单的体系也不 能使用量子力学方程得到电子运动的解析解。对于单电子体系的s c h r 6 d i i l g e r 方 程,比如h 原子或含有两个原子核的类氢离子,可以使用分离变量的方法得到 解析解。对于多电子体系的s c h r 6 d i n g e r 方程,科学家们发展了各种近似的方法 来处理。 首先简单介绍一下量子力学的基本方程。量子力学有两种等价的基本方程, 它们分别由s c h r 6 d i n g e r 和h e i s 锄b e r g 提出的。这里我们只介绍s d 埔d i n g e r 方程, 因为这是几乎所有计算化学方法的基础,而且任何量子力学的讨论都是以 中山大学博士学位论文绪连彩 s c h r 6 d i n g c r 方程为起点。含时的s d 埔d i n g c r 方程可以表述为: 卜篆专+ 导+ 等,+ 矿m 彬脚壳笔竽 m , 方程( 1 1 ) 涉及的是一个质量为所的电子在空间中的运动并且空间中有一个外 加场阼电子的位置由向量,硝卅+ z k 给出,而时间由f 确定。方程( 1 1 ) 中 h 是普朗克常数被2 7 c 除的商,p 是描述电子运动的波函数。如果外加场矿不随 时间变化,可以把波函数的空间部分与时问部分分离,得到妖,;f ) = 似力及力。如 果只考虑外加场矿与时间f 无关的情况,就得到了定态的s d 墒d i n g e r 方程: 一委二v z + y ) 少p ) :印( r ) ( 1 2 ) 上述方程中层即是粒子的能量, v 2 = 等+ 等+ 导 m 3 , 通常还把方程( 1 2 ) 的左边简写成矗奶这里疗是哈密顿算符, 疗:一旦v 2 + y( 1 - 4 ) 2 m 这样就得到了简写的s c h r 6 d i n g e r 方程商沙司妒 1 1 2 多体问题 运用量子力学处理分子问题的第一步是分离原子核运动和电子运动,因为在 使用s c h r 6 d i l l g e r 方程处理多原子核体系的时候,就会遇到一个问题。电子与原 子核都在运动,解方程比较困难,通常采用b o m 0 1 ) p h e i i n e r 近似( 也称原子 核固定近似) 来处理。由于原子核的质量比电子质量大的多,所以电子的运动比 原子核的快的多。因此,电子的运动是由原子核的瞬间位置决定,与原子核的运 动无关。 在b 伽1 o p p 锄h e i i i l e r 近似下,分子的s c h r 6 d i n g e r 方程可以写成: 疗妇甲妇( ,r ) = e 如甲咖( ,r ) ( 1 5 ) 这一方程将电子当作在由固定和产生的场中运动,甲妇是电子的波函数,它是电 子坐标,和原子核坐标尺的函数。类似于经典力学,自可以表示为动能项r 和 势能项矿的和: 2 第一章绪论 疗咖= 丁如+ y 咖 ( 1 6 ) 其中,动能项产为: 丁咖一篆荤c 毒+ 蓦+ 争 7 ) 是库仑势能项: 限 摹警+ 吉雾私菩警 8 ) 式( 1 8 ) 中第一项是电子核吸引势能,第二项是电子电子排斥势能,第三项是 核核排斥势能。 用计算化学的方法研究分子的电子结构,无论是用从头计算的方法,还是半 经验的方法,一个主要的任务就是解方程( 1 5 ) 。如前所述,多电子体系不能得 到s c h r 6 d i n g e r 方程的解析解。 1 1 3 分子轨道理论 1 1 3 1b o r n - o p p e n h e i m e r 近似和s l a t e r 行列式波函数 经过b o m 0 1 ) p 即h e i m e r 近似之后,分子中电子的波函数被简化成( 1 5 ) 的 形式,这个方程很难精确求解,困难在于多电子体系的s c h r 6 d i n g e r 方程中含有 双电子的排斥能项,这一项与两个电子的瞬间坐标有关,无法分离变量而化成像 氢原子那样的单电子s c h 面d i n g 盯方程,所以要引入新的近似单电子近似,或称 为轨道近似。这个近似的思想是:每个电子受其它电子的瞬间作用,看成是其它 电子的平均势场的作用。这样,每个电子都在原子核的吸引和其它电子的平均势 场中运动,所以每个电子都有自身的单电子波函数和电子能量。比如一个多电子 体系的s c h r 6 d i i l g e f 方程可简写为 日y ( ,i ,吃,) = e y ( ,i ,吒,) ( 1 9 ) 电子波函数河以用下面的形式替代: c ,( ,眨,) = ( 吒) ( 吃) ( ) ( 1 - 1 0 ) 式( 1 1 0 ) 中即,忱,蛳通常称为分子轨道。在量子化学中,分子道理论 应用得最为广泛,它采用单电子波函数近似表达每个电子的运动状态。单个分子 3 中山人学博上学位论文绪连彩 轨道惭是某个电子空间坐标n 的函数,这个波函数的平方表示这个电子在空间 的概率分布。| ! f ,l 对应的能量本征值岛是第f 个分子轨道的能量,分子的总能量是 所有被占轨道电子的能量之和。 如果要完全描述电子的运动状态,还必须加入电子的自旋函数印。呀只能取 两个状态,即仪自旋和d 自旋,其角动量在z 方向上的本征值分别为+ 1 2 和1 2 。 如果电子自旋与z 轴方向一致,自旋波函数为珂n : 11 ( + 寺) = 1( 一寺) = o ( 1 1 1 ) 二二 如果电子自旋与z 轴相反,自旋波函数为叮b : 11 ( + 寺) = o( 一寺) = l ( 1 - 1 2 ) 厶厶 由于电子具有完全相等的质量、电荷等固有属性,同样条件下,各个电子的行为 是完全相同的,这就是电子的全同性,也就是说电子是全同粒子。对于全同粒子, 按照波函数的统计意义,交换任何两个粒子的坐标,不会影响几率密度( 即波函 数的平方) 。由于微观粒子的全同性,交换任意两个微观粒子的坐标,波函数要 么是对称的( 正号) ,要么是反对称的(

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